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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001247Chr52497777024986102+MADS-box protein SVP

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001247.m12269PF00319.21SRF-TFDomain85.71.20E-24
LITCHI001247.m1101181PF01486.20K-boxFamily56.92.00E-15
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>LITCHI001247.m1
ATGGATGGACAGGGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGAGATC
AAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACATTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTT
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>LITCHI001247.m1
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>LITCHI001247.m1
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>LITCHI001247.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TCTTTCCAGAACTAGGTTTTTCTCTCTCCAAAAACCATTGGTAAATCTGGTATCCGATTT
ACTGTCAGGTGTCACCAGCTCCCATTTAAAGAAAAAACAAGGTGAGATTGAGATTACATA
TCTTTTGATCTAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGT
TTACTAATTAATGAGCTAGG
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>LITCHI001247.m1 GenomeSequence + 
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TAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGTTTACTAATTA
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TTTCCTTCTTTTTGCCATCTAGGGTTTGTATCAGTTTCCTTTTTTTTTCCCTCTATTATT
TTGGTTTTTGTTGTTGTTAATAATGAGCTTCTTTTTTTAGAAAACCATTTTTTATTTTAA
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TATATATACTTTCTCTACGATGATTTACATGCATCAAACCTCTTTAGGACTCTACAGTGA
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TTGATTTTGTTTTAAGGGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGA
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CTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCAAGGTCTCTCTCTCTGTCTCC
CTCTCTCTCCCTCTCTCAATCTCTTTTACTTCTCCGTCATTTTTCTTTCTGTTATTATGT
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TGTTTTGTGTGTTCGAGTGTGACTGTCAGAGAGAATCGATGAGGGATTTGGTGTAAATTA
GGATCTTTTTAGTTCAACAAAACTCTCGTTAATAAACAAGACTAATATAATTTAGGGAGA
TGTTAGTATAACCATGGAGGCATGCATTCTCTGGCAAAGAAACTTTTTGTTGTGAGTACT
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AAAGAGTTTCCCGTTATTCTTGTAATTTTAAATTACAACAGTTACTGTCTTCATCCTTTA
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TTATGATTGATTTGGGTATTGCTACTACTTTGTATATTGTTATTATCCTATTCAATAATA
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TTTGAATTTAATGGTAGTTTTCTCCCACCATTGAAAAAAAAAAAAAGTGAGGAGGGCACG
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AAATATAGGACTTCCCAACAAGCTGCTAAAGGTTTCTTTATATTCTAAATGCAAATTGTT
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GTTATAACAAGGATAGACTTCTCAGCTTGCTTTGTGCGGTAATTATACATTTAATTAATA
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GATGCCAAGGTAAACCCACTAAATAGTCTATTGAATTTGTTGATATATATGTTATAGGTA
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TGCTTAACAATAAATCAACCTTAGCTCTGTAAGAAATTGTTTAAGGCTTGTGTTATCGGT
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GTCCCAATTGCATTCATCTTTCATTATAATTATTGTTTTAATTCTTTTAATCTTTATTAG
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GCTCTTCAAATGTATTCCAATTAAAAGTGTCTAAATCAGAAAACCTTACGTACATCTCTC
CCTCAAACTTTCCTCTAAAGGTTATAGTGGTGATGACACTGACAGTGATAATGTTTAGGG
TATTTATTTGTCGCTGAAAAAGAATTAGATCAGATTTGGTGATGATTTTCACTAGGGTTA
ATTACAATTAGTTGCGTTCACTTACCAGACTACCACTATATTACATATGATATTTGTTAG
TTTACTTGTTACTGTTTGTTAAATGTGCAGGAACAACAACTGATGGATGAAAATCTGAGA
CTGAGACAAAGAGTGAGATATTTAATTATTTAATTCAATTAAAGAATTTGCATTTACTTG
TTTGATATGCTAATACACAACATTATATGTTTTGAAAAAAGATAAAAATAACCTACTTAT
TCACAGTTTCACTTTTCAATATGTGCCTAAATAGCGCATATTAACATCTTCCTTCTCTTG
ATCATATGCTTTTAAGATATGCTAATATGCATTATTATAATTTGATTTGTCAGACAGGGA
ATTTAGATTCACATGTACAAGGCCAGTCGTCAGAGTCAGTTACCAATATCAGCATCTTAG
GAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGCTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGGTAA