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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001127 | Chr5 | 23273041 | 23277140 | - | LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001127.m1 | 79 | 117 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 38.3 | 1.30E-09 |
| LITCHI001127.m1 | 542 | 564 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.4 | 0.96 |
| LITCHI001127.m1 | 641 | 698 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.5 | 1.40E-08 |
| LITCHI001127.m1 | 663 | 722 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 28.9 | 7.60E-07 |
| LITCHI001127.m1 | 736 | 794 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 33.7 | 2.50E-08 |
| LITCHI001127.m1 | 759 | 781 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.5 | 0.19 |
| LITCHI001127.m1 | 902 | 1170 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 143.2 | 1.00E-41 |
| LITCHI001127.m1 | 905 | 1170 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 136.4 | 1.10E-39 |
| LITCHI001127.m2 | 79 | 117 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 38.5 | 1.20E-09 |
| LITCHI001127.m2 | 195 | 253 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 27.1 | 2.80E-06 |
| LITCHI001127.m2 | 542 | 564 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 10.5 | 0.87 |
| LITCHI001127.m2 | 641 | 698 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 34.7 | 1.20E-08 |
| LITCHI001127.m2 | 663 | 722 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 29 | 7.50E-07 |
| LITCHI001127.m2 | 736 | 794 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 33.8 | 2.30E-08 |
| LITCHI001127.m2 | 759 | 781 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 12.7 | 0.17 |
| LITCHI001127.m2 | 902 | 1069 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 106.1 | 2.20E-30 |
| LITCHI001127.m2 | 905 | 1069 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 95.7 | 2.90E-27 |
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>LITCHI001127.m1 ATGGCAATTCAGTCGAGATTCTTTTGTCTCACCATTCTTATTCTATGTTTGAAAATGAAG TCAACAGTCTGCATTCTTGTATATATACCTATACATAACTACTTGTTCGTCATAGCCAAA TTAAGGAAATCATCTCTCATGGAAAGAAATCAATCTCTCAATGTTTTCGTCGTTTCATTC TTATTACTTCATTCCATCACCTGTTGCTTTTCATTACTACCCAAAAATATTATGACTGAT AGGGATGCTCTCCTTGCCTTGAAAGCTCATATAACTCATGATCCAAATACTTTACTGGTC AAAAACTGGTCCATGAGTGCTCCCATCTGTAGCTGGATTGGTGTCACTTGTGGTGTTCGT CACCACAGAGTCATAGCCTTGAATATTACTTATCTTGGTCTCACAGGGACACTTCCACCT CAACTAGGAAATCTTTCCTTCATGTTATCGCTATCCATCAGTGACAACAATTTCTATGGC TCTCTTCCATATGAGTTGGCACATTTGCGTCGATTGAAATACATTAATTTCAATCACAAT CAGCTTTCGGGCAACGTACCTTCCTCCATCTTCAACATATCTTCATTGCAGGAGCTTAGA CTCAAACACAACCACCTCTCATCAATAGCCAATGTAACCGGCGGTGGAGTACTTAATTTA ATGTCACTTGATTTGTCTGAAAACTTGTTCGAGGGAGAAATACCATCCTTCATATCAAAG TTCAGGCAGCTACAATTTTTGAACTTGACATTAAACAATTTCAAAGGAGGCATACCAAAA GAAATCGGCAACTTGACCAAGTTGAAGACTCTATCAATTGGTAACAACAAACTTCAAGGA GAAATTCCCAAGGAGCTGGGGAATCTGGTAGAATTGGAGAGACTGTCACTACCACATAAT GTCCGATTAACAGGGCAGATTCCTTCACTTATATTTAACATTTCATCTCTATGGCTTATT 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>LITCHI001127.m1 MAIQSRFFCLTILILCLKMKSTVCILVYIPIHNYLFVIAKLRKSSLMERNQSLNVFVVSF LLLHSITCCFSLLPKNIMTDRDALLALKAHITHDPNTLLVKNWSMSAPICSWIGVTCGVR HHRVIALNITYLGLTGTLPPQLGNLSFMLSLSISDNNFYGSLPYELAHLRRLKYINFNHN