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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001248Chr52500272525011649+MADS-box protein SVP

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001248.m11057PF00319.21SRF-TFDomain85.71.10E-24
LITCHI001248.m191170PF01486.20K-boxFamily59.23.80E-16
LITCHI001248.m21057PF00319.21SRF-TFDomain85.81.10E-24
LITCHI001248.m291169PF01486.20K-boxFamily58.27.70E-16
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>LITCHI001248.m1
ATGACGAGACAGAAAATTGAGATCAAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACA
TTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGAT
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>LITCHI001248.m2
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>LITCHI001248.m1
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>LITCHI001248.m2
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>LITCHI001248.m1
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AAGTAATAATTTTCTAGTGTTGGATCAATTGCAGTTCAATTGGATGTAGAAACAGAAACG
ATG
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CATGACACACAAACATAGACTTGAAGTTATTGACCAAATGCTTTCGAGTATAACTCATGT
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GATGATGTGTAGAGGACTGAATCGTTGATGTTGTCTGAAAATAGGTATCAGTGTAGAATT
TGATAAGTTTTGCAAGAGAA
>LITCHI009851.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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ATTTCTCTTCCCATCAATAAAGTCAATACATCGATATTCAAAATTTTAACTTTAACTTAT
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GATGATGTGTAGAGGACTGAATCGTTGATGTTGTCTGAAAATAGGTATCAGTGTAGAATT
TGATAAGTTTTGCAAGAGAA
>LITCHI009851.m4 -  Up_Stream_Len 2000
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CATGACACACAAACATAGACTTGAAGTTATTGACCAAATGCTTTCGAGTATAACTCATGT
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>LITCHI009851.m3 -  Up_Stream_Len 2000
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AATTGTTTTACATAGATTTCGATCAGTTTGGTTTGTGTTTCCGGTTCTGTTGGGGCGCTC
TCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATTTTTGACCTCCGGTTTTATCTGCTTTTCGTTGT
TCAACACTTGTCCTGACTTTAGATCTGAACTCTGTCTCTCTCACACCCGCACACTTGATG
TCTTGTTCCCGTTAATTGGTTTCAAAAAAGTTTGGATTTCGATTTGTGCTTCTCTTCGGT
TACAAGATGTTGTGGCTGCCGTAAAGAATTCTTCTACAGGTATGTGAATTATTAATTTAT
