Search Result

On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001274Chr52527093425273352-GATA transcription factor 29

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001274.m1170201PF00320.30GATADomain45.73.90E-12
Download   Copy
>LITCHI001274.m1
ATGGATTTTCAATGGATCTATCCACAAGCAAGTGATCTAAACCGTGATCAACATAACAAT
AGAAAAGACGATATTGATCTTACTCTAAAATTAGGAGTACCAAGTGGATGCAATGATCAA
AATCAAGCTCGATTGTTTGATTTTGTTCCCAATATGTCCCCACATGGTCAAGCTAATTTC
AACAACCGTGATCATCAAAATTATAAACAGGGGACAACTAATCACCATTATATGAGAAAT
AATGCACAATCAAAGGTGCATGGAATTGGTGGCCAATTTTTTGTGGGCTCTTCCTCAGCA
ACTGCTGCTCCTTTTTACTACAACCGTTTTCAACTTCAAACCAACTCCAGCTTCAATATG
AACCCTAATCGACCACCACTGCGTGCCATGAACAGATACACAATTCTCGATCACTTCCCA
ACAAGGAGGGCTAATAGAAGTGGAAGCTCAAGCTCAAGCGCTAGTGGTTTAAGAAGGCAA
TTAGGCTACCCTGATACTCGTCCAAGATGTTCTAATTACAATTGCAAAACCGAGTATACT
CCTTTGTGGCGTAATGGCCCTCTTGGCCTTAAGACCTTATGTAATGCCTGCGGCCTGAAG
TACTTTAGGATGGAGGGGAAAAAGAAGAAGGCAATTGAAGCAGCAAGCAGTAGCAGGCTT
CATGGTCAAGAGTCCAACAATCAAGTTGGCAGCATCGATTAA
Download   Copy
>LITCHI001274.m1
MDFQWIYPQASDLNRDQHNNRKDDIDLTLKLGVPSGCNDQNQARLFDFVPNMSPHGQANF
NNRDHQNYKQGTTNHHYMRNNAQSKVHGIGGQFFVGSSSATAAPFYYNRFQLQTNSSFNM
NPNRPPLRAMNRYTILDHFPTRRANRSGSSSSSASGLRRQLGYPDTRPRCSNYNCKTEYT
PLWRNGPLGLKTLCNACGLKYFRMEGKKKKAIEAASSSRLHGQESNNQVGSID.
Download   Copy
>LITCHI001274.m1
ATGGATTTTCAATGGATCTATCCACAAGCAAGTGATCTAAACCGTGATCAACATAACAAT
AGAAAAGACGATATTGATCTTACTCTAAAATTAGGAGTACCAAGTGGATGCAATGATCAA
AATCAAGCTCGATTGTTTGATTTTGTTCCCAATATGTCCCCACATGGTCAAGCTAATTTC
AACAACCGTGATCATCAAAATTATAAACAGGGGACAACTAATCACCATTATATGAGAAAT
AATGCACAATCAAAGGTGCATGGAATTGGTGGCCAATTTTTTGTGGGCTCTTCCTCAGCA
ACTGCTGCTCCTTTTTACTACAACCGTTTTCAACTTCAAACCAACTCCAGCTTCAATATG
AACCCTAATCGACCACCACTGCGTGCCATGAACAGATACACAATTCTCGATCACTTCCCA
ACAAGGAGGGCTAATAGAAGTGGAAGCTCAAGCTCAAGCGCTAGTGGTTTAAGAAGGCAA
TTAGGCTACCCTGATACTCGTCCAAGATGTTCTAATTACAATTGCAAAACCGAGTATACT
CCTTTGTGGCGTAATGGCCCTCTTGGCCTTAAGACCTTATGTAATGCCTGCGGCCTGAAG
TACTTTAGGATGGAGGGGAAAAAGAAGAAGGCAATTGAAGCAGCAAGCAGTAGCAGGCTT
CATGGTCAAGAGTCCAACAATCAAGTTGGCAGCATCGATTAA
Download   Copy
>LITCHI001274.m1 -  Up_Stream_Len 2000
CAATCACATTATAGTTCGAAAATTTTTATTTACATTTAGCACAATTAAAACAAATAGAAA
TTAATCATATGTTAATTTAAATCTTTACATGAAATTATTAAAGTTGACATTTTATAAAAT
ATTTAAAAGCGTCAATATCTATATTAGTAAACAATTTGAGTTCGTACAAATATCGTGAGA
