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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001217 | Chr5 | 24475550 | 24477128 | + | Agamous-like MADS-box protein AGL80 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001217.m1 | 11 | 53 | PF00319.21 | SRF-TF | Domain | 55.5 | 3.20E-15 |
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>LITCHI001217.m1 ATGGCGAGGAAGAAGGTGACTGTTGCGTGGATTGCGAATGGCAGTGCTAGGAAAGCGAGT CTCAGGAAAAGAAGGGCTGGGTTGGTGAAAAAAGTGCGTGAACTAAGTATACTTTGTGAT GTCGATGCTTTCATTGTTATTTATAGTCCAGATGAAAAGGAGCCGACGGTATGGCCTTCT CGCTCGAAAGTGCAAGAGATGATCACAAGGTTTGATGTCATACCAGACATAGAGCGAAAC AAGAAGATGATGAATCAGGAGACTTACTTAAACGAAAGAGTGAGCAAAGCGCAAGATAAA TGTCAGAAGCATGAGAGGAAACACAAGGAGATGGTGGCCTCCAATCTTTTGCATTATATA TATAAGTGCAATGGACTTGATGAACTCAGTGTAGCTGACCTGCATTCTCTTATTTGGTTT GTTGAGGAGAAGCGCATGGAAATCAGTAGAAGGATTGAATATTGTAAGCAACCTCATGTC TCTCCTGATTCTTTACTGCATGGTTTTTCTCCCCTTCCTGCTTCCGCTACTTATGATCCT AACATCGGTGGAGACAATATCGGTGTCTCAATTCATGATGATCATCGTGAGAAGGCTCTT GTGGCGTCAGATTTTTCGTGTGATCAATGGTTTAATATTGATATGATGAACAACCCGCAG GCTATTGTTGGGAGTAGTATCACGGTTAAGTCTAGTCATATGGTTGGGTTGAGTACTGCC ATTTATCAACCGTTTGTTGAAGATGCAAATAGTGGAAACCAATTGGGGTTGGTAGGTCAT GCGAATTATGAAGCCTATTTTGGTGGTTCAAGTGGTACTCCTGAAACTATTGTGGGGCTA CAACAACATACTGGAAATTTGGAAGCCCTGAGTAGTGGTAAAAATGATATGCCCTTATTG CTTCCACCACCATCGGTTCAAGTTCGTGATGACAATGGAAATGATATTTCTTCAGGGCTG CAGCATTTTAGAGGTTACAGAGGGGTTGGTACTAGTGGAAGCGATATGGCCATTAGGCTG CCATTGCCTCATCCTAAAAGCAGTGGTTACAGGAGTGATATTGCTTTTGAATATTTGGTT CAT
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>LITCHI001217.m1 + Up_Stream_Len 2000 GGCCTAAATGTATACAAATCTTGACTACCTAAATAAAAAAATCTTTCATATTTAAAAACT TTCTAAAATTTTTATATAATCCTTACGTACAAAATCCCTATGAATAAAGTTACCAAATTA AAAAATTAAACTAAGAAAATGGTTTCCTAGTCCAATAGAATACTTATGCCTAGACCTAAT ATTCATTTATTTAAAAATCAAACTACGATTTTCTAAACTCAAAATGATTTTTTAAAGAAT ATTTTGCAAAATAAAGAGTTTGAGTTAGATTAGAAATCTTGTTATAATAGGAATTATCAA ACTAGGAATTATAACAGCATAAGGAATATGAACATGACTTTGTATAAATTGGTAATCAAA GTCAACGAAAGTATATAATATTAACATTAATAGTTACTAAATCTATTTATGAAGTTAATC AGAACGTAAACAAAAGTGTTATTATTAAAATTCACTCACAAAATAAACACCAGTAAAACT ATTAAATCATTCAACCTATAAACTCTGAGAAGTTTTCTAACTAAGATATCCTAGATATAA GATTCAAATACTAAGAATAGAATCTTAAAAATAAGAATAAGGCTATACATTAAAAAATTT ATCCATAAATTTTACCCCCATAATATAACAAGTTGATATATAGTTACTGATGATGTATTG ATGATTGAATAATTATATATAGATTTGCCACATTATTTAGACGGATTTTTGGATAGTATA ACATTATTTTAAAAATCATTCTAAAGATATGAATATAGAGTAAGGATTTTCTGTCAATGT TGACATGATACTAAAATTTTATAAAAAGAATTTAAGTTTGAGTAATGTATGAAAGAAAAA ATGACTTTTAAAAAAAAAAGTCATTTTTTTTTAAAAATGACTTTTTTTTTAACTCATGAA TATGAGTAAAAAATTAATTAGGTCTTTCTTTTATTAGTCATTACAAACTCAGGCATATTT TTAGTCATCCGAATATGGCAACATATACACTCAAGGGAACAACATATGGTTGGTCCAATC TAAATTTTTTGAGTAGGTTAAATTTGACTTTTGTTATTACCTTTTTTAGTTAAAACAATT