TTTTTTAGTTATTCGTTAAAAGAATCAATTTTGATTTGGAAATTTAGATGGATGAGTTGG
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GATGATGTGTAGAGGACTGAATCGTTGATGTTGTCTGAAAATAGGTATCAGTGTAGAATT
TGATAAGTTTTGCAAGAGAA
>LITCHI009851.m5 -  Up_Stream_Len 2000
TAACAATCAAAAATAAAAAAGGAAAAAATGGAAAATGGAAAAAAAGGTTTATAATTTTAC
TTGCGAAGAAGAGTCTTGGATTCTTCGTAGGTCCATGGGCGGCTAAGAAAAGCACCCCAA
TCTTGGTCGAATTTACGTTTCATGCCAACACCGAAAGAAAAGTTTGTTGGAAGCCAAACA
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TTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTGTTTTACATAGATTTCGATCAGTTTGGTTTGTG
TTTCCGGTTCTGTTGGGGCGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATTTTTGACCTC
CGGTTTTATCTGCTTTTCGTTGTTCAACACTTGTCCTGACTTTAGATCTGAACTCTGTCT
CTCTCACACCCGCACACTTGATGTCTTGTTCCCGTTAATTGGTTTCAAAAAAGTTTGGAT
TTCGATTTGTGCTTCTCTTCGGTTACAAGATGTTGTGGCTGCCGTAAAGAATTCTTCTAC
AGGTATGTGAATTATTAATTTATTTTTTTAGTTATTCGTTAAAAGAATCAATTTTGATTT
GGAAATTTAGATGGATGAGTTGGAGTAAGTGACAAGAGAAAAACATTGTATGATAATTAT
AGGTGAAAGTTTTTGTTTTTAGTGATGATGTGTAGAGGACTGAATCGTTGATGTTGTCTG
AAAATAGGTATCAGTGTAGAATTTGATAAGTTTTGCAAGAGAAATGGAAGAAGTTGGTAC
CCAAGTGGGTCCTTCCATTTTTATGAGTAGATTCTGTGAAGCGCCTCCCATGGCGAGAAA
GCGTCATCTTTCTTATCATCAAGCACCCACTTTCCAGCAACACCACCAGCAGCTACAGCA
GCAGAGTTCTGACTGGAATTCCAAGCTCTGGGATTGGGACAGTGTCAGATTCGTCGCCAA
ACCTCTAGAGTCTGAGGCTCTGCGACTGGGGACTGCAGCTCCTGACCTTAACAACAACAA
GAGAGAGGATGTGTTTTTGAAGAAGAGCACTGCTACTGCTGCTGAGCTTGATGAGAGGCT
TGATTTGAATCTTGGTGGTGGGTTGAGTTCGATGGAGGAGCCTGTTTCCAGACCCGGTAA
AAGAGTCAGGTCTGGATCTCCTGGAAGCACCAGTTATCCCATGTGTCAGGTTGATGATTG
TAAGGAGGATCTGTCTAATGCCAAGGACTATCACCGCCGTCATAAAGTGTGTGAGGTTCA
CAGTAAAGCTACTAAAGCTTTTGTTGGAAAGCAGATGCAGAGGTTCTGCCAACAGTGCAG
CAGGTTTCCATTTCTTCTTTTCCCTTTCTTTATACCTTCATTTGAATTTGGTCCCTTGTT
TCCTTATCTTTTATATATAACTTCGAATTTTCACCTTTATTGCTAGTGTAGGTTATGTGA
ATCATTGACATGATTGATTTGATGAAGGTCATTTATTAGCTTCTTTAATTGAAGTTTGAA
CCTCTCACCTATTATTGTGCATTGCCTTTTTTGTTTTCAGGTTTCACCCACTATCAGAAT
TTGACGAGGGAAAGAGAAGCTGTAGGCGTAGACTTGCTGGGCACAACCGGCGAAGAAGGA
AAACCCAGCCAGAGGACGTTACCTCACGGCTGTTAATCCCTGGGAACCAGAATAACACCC
CCACTGCAAATATAGACATTGTCAATTTGCTGACCGCCTTGGCTCGTGCACAAGGTAAGA
GCATTGAGCATTGGCTAACTGAACATTAGATGTTTATTTAACATCCTCCTGATTTTGAGC
TGATCGTTTTGAAAATAATAGGAAAAAATGAGGAGAAAAGTATCAATTGTCCATCTGTAC
