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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001466 | Chr5 | 27598968 | 27602581;27606440 | + | LOB domain-containing protein 38 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001466.m1 | 2 | 101 | PF03195.17 | LOB | Family | 85.7 | 2.70E-24 |
LITCHI001466.m2 | 2 | 101 | PF03195.17 | LOB | Family | 85.6 | 2.90E-24 |
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>LITCHI001466.m1 ATGAGTTGCAATGGGTGTAGGGTTCTCCGAAAGGGCTGCAGTGACAACTGCACGCTTCGA CAATGTCTCCACTCCATCGACACCCCCCAAGCCCAAGCCAACGCCACCGTTTTCGTCGCC AAGTTCTTCGGCCGCGCCGGCCTCATGTCCTTCATCTCCAACGTCACTCCCTTCCAACGT CCCTCATTGTTTCAGTCGCTTTTATACGAGGCAGTGGGGCGGACCATAAATCCGGTGAGT GGGGCGGTGGGGCTTCTGTGGACGGGAAACTGGGGCCTCTGCCAGGCCGCGGTCGAGACC GTACTATGCGGCGGCGCGTTGAAGCCACTTCCCAACTGTCTTGGCGGTGTGCCGGAGCTG GATGACGTATCGGAATCTGCAGTGAACGTTGTTTCAGGGAAACCGAAGCCGTTGAAGAGG AAGGAGGATCGTTTTGGTGATGACATCTCTGGAGACGTTGATCTGAACTTGACGGCTAGT ATGCCGCACAGGGAGGAGAAACGGCGGACGACGACGCCTTCGGAGGAGTCGGAAACGACG ACGTCGTTGGTGAGTGGCTTGGAAAATACTAGTAATACAGAGGGAGGTGAGAAAAAGCTG TTGAGACTCTTCTTTTGA >LITCHI001466.m2 ATGAGTTGCAATGGGTGTAGGGTTCTCCGAAAGGGCTGCAGTGACAACTGCACGCTTCGA CAATGTCTCCACTCCATCGACACCCCCCAAGCCCAAGCCAACGCCACCGTTTTCGTCGCC AAGTTCTTCGGCCGCGCCGGCCTCATGTCCTTCATCTCCAACGTCACTCCCTTCCAACGT CCCTCATTGTTTCAGTCGCTTTTATACGAGGCAGTGGGGCGGACCATAAATCCGGTGAGT GGGGCGGTGGGGCTTCTGTGGACGGGAAACTGGGGCCTCTGCCAGGCCGCGGTCGAGACC GTACTATGCGGCGGCGCGTTGAAGCCACTTCCCAACTGTCTTGGCGGTGTGCCGGAGCTG GATGACGTATCGGAATCTGCAGTGAACGTTGTTTCAGGGAAACCGAAGCCGTTGAAGAGG AAGGAGGATCGTTTTGGTGATGACATCTCTGGAGACGTTGATCTGAACTTGACGGCTAGT ATGCCGCACAGGGAGGAGAAACGGCGGACGACGACGCCTTCGGAGGAGTCGGAAACGACG ACGTCGTTGGTGAGTGGCTTGGAAAATACTAGTAATACAGAGGGAGGTACCACAGTGCGA GTACAGCTCTTTATCAACCTCCTCGTTGGGTAG
