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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001251 | Chr5 | 25064834 | 25073836 | + | MADS-box protein SVP |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001251.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 88 | 2.30E-25 |
LITCHI001251.m1 | 89 | 160 | PF01486.20 | K-box | Family | 51.2 | 1.20E-13 |
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>LITCHI001251.m1 ATGACGAGACAGAAAATTGAGATCAAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACA TTCTCAAAAAGGAGAAAAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGAT GCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCA AGTACCAAACAGGTGATTGAAAAATACAAGATGAATATGCAGAATCTTCACAGATTTGAT CAACCTTCTCTGGAGTTACAGCTTGAATGCAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATT GCCGAAAAGACCCGTGAGCTAAGGCAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGCGTTGAGCTTA GAGGAGCTAAAGGAACTAGAAAAATCACTTGAAGGAGGGTTAAGATGTGTGGCAGAAACG AAGGATGAAAAAATTATGAAAGAAATTAGTGATCTCAAGACAAGGATAGGGAATTTAGAT TCACATGTAGAAGGCCAGTCATCAGAGTCAGTCACCAATATCAGCAGCTTAGGAGATGTT CCTCAAGACAATAACAGCTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGGTAA
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>LITCHI009699.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTCCGTCCTAAATTCCTTCTGAATAGACTGGGTTTGGGTGGGTTTGGATTGAATCAGAT CGGACAATTTTGCCATCCCTACGCACATCAAGATCAACATTCATCTTCAGCCTTGAATTA TGAGGATGCCATGAGGACATCCTCCACGGACTTTAGCAGTCCTGTTATTCCAAATACTCC AAAGCAACACGGTAAGTAGCTCAAACAACTCAAGTGAAAGCATTTCAAAGCGAACAAGAG AAGAGCTGCCATATCTGCACCCAGCTTGCCTCTATCAAAGGCCATAAACCCGAAATATAA TGGTTCAAGCAAGCCTCATAATTAACTAAGATCTTTCATTACTATCTCCCCATATGCCTA CTAAAATCTTTCGGTTGATCTCAAAACTGAGAAATAATGTTGCATTCACTATTATATGGC AGAATTTTATTAGACAGATATACTGATTACATCATATATCGATCCGATTGAAGCATTTCT CCTCATAATTAACTAAGATGCTATTTGTAAGCAATTTAAGCGAAGATGAACAAGTCAAAG TTATACCACAAGTTTGTTCATGTCTAACCTACAATAGGAAAAATGTGACATTCCCTTACC TTCCCCTTGAGTTTTTTATTCAATCAAAATCAAATACCTCTTGTCCTAATTGTGACAAAA TATTAGAAGTTCTACGTCACGTTTTTTGGGTAAAGCCTGACCAGATAAAGTATATAATGT TTTGTTCAATTTTTTCCCCTTTTGTTTAATAAATTATTAAGACGATATAATATTCCACAA AACCCATATTAAATTGCTAATAAATCCTGTTTCAGAGCTTACCAAAATTGAAAAAAGAAA AAAAACAAACAATATATACCATAAATTAATTAAGAGTAATGATAAACTTTTCAAAATTTT TGTCTAAATTCATACACAAATGATGTGACATAATTGTTGTTAAAATTTTATAAATTATCA TATCATCTCATAATTTATAAAATCTTGATACCTTACATGTTATATCATTTGGGTATGGAT TTAGATAAAATTTTTGAAAAATCTAGGATTGTTCATTAATTAATAGTTAACACAAGTATT CATGGGTCTTGGTACTTGGTAGTCGCTATATAAATAAGATATATATCAACCGTTTAATTA