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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001246Chr52494428924955215+MADS-box protein SVP

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001246.m11057PF00319.21SRF-TFDomain85.81.10E-24
LITCHI001246.m189169PF01486.20K-boxFamily57.21.60E-15
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>LITCHI001246.m1
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TTCTCGAAAAGGAGAAGAGGGCTTTTCAAGAAGGCACAGGAGCTCTCAACTCTCTGTGAT
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GATGAAAATCTGAGACTGAGACAAAGAACAGGGAATTTAGATTCACATGTACAAGGCCAG
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>LITCHI001246.m1
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>LITCHI001246.m1
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TTGATTTTTGCTGGTTTTATCAAGAGATTATTTCTGAGTATTACGAT
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>LITCHI001246.m1 +  Up_Stream_Len 2000
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TATTATTTATTTATTTTAGTTAAAGCGTGAGTATTATATTAGAGGTAGAAGAAATTTTAA
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GTAAATCTGGTATCCGGGTTATTGTCAGGTGTCACCAGCTCCCATTTAAAGAAAAACCAA
GGTGAGATTGAGATTACATATCTTTTGATCTAACCCAATCCCTATATCTACTATTCTAAT
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CTTCATTTCACTACCAAACTTTTAGTTATTTCCTTCTTTTTGCCATCTAGGGTTCGTTTC
AGTTTTCTTTCTCTCTCATTTTTTTTTCTCTATTATTTTGGCCTTTGTTGTTGTTAATAA
TGAGCTTCGTTTTTTAGAAAACCATTTTTTTTTAATCTTAGTTGCATGCCAGATTTCTCA
GCATTTTCCATATACAGAAATATTCTCCCACTTGTAGACTCCTTTTTCATCAATTTGATT
GGCTAATTTGGGTTAAGATGTGCTAGATATTACTTTTATATATACTTTCTCTGTGATGAT
TTACATGCATCAAACCTCTCTAGACCTCTATCTTGAACATATGTGTGTGTTACCAACTAT
ATATAGCTAGCTGTTTGGGAATAAAATATGTAAAGTTTGGTTGATTTTGTTTGAAGGGTG
GGCTCAATTTTGTGGGTAAA
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>LITCHI006535.m3 GenomeSequence - 
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ATTGGAATTTTGCTTTACAGCTAGAACTTGGAGTGGTGAATAAGTTTTGATTTTATTTAA
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TGACACGTGGAGACATATAGACTGTTGGATGATAATTCCATTTGAAGGAGAGGTGATGAC
AAAATCCATAGCCAACGAAGAGAGACAGTTAACTAGTTCAGTGTGCTTTCGTTCTACAGA
CACCAGAAGCGCTTCTGCCAAAGCTCTTCACACACAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAGG
GTGGGGGGTGTGGGGCAATAGAGAGATTAAATTGGGATAGCTGCTGCACCCAGAGACAGA
