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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001250Chr52504263225051998+MADS-box protein SVP

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001250.m11999PF01486.20K-boxFamily57.31.40E-15
LITCHI001250.m22269PF00319.21SRF-TFDomain85.61.20E-24
LITCHI001250.m2101181PF01486.20K-boxFamily54.79.50E-15
LITCHI001250.m31057PF00319.21SRF-TFDomain85.81.10E-24
LITCHI001250.m389169PF01486.20K-boxFamily54.98.50E-15
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>LITCHI001250.m1
ATGAATATGCCGAATCTTGACAAATTCGATCAACCTTCTCTGGAATTACAGCTTGAATGC
AATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATTGCCGAAAAGACCTGTGAGCTAAGGCAGATG
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>LITCHI001250.m2
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TTAGCATTTCCTAGCTAA
>LITCHI001250.m3
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MTRQKIEIKKIDNTTARQVTFSKRRRGLFKKAQELSTLCDAEIALMVFSATGKLFEYSSS
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TTGGGGTTCAATTGAACTTTGCTGGTTTTATCAAGAGATTTTTTCCGAGTATTACGATTA
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TGCAGTTCAATTTTATGTAGGAGCAGAAATGATGAATGTATGGAAATCTGAAATTTCACA
ATAGAGAAATATCCTTTGATTAAGTGTATGTAAGTGTTTGCTTATTTATTTCAACGAAGT
TGAAAATGTGTGTATAACCAATGGAGATCATATAATATGAG
>LITCHI001250.m2
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CTTTTTTTGATTTTTTTCTATTGATTTTAAACAAAGATTACTGACGTCCACCAAAGTTTG
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CCGATTTACTGGCTTTTCTCTCTCCAAAAAATATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTG
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TTGATCTAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGTTTAC
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ACAGAAAATTGAGATCAAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACATTCTCAAA
AAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGATGCTGAAAT
AGCTCTCATGGTCTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCAAGTACGAA
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TCTGGAATTACAGCTTGAATGCAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATTGCCGAAAA
GACCTGTGAGCTAAGGCAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACGTAGAGGAGCT
AAAGGAACTAGGAAAATCACTTGAAGGAGGGTTAAGATGTGTGGCAGAAACGAAGGGTGA
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TCTTAGACTGAGACAAAGAACAGGAAATTTAGATTCACATGTACAAGACCAGTCGTCAGA
GTCAGTTACCAATATCAGCATCTTAGGAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGCTCTGATAC
TTCTTTAAAGTTGGGGTTAGCATTTCCTAGCTAACATTGGAGCTGGAGATCATTACCAAC
AATAAACGGCTTTGGACTAACTTATTACTCTCTCTTCACATACATATATATATGTACATA
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AATAACTTGGAATGCTTGGAGAGATTTTAATCAAGTAATAATTTCCAAGTGTGGGATCAA
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AATAGAGAAATATCCTTTGATTAAGTGTATGTAAGTGTTTGCTTATTTATTTCAACGAAG
TTGAAAATGTGTGTATAACCAATGGAGATCATATAATATGAG
>LITCHI001250.m3
