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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001440Chr52733328327340216-LIM domain-containing protein WLIM1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001440.m11165PF00412.25LIMDomain40.13.50E-10
LITCHI001440.m1109164PF00412.25LIMDomain47.81.30E-12
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>LITCHI001440.m1
ATGGCCACATTTGGAGGAACACAACAAAAATGCATGGCATGTGATAAAACTGTGTACCTT
GTTGATAAGTTGACAGCCGATAACCGAATCTACCACAAGGCCTGTTTCCGATGCCACCAT
TGCAGGGGTACTCTCAAGCTGAGCAATTACAATTCTTTTGAGGGGGTTCTGTACTGCAGG
CCTCACTATGATCAACTCTTCAAGAGAACTGGTAGTCTCGACAAGAGTTTTGAAGGAACA
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AAGGTTTCCGTAAATGGAGCTGCATATCACAGGAGCTGCTTCAAATGCACCCATGGAGGC
TGTACAATCAGTCCATCAAACTACATTGCGCATGAGGGAAAGCTCTACTGCAAGCACCAC
CACATCCAACTCTTCAAGGAGAAAGGAAACTACAGCCAGCTTGAGGATCATGAGAAGAGC
CACATGCCTTCTATGGAAATTGCCACTGAATCATAA
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>LITCHI001440.m1
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PHYDQLFKRTGSLDKSFEGTPKIVKPEKQTDNENAQKVSNLFVGTRDKCVGCNKTVYPIE
KVSVNGAAYHRSCFKCTHGGCTISPSNYIAHEGKLYCKHHHIQLFKEKGNYSQLEDHEKS
HMPSMEIATES.
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>LITCHI002570.m1
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TATGCAAGTTACCAATGCTGTCTTTAGGTATAAAATATAATTCATAAGATCCCCCATCCA
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TGAAAACTCATAATACCGCAAAAAGCGACCATCCTGAGCAATGGTTTTTCTTCACTGAAA
GACAAGAGAGGGAAGCTCATGGTGGGAGACCTAGCCAGACTACCCCTTCCGGTTACTGGA
AGGCCACGGGCTCTCCTAATTATGTTTACTCTTCCGATAACCGAGTTATTGCAGTGAAGA
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GGCACGAATTCAGTTTGTGCAGAGTCTATGTGACATCAGGAAGCTTGCTGGCGTTTGGTA
GACGCCGATTAGAAGCTGTGACACAAGAGACACAGCCTTTAGCTGATGGTGCAGCATCTT
CTTCTCATAACGCCATAATGGCACAAATTATGTAGCTCTCGGAGGAAAGTTTGAACTCTC
GTGAGCTTATAAGTTACATCCTGGACACGGATGGGGGATCTTATGAATTATATTGCTAAT
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CTCTCCGTTTGCTTCTTCTCATAAAACCACACCTGGTGAGCATTTTATTTCTAAGCTCTC
TTGATCAGTTATTCTCCGACATTTATCTAATTTTATGTTGTTTGCTTTTTTTTTTTTCGA
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TAAGTGACTGATCTTTATGTGTGTTTATTCATTTAGGGCACATACTGAAGAGTGTGCACC