GAGAGAGAGAATACATGACGATTGACGGCTGTTGCAGAAGAGAGAGTCTGCTAGCTGCTG
GTTGGTGCTTGCTTGCTTGTATGTGTATATGTGTATGTTGAGTATTTATATGTGTGTGTA
TTTAATTGAAAAAGGAAAATTAAATGCCAACACAAACACCAACACCAATATTTTGAAGAG
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TTTCAGCTTTTGAAATTTTCCTTTCTTCAATTTCTTCTCTCAACAACAGCAAGCAAGCAC
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GATCAGGATTTTATTATGGATTTTATCTCACAATTGGGGTCTGAGTCAGGTTTAGAGGCG
GAGAAAACATGGCTGGGTTGTTCTCACTAGGTGGTGGTGCTGGAGGAGGAGGTGGAGGAG
GAGGTAGAGGATCAATCAACCGCCACAGCAACGAAGACGACGACGACCAAAGAAACCACA
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AACAACAGCAGCAGCAGCAGCAAGATCTTTACTCTACAGCGGCTATGTTAGAGATGGGAC
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TGATGGGAAGCGGAGGTGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGTGTTAGTTGTCAAGATTGTGGAA
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GTGGAGACACCAACAACAACAGCATCACTAAACGACTCAGAGAAAACAACCCCACCTCTC
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ATATATACATACATGTCACTACTCTTTTCAAGAATTTGGGGCCATATTGAAATGGACCTC
CCTCCTACATTACCAGCAGTTTTTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTCTCTCTTTTTTCTTTA
CAATCCTGTTGGTAATCCTGACGAGTACTGGATTGACAAGGAAGAGAATTGTGTGAGTGT
GTGCGTATCTCTGTCTTCGTGTAGTTATCTATGTAACAAAAGTGTGTGTGCTTGCATTTG
TGTGCCATTCTTTTTATTGTAACATGGGGAAAAAAAAAGAAGAAACTGAAATATATATAT
GTATATATATTTGTTTACCTTATAATATGAAATATGTATGTATACATATAATTCTAATGT
TTTTCGGGGTGTTTTTAGGGTTAGAATTAGGAGGGAAGTATCCGGCAGAAGCGAGCTCTC
AAGCTGTATTCAGGTGCGTACGAGTGAGCAGCGTTGATGACGATGAGGACCAGTATGCAT
ATCAGACGGCTGTGAGCATAGGAGGGCATGTATTCAAGGGAATTCTCTATGATCAAGGCC
CTGAAAACAGCTACATGTCTGGTGGTGAGAGCTCTTCTGTTGGTGGTGCTGTTCAACAAC
AACATAACCAACCACTGAATCTCATAACTGCTTCTCCCGCCAATGTGACCACCACCGCCG
CCGCCGTCACCGCCACAACCGCAGGTAGTGGTGTTGGTGGTGCTGCCTCTACCGCATTTT
TAGATCCTTCTTGTTTGTACCCAGCTCCACTCAACACTTTCTTCGCTGGTACGCAGTTCT
TCCCAAGCCCAAGGTCTTGATGATCACCATCATCACTACTACTCTACACTTCACAAAGCT
CTCACTATAAATGCTCTTCTTTTTCCTCTCTCGTCCACTTCTCTTCTTATAATCTAGATC
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AGTAGGAGTAAGTTAAAAAAAAAAATGAAAAAGTAGATTATGTTTGTCATCTTCAATTTA
GTCCAAAATTTAAAGCTCAATTTAGATTACACTTTATATATATATAAATATATATATATA
TATATATAATTTCTTTGTTCTTATAATTCCACTTTGAAATCTCAATCGAAGTTGTTTGTT
TGTTGATATATTGTATGAGATGGGCAGGCATCAGCATATGTTGCGTAGAGTGTTGTTCTT
TGGCAGTCGTTTGTCTGATTTATTTTTAAAAGAAAATCATCACGTTGAATTGTCTTCAGG
GTCGAAATTTCCGTTATAGTTTCTAGTTAGATTTGAATTCTCTCTTTCACAGCTTAGCTT
