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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001425 | Chr5 | 27112428 | 27119507 | + | MDIS1-interacting receptor like kinase 2 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001425.m1 | 34 | 72 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 35.3 | 1.20E-08 |
LITCHI001425.m1 | 81 | 133 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.1 | 2.80E-06 |
LITCHI001425.m1 | 268 | 289 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.3 | 2.1 |
LITCHI001425.m1 | 297 | 350 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.2 | 2.60E-06 |
LITCHI001425.m1 | 391 | 413 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.3 | 1 |
LITCHI001425.m1 | 440 | 499 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 33.8 | 2.30E-08 |
LITCHI001425.m1 | 584 | 643 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.2 | 1.80E-08 |
LITCHI001425.m1 | 606 | 621 | PF13516.9 | LRR_6 | Repeat | 9.9 | 0.95 |
LITCHI001425.m1 | 608 | 630 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 13.5 | 0.089 |
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>LITCHI001425.m1 ATGGCGAAAATTAATTTTGAGACTCTTATTATGACGGCTTTCTTAGCTCACATTTTGATC ATTTTCGCAGTTATGGCAGCAGCAACCAACATCACTACAGATCAATACACTCTTCTCGCC CTGAAAGTTCATATAACTCATGATCCTACCAATTTGCTGGCCAAAAATTGGTCCACTAGT ACTTCTGTCTGCAATTGGATTGGGGTTACTTGCAGTGGTCGACCCTATAGAGTCACAGCC TTGAATATTTCTAACTTTGGTAAACTCCACGAAAATACATTCGATCATCTTCCTAATCTG AAAATCTTTAATCTCTCTGACAACTTATTTGAGGGTGAAATACCAGCCACTTTATCAAAG TGCAAAAATTTGCAATATTTTGCCTTGTCGTTCAATTATTTCAGCGGAATCATATTGAAA GAAATCGGGAACTTGACTAAACTTAAAAAGCTATATCTTGGATTCAACCATCTCCAAGGA GAAATTCCACAGGAACTGGGCAATCTTGTACAACTGGAGATGTTATCGCTAACAAATAAT GTTTTATCAGGGCCTATTCCTTCAACTATCTTCAACCTTTCTTCTCTAACTAGTTTGGAC TTCACAAATAATAGCTTAACGGGTCACCTACCTGACATTGGTCAAAATCTCCCGGCGTTG GAAGGACTGCAAATGTCTCACAATCAATTCACCGGCGGAATCCCACACAATTTGTGGCGA TGTAGGAATCTTCAAATTGTTTCATTGTCTTTTAATCAATTTGGAGGAAGAATACCAAAT GCTATTGGGAACTTGACCATGCTAAAAGAACTATATCTTAGCTATAACAACTTAGTAGGA GAAATTCCCCAAGAACTGGGCAATCTTGCAGAACTGGAACAATCATGGCTACAAAATAAT GCTTTATCAGGGCCTATTCCTTCAACTATCTTCAACCTTTCTTCTCTAACTACTTTGTAT TTTTCAAATAATAGCTTGACGGGTCACCTGACTGACATTTGTCAAAATCTTCCAGCTTTA AAAGTACTGTCCATGCGTTACAATCAGTTAACTGGTGGAATTCCACACTTGTTGCGATGT AGGAATCTTGAAATTTATCTCAACTTGTCTCCTAATTATCTGACAGCAACTTCAGATATG AGCTTTCTTTCTTCTTTGGCAAATTGCAAAAGTCTACGAGTATTACAGTTAGGGGGAAAT