CAGATAGGGAACAACTTCTC
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>LITCHI009851.m2 GenomeSequence - 
TATGAAAAATAGTAAAAACTAAAAAGGAAAAAAAAATGTCACACTCAAACCGAGACTTGT
CACTCGGGTTCTTTGTTTCTAACGACTTTGATTTCTTAACAATCAAAAATAAAAAAGGAA
AAAATGGAAAATGGAAAAAAAGGTTTATAATTTTACTTGCGAAGAAGAGTCTTGGATTCT
TCGTAGGTCCATGGGCGGCTAAGAAAAGCACCCCAATCTTGGTCGAATTTACGTTTCATG
CCAACACCGAAAGAAAAGTTTGTTGGAAGCCAAACAAAGAATAACTCAAAAAAAAAAAAA
AAAATTGAGAGAGAAAGAGAAAGAGGAAGAGAGAGAAAAGTAAAAGCAAGAACCAAAGTT
GCGGAGACACTTCTCTTCTTCGCTTCGGTTTCCATTTCGTGTTCTGTTCTTGGATCGGTT
GACTCTAGTTTAACGGTCTTGGATTGTCTTCTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTTTTTTTTAA
ATTGTTTTACATAGATTTCGATCAGTTTGGTTTGTGTTTCCGGTTCTGTTGGGGCGCTCT
CTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATTTTTGACCTCCGGTTTTATCTGCTTTTCGTTGTT
CAACACTTGTCCTGACTTTAGATCTGAACTCTGTCTCTCTCACACCCGCACACTTGATGT
CTTGTTCCCGTTAATTGGTTTCAAAAAAGTTTGGATTTCGATTTGTGCTTCTCTTCGGTT
ACAAGATGTTGTGGCTGCCGTAAAGAATTCTTCTACAGGTATGTGAATTATTAATTTATT
TTTTTAGTTATTCGTTAAAAGAATCAATTTTGATTTGGAAATTTAGATGGATGAGTTGGA
GTAAGTGACAAGAGAAAAACATTGTATGATAATTATAGGTGAAAGTTTTTGTTTTTAGTG
ATGATGTGTAGAGGACTGAATCGTTGATGTTGTCTGAAAATAGGTATCAGTGTAGAATTT
GATAAGTTTTGCAAGAGAAATGGAAGAAGTTGGTACCCAAGTGGGTCCTTCCATTTTTAT
GAGTAGATTCTGTGAAGCGCCTCCCATGGCGAGAAAGCGTCATCTTTCTTATCATCAAGC
ACCCACTTTCCAGCAACACCACCAGCAGCTACAGCAGCAGAGTTCTGACTGGAATTCCAA
GCTCTGGGATTGGGACAGTGTCAGATTCGTCGCCAAACCTCTAGAGTCTGAGGCTCTGCG
ACTGGGGACTGCAGCTCCTGACCTTAACAACAACAAGAGAGAGGATGTGTTTTTGAAGAA
GAGCACTGCTACTGCTGCTGAGCTTGATGAGAGGCTTGATTTGAATCTTGGTGGTGGGTT
GAGTTCGATGGAGGAGCCTGTTTCCAGACCCGGTAAAAGAGTCAGGTCTGGATCTCCTGG
AAGCACCAGTTATCCCATGTGTCAGGTTGATGATTGTAAGGAGGATCTGTCTAATGCCAA
GGACTATCACCGCCGTCATAAAGTGTGTGAGGTTCACAGTAAAGCTACTAAAGCTTTTGT
TGGAAAGCAGATGCAGAGGTTCTGCCAACAGTGCAGCAGGTTTCCATTTCTTCTTTTCCC
TTTCTTTATACCTTCATTTGAATTTGGTCCCTTGTTTCCTTATCTTTTATATATAACTTC
GAATTTTCACCTTTATTGCTAGTGTAGGTTATGTGAATCATTGACATGATTGATTTGATG
AAGGTCATTTATTAGCTTCTTTAATTGAAGTTTGAACCTCTCACCTATTATTGTGCATTG
CCTTTTTTGTTTTCAGGTTTCACCCACTATCAGAATTTGACGAGGGAAAGAGAAGCTGTA
GGCGTAGACTTGCTGGGCACAACCGGCGAAGAAGGAAAACCCAGCCAGAGGACGTTACCT
CACGGCTGTTAATCCCTGGGAACCAGAATAACACCCCCACTGCAAATATAGACATTGTCA
ATTTGCTGACCGCCTTGGCTCGTGCACAAGGTAAGAGCATTGAGCATTGGCTAACTGAAC