CAAGATTGACAAAAAAAAAGTAATTATATGAATATAAAGTTATAAACATCATAATAAATG GCATATTATGTCATTTCTTTCTCAATGGATGGCTATGATTGCTTCAACCATAAATTGAAT ACATTCACATGAGATTTTTTTTGTTTTAATAATTAAAAAAATCCGAGTTTTGAAAAACTA ACATAGAAATTATAAACTGAGCGTTTTTAGTTTCAACAATTTCCGTGTAAACCACTTCCC CCTCGCCCCCACTCCCCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCCGTGTGAACCATTTCC TTCCGTGTGAAGCAACAGATAGTTTACACAGAGAGAAATAGTTTTAATAATAAAAGAATT TTCACAATATATACAAATTCAAATTAAAAATTAATAGACATACAAGTTCAGGTGAAGAAG CTATCAGTGAAGTTGATATATAAGTAAAGCCAGAGTGGAGAAATATTGAATAATAAATAA ATTAATAGAATTTAGTAATCTTTTAAATCACTACTATTTATATAAGTAAAGCCAGAGTGG AGCAATATTGAATAATAAATCAATTAATAGAATTTAGTAACCTGTTAAATCACTGCTATT TATTGCTTCATATATATGTAGACAAAGTATTCATGGCATGACTCTTGTGGCCTCTCTCTC TAATATATATTTATCAATCTCTGTCTCTTATAGAGCAGTTGTCTATATATAGAGAATATT GCAGGGGTGTAAGATAGAATTCATTATACCATGTGAGAACAAGAAAATAGCATTCACTGA AATATTTTGAGTGAGTCCAGGAGACTCTCTAAGAAGAAAGAGACAGAGAGAAAGATCATA TAACATTGACAAAACAAAAA
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>LITCHI009699.m1 GenomeSequence + TTAGTAACCTGTTAAATCACTGCTATTTATTGCTTCATATATATGTAGACAAAGTATTCA TGGCATGACTCTTGTGGCCTCTCTCTCTAATATATATTTATCAATCTCTGTCTCTTATAG AGCAGTTGTCTATATATAGAGAATATTGCAGGGGTGTAAGATAGAATTCATTATACCATG TGAGAACAAGAAAATAGCATTCACTGAAATATTTTGAGTGAGTCCAGGAGACTCTCTAAG AAGAAAGAGACAGAGAGAAAGATCATATAACATTGACAAAACAAAAAATGGGCAAAGGAA GAGCTCCATGTTGTGATAAGAGTCAAGTGAAGAGAGGTCCATGGAGTCCTGCAGAAGACT TGAGGCTCATCACCTTTATCCAGAAAAATGGCCACGAAAATTGGAGAGCTCTCCCTAAAC AAGCTGGTTTGTCTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTACATATTTCTTGTGATTA CATTGACAATTGATTAACCCGCTTAGGTCTGTTCTTGGTTGAATGTAAAATATGCATACA GATCAATATGATCATGAATTTGTTACCCATTTTAATATTTTGATTGATTTACGAGTCAGT ACGTACTTACATGTTTATAATATGCACATGATTATATATATAATATGCACGTGGAGGCAC GTGCAGGAACCCTCACGTTTACAAAATGCTAAATTTGTGAAAAGAATATCGATAATAATA TTTTTTTCCTTTTAATTATATACCTTAATTTGAATGGAGCAAATTTTTGTATTATTAATC AATTAGCTCCTGTTTCTGTAACTGATCGGATTCAGTTTGTTTTGATTTGGTTTTTTTTTT TTGTTTTCCTTGTTTTTAATCCTTGTTTTCCAACCAACTTGAAAATGAAGATTTTCCGAC AATAATAGGATTAGATTGCCGGGTTCCTTAGTAAATGTTTTATCTGAAATCTGTAATATA CATGGCATTGACAAGATATTTGTCACGAAAGTGAGTTGTCATTTGTTGTCTGGTTCAATT TGACTTTTGACCACTAAAATAAATCTCACCAAACTAAGTAACAAAAAGATTGAAACGTTT CTTCAATATTGACTCCAATACATATGATATTAATATAATGTCAAATTTGGTTACTCCCAA ACATGGAAGAGTATATCTCGCTTTAAATTCTTACAAGTTTCCCACCTCTGAAGCTACCAA AAAAGTTTCCGAGAAAACTATATAAGGTGCAAAGAGAATTCTCAAGATGAAAATTTGAGA TCATCTTATTATTATTATTATTATTTAATTCTGACATCTAATGAATCGGGAGTTTATCAA TACTTACTAAAATAAATTTAATAATTAAAAAGCATAAGTTCTTGCCTTCGCATGACTGGT ATCTACTATAGTACATTAATCAAATTTTTTCATGTCTACCCAAGTTAGGAACCTTGTATA