CCACTAAATGGCATCCTTCCGAGTTCCATAGGAAATCTTTCAATTTCTATGGAATGGTTC GCCATGGAGGAATGCAACATTACTGGTGACATTCCAGAAGAGATTGGCAACTTACACAAA TTGATGGTGTTAAGCTTGGAGAACAATCGATTGACTGGACCTATTCCTGTTACCATCAAA AGATTGCAGGAACTTCAAGGTCTTTCTCTCCAAAATAATAAACTAGAAGGATCCATCCCA AATGATCTTTGTCATTTAAATAAGTTGGTTAATTTGTTTTTGCACGACAATAAGCTTTCT GGTTCTATACCTCTGTGCCTGGCTAATCTCACCGCTTTAAGGAATCTCTCCTTAGGCTCC AATAAGTTATGTTCGACAATACCCTCAACTTTGTGGAATCTTAAGGACATTTTGTACTTA AATTTGTCATCAAATTCTCTAAATGGACCGCTTTCATTAGACATTGGAAATTTGAAAGTT GCGATAAGTATTGATTTATCAAGCAATAACTTATCAAGTGATATCCCTAGCAGTATTGGA GGCCTACAAAATCTACAATTTCTCTCCTTGAGATATAGTAGACTACAAGGGACGATTCCT GAATCATTAGGTTACATGACTAGCTTGGAATCCTTAGACTTGTCAAGGAATAATCTCTCC GGGGCTATTCCCAAGTCATTGGAGAAACTCTTGTATCTCAAATATCTGAATTTGTCTTTT AATCGACTAGAAGGAGAAGTTCCTAGAGGAGGACGGTTTGCAAACTTCACAATTGAGTCA ATTAGGGGGAATCAAGCATTGTGTGGTTCACCTCAACTGCAAATCCCACCATGTAGGATT AATACTCATCGAAAATCAAGGACATCTTTCATCCTACGAATTGTTTTGCCTGCAATTGCT ACATTAACAATACTCGTCTTGGCTCTCATACTTATATTTTTAACAAAACAAATTATATTA ACAGAATATGGAAAAGAAGGAAAAGTATCTAGAGAATGTGATGTTTACAGTTACGGTATA ATGCTAATGGAGACATTTACAAAGAAGAAGCCAACTGAAGATATGTTTGTTGGGGAAATG AGCTTGAGGCGTTGGGTTAGTGACTCGTTATATGGTTCAGTTATGGAAGTCGTAGACAAC AATTTGCTGAGAAGAGATGAGAAAGATTGGTCCGTTAAACAACAATGTGTCTTATCTATC TTAAGTTTGGCCATAGATTGTACCACAGATTTACCGCAAAATAGAGTCAACATGAAAAAT ATTTTAAGCAGACTTATGAAAGTTAGAGAGAAGTTGATAATTGTGACCCCAACAGCAGCT TAG
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>LITCHI001425.m1 ATGGCGAAAATTAATTTTGAGACTCTTATTATGACGGCTTTCTTAGCTCACATTTTGATC ATTTTCGCAGTTATGGCAGCAGCAACCAACATCACTACAGATCAATACACTCTTCTCGCC CTGAAAGTTCATATAACTCATGATCCTACCAATTTGCTGGCCAAAAATTGGTCCACTAGT ACTTCTGTCTGCAATTGGATTGGGGTTACTTGCAGTGGTCGACCCTATAGAGTCACAGCC TTGAATATTTCTAACTTTGGTAAACTCCACGAAAATACATTCGATCATCTTCCTAATCTG AAAATCTTTAATCTCTCTGACAACTTATTTGAGGGTGAAATACCAGCCACTTTATCAAAG TGCAAAAATTTGCAATATTTTGCCTTGTCGTTCAATTATTTCAGCGGAATCATATTGAAA GAAATCGGGAACTTGACTAAACTTAAAAAGCTATATCTTGGATTCAACCATCTCCAAGGA GAAATTCCACAGGAACTGGGCAATCTTGTACAACTGGAGATGTTATCGCTAACAAATAAT GTTTTATCAGGGCCTATTCCTTCAACTATCTTCAACCTTTCTTCTCTAACTAGTTTGGAC TTCACAAATAATAGCTTAACGGGTCACCTACCTGACATTGGTCAAAATCTCCCGGCGTTG GAAGGACTGCAAATGTCTCACAATCAATTCACCGGCGGAATCCCACACAATTTGTGGCGA TGTAGGAATCTTCAAATTGTTTCATTGTCTTTTAATCAATTTGGAGGAAGAATACCAAAT GCTATTGGGAACTTGACCATGCTAAAAGAACTATATCTTAGCTATAACAACTTAGTAGGA GAAATTCCCCAAGAACTGGGCAATCTTGCAGAACTGGAACAATCATGGCTACAAAATAAT GCTTTATCAGGGCCTATTCCTTCAACTATCTTCAACCTTTCTTCTCTAACTACTTTGTAT