TTTTCCTCTTTACCCGTATATTTGCCGGTTTCAAATAAATATATATTATGGTTTCGTCTC
TGCTTGTACAAAGTACACCAGCTATATATC
>LITCHI006535.m1 GenomeSequence - 
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GACGATTGACGGCTGTTGCAGAAGAGAGAGTCTGCTAGCTGCTGGTTGGTGCTTGCTTGC
TTGTATGTGTATATGTGTATGTTGAGTATTTATATGTGTGTGTATTTAATTGAAAAAGGA
AAATTAAATGCCAACACAAACACCAACACCAATATTTTGAAGAGAGGATTCATCAGGAAA
AGAATTGAAGAGTGCCCTCCAAAAGCATTCGACGTGTGTACCTATTTCAGCTTTTGAAAT
TTTCCTTTCTTCAATTTCTTCTCTCAACAACAGCAAGCAAGCACTAATCGACAACTGTTA
AGTGCTTTTACTGTTTTTAAGTGCTTTCTTTATTTTATTGTATTTTATTTTTAATTTTCG
GCTTTTGGAGAGGAGGAAGAGGGACAAGTACATACGAAAAACAAAGAAGAAGGAACAATT
TTCCAATAATAGAAAACAAAGCTCGAGCTGGTCAGTACTATATTTTCTCTAAAAGAGAGA
AATTATTTATAATAATGATTTCCACATGATGTTCTGGTGGTGGTGATCAGGATTTTATTA
TGGATTTTATCTCACAATTGGGGTCTGAGTCAGGTTTAGAGGCGGAGAAAACATGGCTGG
GTTGTTCTCACTAGGTGGTGGTGCTGGAGGAGGAGGTGGAGGAGGAGGTAGAGGATCAAT
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GGAGGCGTGGTTTTGGTGTAGAAATGAAGACTATAATGTCAAGGGTTTCGAGCTATGGCA
ACAACAAGAGCTTCTTCATCAGAGAATACTACATCAACAGCAACAACAACAGCAGCAGCA
GCAGCAAGATCTTTACTCTACAGCGGCTATGTTAGAGATGGGACCCAGTAGGAGTTCAAT
CAACGTCCCGGATGTGTCCACGTCGTCGAGATCGGCGTTCATGATGATGGGAAGCGGAGG
TGGTGGTGGTAGTGGTGGTGGTGTTAGTTGTCAAGATTGTGGAAACCAAGCCAAGAAAGA
TTGTTCTCACATGCGGTGCAGGACTTGTTGTAAAAGCCGAGGGTTCGAGTGCGCAACACA
TGTTAAAAGCACTTGGGTTCCTGCCTCTAGGCGCCGGGAGAGGCAACAGCAGCTCGCTGC
TTTGCAACAACAACAACAACAACTCCAACTTCAACTTCGTGGAGGTGGAGACACCAACAA
CAACAGCATCACTAAACGACTCAGAGAAAACAACCCCACCTCTCCTACTACTCTAACCTT
CACTCGTATACAGACCGACGCCTCAGGTACACACACACACATATATATATACACTGTTTT
GTTTCTGTGTGTTGGGTTGTGTTGTCTCACGCTTGCCTTCAAAGATATATACATACATGT
CACTACTCTTTTCAAGAATTTGGGGCCATATTGAAATGGACCTCCCTCCTACATTACCAG
CAGTTTTTTTTTTTTCCCCTTTTCTTTTCTCTCTTTTTTCTTTACAATCCTGTTGGTAAT
CCTGACGAGTACTGGATTGACAAGGAAGAGAATTGTGTGAGTGTGTGCGTATCTCTGTCT
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TTGTAACATGGGGAAAAAAAAAGAAGAAACTGAAATATATATATGTATATATATTTGTTT
ACCTTATAATATGAAATATGTATGTATACATATAATTCTAATGTTTTTCGGGGTGTTTTT
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GTCTGGTGGTGAGAGCTCTTCTGTTGGTGGTGCTGTTCAACAACAACATAACCAACCACT
GAATCTCATAACTGCTTCTCCCGCCAATGTGACCACCACCGCCGCCGCCGTCACCGCCAC
AACCGCAGGTAGTGGTGTTGGTGGTGCTGCCTCTACCGCATTTTTAGATCCTTCTTGTTT
GTACCCAGCTCCACTCAACACTTTCTTCGCTGGTACGCAGTTCTTCCCAAGCCCAAGGTC
TTGATGATCACCATCATCACTACTACTCTACACTTCACAAAGCTCTCACTATAAATGCTC
