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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001247 | Chr5 | 24977770 | 24986102 | + | MADS-box protein SVP |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001247.m1 | 22 | 69 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 85.7 | 1.20E-24 |
| LITCHI001247.m1 | 101 | 181 | PF01486.20 | K-box | Family | 56.9 | 2.00E-15 |
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>LITCHI001247.m1 ATGGATGGACAGGGTGGGCTCGATTTTGTGGGTAAAATGACGAGACAGAAAATTGAGATC AAGAAGATCGACAACACCACGGCCAGGCAGGTTACATTCTCAAAAAGGAGAAGAGGGCTT TTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGATGCTGAAATAGCTCTCATGGTCTTC TCTGCCACAGGAAAGCTCTTTGAATACTCCAGCTCAAGTATGAAACAGGTGATTGAAAAA TACAAGATGAATATGCCGAATCTTCACAGATTCGATCAACCTTCTCTAGAATTACAGCTT GAATGCAATACCTATGCCATGTTGAGCAGAGAAATTGCCGAAAAGACCCGTGAGCTAAGG CAGATGAGGGGAGAAGAACTCCAAGGGTTGAACGTAGAGGAGCTAAAGGAACTAGAAAAA TCACTTGAAGGAGGGTTAAGATGTGTGGCAGAAACGAAGGGTGAAAGAATTATGAAAGAA ATTAGTGAGCTCAAGATAAGGGAACAACAACTGATGGATGAAAATCTGAGACTGAGACAA AGAACAGGGAATTTAGATTCACATGTACAAGGCCAGTCGTCAGAGTCAGTTACCAATATC AGCATCTTAGGAGATGTTCCTCAAGACAGTAACAGCTCTGATACTTCTTTAAAGTTGGGG TAA
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>LITCHI025308.m1 MKCFQYFKDKKFRLREDRSAPELKQERKSGDFSGADRVIKSSCSATSPRGIPELYEEKAH NLRVFTFSELRQATNDFNRLLKIGEGGFGSVYKGSIKPADGKGDPIFVAIKKLNRDGLQG HKQWVAEVQFLGVVEHQNLVKLIGYCAVDGERGIQRLLVYEYMPNRSLEDHLFNKAYSPL PWNTRLQITLGAAEGLAYLHEGLEVQVIYRDFKSSNVLLDENFKPKLSDFGLAREGPMAD RTHVSTAVVGTYGYAAPDYVETGHLTAKSDVWSFGVVLYEILTGRRSLERNRPKAEQKLL EWVKLYPVDSKKFGLIMDPRLENKYSINAARKIARLADSCLSKSAKDRPKMSQVVERLKQ IMQISDEGNPSDKSFELSEVDSDVSEPKADQYGPSESWKRRMAHLAKLGEHVEGASRRKL MIMQRAKVV. >LITCHI025308.m2 MKCFQYFKDKKFRLREDRSAPELKQERKSGDFSGADRVIKSSCSATSPRGIPELYEEKAH NLRVFTFSELRQATNDFNRLLKIGEGGFGSVYKGSIKPADGKGDPIFVAIKKLNRDGLQG HKQWVAEVQFLGVVEHQNLVKLIGYCAVDGERGIQRLLVYEYMPNRSLEDHLFNKAYSPL PWNTRLQITLGAAEGLAYLHEGLEVQVIYRDFKSSNVLLDENFKPKLSDFGLAREGPMAD RTHVSTAVVGTYGYAAPDYVETGHLTAKSDVWSFGVVLYEILTGRRSLERNRPKAEQKLL EWVKLYPVDSKKFGLIMDPRLENKYSINAARKIARLADSCLSKSAKDRPKMSQVVERLKQ IMQISDEGNPSDKSFELSEVDSDVSEPKADQYGPSESWKRRMAHLAKLGEHVEGASRRKL MIMQRAKVV. >LITCHI025308.m3 MPNRSLEDHLFNKAYSPLPWNTRLQITLGAAEGLAYLHEGLEVQVIYRDFKSSNVLLDEN FKPKLSDFGLAREGPMADRTHVSTAVVGTYGYAAPDYVETGHLTAKSDVWSFGVVLYEIL TGRRSLERNRPKAEQKLLEWVKLYPVDSKKFGLIMDPRLENKYSINAARKIARLADSCLS KSAKDRPKMSQVVERLKQIMQISDEGNPSDKSFELSEVDSDVSEPKADQYGPSESWKRRM AHLAKLGEHVEGASRRKLMIMQRAKVV.
