Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001458Chr52748522227497149-Agamous-like MADS-box protein AGL62

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001458.m11562PF00319.21SRF-TFDomain71.82.60E-20
LITCHI001458.m1233279PF00319.21SRF-TFDomain82.41.20E-23
Download   Copy
>LITCHI001458.m1
ATGACTAGGAAGAGCAAGGGTAGGCAAAGGTTGGAGATAGTGAGAATGTCAAATGAGAGA
TATCTCCAAGCGACCTTTGCCAAACGTCGATTTGGTATCTTTAAGAAGGCTAGTGAACTT
TGCACGCTCTGTGGCGTTGAGATGGCAATTGTAGTGTTCTCTCCTGGTAGAAAGGTCTTT
TCTTTTGGCCACCCATGTGTTGAATCTGTGCTGAATCGTTTCATCACTCAAATTCCTCAA
CAAACCTTAGGTACCTTGCAATTTATTGAAGCTCATCGTAATGTTAGCATTTGTGAGCTT
AATATGCAACTCACTCAGAAGCGAGGGGAGGATCTGACCCAAATGAAAAGATCCTCCCAG
AGCCATCGTTGGTGGGCAGCTCCAATTGATGAGCTCAACCCATCCCAACTTGCGAACTTG
AAAATTTGTTTAGAAGATCTTAAGCAACAAGTCACTCAGCAAGCTAATGAGGTTATGACC
CAGTCCACTGCTCCTCTTCAATGTTTTCCTGGGAATTCAAGCACTGGAGAAATCCTTCAG
TTTGATCCAACGAATATTGACTCCAACCTCTCCAATAAGAACACGATGCTACCTCCTTCT
CTTCCACCTTTGATCCAATCTTTTGATAATCCTCAGGATTTTTCAAGGATCATGGCAAGG
AAGAGCAAGGGTAGGCAAAAGTTGGAGATGGTGAAAATGGCTAATGAGAGTAGTCTCCAA
GTGACTTTTTCCAAACGTCGATCTGGTCTTTTCAAGAAAGCCAGTGAACTGTGCACGCTT
TGTGGTGTTGAGTTAGCAATCATAGTGTTTTCTCCTGGTAAAAAGGTTTATTCTTTTGGC
CACCCATGTGTTGAATCTGTGATGGATCGTTTCATCACTGGAATCCCTCCACAAACATCA
GACACGATGCAATTGATAGATGCTCATCGTAATGCTTACATTTGTGAGCTTAATATGGAA
CTCACTCTGGCGCTGAATGAGCTAGAAATTGAAAACAAGCGAGGAGAGCAGCTGAACCAG
ATAACAAAAGATTCTCAGAGCCAGCATTGGTGGGAGGCACCAGTTAATGAACTCAGCCCA
ACCCAACTTGCTAACTTGAAAGTGTATCTAGAACAGCTGAAAATAAAAGTCACTCAGCAG
GTTGAGAAAGTCATGATCCAGTCTTCTGCTCCTCAATATTTTCATGGGAGTTCAAGCACT
GAAGGGATCCTTCAGTTTGATCTGACAAATACTGGCTTTAACCTCGCCAACAACAACATG
ATGCCTCCTCCTCCTCCTTCATCTATGATGCAATCGTCTACTCATCCTCAAGAATTTCCA
GGATGTTCAAGCGCTGGAGGGATCGTTCAATCTGATCCAGACAATCTCGGCTTCAACCCC
CGCAACATGAATATGATGCCTCCTCCTCATATGATCCAGTCTTCTGCTCCTCCTCAGTAT
TTTGCTAGGAGTTCAAGCAATGGAGGAATCCTTCTGTTGGACCCAAACAATACCAACTTC
ACCCCTTCCAACATGAACATGATGCATACTCCTCCTTCTCACAATCAACCTCAACAACCT
TTTCAACCTCGTCATTTTCCTTCTCCTCCTCAGCAATCTCATCCTGAGTTCACTCCTGGA
Download   Copy
>LITCHI002258.m1
MTRKKVKLAYITNDSARKATFKKRQKGLMKKVSELSTLCGIDACAIVYSPYDSMPEVWPS
QMGVQRVLSKFKSMPEMEQSKKMANQDSFLRQRIVKANEQLKKQRKDNREKEMTQVMFQC
LTGRDMQNFSIMDLNDMGWLIEQYLKDIEKKIETHNQMATGGASSSATTLLPTALPPALD
LGGMRNVYSSQVADHHQQQWFMEWMNPQDQQQQMGFGGEDMVIPFADTNQNPLWSGSFFP
.
