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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001250 | Chr5 | 25042632 | 25051998 | + | MADS-box protein SVP |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001250.m1 | 19 | 99 | PF01486.20 | K-box | Family | 57.3 | 1.40E-15 |
LITCHI001250.m2 | 22 | 69 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 85.6 | 1.20E-24 |
LITCHI001250.m2 | 101 | 181 | PF01486.20 | K-box | Family | 54.7 | 9.50E-15 |
LITCHI001250.m3 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 85.8 | 1.10E-24 |
LITCHI001250.m3 | 89 | 169 | PF01486.20 | K-box | Family | 54.9 | 8.50E-15 |
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>LITCHI001250.m1 ATGAATATGCCGAATCTTGACAAATTCGATCAACCTTCTCTGGAATTACAGCTTGAATGC AATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATTGCCGAAAAGACCTGTGAGCTAAGGCAGATG AGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACGTAGAGGAGCTAAAGGAACTAGGAAAATCACTT GAAGGAGGGTTAAGATGTGTGGCAGAAACGAAGGGTGAAAGAATTATGAAAGAAATTAGT GACCTCAAGACAAGGGAACAACAACTGATGGATGAAAATCTTAGACTGAGACAAAGAACA GGAAATTTAGATTCACATGTACAAGACCAGTCGTCAGAGTCAGTTACCAATATCAGCATC TTAGGAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGCTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGGTTCAAT TGA >LITCHI001250.m2 ATGGATGGACAGAGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGAGATC AAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACATTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTT TTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGATGCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTC TCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCAAGTACGAAACAGGTGATTGAAAAA TACAAGATGAATATGCCGAATCTTGACAAATTCGATCAACCTTCTCTGGAATTACAGCTT GAATGCAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATTGCCGAAAAGACCTGTGAGCTAAGG CAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACGTAGAGGAGCTAAAGGAACTAGGAAAA TCACTTGAAGGAGGGTTAAGATGTGTGGCAGAAACGAAGGGTGAAAGAATTATGAAAGAA ATTAGTGACCTCAAGACAAGGGAACAACAACTGATGGATGAAAATCTTAGACTGAGACAA AGAACAGGAAATTTAGATTCACATGTACAAGACCAGTCGTCAGAGTCAGTTACCAATATC AGCATCTTAGGAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGCTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGG TTAGCATTTCCTAGCTAA >LITCHI001250.m3 ATGACGAGACAGAAAATTGAGATCAAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACA TTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGAT GCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCA AGTACGAAACAGGTGATTGAAAAATACAAGATGAATATGCCGAATCTTGACAAATTCGAT CAACCTTCTCTGGAATTACAGCTTGAATGCAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATT GCCGAAAAGACCTGTGAGCTAAGGCAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACGTA GAGGAGCTAAAGGAACTAGGAAAATCACTTGAAGGAGGGTTAAGATGTGTGGCAGAAACG AAGGGTGAAAGAATTATGAAAGAAATTAGTGACCTCAAGACAAGGGAACAACAACTGATG GATGAAAATCTTAGACTGAGACAAAGAACAGGAAATTTAGATTCACATGTACAAGACCAG TCGTCAGAGTCAGTTACCAATATCAGCATCTTAGGAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGC TCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGGTTAGCATTTCCTAGCTAA
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>LITCHI001250.m1 GenomeSequence + GAACGAAAAGCAAAACTAGAACCATTTAAAAAATGGTAATTGAAGGTTAACATTTCATTT CTTTTTTTGATTTTTTTCTATTGATTTTAAACAAAGATTACTGACGTCCACCAAAGTTTG GGTTAACCAATCTTGTAAAGAGAATCACATCTTTATTTGGCTATAGACAGAATGTTCTTC TTCTCTCTCTTTCCAGAACTAGGCTTTTCTCTCTCCAAAAACCATTGGTAAATCTGGTAT CCGATTTACTGGCTTTTCTCTCTCCAAAAAATATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTG TCAGGTGTCACCAGCTCCCATTTAAAGAAAAAACAAGGTGAGATTGAGATTACATATCTT TTGATCTAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGTTTAC TAATTAATGAGCTTGGATGGATGGACAGGTTTTCTTCTTCATTTCACTTACCAAACATTT AGTTTTTTCCTTCTTTTTGCCATCTAGGGTTTCAGTTTCCTTTTTTTTTCCTCTATTATT TTGGCTTTTGTTGTTGTTAATAATGAGCTTCCTTTTTTAGAAAACCATTTTTCATTTTAA TCTTAGTTGCATGCCAGATTTCTCAGCATTTTCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTG GACTCCTTTTTAATCAATTTGATTGACTAATTTGTGCTAACATGTGCTAGATGTTACTTT TATATATACTTTCTCTACGATGATTTACATGCATCAAACCTCTTTAGGACTCTACATTGA ATATATGTGTTACCAACTATATATAGCTAGCTGTTTGGGAATATAGTATGTAAAGTTTGG TTGATTTTGTTTGAAGAGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGA 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