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>LITCHI010386.m1 CGGGGAATGACGTAAGGCAAGGGAAGTGAGGCTGACAACAAGGTGGCGTAGGTTAAGGCG TGTGCAGTGCGTAGGTTTAAGTGGAGAGTGTACATGGGGTGCGCATATTTTCAAAGCTAA TTGCGTTGGGCTACTACGACTACTGGTACTAGTACTTTTAAGTGGGAACGCTTGGACGTT AACGTTTGACTGAATTTATGGATGGATGGTGGCGATTCTCTGCTGCTTCACTTGTGTTAT TATAAAAGCGCTTTCAAGTGGTGATACTTGGTTTCTTGATTTGAACGAAGCCCCGTTGAG GCCTTTTCATTTCCAGTGAACACAATTATTGGCGCCATTTTTTGCATTGATGCTTGGGAT GAGAGGCTGTTGAAGTCTGTTGTTTGGTAGAGTATGAGCTCTCAATCAAGTCAGCTAGCC ACGTTAAGAAGGATGAGCCTTTATGAGCCATTTCACCAGATTAGCATGTGGGGAGACACC TTTCAAGGTGATGCTAGCCCGAATACTGGTTCATCCACACTAGTGCAGGTGGATGCTAGG CTAGACAAAAAGTCTGAATATATTTCTCATGAATCAATGGAGCCTTCCAGAAGTGACCAA GAAGCAAATAAACCTGCTGATAAGATACAGAGACGTTTGGCACAAAATCGAGAAGCGGCT AGGAAAAGTCGCTTGCGGAAAAAGGCTTATGTACAACAACTAGAAACAAGTCGTTTGCAA TTAGCACAGTTAGAACAGGAACTTGAGAGAACTAGACATCAGGGTGTGTATGTAGGCAGT GGAATAGATGGCAGTCGCTTAGGCTTTTCTGGAAATGGAAACCCAGCAATTGCTGCATTT GAGATGGAGTATGGACACTGGGTTGAGGAGCAAAATAGACAGATATCTGAACTTAGAAAT GCTCTACAAGCTCATATAACTGACATAGAGCTTCGTATTCTGGTTGAAAGTGGCTTGAAA CATTATTGCAGTCTTTTCCGCATGAAAGCGGATGTTGCTAAGGCTGATGTGTTCTATTTG ATTTCGGGCAAGTGGCGGACGTCGACGGAACGTTTTTTTCAGTGGATTGGAGGATTCCGT CCATCAGAGCTTTTAAATATTCTCATTCCACATATTGAGCCCTTGACTGATCAGCAGCTT GTAGATGTTGGAAACCTGCAGCAATCTTCTCGGCAGGCTGAAGATGCTCTTACGCAAGGA ATGGATAAACTCCAAGAAACTCTGGCACAGAGCGTAGCAACTGATCAACGGAGTCAAGGC CTTTACCATTCTGAATTGGCTGCTGCAGTGGAGAAGTTGGAAGCAGTAGAAGGCTTTGTG AACCAGGCAGATCATCTTCGACAGCAGACTATGCAGCAGATGTCTCGGATCTTAACAACA CGCCAAGCAGCTCGAGCTTTACTTGCCTTGGGGGAATATTTTTACCGTCTTCGTGCACTT AGCTCGCTTTGGGCAGCCCGTCCACAGTTGGAGAGGGATCCTGATGATGAGCAGATAAAG AGTGCATATAGGCGATTGGCCAAATTCTATCATCCAGATGGTTTGTTCCGTCTTGTTAAC CTGTACATTTTGTTCATGTCAACTCTAGGGACTCTTAAGGAAGGGGAAACAGCTGAAGCT AGATTCATCAAGATTCAAGCTGCTTATGAGTTGCTCATTGATGAGGAAAGACATAGGAAA