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GGTTAACCAATCTTGTAAAGAGAATCACATCTTTATTTGGCTATAGACAGAATGTTCTTC
TTCTCTCTCTTTCCAGAACTAGGCTTTTCTCTCTCCAAAAACCATTGGTAAATCTGGTAT
CCGATTTACTGGCTTTTCTCTCTCCAAAAAATATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTG
TCAGGTGTCACCAGCTCCCATTTAAAGAAAAAACAAGAGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAA
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TGCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTC
AAGTACGAAACAGGTGATTGAAAAATACAAGATGAATATGCCGAATCTTGACAAATTCGA
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TGCCGAAAAGACCTGTGAGCTAAGGCAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACGT
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GGATGAAAATCTTAGACTGAGACAAAGAACAGGAAATTTAGATTCACATGTACAAGACCA
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CTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGGTTAGCATTTCCTAGCTAACATTGGAGCTGGAGATC
ATTACCAACAATAAACGGCTTTGGACTAACTTATTACTCTCTCTTCACATACATATATAT
ATGTACATATACATATAAAAAAATATATATAAAATAACCAAGTGCGTCTCATAATTTGTA
CTTAAATTCATGTAGGTTCAATTGAACTTTGCTGGTTTTATCAAGAGATTTTTTCCGAGT
ATTACGATTAATAACTTGGAATGCTTGGAGAGATTTTAATCAAGTAATAATTTCCAAGTG
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AAATTTCACAATAGAGAAATATCCTTTGATTAAGTGTATGTAAGTGTTTGCTTATTTATT
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>LITCHI001250.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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GTGCTAATAACGGTAGCCAAACTTTGAACTTTGAACTGTTAACTACAAGTCGGTATGCTA
GTATTTGCATATATCTTTGAACACATTTGCATGTAAATATGAGTCAGAAGTTTTAATTTT
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AACATGCTATATGTGTAGAAGCTATCCTAGAAAGTTGCCAACATATAACATATTAAAACT
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TAAAATGAAATTTAATTTGATAGTTCCTTTTATCTATTGATAAAAGTTACTATATAGAGT
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AGTCGGACCTCATTAATGGAAAAACAAGTTTGGAGACACCCAAGTTTCATAAAAAAGTAA
GTCATATACACAGAGAAAAAAAGAGTAGCCGTATAGGAACAATACCTTACCTCTTTTGTT
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AATAGGGTTTTAGACTTTCGTAGAAAATCATTTGTATTTTAGAAATTTTTTATTACATGT
TTGGCACATTTAACATTATTATAATGGAAACATTGAACTAAATTTAGTACATATGATGTT
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AATAGAACCTCACCATCTCCAGTGTCATTTCTCCCAAAAGGCTTTGGGCTTGTTCCTTTT
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TGTACAATAAAATTTCTCTCATCAACCTCTCATTATTTAGCTGGAGTGAAACTTCTCTCA
AATAAAATAAAAGCTCTTTCTCCTCTACATCATAATACTCTTATAGTACACTCACTATTA
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CCCATGCCCACCTGTCACTTAGTTCTCAACTTGAGGAAATAAGGTTTCATTCTTGCTAAC
AATTTTATATAGCTTATGTCCTGGTGGTAAGTGTTAGATTCTGCGTCATATAAAAAGGAG
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AAAAACCATGAAAACCTGGATTAGATTCAAGGAATTTAATGAAATTCGGTGATTGCATAA
GTACTAAATACATTATCTTATAAGTCTTATAATTGTTAAAATGTTTTTAAAATAATTTAT
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TTCCTACTTAGTTTTTTAAGTGACAATACTATTGTTTTATTGTCTGGTTAAGTACGAAAC