ATCAAATGATTGTCAGGAGCTTGGGATAAGAACGGTTGTCAGTTGTATATTGCTGTGATC
AACTTGCAGGCATTTCATTC
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TTTTGCTTAAATTACATAAAGCTTGAAATTGTTTAGACATGTGAGATTTTAATTGAATCC
CATCACATGATTAATTAAGTTTATGCCTTTTTCAGATAGACATGTCTCTAACCTTCAGGA
ACCGAGTTTTCTGTAATTACCAAAGAACACGCAAGGCTTTAAGTTTCTTGCAAAATACAG
GATGTGAGAAATCTCAAGGTCATAAATAAGCTTCAAAATCGGTATGTTATTAAAAGATGA
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GGTTGTGAGAAAATGAAAAATGAAAGTGGGGAAAAAAAGAGAATGGAAAAAAAAAAAAAA
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TTAAAAATAAAAAGATAAGAGAGGTATTGAATTGGAGAGACGAGTTGAAGAGGTTGGGTC
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CACGTGTAAAAGAGAGAGAGCGAGTAGAGGAGGTATGATAATTTTGAGAAGTAGGAGTGG
GTTTGGTCACAATAAAAACGAGGCCTTGGAAGCAAGCGAAGACTGCTCACTTTCTCCTTC
TTCTTTGGTCGTCTTCAGCTTCAGTCTTTAGTTTTATTTTATATTTTGGTTCTTCTTATT
CTCTCCGTTTGCTTCTTCTCATAAAACCACACCTGGTGAGCATTTTATTTCTAAGCTCTC
TTGATCAGTTATTCTCCGACATTTATCTAATTTTATGTTGTTTGCTTTTTTTTTTTTCGA
ATTGCATTTGATGTAATATATGGATCAGCTGTTTTTCGGATTCTTTCGTGGTTTGGTGTT
ATTTTAAGTGCTTGTTTTTGTTTATAGAGTTGTTCGATGATCTGATCTATGTATGATTTT
TGTTGTAAATCTAAATACACCGCAAAATCATTTGGTAAAGGTATGGATTTTGGAGATACT
TTAAAATTGATTTTTTGTTATGTATTTCGTTTCAGATATTTTAGGTCCTTTTTTGTGGTA
TTTACATGACCTGTGAAATTGTAATTTTGAAACTTTTAGTTTCATGTTGTTTAGTCAAGC
TTGGTGTTCTCTTGTACTGTCTCCGATGTTGAATGGGTCAGATGGGTTTTATGTAAAATC
GTGTGCGTTATTAAGTTGTTATTGTTGTTTCTTGGTTGCAGGATAAAGCTGGTGAAGGAA
CTGTGGCTTGAAGTTGATGTAAAGTGTGTAGGATCGGGATAATTGCATTCTTGTGCTTTT
CTGGCTTGGAAAGGTATTCAATTTGAGAAAAAAGTTTATTACTTTGCTTTATTTGTTTGC
TTTCTTTGTTTGGGTGCTGAGAAATCTCAGGAAAAGGAAACAGATTGATGGTCATTAATA
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CTTCTCCTTCATTTTGCATTGATAAACACCCCGGTCATGAATGCATCAATATGTTGTGAA
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CATTTGAGAAGAAGGGTTTGATGAAAATGATTTTAGCTGAATATAGTACGTGCATGATTA
TAAGTGACTGATCTTTATGTGTGTTTATTCATTTAGGGCACATACTGAAGAGTGTGCACC
ATCAAATGATTGTCAGGAGCTTGGGATAAGAACGGTTGTCAGTTGTATATTGCTGTGATC
AACTTGCAGGCATTTCATTC
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CAACATCAGGAGCCCATTTTCTCAAACGTTACGTCATCACATGTCATTTAGAAAATGATT
TTTTGCTTAAATTACATAAAGCTTGAAATTGTTTAGACATGTGAGATTTTAATTGAATCC
CATCACATGATTAATTAAGTTTATGCCTTTTTCAGATAGACATGTCTCTAACCTTCAGGA