ATTAGATGTTTATTTAACATCCTCCTGATTTTGAGCTGATCGTTTTGAAAATAATAGGAA
AAAATGAGGAGAAAAGTATCAATTGTCCATCTGTACCAGATAGGGAACAACTTCTCATGA
TTCTTAGCAAGATAAATACACTACCTTTACCAGTGGATCTTGCTGCAAAATTGCCGAATA
TTGGAAGCTTAAATAGGAAAAATCCAGAACAACCTTCTTCTGATCTTCAAAACAGATTAA
ATGGAAATGCATCTGCTCCATCAACGATGGACTTACTTGCTGTTCTATCGACTACCCTGG
CTACATCTTCTCCAGATTCTCTTGCTGCTTTCTCTCAAAGAAATAGCTATGGCAGTGATA
GTGAAAAAACAAAGTCAGCCTGTCTTGACCAGGCAACCCCTAATTTCCAAAAGAGAACTG
CCCAGTTTCCATCTGTTGTAGGAGAGAGAAGTAGTTCCAGTTACCAGTCCCCTGTTGAAG
ATTCAGATTGCCAAATTCAAGATGCTCGAGCTAATTTACCATTGCAACTATTTAGCTCAT
CACCTGAGGATGACAGCCCACCAAAACTGTCATCTTCGAGGAAATATTTCTCTTCTGATA
GCAGTAACCCAACTGAGGAGAGATCTCCATCGTCATCTCCTGTTGTGCAAACGTTGTTCC
CCATGCAGAGCTCGGCAGAAACTATAAAGTCTGAGAAGATGTCCATTAGCAGAGAAGGTA
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>LITCHI009851.m4 GenomeSequence - 
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CTACATCTTCTCCAGATTCTCTTGCTGCTTTCTCTCAAAGAAATAGCTATGGCAGTGATA
GTGAAAAAACAAAGTCAGCCTGTCTTGACCAGGCAACCCCTAATTTCCAAAAGAGAACTG
CCCAGTTTCCATCTGTTGTAGGAGAGAGAAGTAGTTCCAGTTACCAGTCCCCTGTTGAAG
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GCAGTAACCCAACTGAGGAGAGATCTCCATCGTCATCTCCTGTTGTGCAAACGTTGTTCC
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GCAACAAAGTTTTTGTTGGATTCTTACTGTTTGATTCCTCCACAGGATCGCACAGGGAGA
ATAATGTTTAAATTATTTGACAAGGATCCTAGTCATTTCCCTAATACTCTTCGGACACAG
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AGCATGTTGATTCTTTGATCCAAGATTCAGAATTGGATTTTTGGAGAAAAGCAAGGTTTT
TGGTTCATACAGGCAGGCAGTTAGCTTCACATAAAGACGGTGAGTACAGCTGAGGATTTT
ATAACAACTCAAGATTGTGCTCAATTCTGGTGACCAAATGAAATGGTCATGATTGACTAT
ATGGGTTGCATTGTGGATTTTGAATATTGCATTATGGTAACAGTTTGATTTTTGTTTCAT
GAACCAATCTTCAGGGAAGATTCGTCTATGCAAATCTTGGAGAACATGGAGCTCACCTGA
GTTGATCTCAGTATCCCCGTTGGCTGTTGTGTGTGGGCAAGAAGCCTCTCTTAGATTGAG
GGGTAGAAATTTAATCAATCCGGGCACTAAGTAAGTATGATGTGTTTTTGTGTGAAGTGC
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TTGGTCGCATTTTTATTGAGGTTGGACTTTTAATCGTCATCGGTTGTAGGCTTGTAGCAG
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AATAGTTTTCCTGTTATAATAGCGGATGCGACAATTTGTCAAGAATTGAGACTGCTAGAA
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TATGACAGACCCAGATCGAGGGAAGAAGTTTTGCACTTCTTGAATGAACTTGGATGGCTG
TTCCAAAGGAAAAGGACCTTGTCCATGCTTGAAGGTCCTGAGTATTCCTTCAGCCGCTTT