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>LITCHI001250.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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GTTTGGTTTCCATTTGTTAAATATGAAGACCAATTGGTAGTTATGATGATAATTGTTGGA
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GTTTTTACTTTCTAGGTTGCTTTAAAAAAAAAAAAGAGGAAGTTTTTTGGTAGATTTTGT
TGTTCCATTTTATTTTAGGAAAAACATAATTTTATTGTCCTTCTATCATTAATGGCGTAA
TTAACTGTAACGGTATAGCTAATGGTCAAAGGGATTAATTAGTTATTTTGTGCCTTTATG
CCTTAGTTAATTGTAACAATTGAAGAGATTATTTAGTTATTTTGTAAAAAATACGATCTA
GTTGCAATTTGATCAAACATTAAGGCATTTCATTGTAATTTTTCCTTTAAAAAATTAGTA
ATTATGATTCATTGAATGAGGTGAACTTACAAAGAGGTATATAAACAATTTTAGAGGGGT
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TCTTCAAGATCATTATTCTGGTTTTGCATTTTTCATAGGGGGATCATTCAACGGACCTTT
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AAAGTAGGAAAGAAAGAGAGAAAATGTTTTTAAATTTTTATATAATTACAAAAATAAGAT
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TTTTCAACTATCAAACTTTATCGGTGAACTTAAATTTGTTACTTGTGGGTCGAGGTTCGT
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TTTTTTTTGTTTTATGGTCAAAATAAGTACAAGGAAAAGAGATGAGGTTTCTTATATATC
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CTTCTTCTCTCTCTTTCCAGAACTAGGCTTTTCTCTCTCCAAAAACCATTGGTAAATCTG
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ACTGTCAGGTGTCACCAGCTCCCATTTAAAGAAAAAACAAGGTGAGATTGAGATTACATA
TCTTTTGATCTAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGT
TTACTAATTAATGAGCTTGG
>LITCHI001250.m3 +  Up_Stream_Len 2000
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GCATTTCATTGTAATTTTTCCTTTAAAAAATTAGTAATTATGATTCATTGAATGAGGTGA
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ATATCTCTTTAGGCATTAATTCGGTAGCAATAATCAAGGGGGTAGCCGATCCTTAGATTC
TCCCCAATGACTCCTATAGGTTTATTTCCATTTATGGACATTCACCATGCCTATAAAAGG
AGGAGTTCACTGTATGGAAAGACATTCAATCTATCTTTCAACAATATTCATATTTCGCTA
AAATCATTTTAGTGTTCAAAACTTAATAATCTTCTTTCTTCAAGATCATTATTCTGGTTT
TGCATTTTTCATAGGGGGATCATTCAACGGACCTTTAAAGGAGTTCCAGTGATTAGACAC
TATTACAACAATCCTCCGATGTATTCTTCATTCCTTAAAGTAGGAAAGAAAGAGAGAAAA
TGTTTTTAAATTTTTATATAATTACAAAAATAAGATGATATAACCGTCAATTAATTAACT
CAAACATAAATTAAAAATAATTTAAACATTTTAAACTTTTCAACTATCAAACTTTATCGG
TGAACTTAAATTTGTTACTTGTGGGTCGAGGTTCGTCATTTGTAAATAAGAAAAAACTTC
TCTTCTCTACTTACAATAATTGAAAGGTGAGAAGGATTTTTTTTGTTTTATGGTCAAAAT
AAGTACAAGGAAAAGAGATGAGGTTTCTTATATATCTCGTAGGAGGGTTTATTGTGTGGT
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TTGATTTTAAACAAAGATTACTGACGTCCACCAAAGTTTGGGTTAACCAATCTTGTAAAG
AGAATCACATCTTTATTTGGCTATAGACAGAATGTTCTTCTTCTCTCTCTTTCCAGAACT
AGGCTTTTCTCTCTCCAAAAACCATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTGGCTTTTCTC
TCTCCAAAAAATATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTGTCAGGTGTCACCAGCTCCCA
TTTAAAGAAAAAACAAGGTGAGATTGAGATTACATATCTTTTGATCTAACCCAATCCCTA
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ATGGACAGGTTTTCTTCTTCATTTCACTTACCAAACATTTAGTTTTTTCCTTCTTTTTGC