TTCTTTTTCCTCTCTCGTCCACTTCTCTTCTTATAATCTAGATCAAATATTTGATAATGT
TATTGAACTTGAACTACTTGGTGATCATACCACCACCCCATTTAAGTAGGAGTAAGTTAA
AAAAAAAAATGAAAAAGTAGATTATGTTTGTCATCTTCAATTTAGTCCAAAATTTAAAGC
TCAATTTAGATTACACTTTATATATATATAAATATATATATATATATATATAATTTCTTT
GTTCTTATAATTCCACTTTGAAATCTCAATCGAAGTTGTTTGTTTGTTGATATATTGTAT
GAGATGGGCAGGCATCAGCATATGTTGCGTAGAGTGTTGTTCTTTGGCAGTCGTTTGTCT
GATTTATTTTTAAAAGAAAATCATCACGTTGAATTGTCTTCAGGGTCGAAATTTCCGTTA
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TATTATAATAATAATAATAATAATAATAATACTCTCACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
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TAGAATTGAGATGCATAGATGTGACCTTGATGATAAAATGGGAAACATTGCATATCACTG
CTCTCATTGATTAATGCACACACAGCCTGTAAGAAAAGTAGAGTACGTATATATATGTAT
ATAATTACACATTCTGTGTCAAAAGAAAATTTTTGCATATTTATGTATATATACGTTGCA
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TCCATTCTCTTTGCCACTTTGAGCACCTGTACACAGTTAAAATTATTGCTTCTCTCTTCC
CAATTAACCCCACAAATCAAAAAAGTAAAAGGGTTTTTCTTTTAAAAGAAAAATATGAAC
TGCTTTTCTTTGGTGTTTAAATTCACTTCGGCATGCTTATATAGTATATTTTATTATATC
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GTTTGCTATTGCTAATTAATAGGTTTGATGGAGTGTGGTATTAGGGAATAAGATCTTGTG
TGGTATTAGAGAATAAGGTCTTTTGCTTTGAGAATGAATATCACTCGCGTCAGAGTTTAG
AGAGAGGTTTGATTTATATATTTTTTTAATTATTATAACATAGCATATTATTATGTTTTA
AGGGTAGTTAAATTATTGCATGTAAATTTGATCTAAGAAATCTTTCAAAAACTAATTTTT
AGACTTGGCTTAGATTGTTTTCTACATCTACCTATATATGTATTATGAAATTATATTCAA
AATCAGCATACATACATATATATATATATATATATATAAAACTTTCTTAGTAGATGATAT
AAGATTAAAAAATTTGCCAAATCTACTAGAAAATACGACTAAATTGGGGAACAAAAAGAT
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TTATATGTAATTACACATAAAATAAAGAGTAATGCTAGACTTCCAAAAATTGTATCCAAA
TTCATGCCTAAATGATCTAACATGTGAGTTGTTAACATCTTGTAAATCATGAGATAATAT
GATAATTAATAGGATCTTGACAACTCACCTACCGCATCATTTGGGCAAAATTTTAGGAAA
TCTAATATTACTCTAAAATAAATGAAGTCACTTGTTAACCATGCATGAACATCAGAGGTA
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TGCGTCCAAATATTTCAAAAGAAAAACCAGAACTCCAGTTACTGCTTGTTCCAGTAATCT
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AAAAATGTCATCACTCAAGTTTCAATTCATAGACGTCTAGAAGCTTTATTACTCTCTTCT
AGTTTTATATACAGTATGATGAGGTTAGCTAGCTATAGGGCCTTTAAAATCCTATCTAGC
AAAATATGAATCAAGCAAAAGTACATTTTCCCATGTGATTTCTCATAATGGATACCAGTG
TGTATATGAGTTTTTATAGTCTATAGCTAGTTTATAAACTAGCCTTTACATTGTACATTT