CCTAAAAGTTAAGGCAACTGAAGTTCTTGAAATAATGGTCACATCACAATGCCATATGGT CCATTCTACCTAACTGGCTTCTGGCCCTTTTTTCTGACCTTTTAAATTGACAATTTGATG CATACTCGGTAGCCATCTAGCTAAGTGACTGTTACGAATGTATAATGATTTTTTTAGGAT CATCTCACAAGTCACAATGTCATATTCACACTTCAAATATAATAGAAAAATCTTAAATTT CAATAACTGTTGTCTTAATATAAAATTAACGCACTCATAAAAGTCTCTAAGTCCATAGAG GTTTACATCATGCAATACGTACCACAAGAATAGAGAGGATTGAGTCATACCAGTTAAAAG CACTTTTTATTTTAGTTTCCGAAAAAAAAAAAACACATTTTATTTTATTTTATATGGTGC AAAGTAAAGGCCTTGACCCTTGTTTTATTTTATTTTATTTACTTTTTTTTTTTTAATTAT CTTTTTAAAGGGCTCTTGCGATGTGGTAAAAGTTGTCGATTGAGATGGATAAACTATCTA CGACCGGATTTGAAAAGAGGCAACTTCACTCAAGAGGAAGAGGACACCATCATCAAGCTA CATGATACTCTGGGGAACAAGTAAGTTGATTTATATATGTAACCTAATAAATTAAATTAA ATTAAATTAAAGGTACATAACGTTATTAGAATAGTTGGTAGAAAGTGGATTCATTCTAGT AATTGGATTCCATATTATTTATATCCACCTACAAATTATCTCAACAGAGTATTGACATTA ATATATAGGGTTTTATTATTTTACTGGTTGAACAAGATTATTCATTAATAAAAATCCTTA AATATTCTGAAATAACCATTCTTACAATCAATCCACGAGTTGTTATTGATGGATATATAA CCTTACTCAATCAGTAATATAGTCAAACTCATATATTCATGTTTAGTTTTTACTTAATTT ATAAACTAGCTAGGGGTTTCACTTTGATTAGTCTAAATCTCAGAAGAGGTTAATGAAATT TAATGACCTTTTCTATAGTACGTCTTATACTTTATTATCTTAGATTGATAATCTAAAACT TGAATATTTCAGGTGGTCAAAAATTGCATCTTACTTGCCTGGAAGAACAGACAATGAGAT CAAGAATGTTTGGAACACTCATTTGAAGAAAAAAATAAAACCAAATTCTGATCAATCTAA GGAATCCTCATCGACGTCCTCCTCGACTTCCTCATTATCCACCGCATCAAATCATAATTC AAGGGAAAAAAGAAGAGTGGAAACTGAATTACTGGATGATGAACACCAATGGGACAACTG TCACATGCCCAAAAAACCTCGGGAATCGAGTGACGTGGCAGAAGATCAATCCGATCAGAC CATCGAAGACATGTCAAGAAGCTCTTCATTTTCTTCAAACAACTCTAGTTCTGTCACAAA TTCCAGCCAAGTTTATCATAATCATGATCATGATGCTACAATCAGGTCAGAAGATGATCA TCAAGTGGATTCTTTCTTTGAGTTCAGTGAAGCACCTCATGGTTTTGGTATCAACACATT AGAGGAGGTCAATAAACCCGAAATCGTGCCAAATAATAAAAATGATGACAACATTAATAT TAATGAGTTTGAAATCCCATTAGAGGCCGATTTGGATTTCTGGAACATGTTGGATTGCTT ATCAGGATCATTCCAGTCCAATCCAATCTCATCTTTGGAAGTCAGTTCCAATATTAACAA TACTAAGGAGGAGGTGGATAACAGGAAGTGGTTTCAATATTTAGAAAATGAGCTTGGTTT GGAGGCCACAGAATATCACAACCAGGAAAAATATTCAACCAAGGAATCTGAGCCATTGAT TCCTGCAGAGACTTATGAGATTCAGCAAAAACCAGAACTTGACCCTGGGATGAGTTATTT TCAACCGTGGCCTTCTTCACCACCAACACCTCAGAATCCTGTCCTTTGAGTCAATATATA AAAACTAATTAATCAATGTCAAGCTAGTAGTTCTCCATTAGATCAGCATGTCAAAATTGA CTTCCTTCGATATACATATAATTGCTAGGATTTTTTTTTTCCTTTTTTCTTTTCTAACCT ATATTTTTAAATTAATTACAGGTCTATATGATGTATGATGGATTTGAATCATTTGAAGTG TCCATCTATATACTCTATGTATTAAAACCTCATCTATATTCTAAAGAAATTAAAATCAAA ATTTTCATGAATTAATTAAATCAAACACTTGTACATGGGTGGTTGATGTTGTCCACCTGT TAATATAATAAATATCACAACCTAGCTAGTTGACATTATTTGAAATCTTCTAACAATGAA GCCAAATAATGACATTGATTTGTTGAATTAATGAACAAAATCAGATGGAAAATATA