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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI001182Chr52408873224090773+NAC transcription factor ONAC010

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI001182.m147172PF02365.18NAMFamily136.57.30E-40
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>LITCHI001182.m1
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>LITCHI027631.m1
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>LITCHI029025.m4
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>LITCHI001893.m3
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AAGATTGTCTAACAAAAATAATTTTGTTAGACAATCTAACAAAAACGAAATCTAAGACCA
ACACAATTGGTGAGGAAACATTCCTT
>LITCHI001893.m2
GAGACACATTCAGATTGAGAGTGAAAGCATGACTTTTTCTTTCATTCAAATTCTCTATAT
AACAATATTAAAATTGAACATAAAATAACGACAATACCTCCACCAACCAAGTTGCTTTCT
TCTATTTAACCCAACAAAGCAAAACAAGCTCTCTTTCTACTTACTTCTCTCCAGAGGTTT
CTCTCATCTCATGTCAGAGAAACTTGTCCACTTTGCTCTCTCTTGTCTCAACTGCCCATA
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GTTTGTTTTACGACCTCTAATTTAGATCGCTGTTTTTGCCTGTGTAATTCAATATGGGAT
GGTTTCTCTTGACTTGGATGTCAAATGTTTTCCTCCTGTTTTTACATGGATTTGCTTTTT
TATTGTAACGTTCTGGTGAATCTTAACACTGCTAGAGTTCAATATTCCTTTGCTGTTTTT
AAGAAATAGAACCCATAATTGATGTGTCACAAAATCCTTGATTTCAAGATTGTCTAACAA
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>LITCHI001893.m1
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AACAAAAATAATTTTGTTAGACAATCTAACAAAAACGAAATCTAAGACCAACACAATTGG
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TCAAATCGCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCGAACGTTCAATTCTATATGCCGTGAC
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TCTAGATCAGGAACACCAAA
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AAGTACTTGTACTTCTCTCGCGAACTTTCCCATACTTTGGAGTTTTTGAGGTGCAAATCT
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CAGTGTAAGCATTACGATGATAATAAAAAAATTATATCTCCAGCAATGTTATAGTGAATT
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>LITCHI001893.m2 +  Up_Stream_Len 2000
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TTATTTATTTTTTGTTTCCATCTCGTATTTTTAAGTCAAATTGAAGGCAGCTAGCTAGTT
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GGCCAATTATATATAGATACTTGTAGCTGGTGTGGGGACTCATAATGGTTGAGTGGTGAC
ATTATGTCACTGCTTCCTGCTACAAAGCTTTAATTGAAGAGCTTCGATGGCAGACCATCC
ATATATGAAATAGATTGAGATAAAATTGGCCAAAAAAGGAAGGTGCCGGAAGTCAAATCA
AGATAAGCCAGAATCCAAAGCAATGGAAAAACCACCGTGGAAGTTCAGCTGTATTCTACA
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TCTAGATCAGGAACACCAAA
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>LITCHI019622.m3 GenomeSequence + 
CAAGCTCTTTTCATCTGCACTGGCATGGTATTTCCAAGCTTTTGCTCTAAGTCATTCATA
TGTGCTTCTTTTTGTTGTTTTGGTGGTAACAATCTTTAATGGTCTGTTTGGCTTCTAAAT
CAATGAGACTAATTACAAGAAGAACTGATTTTTGCATGACTGAGAAAATTCACTTAATTT
TTTTGAAAATATTAAGTTAAATATGTATGTTTGGTTTTCATGTTTTAATTATCAGCAGAA
GTTATTCTACTGATGGTAATGTTAGTGTTGAATGTGTTGAATTTATATTTCACAGATGGC
CTGGCAGAGAGTTTATCTAATTTGGATCATACTTGCTTTATCATCGTGTTGCTTTTTCCT
TCATGCTCTTGAACAGATTACTCATCCAGCTGAAGGTTGATTTCTTTTTGCTTTTGTACT
TCATTATGGTCGTGTATATGATGACATACTTGTTAATACTGAAATCAAAATATTAGATTA
TGATTTGGAATTTTTCTTATTAGATTCTTAATCACTTTGAAAAGGTTGTGTTTCTTGAAC
TACAGTTGATGCTTTGCTAGCTGTACGCCGTAAACTCAAAGATTCAAGTAAGAATCTCAA
CAATTGGAAGAAGACTGATCCATGTTCATCAAACTGGACAGGCGTAATCTGTGCAAATTC
GGACGATGGTTATCTCCATGTCCAAGAATTGTATGTTGATCAACTTTAGTATTTATTCTT
TGCTCTTTAACATGCTTATTGTGTCAACTTTGATTCCATTTTAGTAGACTTGGTTTGGCA
CATGAGACTGCCATCTTAGTTTAACTGAAATCAAAGATAGGATGTCATAATATGAGAGAG
TTTTATGTAATTTTTTCTACTTTGAATGTTTTAGATATCATTTAAGTTATTACCTTTTTT
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GGTTTTCCTTTTTGGGTTCAATCATGATACAGGCGGTTGCTCAAAATGAATCTCTCTGGA
ACACTGTCTCCTGAACTTGGCCAACTATCTCATATGACTATATTGTGAGTCATGTTGTGT
TAGACACCAAATTATGGTGCATCATTTTGGTTGAGTCTTGTTTTGCTTTAATCTTTATCC
ATGTTAATCTTCAATATGCATTTGTTGTGCTTATTGATCCTTTTTGTTTTTTCCAATTTT
TTTCTGGCCAGGGATGTGATGTGGAACAACATAAGTGGCAGCATACCTAAGGAGATAGGC
AATATCACTTCTTTGAAGCTCCTGTAAGTTGGAATTTTTATGGTTTTAGACTTAGTCAAA
TGTATAACGTTGCTGTCAAGTGCCTTGTATGACAATATTACTTATTAATTGTTCTTCGTG
GCAGGCTTTTGAGCGGAAATCAATTATCAGGGCCTTTACCAGATGAGCTTGGTTTTCTCT
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TCAAACGGTTCATGACATTGGCCCTGAAATGCTGTGAGGACAACACAGAGGCACGACCCT
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TCTCCTTTATTCTTCACTATTTATAACCGTTG
>LITCHI019622.m5 GenomeSequence + 
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CCATTAAGGATGATTATTACCCTAGTTTCTTTCTTCTTGCTGCAGCCAACTTGATAACAA
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>LITCHI019622.m4 GenomeSequence + 
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>LITCHI019622.m1 GenomeSequence + 
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CTAACTTGACAATATTTAACCTGGAGCAGAACTTTATATCAGGACCACTTCCCGTATCAT
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GTGTTAGTCATTTGAACAACAATTCCATCAGTGGTCAGATTCCACCAGAGTTGTCTGAGT
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CCCCTGGACATTCAGTAAATTTTTTTGGATAGCTAAAACTGACTGCTAGTTAGATGGAGG
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