Download   Copy
>LITCHI002258.m1
ATTTATTTTATGTATTTTCTCAATAGTTTACGAATAAAGAATATTGTTAAAAATATATAT
ATGTTCTTATAATTTGGCTCTAGTTTCAAAACTCACACTATTTTCAATTCTATTTAGTAT
CACTAATTCCTTCTAAGAAGAGTGAAGCGGGCGTGCCCGAATAATTAAATTACGTACCCA
TATTATGTAACAACAAAAACACATATTCCTAGTAAGAATTGTAGAGACACGTAATCATTA
TTATTATATGAGGTATCTCGTATATCCCTTTATAGCATAATTTTGCACTGCCTAGGGCAA
TAAAAGCTAGCACATAGAGAAACAAGTTCCATATTCCTTTTTGTTTTCTCTCCTTTCCAT
TGGATTTTATTTTCTCTCTTTGTAGCCATGACCAGGAAGAAGGTGAAGTTGGCGTATATC
ACCAATGATTCTGCAAGGAAGGCAACCTTCAAGAAAAGGCAGAAGGGTCTAATGAAGAAG
GTGAGTGAACTTAGCACCCTTTGTGGTATTGACGCTTGTGCTATTGTTTACAGCCCCTAT
GATTCTATGCCTGAGGTCTGGCCTTCTCAAATGGGGGTCCAGAGGGTGCTGTCCAAATTC
AAAAGCATGCCTGAAATGGAGCAAAGCAAAAAAATGGCGAATCAAGATAGCTTTCTTAGA
CAGAGGATTGTCAAGGCCAATGAACAGCTGAAGAAACAAAGGAAGGACAACCGTGAAAAG
GAGATGACTCAAGTCATGTTCCAATGCTTGACTGGGAGAGACATGCAGAATTTCAGCATC
ATGGACTTGAACGATATGGGGTGGCTGATCGAGCAGTACCTAAAGGATATTGAAAAGAAA
ATTGAAACACACAACCAAATGGCTACGGGCGGAGCATCATCGTCAGCAACAACACTACTG
CCAACAGCCCTTCCACCAGCACTAGATCTCGGTGGAATGAGGAATGTTTACAGCTCTCAG
GTAGCAGACCACCACCAACAACAATGGTTTATGGAGTGGATGAACCCACAAGACCAACAG
CAGCAAATGGGGTTTGGTGGGGAGGACATGGTGATTCCATTTGCAGATACCAACCAGAAT
CCACTCTGGTCTGGTAGCTTTTTCCCCTGAATGACA
Download   Copy
>LITCHI002258.m1 +  Up_Stream_Len 2000
AATAGGATATACAGTTAGGTGAAGCAATCGTAAAATATATCTGTTTAATAAACTAGCAAA
ATTTGTAAATAGATCAACCCCTTTTTCTATATGGTTTTCAGTGTTAAAATTGATTATGTT
AATTCTCTTTTTTCTTTATATTTTAATCTGATTACTAGATCATGATAGTGAATTTTGTTG
ATTAATTGAGTCTTGTTGTTTGATATTGATTTGAATTTTTGATTCTTAATCTATATTTGG
ATTTAATTCTTAATATTGACCTAAACCTTGATAACTAACCAATCTTGAATTGTGATTTTT
TTTTTTTTTGAATTTCTGAAAATCAATTTGATTTTTTTTTATACATCTATTCATCCCATT
TTGTTTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTTTTAAATTGTAAGTTAACTATTGTTGTTATAAAA
TATATTAATTCAAGCGTTTAAGTAAAAAATTCATATCGTATCAATTCACTTAAATATCCT
CGTAATTTTGAATTGTACCGAATAATCGAAATGAACTAGTTATTTAAAGTGCATAATTGT
TTTTTCTTCGAATCTTCCAGCAATCAAGAGATAGGAGCATAAATCTGTTTTTGATATGAC
ATGAAAGATTAATGAAAGATACAATAGATCAATATTATTCTTAGTAGTCATTAAATTGCT
TTCATGAAATTGAATGCAATTTGATACAAGGATACAATAGATCAATATTATTCTTACAGA
CAACTAATAGTCATTAAATTGCATTCATGCAATTGAATTCAATTTGATACTTGGATATCA
TTTAACGATGGCCCCAATAAAAACCACTGTGATTGGTGCTAGAATTGTGATGTGGAAAGT
GATTAGTTTGCTCGAATGCAAAGGCGGAGGGGTTGGTAGGAAAATACTACAAAATTTTCA
TCAAAAAATTGTAAACGAGTTTTTAAATTTTAAAAGTTTTACACTTTGACCCTTGTAATT
