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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001459 | Chr5 | 27501383 | 27502803 | - | Transcription factor bHLH85 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001459.m1 | 297 | 337 | PF00010.29 | HLH | Domain | 34.8 | 1.30E-08 |
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>LITCHI001459.m1 ATGGAGCATATCGGAGCCATTTGTGAGGGAGAGTGGAGTTCTCTAAGTGGAATGTACTCC AATGAGGAGGCTGATTTTATGGCCCAATTGCTTGCAAACTGTCCGCCTTCAAATGAGCTA GATGGAAGTACAAGCTTGGGAAATCAATCTACACTTTGGCCTAGCTATGGTTCAACAATG AACATGGCAGGTGTTAATCAAAACTCTTATTTTCCTTTTGATATTGGTAAAAATACTAGT TCATTTTGTTTTTCACAAGGGAGTAGTTATAGTGGTGGTAGTAGTGCTCTTTTTCCTTCT TCAAGCCAAGAAAGCTACTACTTGAGTGGCTCCAATCCAATTTTGATAACCAATCATAGC TCCGTGTCAATGGATTTTTGCGTGGGGGATGCAAACAACACCAGCTCATACTTGATCGAA GGCGATGACTGTTCCAACCAAGAGATGAGTGATGGAAATGCTGGGGACCAATCTGGTGGA AGCCAGTCAGAGCTTGGTCTCGATGTTAAGACTTTGCCGCCCAAAATGGAATCAGAGATG CAAGCTCCTGAACCAGTCACAGAAGAGAAGCTCAACAACCCATCTGAGAATTCTAAAAAA AGATCAAGAAACTCAGCTGATGTCCAAAAGAAGAGGAACGTGAGGTCCAAGAAAAACCAG AAGGCTGTGTCAACAAGCAACGATATTGAGGAAGAAAACGACAATAATTCTAGCCTTAAC AAGCCAACCTCAAGCAGTTGCTCCTCGGAGGATGATTCCAATGCTTCTCAGGAACCAAAC GGAGGAGAGACTTCAAGCATGAGCTCAAAAGGGAAAGCAGCTCTCAACCTTAATGGCAAA ACTAGAGCCAGCCGTGGCTCAGCAACTGATCCTCAAAGCCTCTATGCAAGGAAAAGAAGA GAGAGGATCAATGAGAGGCTAAGGATTTTGCAGAACCTAGTCCCGAATGGAACAAAGGTT GATATCAGCACAATGCTTGAAGAAGCTGTCCAATATGTGAAGTTTCTACAACTCCAAATT AAGCTCTTGAGTTCTGATGATCTATGGATGTATGCTCCAATTGCTTACAATGGATTGAAC ATTGGATTTGATCATCTCAAGGTGACTACTACTCCAAAATTATCATAG
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>LITCHI001459.m1 MEHIGAICEGEWSSLSGMYSNEEADFMAQLLANCPPSNELDGSTSLGNQSTLWPSYGSTM NMAGVNQNSYFPFDIGKNTSSFCFSQGSSYSGGSSALFPSSSQESYYLSGSNPILITNHS SVSMDFCVGDANNTSSYLIEGDDCSNQEMSDGNAGDQSGGSQSELGLDVKTLPPKMESEM QAPEPVTEEKLNNPSENSKKRSRNSADVQKKRNVRSKKNQKAVSTSNDIEEENDNNSSLN KPTSSSCSSEDDSNASQEPNGGETSSMSSKGKAALNLNGKTRASRGSATDPQSLYARKRR ERINERLRILQNLVPNGTKVDISTMLEEAVQYVKFLQLQIKLLSSDDLWMYAPIAYNGLN IGFDHLKVTTTPKLS.