QLSGNVPSSIFNISSLQELRLKHNHLSSIANVTGGGVLNLMSLDLSENLFEGEIPSFISK FRQLQFLNLTLNNFKGGIPKEIGNLTKLKTLSIGNNKLQGEIPKELGNLVELERLSLPHN VRLTGQIPSLIFNISSLWLIDFTNNSLTGELPHNMCSHYPRPVLKELHLNYNQIAGTIPY NLWQCRELTNVHLALNQFRGHVPKDIGNLTSLKVLLMSANNLTGEIPNEVGTLPNLEYLG FARNNLVGHIPVNIFNISTLKFLSLHDNQFSGSLPSNIGFRIPNIERLNFGGNNLSGAFP TFITNASNLLSLEMGSNKFSGFIPSTIGDSLTSLEWLGLSSNYFTSSTQDLSFLTSLTNC KNLQVISVSGNPLNGFLPSSIGNLSVSLYVFDMSYSNVSGNIPQEISSLTNLLHLYIGYN QLTGSIPVTLGKLQKLQGLQLQYNKLEGSIPDDLCYLDHIVELHVFGNKFSGAIPACFGN LTSLRVLSLASNRLTSVIPSSLWNLRDLLHLNLSTNSLTGTVPSDLGNLKRAVEVDLSMN HLNGGIPTTIGGLQDLQSLSLKFNSLQGPIPDSFGDLISLEILDLSYNNLSGVIPKSLEA LLYLKFLNFSFNQLEGEIPTNGPFANFSSNSFMMNHALCGLPQQGVPKCKTSIHPKSRIG LVLAITLPLTFIVFLALAVVLRKYGKWRGAQPLYNDVIDAPQQAIWRRISYRELVRATDG FSESNLLGRGSFGSVYRGRLSDGMEIAIKVFHVQLERAIQSFDVECEVLSGIRHRNLVKI ISSCTNIDLKALVLEYMPNGSLAKCLYSNEYSLDILQRLNIMIDVGLAIEYLHFGHSIPI VHCDVKPSNVLLDQSMVGHLSDFGITKLLGEEDSMIETQTLATIGYMAPEYGREGRVSRQ GDVYSYGIMLMETFTKKKPTDEIFTEEMNLRRWVGDSLNRSIIEVIDSDLLQLDDSHFSA QEQCVSSILSLAMDCTANLPKDRIDIRNAMSILTKIRATFLSSTREHHVHVRVM. >LITCHI001127.m2 MAIQSRFFCLTILILCLKMKSTVCILVYIPIHNYLFVIAKLRKSSLMERNQSLNVFVVSF LLLHSITCCFSLLPKNIMTDRDALLALKAHITHDPNTLLVKNWSMSAPICSWIGVTCGVR HHRVIALNITYLGLTGTLPPQLGNLSFMLSLSISDNNFYGSLPYELAHLRRLKYINFNHN QLSGNVPSSIFNISSLQELRLKHNHLSSIANVTGGGVLNLMSLDLSENLFEGEIPSFISK FRQLQFLNLTLNNFKGGIPKEIGNLTKLKTLSIGNNKLQGEIPKELGNLVELERLSLPHN VRLTGQIPSLIFNISSLWLIDFTNNSLTGELPHNMCSHYPRPVLKELHLNYNQIAGTIPY NLWQCRELTNVHLALNQFRGHVPKDIGNLTSLKVLLMSANNLTGEIPNEVGTLPNLEYLG FARNNLVGHIPVNIFNISTLKFLSLHDNQFSGSLPSNIGFRIPNIERLNFGGNNLSGAFP TFITNASNLLSLEMGSNKFSGFIPSTIGDSLTSLEWLGLSSNYFTSSTQDLSFLTSLTNC KNLQVISVSGNPLNGFLPSSIGNLSVSLYVFDMSYSNVSGNIPQEISSLTNLLHLYIGYN QLTGSIPVTLGKLQKLQGLQLQYNKLEGSIPDDLCYLDHIVELHVFGNKFSGAIPACFGN LTSLRVLSLASNRLTSVIPSSLWNLRDLLHLNLSTNSLTGTVPSDLGNLKRAVEVDLSMN HLNGGIPTTIGGLQDLQSLSLKFNSLQGPIPDSFGDLISLEILDLSYNNLSGVIPKSLEA LLYLKFLNFSFNQLEGEIPTNGPFANFSSNSFMMNHALCGLPQQGVPKCKTSIHPKSRIG LVLAITLPLTFIVFLALAVVLRKYGKWRGAQPLYNDVIDAPQQAIWRRISYRELVRATDG FSESNLLGRGSFGSVYRGRLSDGMEIAIKVFHVQLERAIQSFDVECEVLSGIRHRNLVKI ISSCTNIDLKALVLEYMPNGSLAKCLYSNEYSLDILQRLNIMIDVGLAIEYLHFGHSIPI VHCDVKPSNVLLDQSMVGHLSDFGITKLLGEEDSMIETQTLATIGYMAPGKNVPNVALCY IVFLFSLLLIFTHL.
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>LITCHI001127.m1 CCCATGTGGACAAATAATCATTGTGATGACCAAGGTGCACTACAATGGACCTCGTGGAAT CACAAGCTGGCTCTAACTAGGTCTTCCTGAAATGGCAATTCAGTCGAGATTCTTTTGTCT CACCATTCTTATTCTATGTTTGAAAATGAAGTCAACAGTCTGCATTCTTGTATATATACC TATACATAACTACTTGTTCGTCATAGCCAAATTAAGGAAATCATCTCTCATGGAAAGAAA TCAATCTCTCAATGTTTTCGTCGTTTCATTCTTATTACTTCATTCCATCACCTGTTGCTT TTCATTACTACCCAAAAATATTATGACTGATAGGGATGCTCTCCTTGCCTTGAAAGCTCA TATAACTCATGATCCAAATACTTTACTGGTCAAAAACTGGTCCATGAGTGCTCCCATCTG TAGCTGGATTGGTGTCACTTGTGGTGTTCGTCACCACAGAGTCATAGCCTTGAATATTAC TTATCTTGGTCTCACAGGGACACTTCCACCTCAACTAGGAAATCTTTCCTTCATGTTATC GCTATCCATCAGTGACAACAATTTCTATGGCTCTCTTCCATATGAGTTGGCACATTTGCG TCGATTGAAATACATTAATTTCAATCACAATCAGCTTTCGGGCAACGTACCTTCCTCCAT CTTCAACATATCTTCATTGCAGGAGCTTAGACTCAAACACAACCACCTCTCATCAATAGC CAATGTAACCGGCGGTGGAGTACTTAATTTAATGTCACTTGATTTGTCTGAAAACTTGTT CGAGGGAGAAATACCATCCTTCATATCAAAGTTCAGGCAGCTACAATTTTTGAACTTGAC ATTAAACAATTTCAAAGGAGGCATACCAAAAGAAATCGGCAACTTGACCAAGTTGAAGAC TCTATCAATTGGTAACAACAAACTTCAAGGAGAAATTCCCAAGGAGCTGGGGAATCTGGT 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