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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001248 | Chr5 | 25002725 | 25011649 | + | MADS-box protein SVP |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001248.m1 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 85.7 | 1.10E-24 |
| LITCHI001248.m1 | 91 | 170 | PF01486.20 | K-box | Family | 59.2 | 3.80E-16 |
| LITCHI001248.m2 | 10 | 57 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 85.8 | 1.10E-24 |
| LITCHI001248.m2 | 91 | 169 | PF01486.20 | K-box | Family | 58.2 | 7.70E-16 |
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>LITCHI001248.m1 ATGACGAGACAGAAAATTGAGATCAAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACA TTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGAT GCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCA AGTACGAAACAGGTGATTGAAAAATACAAGATGAATATGCCGAATCTTCACAGATTCGAT CAACCTTCTCTAGAATTACAGCTTGAATGGAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATT GCCAAAAAGACCCGTGAGCTAAGGCAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACATA GAGGAGCTAAAGGAACTAGAAAAATCACTTGAAGGAGGATTAAGATGTGTGACAGAAACA AAGGGTGAAAGAATTATGAAAGAAATTAGTGAGCTCAAGACAAGGGAACAACAACTGATG GATGAAAATCTGAGACTGAGACAAAGAGTGAGATATACAGGGAATTTAGATTCACATGTA CAAGGCCAGTCGTCAGAGTCAGTTACCAATATCAGCATCTTAGGAGATGTTCCTCAAGAC AGTAACAGCTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGGTTAGCATTTCCTAGCTAA >LITCHI001248.m2 ATGACGAGACAGAAAATTGAGATCAAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACA TTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGAT GCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCA AGTACGAAACAGGTGATTGAAAAATACAAGATGAATATGCCGAATCTTCACAGATTCGAT CAACCTTCTCTAGAATTACAGCTTGAATGGAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATT GCCAAAAAGACCCGTGAGCTAAGGCAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACATA GAGGAGCTAAAGGAACTAGAAAAATCACTTGAAGGAGGATTAAGATGTGTGACAGAAACA AAGGGTGAAAGAATTATGAAAGAAATTAGTGAGCTCAAGACAAGGGAACAACAACTGATG GATGAAAATCTGAGACTGAGACAAAGAACAGGGAATTTAGATTCACATGTACAAGGCCAG TCGTCAGAGTCAGTTACCAATATCAGCATCTTAGGAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGC TCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGGTTAGCATTTCCTAGCTAA
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>LITCHI008820.m1 AGTATCCCATCTGTCACCTTTACAAATTATATCCTAATTTTGGCTTCACTTTCCTTCCAT AGTCTGTTCAATTTCAGAAGCTTAGTTATATTTAGGGACCCTTTTCGTATATTTAATCAT CATCATCTCCATTCTTGTTTTTGTTGTTGTTGTTCAAGGTGTGTTTGAGAGTAGAGAGAA AAAAAAATGGGTAGAGGGAAGATTGAGATCAAGAGGATTGAAAACGTCAACAGCCGCCAA GTCACCTTCTCAAAACGCCGTAATGGGTTGCTCAAAAAGGCCAAGGAGTTGTCTGTTTTG TGTGATGCTGAGGTTGGTGTCATCGTCTTCTCTAGCACAGGCAAGCTTTATGAGTATTCA AGTTCCAGCATGGAATGCATTCTCTCAAGGTACAATAAAGGCCAGGAAATAGAACATCCT GCTGCAAATCATGAAGCGCAGCAATCACAAGTAGCAGAAGCCAGTTCCCTGAAAGATGAG TTTGCAAGGCTGCGTTTGGCATACATGCAAATGAATGGTAAGGAACTGGATGGCTTGAGC TTCCAAGAGCTGAATCAACTGGAGCAACAATTGAGTGAAGGGATATTTGCTGTTAAAGAT AAGAAGGAGAAAGTTCTAGTGGAACAACTAAAGAGATCAAGATTACTGGAGCAAAAGGCT GTCCTAGAGAATGAGACTCTTCGAAAACAGATTGAGGAGCTTCGACGTTCTACATCATCG TTGATGGAATTAAATCCTCTGGAAAGGAGGTTCTCTTTTGCAAGTTCGAAAGGAAATAGT CCTTGTGCATCTGAAGAGGAAGATGACCATTCTGATACATCCTTGCAATTGGGGTTGTCA ACAGATCCTGTTTGTCGGAAGAGGAAATTGGCTAAGACTGAGTCCGTCTACAACGATTCA GGGAGTCAAGTGGCATCAGAGTGATGAAATTAATAATTATCTACAATGAGATGAATGTCT TTAGTTTTAGATTCTGATAATTAGGTGGTTGAATTTCTTCTAATGGCAATGAGACATAGA TGTTTTGCTTTTGTTTTTTTGATATTACAAGTATATTTACAATTACCTGGACCACCTGAT CTGTACTTAATGGTACGGCCCAGATCGCTACTCTTTATACTTTACTTCCAACTAAGCGGG AGAGAGTGACTCTCACTAAGTGCGAAAACTTAGCCCATACAGATGCTTTGTTTTAAAGGT ATGTCATGTTAGATTTTCAACAGTTGCTTTCGCCCTTTGTTACTAAATTTGTCTATCCTC ATAATTTGTTAATTGTCTTTAGTTAACAACAACTTTTTGATGTTAACAGACTGACAATCA ACAATTTTAAATTAATAAACTACTCACTGAAGTAGAAAATTTTTTACATTCTTATGA
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>LITCHI008820.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCATTTCAGCCAATCTATGATAGCTAGACTAGGAGAAGTTTGCATAGGAGTTTTGGTGGA CTTGAGACACTTGAAACGGGAAGTCCACGTAAACACATATAAGTTGATTAGCTTGTTAAA TAAGCTACTGAGAATATAAAAGCAATAACTTTACTTTCTTGTAATTAACAAGTAGCATTG TATCCCATCATCTCCCATCAATATAGTTCTCTTCAAGTTTCTCTTAAATTAGGTTTTGTG TAATATTAATTTCACTTAACAATCTATGTAAATTTCATCAATCAAACAATTATGGTTAAA TTAAAAGAATGTGTAATTGTTTCTATTCTTTTAAACAATTTTAGTATTTACATAAGAAAT GTTAAAATTTTCTTAGAGGTGGTTATATTGTGATTTTGCACTTTTGCTTTTGATTGATTG TGTCAACTTGTAAAATTTTCAAGTTTATTATATACAAATAATATTGAACTTATGCAAAAA TATATCTTTATGCAACCATGAAATTAAGCACTTAAATTTTACATAAGCAAAGTATAGAAA AAGCTGTATTAAAAAATGAAGAGATGAAACATTCTAGTAATTTCACTGTAGAAACCAACA TGGTGAGGAATATTATTAATGACTATGATATTTATCTATTTATATTCATATTTATCCAAC ATAGGAAAACATCCTCTGAAACCTTCCATCTAGACTGCACCACATTAATTGCCTCAAAAA TGGGGAGGCTGTGTTTGGAATCCCCATACATGATTTTAGGAGTCAACCAAATGTCATTTT