ACCGAGTTTTCTGTAATTACCAAAGAACACGCAAGGCTTTAAGTTTCTTGCAAAATACAG
GATGTGAGAAATCTCAAGGTCATAAATAAGCTTCAAAATCGGTATGTTATTAAAAGATGA
AATAAATTTAAAAATCTTTTTAGATATAAAAATTTGGATAGAAAATTATTTAAAATTCAG
GGTTGTGAGAAAATGAAAAATGAAAGTGGGGAAAAAAAGAGAATGGAAAAAAAAAAAAAA
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TTAAAAATAAAAAGATAAGAGAGGTATTGAATTGGAGAGACGAGTTGAAGAGGTTGGGTC
TACACACGCGATATGAGAGGGCAAGAGACCTCGAAAAAGAAAATAACAGAGGTTAGACGA
CACGTGTAAAAGAGAGAGAGCGAGTAGAGGAGGTATGATAATTTTGAGAAGTAGGAGTGG
GTTTGGTCACAATAAAAACGAGGCCTTGGAAGCAAGCGAAGACTGCTCACTTTCTCCTTC
TTCTTTGGTCGTCTTCAGCTTCAGTCTTTAGTTTTATTTTATATTTTGGTTCTTCTTATT
CTCTCCGTTTGCTTCTTCTCATAAAACCACACCTGGTGAGCATTTTATTTCTAAGCTCTC
TTGATCAGTTATTCTCCGACATTTATCTAATTTTATGTTGTTTGCTTTTTTTTTTTTCGA
ATTGCATTTGATGTAATATATGGATCAGCTGTTTTTCGGATTCTTTCGTGGTTTGGTGTT
ATTTTAAGTGCTTGTTTTTGTTTATAGAGTTGTTCGATGATCTGATCTATGTATGATTTT
TGTTGTAAATCTAAATACACCGCAAAATCATTTGGTAAAGGTATGGATTTTGGAGATACT
TTAAAATTGATTTTTTGTTATGTATTTCGTTTCAGATATTTTAGGTCCTTTTTTGTGGTA
TTTACATGACCTGTGAAATTGTAATTTTGAAACTTTTAGTTTCATGTTGTTTAGTCAAGC
TTGGTGTTCTCTTGTACTGTCTCCGATGTTGAATGGGTCAGATGGGTTTTATGTAAAATC
GTGTGCGTTATTAAGTTGTTATTGTTGTTTCTTGGTTGCAGGATAAAGCTGGTGAAGGAA
CTGTGGCTTGAAGTTGATGTAAAGTGTGTAGGATCGGGATAATTGCATTCTTGTGCTTTT
CTGGCTTGGAAAGGTATTCAATTTGAGAAAAAAGTTTATTACTTTGCTTTATTTGTTTGC
TTTCTTTGTTTGGGTGCTGAGAAATCTCAGGAAAAGGAAACAGATTGATGGTCATTAATA
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TCTTTGATAGGAATTTGCATGAAATTTACCGAATTTTTTTTTTTTTTATTGAGAATGCAA
CTTCTCCTTCATTTTGCATTGATAAACACCCCGGTCATGAATGCATCAATATGTTGTGAA
AGCAACCAAATGTTGTTTGCTCTTTTTATGTTTTAGGGCGTCTCTAAAACATCAAGGACT
CATTTGAGAAGAAGGGTTTGATGAAAATGATTTTAGCTGAATATAGTACGTGCATGATTA
TAAGTGACTGATCTTTATGTGTGTTTATTCATTTAGGGCACATACTGAAGAGTGTGCACC
ATCAAATGATTGTCAGGAGCTTGGGATAAGAACGGTTGTCAGTTGTATATTGCTGTGATC
AACTTGCAGGCATTTCATTC
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CATCACATGATTAATTAAGTTTATGCCTTTTTCAGATAGACATGTCTCTAACCTTCAGGA
ACCGAGTTTTCTGTAATTACCAAAGAACACGCAAGGCTTTAAGTTTCTTGCAAAATACAG
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TTCTTTGGTCGTCTTCAGCTTCAGTCTTTAGTTTTATTTTATATTTTGGTTCTTCTTATT
CTCTCCGTTTGCTTCTTCTCATAAAACCACACCTGGTGAGCATTTTATTTCTAAGCTCTC
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GTGTGCGTTATTAAGTTGTTATTGTTGTTTCTTGGTTGCAGGATAAAGCTGGTGAAGGAA