ACTCTTTATATGGTTAATGAACAAAACTAACCAAATGTGCATATTACTAATTAAACCATA TATAGGTAATCATTCACTGGATATTGTATGTTACAAACAATCAATTAAATCTTACTTAAT ATGAGAATCCATAAAAATGATTTAGATGTAAAAATTAATTAGGTCTTATCTGTTGAGATA TATAAATTAAAAAATATACTTAATCTTGCAATGATCTAATGATAAAAATTGTGTATGTGA GTTGGTCTGTCAAAATTAGATACCTAGCATAAATAATAATGAATCATCTTACCATATTGC CAGCAATAATTTAATGAAGCATAATTATCTTAGAATGTGACAAATAGATTTCTTAATCAA CATATATAATCTATATTGTATATTATGTAAAGAATGATATTACATTACCTAAAAATCTGA CCAAATTTATTGTTCAAATGATGTAGCAAACTTATATGTAACCAGCACATCATTAATATA TATAATTTTAAAATTAATATAGTAACTACAAATAAACTTGTCATATTATTTGAACAAAAT TTTTGTTTAAATTTTTTTGGAAATGTAGCATTATTTTTAAGTAAATTACCTAAACAGTCG CCCCATGTCTAATTTTAAAAATTATGGGTGTGAGTTGGTTAGTGAAAATTAGAAACCTGG CATAAATAATAATGAATCATCTTATCATATTGCCAGCAATAACTTAACCAAGCATAATAA TCATCTGAGAATGTGACAAATATATTTCTTAATCAACATAAGCTACATTACCTAAACTGT GTATATTACCTAAATAAACCTCCCATGTCTAATTCCCATTTTGCCCTAGAAAGAGCATTC TCTTTCTCTATATAACCTTGTTGATGGATAAAGCAAAAATCACTCTACAAAAGATCATAG ATTTATATTAAAGACTAAAC
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>LITCHI001217.m1 GenomeSequence + GCCAGCAATAACTTAACCAAGCATAATAATCATCTGAGAATGTGACAAATATATTTCTTA ATCAACATAAGCTACATTACCTAAACTGTGTATATTACCTAAATAAACCTCCCATGTCTA ATTCCCATTTTGCCCTAGAAAGAGCATTCTCTTTCTCTATATAACCTTGTTGATGGATAA AGCAAAAATCACTCTACAAAAGATCATAGATTTATATTAAAGACTAAACATGGCGAGGAA GAAGGTGACTGTTGCGTGGATTGCGAATGGCAGTGCTAGGAAAGCGAGTCTCAGGAAAAG AAGGGCTGGGTTGGTGAAAAAAGTGCGTGAACTAAGTATACTTTGTGATGTCGATGCTTT CATTGTTATTTATAGTCCAGATGAAAAGGAGCCGACGGTATGGCCTTCTCGCTCGAAAGT GCAAGAGATGATCACAAGGTTTGATGTCATACCAGACATAGAGCGAAACAAGAAGATGAT GAATCAGGAGACTTACTTAAACGAAAGAGTGAGCAAAGCGCAAGATAAATGTCAGAAGCA TGAGAGGAAACACAAGGAGATGGTGGCCTCCAATCTTTTGCATTATATATATAAGTGCAA TGGACTTGATGAACTCAGTGTAGCTGACCTGCATTCTCTTATTTGGTTTGTTGAGGAGAA GCGCATGGAAATCAGTAGAAGGATTGAATATTGTAAGCAACCTCATGTCTCTCCTGATTC TTTACTGCATGGTTTTTCTCCCCTTCCTGCTTCCGCTACTTATGATCCTAACATCGGTGG AGACAATATCGGTGTCTCAATTCATGATGATCATCGTGAGAAGGCTCTTGTGGCGTCAGA TTTTTCGTGTGATCAATGGTTTAATATTGATATGATGAACAACCCGCAGGCTATTGTTGG GAGTAGTATCACGGTTAAGTCTAGTCATATGGTTGGGTTGAGTACTGCCATTTATCAACC GTTTGTTGAAGATGCAAATAGTGGAAACCAATTGGGGTTGGTAGGTCATGCGAATTATGA AGCCTATTTTGGTGGTTCAAGTGGTACTCCTGAAACTATTGTGGGGCTACAACAACATAC TGGAAATTTGGAAGCCCTGAGTAGTGGTAAAAATGATATGCCCTTATTGCTTCCACCACC ATCGGTTCAAGTTCGTGATGACAATGGAAATGATATTTCTTCAGGGCTGCAGCATTTTAG AGGTTACAGAGGGGTTGGTACTAGTGGAAGCGATATGGCCATTAGGCTGCCATTGCCTCA TCCTAAAAGCAGTGGTTACAGGAGTGATATTGCTTTTGGTATGTAGCCTATGGGAATGTC AAAGTTAATAATAGTTTTAGTGAGGGTATTCACAAGGGTTCACCTTTGCAGGTACCATCA TTGGGAACGATGTTAGTCCATCCAAACCATGGCCTAGCAAATTCTATCATTGATCTTGTA TGATATGGTTCTTGTTTTAATTTTTTTTTTTTTAATTATTTTAAGTTTTATGTGTCATTT CTTATGTATTGTTCCATTTCAGGAATGTTTGGTTTATGTTTGTTTGTATTTTTTCTTTTT TTTAGAATATTTGGTTCAT