CATCTAGGGTTTCAGTTTCCTTTTTTTTTCCTCTATTATTTTGGCTTTTGTTGTTGTTAA
TAATGAGCTTCCTTTTTTAGAAAACCATTTTTCATTTTAATCTTAGTTGCATGCCAGATT
TCTCAGCATTTTCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTGGACTCCTTTTTAATCAATTT
GATTGACTAATTTGTGCTAACATGTGCTAGATGTTACTTTTATATATACTTTCTCTACGA
TGATTTACATGCATCAAACCTCTTTAGGACTCTACATTGAATATATGTGTTACCAACTAT
ATATAGCTAGCTGTTTGGGAATATAGTATGTAAAGTTTGGTTGATTTTGTTTGAAGAGTG
GGCTCGATTTTGTGGGTAAA
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>LITCHI001250.m1 GenomeSequence + 
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CTTTTTTTGATTTTTTTCTATTGATTTTAAACAAAGATTACTGACGTCCACCAAAGTTTG
GGTTAACCAATCTTGTAAAGAGAATCACATCTTTATTTGGCTATAGACAGAATGTTCTTC
TTCTCTCTCTTTCCAGAACTAGGCTTTTCTCTCTCCAAAAACCATTGGTAAATCTGGTAT
CCGATTTACTGGCTTTTCTCTCTCCAAAAAATATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTG
TCAGGTGTCACCAGCTCCCATTTAAAGAAAAAACAAGGTGAGATTGAGATTACATATCTT
TTGATCTAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGTTTAC
TAATTAATGAGCTTGGATGGATGGACAGGTTTTCTTCTTCATTTCACTTACCAAACATTT
AGTTTTTTCCTTCTTTTTGCCATCTAGGGTTTCAGTTTCCTTTTTTTTTCCTCTATTATT
TTGGCTTTTGTTGTTGTTAATAATGAGCTTCCTTTTTTAGAAAACCATTTTTCATTTTAA
TCTTAGTTGCATGCCAGATTTCTCAGCATTTTCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTG
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ATATATGTGTTACCAACTATATATAGCTAGCTGTTTGGGAATATAGTATGTAAAGTTTGG
TTGATTTTGTTTGAAGAGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGA
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GCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGATGCTGAAATAGCTCTCATGGT
CTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCAAGGTCTGTTTCTCTCTCTCT
CTCTCAATCTGTTTTACTTCTCCTTCATTTTTCTTTCTGTTATTATGTACCTGGTTCAGT
GATTTCATTTATTGTTTAATTCATTTTCGGCAACTTGCGATGGTACTATGTTTTGTGTGT
TCCGAGTGTGACTGTCAGAGAGAATCGATGAGGGATTTAGTGTAAATTAGGATCTTTTTA
GTTCAACAAAACTCTCATTAATAAACAAGACTTATATAATTTAGGGAGATGTTAGTATAA
CCATGGTGGCATGCATTCTCTGGCAAAGAAACTTTTTGTTGTGAGTACTAAAGAGGTTAT
ATTAATGAATCATTTACATGAAGGATTTGATGTAATTTGGATCGATTCTCTAGGGACTCA
TCTCTAAATTGACTTGTTTTATTCAAACAAAATAATTTATTTCTTGAGGAAAGAGTTTCC
CGTTATTCTTGTAATTCTAAATTACAACAGTTACTGTCTTCATCCTTTAGGCTGATTACA
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TGGTAGTTTTCTCCCACTATTTTAAAAAAAAAAAAAAGTGAGGAGGGCAGGAAACATGTG
TGTTAAAGAAAAGTACCCTAAACTAGATTTTATTAATAAATAGTGGTTAACTATTCTCTT
TGAATTAGTTGTAATTGTTAAGTTCATTTAACAAGTTATAACGTTTTCTAATTCTAAAGC
TATTGAAGAACTCATTTTAAGGTAATATGCAACAATGTGTGGTGCATGTTGCTGTTGTGT
TGTGCATAACATTGAAAGCACTTTTGACAAAAATACTATTGTAGAACTGGCAAGGGTATT
CAATTATATTTTTAGACAGATTTAGAAAACAAAGAAGATACTAATTTATTGCCCTATAAA
GCTTATGATATATATATATATATATACAAAGATCGCAATCTTCTTTTTGATATGATGCTT
CCAACATACAATTAATGACATTTTTAAGAAAGTATGTCCTCATAAAATATAGGACTTCCC
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TTAAGTTTACACTTTTGCTATATATCTTTAGAAATTGCTTTTGTGTTATAACAAGGATAG
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>LITCHI001250.m3 GenomeSequence + 
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