CTGTGGCTTGAAGTTGATGTAAAGTGTGTAGGATCGGGATAATTGCATTCTTGTGCTTTT
CTGGCTTGGAAAGGTATTCAATTTGAGAAAAAAGTTTATTACTTTGCTTTATTTGTTTGC
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TCTTTGATAGGAATTTGCATGAAATTTACCGAATTTTTTTTTTTTTTATTGAGAATGCAA
CTTCTCCTTCATTTTGCATTGATAAACACCCCGGTCATGAATGCATCAATATGTTGTGAA
AGCAACCAAATGTTGTTTGCTCTTTTTATGTTTTAGGGCGTCTCTAAAACATCAAGGACT
CATTTGAGAAGAAGGGTTTGATGAAAATGATTTTAGCTGAATATAGTACGTGCATGATTA
TAAGTGACTGATCTTTATGTGTGTTTATTCATTTAGGGCACATACTGAAGAGTGTGCACC
ATCAAATGATTGTCAGGAGCTTGGGATAAGAACGGTTGTCAGTTGTATATTGCTGTGATC
AACTTGCAGGCATTTCATTC
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>LITCHI017386.m1 GenomeSequence + 
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TTTGCCAAATTTTAAAATGGCTATGCATTACGTCTATAAGAATTACAGGTCATCCCAGAG
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AGAACAGAAAAGCAACCTTTTTCCAAATGGGAAGGAGTCCATGTTGCGCCAAGGAGGGAC
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ATGGTGATGGAAAATGGAGAAGCTTGCCCAAAGCCGCAGGTACGATACTAATTACTAAAG
GATGCAGGTTAGTTTATTGTGTTTGTCTAGTGTTAGCTAGCTTTTTAGAGACATCAAGTT
GAAAGAAAAGGCAGCTTCATATATGTTAGACAGAGCTAGACGGGAAAAATAATGATTTCA
AAGCGTGGATTAATATTTGTAGATTTTTAATTAATTTGCAGGTCTTAAGAGATGTGGGAA
GAGTTGTAGGCTGCGCTGGTTGAATTATTTGAGACCTGGTATCAAGAGAGGCAATCTTAC
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TGTTCTCATAATCTCATTTTATTTCCCATCTTATTTGGTGGTAACTTGAATAAGTGAATG
ATTAGTTGACTTTGAGACCTAATGTGTGTTAACAGGTGGTCTCTTATAGCCGGAAGGCTT
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GAGGCCCCGACCAAAGTTCATAGGACAAGAGCTACACGTTTGGTGACCCACCAGGTTCAG
GGTCTTCATCAGTTGGTCAACACAGAAAAAATTAAAAATCCTAAAAATGACAACGTACTG
GAGACCCCATCATCCACGGATGCCGACTTGGAGCCAGTGGAATCCGAGTCCACTGGCCAG
ACATCGTTTTCCTTCCGGTCCAAAGAAGAAAATTCTTCAGAGTATATGATGATGGGTCAA
TTCAACGTTGGAGACACAGACCTCTCAGGAATCCTTGACTTCGATGATTTTTGTGATGTG
AATAATGTGATTAAAGGAGATACAATTCCTGATGAGAGCAACACCGAATTATTGCCTCCA
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GATGGTTTTATTCAAGCTAACATGGATTCGAATTTCGGATCTTTCGCTTCTTTTCTTGAA
GCGGGAGATGACTGGATGATTTAATTGTTATTAGTTATTACCATTGCTTCTTCTATTCAA
AGGCTAATTAAGTCTTTGCCAGAGTTTGTTACGCTATTTAACTTGTAATTTAATCACATA
TGTGCATCCAGCTGCTAGGTTTTTATGATTTAGTACGTGTGGTTGTAGCAGCCTCGGGTC