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>LITCHI001459.m1 ATGGAGCATATCGGAGCCATTTGTGAGGGAGAGTGGAGTTCTCTAAGTGGAATGTACTCC AATGAGGAGGCTGATTTTATGGCCCAATTGCTTGCAAACTGTCCGCCTTCAAATGAGCTA GATGGAAGTACAAGCTTGGGAAATCAATCTACACTTTGGCCTAGCTATGGTTCAACAATG AACATGGCAGGTGTTAATCAAAACTCTTATTTTCCTTTTGATATTGGTAAAAATACTAGT TCATTTTGTTTTTCACAAGGGAGTAGTTATAGTGGTGGTAGTAGTGCTCTTTTTCCTTCT TCAAGCCAAGAAAGCTACTACTTGAGTGGCTCCAATCCAATTTTGATAACCAATCATAGC TCCGTGTCAATGGATTTTTGCGTGGGGGATGCAAACAACACCAGCTCATACTTGATCGAA GGCGATGACTGTTCCAACCAAGAGATGAGTGATGGAAATGCTGGGGACCAATCTGGTGGA AGCCAGTCAGAGCTTGGTCTCGATGTTAAGACTTTGCCGCCCAAAATGGAATCAGAGATG CAAGCTCCTGAACCAGTCACAGAAGAGAAGCTCAACAACCCATCTGAGAATTCTAAAAAA AGATCAAGAAACTCAGCTGATGTCCAAAAGAAGAGGAACGTGAGGTCCAAGAAAAACCAG AAGGCTGTGTCAACAAGCAACGATATTGAGGAAGAAAACGACAATAATTCTAGCCTTAAC AAGCCAACCTCAAGCAGTTGCTCCTCGGAGGATGATTCCAATGCTTCTCAGGAACCAAAC GGAGGAGAGACTTCAAGCATGAGCTCAAAAGGGAAAGCAGCTCTCAACCTTAATGGCAAA ACTAGAGCCAGCCGTGGCTCAGCAACTGATCCTCAAAGCCTCTATGCAAGGAAAAGAAGA GAGAGGATCAATGAGAGGCTAAGGATTTTGCAGAACCTAGTCCCGAATGGAACAAAGGTT GATATCAGCACAATGCTTGAAGAAGCTGTCCAATATGTGAAGTTTCTACAACTCCAAATT AAGCTCTTGAGTTCTGATGATCTATGGATGTATGCTCCAATTGCTTACAATGGATTGAAC ATTGGATTTGATCATCTCAAGGTGACTACTACTCCAAAATTATCATAG
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>LITCHI001459.m1 - Up_Stream_Len 2000 ATTAAATCCAAAAAGCCCACCATCTTCTGCGCACAATAAATCAATTGTGCTCAAATTGAC CCTATTCTTAATTTGAAAATAATTACTTACATATACGTGCACTGCAGATGTAAATCATAT TAACAGAAAATTTGAGTCATTCATCTCCATAAAAATAGATAAATAAACCTCATTAATTTA TTGAAAGACACCTCGTCCTCTTTACTCATCGTATAACTGTGGGTGGCTACAAATTAATAA GTTAACCAGATCTATGTCACCTAAAAATAAACAACTAAATTTATATCACATATTTGACTT ACAGGATTTTGTGGATCTTTTCTTTTTTTATCCTGCCCTGACACTTTCATTACTCATGGT ACCCTGTGCATATTGATCATAACAAAATTTGTATTAATAGCATTCCGAGACTTACCAGAA TCCTGATTCAACTCAAGCTAGTGCTTGATAAACACTAGGAAAGATTAGGTCCAGATTTCA ATTATTATTATTTTTTCTTTTTTAGATTTTTATTTTATTATGTATAATAAATTTTATAAA TTTAATTAGTCTCACTCAGCATCATGACATCGAAATTACGTTAAAAAAAAAAATGAAAAA TCACCACCCCAATAATTATTAAATAAAAATTATATATAATTATATCTTCGTACTCTAAGT CCAACCACCTGTTTGGATCTGCATGGGATATGCAGACAAATTGTCTTGTTGCGACAAGCT TAATTCATGAATCACATCATAAAGAGTGAGACTAATTTTTATTTTTTTCTTATTAATTTT TTATAAGAATATTATCATATTTTTCATATATAAAAAATTTAGTAGTCATTTAAAAATTAA ATACATCTTATAATAATTATAAAATTTATATTTCTTCATAATGATATTTATGATAAAAAT