TATAGAAGAGAATAACGACTCTCATAACTTTATAACGTATATGAGTTGTACCTACCATAA
ACTTCGCAGACCTTCCATATTGTAAAGAGCCCTTCTTTTGAAAACACGATAAATTGAGTC
CAAAGTCTTATCATTTTTATTCACATCGCACCCATCACTATCCACCTCCACCTCTTCATA
CTGCAATTAGCTATGTAAGTCTCTCCATTTTTACTTAAGTTTTCTTTACAATCATCTCCT
CCCCTACCACCATCTTTTTCCCAACATTTTTCCTCTACAATTGTATGTTTTATATGGGGT
GGTAACGGTGAGAATCAACTAGATTTGAGTAATTAGTCACTTATTTATCCTTTTACATAA
TGTCAACTTTTAATTTTTTAAGTTTTACATTTTGGTCGAAGTACTTATTATAAGGTATGA
CATCTAAAAGAAAAAAATTGGTTCATCTCTCTCTCTCTCTCTTTTCATATAATTTATGTT
TTGTATTCTTTAGAACTTTTGATTATCTTTAAAAGGGGAGAACAGTTCTTGTGCTTTCAT
GATTGGTTTAAGCTTTTATATACTTTTTCGTGCTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTCAT
TAGATCTTGGTAAACTCTTTAAAATATGTAGTATTACAATTTATATACCAAACCTAGACA
CCTTTATTGATCATCTTTTCTATTATGGTATCAAAATGAAATATACTTATATGTATGCAT
GATTGTATTTGATGTTGATTTTACATGATCTTTTTTTTTTTTTCCCTCATTCTTCATGTT
GATACATTATGAGCATAAGTGTGATTGATTTGATGATGAATTGTGTATTATAATTGATCA
TAGATCTCATCAAGTTGGATTTATGTTAGCTATCCAGTTTACAGAGTCATAAATAAAATC
TATTTGATTCTACACAAATAATATTTGGATGTGTTCTCCACTTAATATATGAAACATATA
TAAATCTCTGTAGTTGGCGGGTCAATTTTCCCTCATTCAGTATGAGGTCTCTCTCTCCCT
GCTAATTAAAGAGTATAATCTAGATGGTACGGCCCGACCTATTTTTTAGAGTCAATATCT
AGAGAGCTCGTAGTTGTAATTGTGTTTATGACACCCATATATATATATATATGTGCGTGT
ATATTATATGACATCACTTTTGCTAATGGTGATATCTGTAGTCTCCCACGTGAAAATTTT
GTCATCTACTACGTCATTTTGTTATATATATTCGTCTCTGCTTTCAATATTGGCTAACAT
TGTCATTTGGTTGCTGGCGCAGTTGGTTGGCGTCAGCAACCACCCATGCCTCCCTTTGTA
AGAGGCATGGGTTCAACATCCACCGGATCCAAATTTCTACATATAATATAATAATAGTAT
ATAATATATAATAATAATAATGATCATTAATCTCCCACCAATTGTGTGGGTTGCTCTCCC
ACCCTAGTGTAGATCTCCCCCCCACCTCCATGTAGGTGGATTCCTCCCAATTGGGAGTAG
TCCTCCGGGCCGTGCCACCGGTGTCATATCTCGGTTGGTCCCAAAAACCCCTTGGGTCTG
TCTCAGATACAGTTATTATACTAAAAAAAAATAAATATTGGCTGACATTTCTTGCATTCC
CAAACCCCACTATATACCTCTCTGTTTAATATTTTTATCATATTCAAACATAGACTTTTA
TCTTTACTAAATTGACAGTACAAAGTTTAACTCTTCCAGCCACTCTAAGTAATAATATTG
TACGTATATTGTAATTATTCTAGTATATAACAATATAATATATGGATTGTTGATCAGATA
GCACAAGTCTGCAAGTGATC
Download   Copy
>LITCHI001274.m1 GenomeSequence - 
ATGGATTTTCAATGGATCTATCCACAAGCAAGTGATCTAAACCGTGATCAACATAACAAT
AGAAAAGACGATATTGATCTTACTCTAAAATTAGGAGTACCAAGTGGATGCAATGATCAA
AATCAAGCTCGATTGTTTGATTTTGTTCCCAATATGTCCCCACATGGTCAAGCTAATTTC
AACAACCGTGATCATCAAAATTATAAACAGGTATACATATCTCTTTATATTTTTCTTTAT