TGTGGCATCTAGGGAAAATGATGAGAACTTTTCTTATGAATGCTTTGGGAGCCATTTCAA
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ACATGAAAAAAAAATGTTTTAGAAACATTTATGGAAATTTAATTAATGTATCTATGCCAG
AAAAGAGTGCAGTATAGTCTCCTTTTAAATATTAGCTAGAATCGAATAAGCATGCTTTTG
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GTGAAGTGGCGAAATGTTGTTCCGTCTACATTTTCTAGTTAGCTAGATAAGGCTTCAAGA
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CTCTAATTAGTACATATGGATTGAAATCAGTTAGACGACTAGAAGATCTATTAACTAATA
TAAATAGGATGTTATGGTGGTGAAGTGGCGAAATGTTGTTCCGTCTACATTTTCTAGTTA
GCTAGATAAGGCTTCAAGATAATTTTGTGAACTATATATGTTTGAGATGCATAGGCCATT
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AATCTTGGACTATATATCTTGTGTGTGTCTTGTGGTTGTGTGAGATATATGTAGTTCAAC
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AATGCGGTCGTATGCTTGATTGATTGCATCTGTCACCTATAAGTTTATAGGAAAGTTTTG
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ATAACTTTAAAAAATTAAGATGAATCAATCAAATTTATCCAGTACCTTTGAATTAACTTG
TAAAACAAATTCTCTCTCATATTTAATTCAAATGTGAATTTAATTGGTTCATTTTAATCT
TTTGAAGTTATGAGATATTGATAGTAAAATTACATACTCTTCTCTCTGTATATATTATCC
ATTTTGAGATCCATCATATTTTTTCGCGCGTGATTCTAATTTTGTGTGGTCATAAAACCA
TTTATTGCATCTTATTAACAAGTTTGTGATAATACAAAATCAGGATTTTATGAGAAATCC
CGCCCCCCAAAATTTCTATACATACAGCTAAATAGAGGGATCTTTCTTATTAAATTAACC
CATTTACATTTTAAATCTTAAATCTGTTGTATCCACATATATACAATGGCTGCCAACACA
GTAATGATATTGTTTTAGCATTTATTCAATGCAATCATACTTGTTCAATATTTCAGGAGA
GCATTTGGGAGCCTGGAACAAGCCAGTAGATCTGTTATTAATTTCCTTTAGAGTAATTAT
TTTGGGCACTGGGCAGCATTCCTTTTCAGTACATGTTTGAGTCGCCGAAGAAATCAATTA
TAATCCTAAACTTAAATACAAATATTTATTTTCTCCTTAGAAGCCCCTCATTTGAATTTA
TTTTATATCAAGAATTGATTCTATTATTAGTCCTTCTAGTTGGGATGAATTGGGGTTATA
TTCTATATTGTCTTACAATCCGCAGAAAACTTGTAGTATTGCCGCTAACTCCACAAAGGA
AAAAAAAAAAAACTCATTAATTAATTATATAACACCTACATGAGCCTTGCAGTCCATGAA
AGCCTCCAATGGCCAATATGTTTAGACATTGCTTCGAAGTCTCTATTTTTCAATATATTA
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GTTGTTCTAGCTAGCAAGAAACTATAACTAAACTGGTTTTCAAACGTAAAATCATTCACA
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ATTGGGATGTGACGGACATGTAGTTGATGTGTCTCTCACCTAAAACTGAAAAGAAATGAT
ATTACATTTCAACAGATGATTAGGAGAATGTCCCCCTATATTTTCCATGTCCAGAAACTT
TCACTTTTCACGAATTCTCATGTTGGCTACACAAAAGAGGAATATTGTTCCTCACACCCA
CTATCTACTATAGCAAAAACTTTCATTTTTGGCTGCAAAACAAATATGCTACTCATCCTC
TTTTTTTTTTTTGGTTTAATATATATATATATATATGTATATAGATTGGGGAGGTGATTT
GATGAGTAAATTAAAGGCCATGGAAAATGTGTGTGCGTGTGTATATAATAAACAACCATT