TAATAAATATTACATTATATAAAATAATTATATATAATTTTAATTTATTTAATATAATAT TAACAAATTTCACAATTTATCAAACATAAAATATAATTATTTTGTATTCAGTCTCAAGAC ATACCAAAGAAACGATAATACTATTTTTCATTTTAATCTTAACTACACCAAATATATCAT AATATTAATTTAATCTAATTCTATTAAATCCACTTTAATTCAATCTAATATCTTAAAAAT AGTCCAATAGAATCTCCGGCATGCCGTGAAATATAAAAGGCTGCATCACGTTATGTACAA TTGTGAAAACATGTGAAAATCTATTTTCATCCAACATAATATGAGATCAAAATTTCGGCT TATGAAAAAATATAGATTCAAAAGGTGGAAGGAGAACACATGATGGGGATCAATTAGAAG AGATGGAGGAGACAAATATCCAGTAAATTAAGCGATAATAGTGTCTGATTCCATGTAGTT TTCAGGATGTCATACTCACGTCCACGATCTGGCCGCCCTTTTGAGGACCACATCATTTTC ATTTCATGCTGTTTTAAACTTAATTTTTTAATAGAAGAAAAAAGCCCCCCACGTTCTCTC GGTTGCCAGGTGTATTCCTCTTCAGCAAATCTCATGTTTCAATTTCCTTACCGTGACAAT TTTGATTATTAATTAACTAATCTCAGTTTTGAGTCACATAATTTTCAGTTGTCTCTGAAT TTTTAATCATTCTTTTTTTAATTAATTCTGTTAAGTCCAAGACGTTTTAGGCCACTTCAA AGGTTGCATTATTATAATCTATCATTGCGTGAACTTGGTCTCGTCTGAGTTGTACTTGGC CCCATTACGGAATTCTGAAAATCTGTTACAGGGAATTGGGACTTTTTGCATACTAATAAT TGATTAGTTTCTAATGAGATAATGTTACACAAGTGCAAGTCAGTGCTTTTGCTGACATTC TTCTTAGCTGTTGGGTGTATATATGTCTCTAATTTTCCTGGTTCACATTCAAGCATCGAC ACGAATTCAAGCTTCTTCCAACACTTGAAAACTTTTCAAATACTAGAGATATCCTTTTTC ACGTAGGAACCCAAAAAACA
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>LITCHI025424.m1 GenomeSequence + GTGGAATCATTTGTCCACGAATGCATGAAACTATCCATGCAATATAGCCATTCTCAACCC CTCATTATTCAAAGAAATATATTCACAATATTGACCCTCCACATTTTACTACATTGTACA TATATATATATGTGTGTATATGTATATATATTCAATTGAGGCCATGAAGAGAGAGAAACA AGATACAGTGAGAGAATAAAAAAGAAAAAATCTCATGCCTTACAACTGCATGTTCACTCC TTGCACGTTCCTCTGCCCCCCGGCCCTCTCCCATCAACATATCAATCCCCACCTTAATCA TCATCACTCGATCTCACACAACCGTCACTTGTGAGAGAGCTCTGAGACTGAGAGTGAGAG ACCACTCTCTCTGGTCTCTAGCTACCTGTTTTGTTTTATTATCAACCACCACCGCCAACA GCTAGCACACACACAACATAAGAACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATCTACTCTCTT TGTTGCGGAGAGCGCGGACTTGGAAACCAAAATTTTAAAAACAACCGAAATGGACATGTT TCGCATTGACGACCTTCTTGATTTCTCTAACGACGAAATCTTCACTTCTTCTTCGACCAC CACCGCCGCCGCTACAGCCGCCGCCGCCTCTGCTAAGAGCACCACCACCACCGACACACA CCAGCTATTTCCCCAACATCAAAACCTCCCTACTCTTTATTCTTTGAATTCCTCTCCCAT CTCCACTGACTTCACCGACGATCTCTGCGTTCCCGTGAGTTTATTTTCTATTTTTGTTTA TTTTTGATTAAATTTAATGTTGAAACTTCTCTCTTTTTCTTCTTTTTTACTTTTTTACTT TTTTTTTTTAATCTGCGTAGAGTGATGACGTGGCGGAGCTGGAATGGCTGTCGCGCTTCG 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