ATAATTTATTTTTTTTTTTTAAAAAAAAGGGTATTACTTGCCCACGTTTTAAATTAGTGA
ATATCTGGTGATATAATTTGCGTTCTGTGTTTTTTTCCCCTTTTGGGCCTTATATTGGTA
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ATACTTTCTTTCACATTTATGATGGAAAGTTTGACTTTCACCATGGGGAATTACGACTAT
AAGAAAATAGGACTAGTGACGAAACTTGTAGCGAC
>LITCHI017386.m2 GenomeSequence + 
CTTGTTAATTAATGACACATATGTAAGCAATTTTATCTAAAATCAGTGTAGTTGGTGAAA
TTTGCCAAATTTTAAAATGGCTATGCATTACGTCTATAAGAATTACAGGTCATCCCAGAG
AGCAGGAACAACGGGGCAAACATTCTCTCTCACTCTAGTTACTTGAAAAGGAGAGGGACA
AGAACAGAAAAGCAACCTTTTTCCAAATGGGAAGGAGTCCATGTTGCGCCAAGGAGGGAC
TGAATAGAGGAGCTTGGACTGCCACCGAAGACAAAATCCTCACCGAGTACATCAAGATTC
ATGGTGATGGAAAATGGAGAAGCTTGCCCAAAGCCGCAGGTACGATACTAATTACTAAAG
GATGCAGGTTAGTTTATTGTGTTTGTCTAGTGTTAGCTAGCTTTTTAGAGACATCAAGTT
GAAAGAAAAGGCAGCTTCATATATGTTAGACAGAGCTAGACGGGAAAAATAATGATTTCA
AAGCGTGGATTAATATTTGTAGATTTTTAATTAATTTGCAGGTCTTAAGAGATGTGGGAA
GAGTTGTAGGCTGCGCTGGTTGAATTATTTGAGACCTGGTATCAAGAGAGGCAATCTTAC
TCAAGATGAAGAAGATCTCATCATAAGACTCCACCGCCTGCTTGGCAACAGGTCCTTCTA
TGTTCTCATAATCTCATTTTATTTCCCATCTTATTTGGTGGTAACTTGAATAAGTGAATG
ATTAGTTGACTTTGAGACCTAATGTGTGTTAACAGGTGGTCTCTTATAGCCGGAAGGCTT
CCAGGGCGAACAGACAATGAAATCAAGAACTATTGGAACACCAAATTGTCTAAGAAGGCA
CAAGCAGAGCAATCAAAGCCTTCCAAATTGGACAAGAAATCAATAACCAGACCATGTAAT
GAGGCCCCGACCAAAGTTCATAGGACAAGAGCTACACGTTTGGTGACCCACCAGGTTCAG
GGTCTTCATCAGTTGGTCAACACAGAAAAAATTAAAAATCCTAAAAATGACAACGTACTG
GAGACCCCATCATCCACGGATGCCGACTTGGAGCCAGTGGAATCCGAGTCCACTGGCCAG
ACATCGTTTTCCTTCCGGTCCAAAGAAGAAAATTCTTCAGAGTATATGATGATGGGTCAA
TTCAACGTTGGAGACACAGACCTCTCAGGAATCCTTGACTTCGATGATTTTTGTGATGTG
AATAATGTGATTAAAGGAGATACAATTCCTGATGAGAGCAACACCGAATTATTGCCTCCA
TTTTCTGGTCAATCATATAACTTGTTAAATGATGAATTAATGCTGAAGAACTGGAATTGC
GATGGTTTTATTCAAGCTAACATGGATTCGAATTTCGGATCTTTCGCTTCTTTTCTTGAA
GCGGGAGATGACTGGATGATTTAATTGTTATTAGTTATTACCATTGCTTCTTCTATTCAA
AGGCTAATTAAGTCTTTGCCAGAGTTTGTTACGCTATTTAACTTGTAATTTAATCACATA
TGTGCATCCAGCTGCTAGGTTTTTATGATTTAGTACGTGTGGTTGTAGCAGCCTCGGGTC
ATAATTTATTTTTTTTTTTTAAAAAAAAGGGTATTACTTGCCCACGTTTTAAATTAGTGA
ATATCTGGTGATATAATTTGCGTTCTGTGTTTTTTTCCCCTTTTGGGCCTTATATTGGTA
TAATTTCTTTTAAATAAAATTTATTAAATCGGCACATTGTCTTTTAGTTCAGTTGTGTAC
ATACTTTCTTTCACATTTATGATGGAAAGTTTGACTTTCACCATGGGGAATTACGACTAT
AAGAAAATAGGACTAGTGACGAAACTTGTAGCGAC