TCTAATTTAACCTAAATTATAAACCTTTTTTGTTAAAAAGAATTTAAAAAAATACCAAAG
AGGAAGAGGAGCTCATGCGTATATGAATTGTTCAAAGGAGTGAGAAGTATATGCACACCT
CATGTATGATTTATTTCTTCAGCTGAAGTGTATGCATCAAAACCTTCGACAGTGCCAGAT
AGATATAGCTGAACTCAAACTTGGATTGTGCTTGTCATCACCCATGTCTGCTTCTGTTTT
CTACTGTTGTGACTCGTGAGTTGTCCCTAGACTTGATGAGAAGGCAAATAGAGAACCCCC
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TTGGAGAAAGACTAAATGTTTTACAGTGGTCGATGGAGGTCCATGATTTTGTACTCCTAG
AGATAGGGAGAGAAAAAAGAGAATGAGAAAGAGTGAGGGTTGAATTGGATTCATAATTTC
ATATACCACAAAGATTTAAAAAAAAAACAAAAAACATCTTAAAAAAATTTCCCTTACAAG
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GTAGGTGTGTGAGAGAGAGACATTTCTAGGGTCAGGCCACAGAGGAGATAGATAGGAATC
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GGCGTGGTCCCAGTCAGAGAAATGCCTCGGCTTTGTTTTCAAAAGCTTGTTTTTGCTCCA
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GTGTGTGAGCTACCGTGCTGTGTACACCAAAAATAAGTAGGAAATAAAAAGAAGAACAAA
AAAAAAAAAAAAAAGGGTTCAAATACGCTGTACATAGAAGCAATTCGATCGGGAAAGTTG
TAGCCTTTGGGACCAAAGAAGGCTGCAAATATTGTGTTTTTAGCAGTGATTTTTGGTACA
ATTCGTCAAGCCAAAAGCTTACTTCTCTGTGGTGTCTCACTTCAGTGGGGCTAATCTGAT
GTGTATATTCTTTCTGTTGTGGAAGCTCTATATATGTGCACGCTTGACTCAAGTTTGACT
GCCGGTGATGAAATAAAAATCTTTAATATATATATTACTAAAATTTATGTCTAAATGATA
TGATATGTGATTTATCGAGATTTTATTAATTAAAACAATGTTATGATTTATAAGATTTTG
ACAAATCATATGTCATATCATTTGAGTATAGATTTGAATAAAATTTGTAGGAGGTCCTAA
CATTGCTTATATATATATTAAACTGATTAATTAATACCAATATAATACTTATTAAAAAGT
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TTCAGTAGTTATATACATATATATATATATATATATATGAATGATCATCTGTTAAGGTTT
CTAGGTGAAAAGTCTTGGGATCGTAATTAGTTTTTACGTATCACTTCTCAAGGAATATTC
CCTTCAAAACTTTCACGAACTTGCAGTTATTGCTTTTATCAGAAACAATAATGGGAAGGT
GAGGATATTCTCTATATATGTTAGTTGAATTGAAAAAGCTGTTGTAATCTTGAAGTAGAA
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GCTAATTAAGGGTACTCTAGAAATAATTTACCTTTTCATAATGTTCCGGTTGATTTGATT
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CGAGTCAGTTTGTCATTCTTTAAACTTATACGTCCTCCTTGTTCTTTGTAGGTCAAAGTT
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GGTAGCGTTGGCACTTTTCTTGGTGACTTATCTTGGTTCTTTGCGTCTTAAGCCTGCTTT
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GCATCGATTATGGATTAAAACAATAAATTCTCCATCTTTGGTTATTTATTTCAATATTTC
TCAGTTCCTCCC
>LITCHI006535.m2 GenomeSequence - 
AAAAAAAAAAAAAAAAGGAGGGTGGGGGGTGTGGGGCAATAGAGAGATTAAATTGGGATA
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