ACAAGAACATCAGAAAATACATTTTACCTAACATTTTTTTTTAGAAAACTATAATATCAA TAGAGCCAATCCTCATTTTAGTGAGAGGACTTTGAATTTACAATATCTTATATAATGATA AAAAATCTTACAAACTAAACTAACTTAATAGCTGAGTGAACTTTTTAGTTTTTACTTAAC ATTTTAAGATATATATATATATATATATATATACCTCCTAACGTTTATGAGTACATTGTT TTACAGTTTTACGTTTTTGTATTTGTTAAAATTCCCTTTTTTTTTACTACTGTTTAAATT GAAAATGGAAAAATCTAATTTATCCATAAAAATAATTATAAAATATTCAAATCTAAAAGA TTCAAATAAACCAATTTTAAGGGATCAGAAAAAGAGCTATATGAGAGATATTATAGTGTG GCAATTAGAATGTGAGAATTTTCATTGTTATTTCTAATTTTTCAATTTTATATGATGTAA TATTATATCACTTTTAATTTTTTACTGTGAAATATGAGGGGGCGGAAATGATAACAACCC TTGTACACTTCTAGATGAGTATTTGAACATTTTTTTTTTAATACAAAAGACTGTCGAAAC TTATAAAGATTAATCATTAATATAGTACAGTTTGAATGATTAGCACAATCGAAGATAACT AATTTTATAAGTAGAGACTCACATCCATACTTTGTGTTTTAATAGAATAAGAGTGAGGAT CGAATCCTTTGACTTATTAAAGTAAGGGAGATATTCAACCAATCCTATCTAGTGAGGGAT GAAATGAGTATTAAACAAAAATTGAAACAAAATTGGTATTATATATTTTGTAATGAAGAT TTAACAATCCGAAAATGAAGTCAAAAATAGATTATGAGAAAAAAAAATGGACTACCAGCC AAAAAAAGTGCTTCTAAAAGTATCCAAAAAGAGCAGCGGTAGGTCCAAGCACAGCCAAAA CGGGAAGAGCCAAAAGAGGTAAAAAACAGTCCAGAAGTAATTAGGCATACCATAATTGGA TAATTGCTACATATAGTATCCCATCTGTCACCTTTACAAATTATATCCTAATTTTGGCTT CACTTTCCTTCCATAGTCTGTTCAATTTCAGAAGCTTAGTTATATTTAGGGACCCTTTTC GTATATTTAATCATCATCATCTCCATTCTTGTTTTTGTTGTTGTTGTTCAAGGTGTGTTT GAGAGTAGAGAGAAAAAAAA
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>LITCHI008820.m1 GenomeSequence + AGTATCCCATCTGTCACCTTTACAAATTATATCCTAATTTTGGCTTCACTTTCCTTCCAT AGTCTGTTCAATTTCAGAAGCTTAGTTATATTTAGGGACCCTTTTCGTATATTTAATCAT CATCATCTCCATTCTTGTTTTTGTTGTTGTTGTTCAAGGTGTGTTTGAGAGTAGAGAGAA AAAAAAATGGGTAGAGGGAAGATTGAGATCAAGAGGATTGAAAACGTCAACAGCCGCCAA GTCACCTTCTCAAAACGCCGTAATGGGTTGCTCAAAAAGGCCAAGGAGTTGTCTGTTTTG TGTGATGCTGAGGTTGGTGTCATCGTCTTCTCTAGCACAGGCAAGCTTTATGAGTATTCA AGTTCCAGGTATGTATTTATATATCTTTCTCTTTTCTTTGTTTTTGTAATCTGGTTTCAA GTCATTTGATGTACATATCTTGTTTTTCATAAATCTGATTTTCATGTATGAGATCTACAA TTTTCTTTGATGATTTGGGATCACTTGATTGACTAGTAAACTTGTGACAAATTTATTATT AGTTTGGTCTAGGTGGTTCTAAGAACACAAAAAACACTACAGGTTTATCTGATAATATGT GGTTTGCAGGTGGTTGTTGCTCATATTTGGGGTTTAATCTAATTTGGATTTGTACCCATT TTGTTATTTGTTACCATATATATTATATTTTAAGAAATAGGTACCAAAATATATAAAAAT TTAGTTATGTGATAAACCCTAGAAAGGACTAAACGTTTTGGATCATTAAAAAGAGAAAAA AAAAAAAAAAAAAGCTTAATCAGAAGTTTGAGAAGGTGAAGTAATGAAGAACGGTGTAGA TGTCTAATCGTTTTTTTAATTTTTTAATTATATAAGATAAGTAGATGTCTAATTTTAGTA 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