TTTTCTTTTAATATAATGACATGAAATATAATTTTTTTGGCTTTGCCCTCCTCAAATGTC
ATGATATATTATATGTTATAATGCTAGGTGTTCTTTGTTTGATATAAGAATTGACATTAA
AATTGGGCACACAAATCTTAATTTTCTTAACAGCAAGGGCATTAACATCTAAAAGAGCAA
TAGATAAGCAGATTATACAATCAATTATTATGATTTAAACTTGGATACTGTCATTATTAA
TTGATGATTTATATTATCTTAACAAATTATTTAAATTTTGTACCAACTCACCAAATTTAA
TTTTCTCCGTCATATTACCAATTTTTACTACTACCTCAGATTTTTTCATATCCAAAATTT
ATAACCTTAATTGTCATATTTGGTGCCTTGACATGAGCACCCCATTCTTAATTGCTAGGA
ATGAATCTAGATTATGATGCTATTGTAGTTTGTTGGACAAATTCTAGAAGATTGTAGATA
GGACTTTTTGAAATTTCTTGAAATAATTTGCATGGAAGAATTTTTTTTTATTAATTTAGA
AACTAATTGAATTCAAATGTAATTCCATTATATCTCGACTGATCAATAAATGACATGCAT
ATTCGATTTGATTCAATATGATACAACGAGCAAAATCTAAAAGAATTATAGGAATTTATT
TTATGTATTTTCTCAATAGTTTACGAATAAAGAATATTGTTAAAAATATATATATGTTCT
TATAATTTGGCTCTAGTTTCAAAACTCACACTATTTTCAATTCTATTTAGTATCACTAAT
TCCTTCTAAGAAGAGTGAAGCGGGCGTGCCCGAATAATTAAATTACGTACCCATATTATG
TAACAACAAAAACACATATTCCTAGTAAGAATTGTAGAGACACGTAATCATTATTATTAT
ATGAGGTATCTCGTATATCCCTTTATAGCATAATTTTGCACTGCCTAGGGCAATAAAAGC
TAGCACATAGAGAAACAAGTTCCATATTCCTTTTTGTTTTCTCTCCTTTCCATTGGATTT
TATTTTCTCTCTTTGTAGCC
Download   Copy
>LITCHI002258.m1 GenomeSequence + 
ATTTATTTTATGTATTTTCTCAATAGTTTACGAATAAAGAATATTGTTAAAAATATATAT
ATGTTCTTATAATTTGGCTCTAGTTTCAAAACTCACACTATTTTCAATTCTATTTAGTAT
CACTAATTCCTTCTAAGAAGAGTGAAGCGGGCGTGCCCGAATAATTAAATTACGTACCCA
TATTATGTAACAACAAAAACACATATTCCTAGTAAGAATTGTAGAGACACGTAATCATTA
TTATTATATGAGGTATCTCGTATATCCCTTTATAGCATAATTTTGCACTGCCTAGGGCAA
TAAAAGCTAGCACATAGAGAAACAAGTTCCATATTCCTTTTTGTTTTCTCTCCTTTCCAT
TGGATTTTATTTTCTCTCTTTGTAGCCATGACCAGGAAGAAGGTGAAGTTGGCGTATATC
ACCAATGATTCTGCAAGGAAGGCAACCTTCAAGAAAAGGCAGAAGGGTCTAATGAAGAAG
GTGAGTGAACTTAGCACCCTTTGTGGTATTGACGCTTGTGCTATTGTTTACAGCCCCTAT
GATTCTATGCCTGAGGTCTGGCCTTCTCAAATGGGGGTCCAGAGGGTGCTGTCCAAATTC
AAAAGCATGCCTGAAATGGAGCAAAGCAAAAAAATGGCGAATCAAGATAGCTTTCTTAGA
CAGAGGATTGTCAAGGCCAATGAACAGCTGAAGAAACAAAGGAAGGACAACCGTGAAAAG
GAGATGACTCAAGTCATGTTCCAATGCTTGACTGGGAGAGACATGCAGAATTTCAGCATC
ATGGACTTGAACGATATGGGGTGGCTGATCGAGCAGTACCTAAAGGATATTGAAAAGAAA
ATTGAAACACACAACCAAATGGCTACGGGCGGAGCATCATCGTCAGCAACAACACTACTG
CCAACAGCCCTTCCACCAGCACTAGATCTCGGTGGAATGAGGAATGTTTACAGCTCTCAG
GTAGCAGACCACCACCAACAACAATGGTTTATGGAGTGGATGAACCCACAAGACCAACAG
CAGCAAATGGGGTTTGGTGGGGAGGACATGGTGATTCCATTTGCAGATACCAACCAGAAT
CCACTCTGGTCTGGTAGCTTTTTCCCCTGAATGACA