AAATTCTTACTCGTATTCTCAGTCGAACGGGGTTGCTGTTCTTTAGTGAAAGCACTCCTT
GACATGGTGGTGGAAAAAACAATGGAAATGGGTGGTCCAACTAGGGAGTCATATGAGATG
CTTTCTGAGATTCAGCTTTTAAACCGGGCAGTGAAAAGGAGGTGCAGGAAGATGGCTGAC
ATGCTGATTCATTATTATATCACTGCCAGTAATGATTCCTCTAAGACATATATCTTCCCA
CCAAATCTTGAGGGACCTGGTGGTATAACACCTCTACATTTGGCTGCATGTACATCAGAT
TCAGATGAGATGATAGACACTTTGACGAATGATCCACAGGGGGTATGTTAAATTCTGCTG
TTTTCTTGCTCCAACTGTGATCTTCTGTTTACATATAGCTTTGACACCCTAATAAACCTC
TTCTTTTGAAACTCTTAGGACTCTTTTGCATATAGTAATCCTAATTGCATTATACATGGT
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GCCACTGAAATTGTGTCTGGTCTCATTTTATTTCTTGATTGAGCTATATTCAATCTTAAT
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GGATGCTAATGGACATTCACCATCTTCATATGCTGTTTTGAGGAATAACCGCTCCTACAA
CGAGCTGGTAGCTCGTAAACGTGCTGACAAAAGTAATGGCCAAGTTTCTGTAACAATTGG
AATGGATATAGAGCAATCTGGCTCGACAATGGTGAGTTCCCAGTTGAAACAAGAGTGGAA
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GGGCTTGCTTAGCCGTCCCTATGTTCATTCAATGCTGGCCATTGCTGCCGTTTGTGTTTG
TGTCTGCCTATTCTTGCGAGGTGCCCCAGACATTGGTCTGGTTGCTCCATTCAAGTGGGA
GAACTTGGAATATGGTCCGAAGTAGTGATATTGAGAAAGAGTTTTTGAGATATTAAAGGA
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CATGGTGACTGGTGCAGCTATGCGAGGCAAGATATACCTGGTAAAAGGGATGTAGGAATT
GGACAAATTGGCAGGCTGTCCAGTTCAGACACCACGTATTATTTAACAAAGCTGATATCT
GGGATTTTATGGTTTATGCCTCTTTTTTCTGCCTTATTTGTGTTTCAACATGGAAGACAC
TTTCTCAGATTGTGGATAAGTCAGCTTTTCAGACCCTTAGAATGTAGGGGGGTGGGCGGG
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TTTTCTGCTTTTCCATTCCTTTTTGATTCATGATGAAAGCTACCGACGCCAAAGTATAAC
TGACTTGTGTATTGATTTTGTCTTTGTAAAGTTGATTGGTAGGATCTTATCAAAGAACTT
GAATACTGTATGATTAAATAGGAAATTATTTGTTGACATACATATATATATATATATAAT
TAAAAATAAGAGGCAGGCCCCTTCGCATGTCAGCTTTTTTCTGTCAACTTACGTGCGTAG
TGTTTTTTTTCCCACTTGCATTGATCCTTATTGTGCTCGGGTTCTTATTTTGTGGAGTAA
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GGATTAGATCATCTATCCAACCGAGAAGTGACCTACCTTTGTTGATCCTCATCTACTTTG
AAGTAGAATCAGACAGTTAAGTAAA
>LITCHI009851.m3 GenomeSequence - 
TATGAAAAATAGTAAAAACTAAAAAGGAAAAAAAAATGTCACACTCAAACCGAGACTTGT
CACTCGGGTTCTTTGTTTCTAACGACTTTGATTTCTTAACAATCAAAAATAAAAAAGGAA
AAAATGGAAAATGGAAAAAAAGGTTTATAATTTTACTTGCGAAGAAGAGTCTTGGATTCT
TCGTAGGTCCATGGGCGGCTAAGAAAAGCACCCCAATCTTGGTCGAATTTACGTTTCATG
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