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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001247 | Chr5 | 24977770 | 24986102 | + | MADS-box protein SVP |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001247.m1 | 22 | 69 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 85.7 | 1.20E-24 |
LITCHI001247.m1 | 101 | 181 | PF01486.20 | K-box | Family | 56.9 | 2.00E-15 |
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>LITCHI001247.m1 ATGGATGGACAGGGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGAGATC AAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACATTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTT TTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGATGCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTC TCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCAAGTATGAAACAGGTGATTGAAAAA TACAAGATGAATATGCCGAATCTTCACAGATTCGATCAACCTTCTCTAGAATTACAGCTT GAATGCAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATTGCCGAAAAGACCCGTGAGCTAAGG CAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACGTAGAGGAGCTAAAGGAACTAGAAAAA TCACTTGAAGGAGGGTTAAGATGTGTGGCAGAAACGAAGGGTGAAAGAATTATGAAAGAA ATTAGTGAGCTCAAGATAAGGGAACAACAACTGATGGATGAAAATCTGAGACTGAGACAA AGAACAGGGAATTTAGATTCACATGTACAAGGCCAGTCGTCAGAGTCAGTTACCAATATC AGCATCTTAGGAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGCTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGG TAA
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>LITCHI001247.m1 GenomeSequence + ACTAGGTTTTTCTCTCTCCAAAAACCATTGGTAAATCTGGTATCCGATTTACTGTCAGGT GTCACCAGCTCCCATTTAAAGAAAAAACAAGGTGAGATTGAGATTACATATCTTTTGATC TAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAATCCTTCATTTGAAACTTTTGTTTACTAATTA ATGAGCTAGGATGGATGGACAGGTTTTCTTCTTCATTTCACTTACCAAACATTTAGTTTT TTTCCTTCTTTTTGCCATCTAGGGTTTGTATCAGTTTCCTTTTTTTTTCCCTCTATTATT TTGGTTTTTGTTGTTGTTAATAATGAGCTTCTTTTTTTAGAAAACCATTTTTTATTTTAA TCTTAGTTGCATGCCAGATTTCTCAGCATTTTCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTA GACTTCTTTTTAATCAATTTGATTGACTGATTTGTGCTAACATGTGCTAGATGTTACTTT TATATATACTTTCTCTACGATGATTTACATGCATCAAACCTCTTTAGGACTCTACAGTGA ATATATGTGTTACCGACTATATATAGCTAGCTGTTTGGGAATATAATATGTAAAGTTTGG TTGATTTTGTTTTAAGGGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGA GATCAAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACATTCTCAAAAAGGAGAAGAGG GCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGATGCTGAAATAGCTCTCATGGT CTTCTCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCAAGGTCTCTCTCTCTGTCTCC CTCTCTCTCCCTCTCTCAATCTCTTTTACTTCTCCGTCATTTTTCTTTCTGTTATTATGT 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