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>LITCHI001466.m2 + Up_Stream_Len 2000 AGAGATGAATTAATTGAAACTAAATACTCTTCTTCGGAACTTACCTCTTCGTTTATTCTA AAAGGGCATATAATGAGTATTCTTAAATCAAAGCATTGTTTCCATTACAAAATAATAATT AAAGAGACATCTAATAGATATTCCTTTGCAAAGCATATCAAGTACTTTTCACATATCAAT TGTTTGGCTCAATTTTATATGAAGTCTTCTTTCTTTCTTGTCTCAATTGATATGTTCGAA TAACTAGATTACCAAGGTGTTATTTCATTTGACCACTATGATGATTGCAACATTTACTTT TTCTATTCGTTTATTTACTGTCAATCATAAATTGAATCCCTCAAAGTAAAAACTCCAATC AGGACCAGAACTTAACCATTGTAGTCAACGATTAAATTATGTAAATTCTTTGTCCAATGC CCATCTCCAATATCCTTAGAATGTCTCTCTAAACCATGGAAGAGACACAAAAAGACAAGC CAATCAAATAATTGTGAAGCAAATCGAAATCATCCAAAAACGTCACTCTCTACTCTCTCT CTCTCTCTTTATGTGGTCACAGCGTCCGGGTTCTTGACCTCCTACACGCTGGAGTTAAAT GAAGACAAAAATGAGTGAGTTGTTACAAGATTGGAATCTAGTTCGCCACAAACTTTGGTT TATTTTTTTAGTAGGATTAAACAATAGATAAGGAGATAAAGATGCCACGCAACCAGGCTT TCGACAACAACTTGAATAGGATGACTTCGTATGATCCGTATCATGGTCGATTTTGGCGTC TTCCTCTTGCATGAGTTATGTCTTGGGCGAGTTTTCACTTCATTTTCCAACCTCGTAAGT ATAGCCAACGGTTTTCATCCAATATATAGATAGATTACAGACATATGATCTCTATAATTA CAATGCAGATTATATGGACTGATAACTGAAAAACCTTGGGCCGTGCAAACCTTGGGAATT CTTATAATAACATATTGGATTTCATTTGGGCGCATGTCAAAATAATGATTAAGAGTGTTT TGTCCCTCTTCTTATTTACAGTAACAAGATTAAATCTCGCTATTTATAATTATCGTCATG TAATAATTATCATGTTAGTCTCGATTATCTAATTTCATTGGTCCCAATATAACTTGTTTT ATAAGATTTCAAATGACTAAAAAATATTTATACAATATTAACTTGCTCACTTAGTTAATG GAATAATATGGCGGAAGAAAAAAATGTGGAAACCAAAAGAAGTCCTATTGTGCATTCCAA GTAATTGCAATTTTCGGATTTTGTTTGTGTTGTTCTATGTAGACACCGACTAATCTTATT GTACATTGATTTTAGTTTGGTTGATTGACGTAACAGCATCAACCCCACTTGCTATGTTTC TTTAAGTATGAATAAGATTTAAAATTTAATGACTATAAAAAGAGTGATAATTTTTTCAAT TAATTATAAATAGATCTCCCTTAGTCTTGGGAGCAATATTTTAGACTGCTCACTAAGTAG GGTATATCAATAGGTCTCGATAGTTATCTACCAAGGTGTAAAAATAACATATATCTAAAT GGTTATTAATATTTAATTGTAGTTTCCGTAAAAGAGAAGGCAATAGACAAAGAATCAGGC GGCAGTCATAGACATCCAAGGAAACAAAAAGGAATCCAACGGCTGAGAAAACCCCCAAAA CAAGCATTTGCGGAGACACGGAGCCGCAACTCACCCAATTTGTTTGGAGCCCCACCCCAC CCTGCCCTCCACTTAACTAAACCACACAACCCAACCCAACCATGGTCACTTTTAACCCAA TCCAATAATTACCCACCTGCCCTCTCTCTCTTCTATATAATACACACCTTCCCTTGTTTC TCTCTTCCCTCTCCCTCCATCTCTTGCTTCAATTATTATCCTTCCTTTCCCATTCTTGTG CCCCAAGAAACCCCACATATTCACCCACATTTTGATGCATTGAACCACCACCATTCCTTC ATTCCCAGTATTTCAACGTC >LITCHI001466.m1 + Up_Stream_Len 2000 AGAGATGAATTAATTGAAACTAAATACTCTTCTTCGGAACTTACCTCTTCGTTTATTCTA AAAGGGCATATAATGAGTATTCTTAAATCAAAGCATTGTTTCCATTACAAAATAATAATT AAAGAGACATCTAATAGATATTCCTTTGCAAAGCATATCAAGTACTTTTCACATATCAAT TGTTTGGCTCAATTTTATATGAAGTCTTCTTTCTTTCTTGTCTCAATTGATATGTTCGAA TAACTAGATTACCAAGGTGTTATTTCATTTGACCACTATGATGATTGCAACATTTACTTT TTCTATTCGTTTATTTACTGTCAATCATAAATTGAATCCCTCAAAGTAAAAACTCCAATC AGGACCAGAACTTAACCATTGTAGTCAACGATTAAATTATGTAAATTCTTTGTCCAATGC CCATCTCCAATATCCTTAGAATGTCTCTCTAAACCATGGAAGAGACACAAAAAGACAAGC CAATCAAATAATTGTGAAGCAAATCGAAATCATCCAAAAACGTCACTCTCTACTCTCTCT CTCTCTCTTTATGTGGTCACAGCGTCCGGGTTCTTGACCTCCTACACGCTGGAGTTAAAT GAAGACAAAAATGAGTGAGTTGTTACAAGATTGGAATCTAGTTCGCCACAAACTTTGGTT TATTTTTTTAGTAGGATTAAACAATAGATAAGGAGATAAAGATGCCACGCAACCAGGCTT TCGACAACAACTTGAATAGGATGACTTCGTATGATCCGTATCATGGTCGATTTTGGCGTC TTCCTCTTGCATGAGTTATGTCTTGGGCGAGTTTTCACTTCATTTTCCAACCTCGTAAGT ATAGCCAACGGTTTTCATCCAATATATAGATAGATTACAGACATATGATCTCTATAATTA CAATGCAGATTATATGGACTGATAACTGAAAAACCTTGGGCCGTGCAAACCTTGGGAATT CTTATAATAACATATTGGATTTCATTTGGGCGCATGTCAAAATAATGATTAAGAGTGTTT TGTCCCTCTTCTTATTTACAGTAACAAGATTAAATCTCGCTATTTATAATTATCGTCATG TAATAATTATCATGTTAGTCTCGATTATCTAATTTCATTGGTCCCAATATAACTTGTTTT ATAAGATTTCAAATGACTAAAAAATATTTATACAATATTAACTTGCTCACTTAGTTAATG GAATAATATGGCGGAAGAAAAAAATGTGGAAACCAAAAGAAGTCCTATTGTGCATTCCAA GTAATTGCAATTTTCGGATTTTGTTTGTGTTGTTCTATGTAGACACCGACTAATCTTATT GTACATTGATTTTAGTTTGGTTGATTGACGTAACAGCATCAACCCCACTTGCTATGTTTC TTTAAGTATGAATAAGATTTAAAATTTAATGACTATAAAAAGAGTGATAATTTTTTCAAT TAATTATAAATAGATCTCCCTTAGTCTTGGGAGCAATATTTTAGACTGCTCACTAAGTAG GGTATATCAATAGGTCTCGATAGTTATCTACCAAGGTGTAAAAATAACATATATCTAAAT GGTTATTAATATTTAATTGTAGTTTCCGTAAAAGAGAAGGCAATAGACAAAGAATCAGGC GGCAGTCATAGACATCCAAGGAAACAAAAAGGAATCCAACGGCTGAGAAAACCCCCAAAA CAAGCATTTGCGGAGACACGGAGCCGCAACTCACCCAATTTGTTTGGAGCCCCACCCCAC CCTGCCCTCCACTTAACTAAACCACACAACCCAACCCAACCATGGTCACTTTTAACCCAA TCCAATAATTACCCACCTGCCCTCTCTCTCTTCTATATAATACACACCTTCCCTTGTTTC TCTCTTCCCTCTCCCTCCATCTCTTGCTTCAATTATTATCCTTCCTTTCCCATTCTTGTG CCCCAAGAAACCCCACATATTCACCCACATTTTGATGCATTGAACCACCACCATTCCTTC ATTCCCAGTATTTCAACGTC
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