TATGATACAGAGAACCGAGTAAATCCAATGAAGCGGGGTGATATGGCCATTGCTGCTTGG GTGCAGCAGCAGCAGCAGCTTGAGCTGAATCTTCCTGCTCGACATCTTTCTCGTTCAAAG GTCGACCCTGATGAAGAAAGAAAAATCTTGGCAAGAGAGCAAAAGGCATCCAAGGAGTAT TTTCACAATACTTTTAAGCAACATACACTTGTCTTAAAGAAAAGGGACTTGATGAGAAAG AAAGCAGAGGAGGAAAGGAAAAAGGTTATCGGTCAGCTCTTAGCTGCAGAGGGCCTTGAG CTTGACATAGATGATGGTGAAGCAATTTAG
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>LITCHI010386.m1 - Up_Stream_Len 2000 AAGCCCCGTTGAGGCCTTTTCATTTCCAGGTGCATGATTTCTCTCTCTTTTTTTTTTTGC TTACGAACTCTAAATTTCTGTTCCTTTTGCTCCTTCCTTTACTGAATTGGATTTTTGTTA GTTTTATTTGATTTATGATTTATGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTATTCAGTTGTTTCTAG AACCTTTTTTATTTTGGTAGAGTGCTGGTTACTGAAGAGCTCTTTTACTTTTGGTCTGTG TTTTAGTGAACACAATTATTGGCGCCATTTTTTGCATTGATGCTTGGGATGAGAGGCTGT TGAAGTCTGGTGAGTTGCTCTGATCTTGATTGCTACAAGTCGATTTTGTGTTCAAGAAGT TTGTGTTATTGTTGGCAGAATCAGAGTCTTTATTACTCTCTCTCATATCACATGAACACG ACTGGCACCTGTCTAATTCAATATATTTGGTCTGTTTGAATAGCAAGTTGCAGATGTTTA TGTGGGTTATTAGGATATTCCTCGTTCCTGTCTTGTTCTTTGCTTATACATTGACTGCCC TTTCTGTTGGAGAAATTCTTTGGAGCCTGAAATTTTCTGACTTGGGATGGACAAGACAAG CAAAAGTTTCATAATTTGGGAATACTAACTGTCTACTTTTAATCAGTCGTGAAGTGGTTG TGTTGTCTGTCATCCGCAGTATCGAAAGTCATTATATTACTTGTTTGTAACCAAGATACA TGATGAGGTAACGATCAGTCTTCGTCGAATTTAGAAAGGAAAAAGAAAGTTGTTTTGGTT CGAGGTGGAAAAGAGAAGCAATATTTGTTGTTAAGTAGCCTTCCGCTATTGGTCTTTCTG CATCTATAGCATTTCTTGAGATAAAAATTGTGGTTTTAGGAGAAGCAGAAGTGGGAGAAC TTACAACAGAAGCATCATGCTTACCTTCTTTTGTGCACTTTCTCATGGTATCTTATGTTA ATATTAGGAAATCTCACCAAGTTGGAGAAAATACACATCGGTTATAATAAATATAACGCC ACCTTTAGGCACTCAACTGAGTTGTGGATAAGTTATTTTCTGACATTTTGAATTGCGAGT AGATTTTGCTTAGGAAGTATATATCATAACTTACAGTACCCATGAAACGAAATTCTTCTC TGAGAAACTAAAAGAAAATCAGGATCAAAGGTTCCATATGGCTTCCAAAAGTTTTAGTTG TCCAAGTCTGTTTAGGTTCCAAATCAAAAACAACAATGGCCTGTTTCAGGGGTATCTGCA TTTAGTTGTTTTCTTAATGAAAGTAAACAAACCCAGTTATTCAGTTGTCCATATTTGTTT