AAATTATTTTGTGGTTTAAATTTTGAAATTTAAATAAGTATACTGTAATATTATTATGGG
ATACTATTATAACTTTGTATGGAATGAACACTTAGTGTGAATTAGATAATAATAGTCAAT
ACTAAAAAATTACTAAGAACTTCCAGTAGTGATTTTTTCTTAGCATTGATGGTTATACAC
AGTATTGAAGTTCAATTCTCATCAAATACATTTTAAAGTTTGTATGATTAGTTTACTTCC
ATTATTATGTAAGTATTTATTTCCCATTTATAGAGGTAGATTAAGACCTTATAAATAGTA
TTTGATATCAGCAAATCTTGATAAACCTTAGACCTATTGGTGTTATCTTTTAAGAGAACC
ACTTAGACACACACAAAAATCCTAATATAGGCTTTCTAAAGGGAGAAAAAAAAAAGATAA
TTAGCAATATATATATTTTGAAGTTGTACTTATGGGGAGTATGTATTTAGATTTTATTGG
AATTTAAAATAATTTAAAAGTTTAGATGTATTGAATCTATACGGAGTCTATAAAATTTAT
AAATTCCATCAAAATCTATCATTTAAAAAAAAAATTCATCAAACTACAATAAATTCTAAA
TTACATACACCCCCTTTAATAATAAATATTTTTTTTAATAGCAAGTGAGTTTGTACTCGT
CAATGTTGAGTTCTTTATATTTGTGAATTTTTTTGTGTGGTGCTTTTTAAGGAATGGTAC
ATATATTGATGGATAGTCTTACAATCCAAAAGATTAGTTTATTAGATTGTGGCACTCGTT
GATGCATATACTTGGCTCTTGGTTTTATATATTCAATGTGAGATTCATCATATCTTGTTG
TACATTTGGGATACTCTACCAACAAAATATACATATTTCGTATTACACTCTAGCAATAAT
AGTGAGACCAAGGATTGGATTATTGATTTATTTTTTCAATCCTCATTGTCTCTCATGATA
TTTTTTGTCTTATTTATATTAGATTTTTTTTTTTACACTTAAATTATTTAAATTAATGTA
CATAATTTTATTTTATAATTGTTATAATAACGTATAAATGTTTCTTGATTTGTACTTACA
TCTAACTTGTTAATACTACAGGGGACAACTAATCACCATTATATGAGAAATAATGCACAA
TCAAAGGTGCATGGAATTGGTGGCCAATTTTTTGTGGGCTCTTCCTCAGCAACTGCTGCT
CCTTTTTACTACAACCGTTTTCAACTTCAAACCAACTCCAGCTTCAATATGAACCCTAAT
CGACCACCACTGCGTGCCATGAACAGATACACAATTCTCGATCACTTCCCAACAAGGAGG
GCTAATAGAAGTGGAAGCTCAAGCTCAAGCGCTAGTGGTTTAAGAAGGCAATTAGGCTAC
CCTGATACTCGTCCAAGATGTTCTAATTACAATTGCAAAACCGAGTATACTCCTTTGTGG
CGTAATGGCCCTCTTGGCCTTAAGGTAATGGAATTCATAACTAAAATTCGTATATAGCTC
ATTTCATTATTATTATCTTTTCTTTGAAGATTTTATGATCGATGCATCTAACATGAAAAA
AAAAAATGTTTTGGCACAAAATAAGCAGCGAATGCATCAATAGATGTAAAACTCCTTAAT
AGCTTTGGCCAAATTTTTATTACTTGTATACTCTCTTGTTTTCTTTTGTAGTGGCGTAAA
AGAAAATATAAGATATAATTGTATAAAATATAGTTCAAAATATATGGGTAAATATGTTTT
TTTTTTTTTTGTTTCATGTATAATTCTGCATGCATTCAGGTATGTATTTATTTTTCAATA
GAAAATATAAGATACTTAGATATACACCATTGTATAATGGCTATGTTTTGTATGTATGTA
TGTATATATATATATATCTATATATATATAGTTTTATAAAATTTTGTAACATTGCAAAGT
TGGATCTTGTATTGCATGCACAATTCACACTTGATCCTCTCGCTCTCTTTATATATGTAT
CTATGTATTTTCATTGATGAAAATTCATATATATATATTTTTCATTTGTCCTCTTGGGCA
TATATTGTAGACCTTATGTAATGCCTGCGGCCTGAAGTACTTTAGGATGGAGGGGAAAAA
GAAGAAGGCAATTGAAGCAGCAAGCAGTAGCAGGCTTCATGGTCAAGAGTCCAACAATCA
AGTTGGCAGCATCGATTAA