TTTTCAAATAATAGCTTGACGGGTCACCTGACTGACATTTGTCAAAATCTTCCAGCTTTA AAAGTACTGTCCATGCGTTACAATCAGTTAACTGGTGGAATTCCACACTTGTTGCGATGT AGGAATCTTGAAATTTATCTCAACTTGTCTCCTAATTATCTGACAGCAACTTCAGATATG AGCTTTCTTTCTTCTTTGGCAAATTGCAAAAGTCTACGAGTATTACAGTTAGGGGGAAAT CCACTAAATGGCATCCTTCCGAGTTCCATAGGAAATCTTTCAATTTCTATGGAATGGTTC GCCATGGAGGAATGCAACATTACTGGTGACATTCCAGAAGAGATTGGCAACTTACACAAA TTGATGGTGTTAAGCTTGGAGAACAATCGATTGACTGGACCTATTCCTGTTACCATCAAA AGATTGCAGGAACTTCAAGGTCTTTCTCTCCAAAATAATAAACTAGAAGGATCCATCCCA AATGATCTTTGTCATTTAAATAAGTTGGTTAATTTGTTTTTGCACGACAATAAGCTTTCT GGTTCTATACCTCTGTGCCTGGCTAATCTCACCGCTTTAAGGAATCTCTCCTTAGGCTCC AATAAGTTATGTTCGACAATACCCTCAACTTTGTGGAATCTTAAGGACATTTTGTACTTA AATTTGTCATCAAATTCTCTAAATGGACCGCTTTCATTAGACATTGGAAATTTGAAAGTT GCGATAAGTATTGATTTATCAAGCAATAACTTATCAAGTGATATCCCTAGCAGTATTGGA GGCCTACAAAATCTACAATTTCTCTCCTTGAGATATAGTAGACTACAAGGGACGATTCCT GAATCATTAGGTTACATGACTAGCTTGGAATCCTTAGACTTGTCAAGGAATAATCTCTCC GGGGCTATTCCCAAGTCATTGGAGAAACTCTTGTATCTCAAATATCTGAATTTGTCTTTT AATCGACTAGAAGGAGAAGTTCCTAGAGGAGGACGGTTTGCAAACTTCACAATTGAGTCA ATTAGGGGGAATCAAGCATTGTGTGGTTCACCTCAACTGCAAATCCCACCATGTAGGATT AATACTCATCGAAAATCAAGGACATCTTTCATCCTACGAATTGTTTTGCCTGCAATTGCT ACATTAACAATACTCGTCTTGGCTCTCATACTTATATTTTTAACAAAACAAATTATATTA ACAGAATATGGAAAAGAAGGAAAAGTATCTAGAGAATGTGATGTTTACAGTTACGGTATA ATGCTAATGGAGACATTTACAAAGAAGAAGCCAACTGAAGATATGTTTGTTGGGGAAATG AGCTTGAGGCGTTGGGTTAGTGACTCGTTATATGGTTCAGTTATGGAAGTCGTAGACAAC AATTTGCTGAGAAGAGATGAGAAAGATTGGTCCGTTAAACAACAATGTGTCTTATCTATC TTAAGTTTGGCCATAGATTGTACCACAGATTTACCGCAAAATAGAGTCAACATGAAAAAT ATTTTAAGCAGACTTATGAAAGTTAGAGAGAAGTTGATAATTGTGACCCCAACAGCAGCT TAG
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>LITCHI001425.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAATCATCTCTCAAGGGATTAAGTAACAACAATGGACTTGCACCTTTCTTTTTTCTATTT TCTCTTCTTGTGAAGTCTGCACAAGGGATTCTTTCCATATGCTTGTCCAACTGGAACCAA CAATAAACATTCATGAAAATATGTCCAAAACTCTATATTGGAACAAATCCTTTTACATTT TTTACATCCATGACTAATGAAACACCAAACTTTCACCCAAAAAGAATCACTTGATTAAAA CTAAAATAATTCAAACAAGCTTCAATTCTTCAAGATTTTTTATCAATCAATCTCTCTCAT ATACATTAAGCATATAAAGTTAACATGAATTGCAATTATACAAACATCATTTGCTAAAAA AGAAGGGCAGCATCATACCAAATACCATCACTAAAAACAAAACAAGCAACATTCAAATCT TAATACCTACAAAGTCATGGATGAATTTCCCTGCTGTATCAATTGATCTATCTACAAGTG AGCACCACCCTCTCTTCACATCCCTCACTATCTTCAACCGAATTGATATTTCCACACCAT AACTAATTTATAGAGTGAGAGAAAATGAAATAAACTAGTGGATTGAAATAAAAGGAAAAA GAGCCAAAACAGAACTTGATGTTTTTCTTTTATCTAACCAAAGTTTAATCAAGAACAACA