CAGGTTCTCCGTTTGTAATCGAATCTTGTTTTTAGTTTTCATTTTTGTTTGTTTTGTTGG TAGATTTCTGGTTCACATTTGTAACTTCTTTCTTTTTATTAATAAAGTCTTAGTTTCCTA TCAAAATAATGATAATAATAATGCGTATAATTGTCCAGCGGAAATCATAAACTAAAAGTT TTTGCTGAATCTCTTGGAGTATAAGTAGGTAAGGCTGAACTTGGTAAAGAACCTACTCTC CAATGTAATTCTACAATGATTCTGGATGACCTCCATCTGTAAAAGTATTGCTTTTTCTTT CTGTATAACCTAACCGTTGAAGAAATTTAACCTTTCATAGTCCAGCAAACAAATGTAAAG TTTATGCAGTAATAACATCGGTTTCTTCATTGATTAATATTTTATTGGTGATTATATGGA GGAAAGCTGAACCTTTTTAGAATTTAGCTGGAAACTGGAATGTTGTTGGTTTAGTTTTGT AGACCTTACTTTTTCTTCAAGACTATGCTTCATTCTGAACTATTTTTGCTTGTCTTGCTA TCCATATTTTGACTTTCAATGATATCTTTTTGTTTCTACTTTATGGAGACAAGTCTCAGT TAATTTTCAGCAATCCATTTAATTTCAGTAAATTAGTTTGTTTTGTTTCTTTTTTCCATG TTTCAGTTGTTTGGTAGAGT
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>LITCHI010386.m1 GenomeSequence - CGGGGAATGACGTAAGGCAAGGGAAGTGAGGCTGACAACAAGGTGGCGTAGGTTAAGGCG TGTGCAGTGCGTAGGTTTAAGTGGAGAGTGTACATGGGGTGCGCATATTTTCAAAGCTAA TTGCGTTGGGCTACTACGACTACTGGTACTAGTACTTTTAAGTGGGAACGCTTGGACGTT AACGTTTGACTGTAGCGCTCCATAAAGCACTCTTTTTCATTTGCTGTTTTCATTATCAGA TTGTTTCGATTCCTGTTACTTCGGGTTCTTTTGTTTTTTCTTTTCAGGAATTTATGGATG GATGGTGGCGATTCTCTGCTGCTTCACTTGTGTTATTATAAAAGCGCTTTCAAGTGGTGA TACTTGGTTTCTTGATTTGAACGAAGCCCCGTTGAGGCCTTTTCATTTCCAGGTGCATGA TTTCTCTCTCTTTTTTTTTTTGCTTACGAACTCTAAATTTCTGTTCCTTTTGCTCCTTCC TTTACTGAATTGGATTTTTGTTAGTTTTATTTGATTTATGATTTATGTTTTGTTTGTTTG TTTGTTTATTCAGTTGTTTCTAGAACCTTTTTTATTTTGGTAGAGTGCTGGTTACTGAAG AGCTCTTTTACTTTTGGTCTGTGTTTTAGTGAACACAATTATTGGCGCCATTTTTTGCAT TGATGCTTGGGATGAGAGGCTGTTGAAGTCTGGTGAGTTGCTCTGATCTTGATTGCTACA AGTCGATTTTGTGTTCAAGAAGTTTGTGTTATTGTTGGCAGAATCAGAGTCTTTATTACT CTCTCTCATATCACATGAACACGACTGGCACCTGTCTAATTCAATATATTTGGTCTGTTT GAATAGCAAGTTGCAGATGTTTATGTGGGTTATTAGGATATTCCTCGTTCCTGTCTTGTT 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