TAATAAATAACTTTAAAAGTTCTTTGAAAATTAATTTACCTTGATGAGTGATGAGGAACA AAGTAAATGGATAAACATAATGAATTGATGCAATGAAGCAAAGAAATGTCAATTCAGGAG CTGGAGACAAGTCATCGCCGATGGAGGTGGCGGCGACAATCAAGTGTGGTCGATCTTTGA CAACGTCAAGTTCATGAGCCTAGTGGAGGACGGAGTTGGAGGTCGTCGGTTCATTGATTT GAACTTGAGGTAGCTCTGTCATGAGGAAATTGACGGTCAAAGATTAAACTAAGTGGCAGA GAAAGATGGCTCCTGAAAGTTTCAAGAATACAACTTCATCCCATCATAGATTAGGTTCAC ACTAGATTTCAACTTTATCATAGAATAGATCAGGGTTCAGATGTTTTCAGAAAGAGAAAA ATGCTCAAATGGGATGTGAAAGACATTTTTGATTTATTGTTCATTCCATTAAGGCTAAAA TGGGAACTATGAAAAATTCATTTAAGTGAAAAACAATTTCCTATGTTTCTTAAGGAAGCT CTTTCCCATAAAGCTACCAAAGACAACTTCCACTAAAAGAGCTTCTAAGTACCAAAAGGT CTTTTTCAATTTTTACTCAAATAGCCCTTAAAATCACTTTTGGATTCAAAAAGAGCTTTT GAACCCTCCAAAAACTATGTCAAACAGGCACTTACTATATGATAGATACCATTATACAAT GACTTATTTTATTTACATCATTTTCTTATAAGTTTCTTTGAAACTTTGTTTTGATGGTTT CTTTTTAGAAATCATTATAATAATACTAAATCTTTTTTAGGATCGACTTCTTATTTATAA TTTTAAAAAAAAAAAGATTTTTTTTTTTGAAATCTAGGATTGACCCAGAGGGTTACCGAA ACTAACGTGGCACAGCCCGGGGAATAACTTTCAATTGGGAGAAATCTGCCTATACTATGA TGAGGGAGAAACTCACATGAAAGTAGGAGATCAACTCACACTGAATAGTGAAAGATAAAA GTATATTTATATTATTATACTATTATATTATTATTAATTAATTAATATGTATATTTTTGG ATTTGACGGGCTGACTGTCGAACCCACGCCAACACATGACATAGGGAACGACACCACCAG CAGCCAAATGGCTTATTCCATTTGCATCATTTATACTTTAAAAAAAAAAAAATTGATACT ATATGATAGGTACCATTATACAATAACTTATTCTATTTGCATCATTTTCTTAGCAGTTTC TTTGAAACTTTGTTTTGATTATTTATACCTTTGACCACAAACCAAACATATCTATCTCAC ACTTCAAAATACAATCTCTC
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>LITCHI001425.m1 GenomeSequence + ATGGCGAAAATTAATTTTGAGACTCTTATTATGACGGCTTTCTTAGCTCACATTTTGATC ATTTTCGCAGTTATGGCAGCAGCAACCAACATCACTACAGATCAATACACTCTTCTCGCC CTGAAAGTTCATATAACTCATGATCCTACCAATTTGCTGGCCAAAAATTGGTCCACTAGT ACTTCTGTCTGCAATTGGATTGGGGTTACTTGCAGTGGTCGACCCTATAGAGTCACAGCC TTGAATATTTCTAACTTTGGTGTTGAAGGCACCATCCCTCCTCAATTGGGAGATTTGTCT TTCCTTCAAAAGCTTGATCTTAGTTATAACCAGCTTTCGGGTACCATACCCTCCTCAATC TTCAACATATCTTCATTACAAATCCTTGATCTCAGTGATAATCAGCTCTCGGGTTTGTTT CCTTCCATCATTTCCATCATGCCTTCATTACAAGTCATTGACTTTGGTGATAATGGATTA TCAGGTAAACTCCACGAAAATACATTCGATCATCTTCCTAATCTGAAAATCTTTAATCTC TCTGACAACTTATTTGAGGGTGAAATACCAGCCACTTTATCAAAGTGCAAAAATTTGCAA TATTTTGCCTTGTCGTTCAATTATTTCAGCGGAATCATATTGAAAGAAATCGGGAACTTG ACTAAACTTAAAAAGCTATATCTTGGATTCAACCATCTCCAAGGTATGAAGCAGCCCAGA TGTATATTATGGACAAAATTGGCATTAGCTTTTTTTCTTTTTCTCTTTTTTGTTAAATGA TAAAAAAAAAAAATGTTTACACGTATTGATTTAATTAATTTTCAGGAGAAATTCCACAGG AACTGGGCAATCTTGTACAACTGGAGATGTTATCGCTAACAAATAATGTTTTATCAGGGC 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