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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI001011 | Chr5 | 21638894 | 21644348 | + | Auxin response factor 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI001011.m1 | 358 | 400 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.6 | 2.90E-08 |
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>LITCHI001011.m1 ATGAGATGGGATTTTAAAGGGAGTCAAAGATTTTTCTTCATTTTTGCTATTGCCACCCCA ACCATCTCTTCCTTCTATCTTTCCCCCTCCACTTCTTCCATTTCCGTCACCGCACGATAC AGCGGCAGCGACGACGCTTTTCGTCGCTTCTCCAGCCCCAACGAATTTCGGCGCGGCCTG GACGACTCCGTCGATGAAAAATCATACGATATCGAGACCTCAGGTCGGATACTTATGAGT TGTTTGAAGAGGGTCGGCAATGAGATGTATAAGAAGGGCCATTTTGTTGAGGCTCACAAG TTGTATGACAAGGCGATTTCTATGTCGCCGGAAAATGCGGCGTATCGGAGCAACCGAGCG GCGGCTTTGACGGCGATGGGGAGGTTGAGGGAGGCTTTGTTGGAGTGTGAGGAGACTGTC AGGTTGGACCCTGTTTATGGCAGGGCTCATCAGAGTGTGCAAATTGCTTCTTCACTGACA TTCCCTGCTGATCTCAGCACCAAATATGCTGATTCGGACGAATGTGAAGGGAAATTCTTC CCAGGCATCCCTGCCATTAAGTATGAGTCTGTGATTGCTGACCAAGTCATTAATGGCCAC GATTGGATGAGATTCAGTGTTGCCTTTTGGCACACGTTCCGTGGAGTAGTGTGGCCTTTG AATCATTCTTCCGGAGGACCCCTTTCAGGGGGCTCCAATGATGCTTTGTACAGGGAATTA TGGCATGCTTGTGCTGGACCTCTTGTCACCCTGCCTCGTGAAGGGGAGCGAGTGTATTAC TTCCCTCAAGGTCACATGGAACAGCTAGAAGCATCAATGCATCAGGGACTGGAGCAGCAA ATGCCTTCATTTAATATGCCATCTAAGATCTGTGTAAAGTGCAAAGTGAGGTTACAAGTC CAGATCCTCCTCCCCATGAAGCTGAAAAGTGCACGGTCCATTCATTTTGCAAGACGCTTA CCTCATACAAGCACCCATGCTGAATACAGCCTCCATGGCAGGAATTGGTTGCAACTGATC TGCATGGGAATGAGTGGCATTTTCGGCACATTTTCTGAGGTTGGCATCAGTCAACCTAGG CGTCATTTGCTTACTACTGGGTGGAGTGTGTTTGTTAGTTCCAAAAACTTGGTAGCAGGT GATGCATTTACATTTCTGAGAGGAGAAAATGGGGAACTGCATGTAGGAGTAAGGAGGCAC ACGAGGCAGCAGACAAATATGTCATCTTTAATTAAATCTAGTCAAAGCATGCATCTTGGG GTAATTGCAACTGCTTCCCATGCCATTGCAACCGGAACACTCTTTTCTATCTTCTACAAG CCAAGGTTTTGTGTCTTTACCTTGTACTGCGAAGTAAAATGTGTTTCTTGTGGGTCATCT GCAAATGTCTATTGGCTTGAAGCGCCGAGTGTTTGTTAA
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>LITCHI001011.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACACATATATCATACTCATATAAAATAACCTACAATTAAAAATTAGTTCTGAAAATATAT ATACATATCAGTTTTGACATGGAATTAATCAAACATTTAGGCAATAAAGCAGTGGTTCAA AACTAGAAAACAAATCATATTAAGACATTAAATTATGATACACGTTCTCATACTTGATGT TAGAACATTCTACCTTGAAAAGACAACATGCTTTTAGCAACCAAACAACAAAACTAGGGA ATAAACACATACTCATACTATCAAATGTTTAATAACATGCATTACACAACAAAACCACTC ATCAAAAATATTTTTTTTAAGCACACAACTTCAAGACAAAAGCAATTTATGCCACAAACC TTAAAACCCAACCATATAAATAAATTTATAAACACTAATTAGTCAACACAACATATAAAT TCATCAATTCTCACATGCAATTCCTCAAATAAATAGCCAACAAATAAGTGATGCAAAACC AGTAAACATATCATACTAAAACAAGTTGTTACGTTATCATTTTCTGACAAGTATAAGAAC TTATAGATGTTTTAAAAAAAAAATTACCTTCAAATGACAGTGTCTTTTTAGGCACCAAAC AACAAAACCATCAAATAAACACATAAACATAGTATAACCATTTAATTTCATGCATCAAAA AACAAAACCAATCATGAAAAACAATCTTTTAAAGTAGATTCTTGAAGAAAAAACAAGTTT TTGTCAGAAGCTCTTAACCTGAACCAATAATTTTTTACAAACAAAAATCCCATCTTTTTT TTTTTTCAAAACCAATCTGCGTTTGTTAATGAACCAAAAACATTATTTTTCCTCAACTTT ATTTCACAGATTTCATCAAAACCCACCCATAGCCCTTTAAACTCATATATTACGACATAA CTTACCTGATTTGCAATGAATATCACAGGCTCTCCACTGTTCTCTTACCCAAATGCTTCT AAAAGATGCACTCAAATAGAGGAAAAAAACATCAGTTTTCTTTGTTGTTTGAGAAAATGG CATTTGGACGGTTTCTCAACAATATAAAGCATCTCTCTTCAGTTTTTGGTGCGAGTTTAT AGTCTCTGACAGTCCATAATACACACCATTTCGTGTGTTTAATCAAAGGCGGCTATACAC ATCATCCAATGACTTTTAATTAATTTAATAATCAAAAAATTATTTTTTTGTTTCATTGTA ATAATTACACCTAAATATTTTATCCAATATCAATGTCATTTGACCATTTTACCCTTATCC TATGCCACTTAACACCTACTTAGTAACGACAAGATGCTGAAAGGGGAGATTTGTGCTGAG TTTCAGAAACGTCAGGGGAGGGCACTGCGAGTTTCCCAAACATCGTCATTTTGGTGCAAT TATACCTAACCTCAGGGGGGTTTGTGCAATTTGTCCTAAAATGTAATAATATCAAATTAT TTTTTAAATGATCAAATCATTTAAAATTATTTAAAAATAATTAAAATATTAAATAAAATT TTTTATTTTTTTTATTTTATTATAAATTATTTAATGATATTTAAAAATTTTTTTTAAATA TTTCTTTTTTAAAATAATATAATTTTAAAATTATTTTTATTTTATATTACTCATATTTTT TTCCTTTTTTTCTCTTAATGCTTACGAAAAATATATTTAAAAAAAAAAACTAAATATATT TCATATTAAATTATTTTAAAATTTAATTAATATATTTTAATTTATAATTTAAATATTTAT TTTTAATTATTTTTAAAATATATTAATATATTTAAATATATAAATATCGATAATGTTATT ATATATTTTTATATTTATATTAAATTAATTAAAATTATATAATAATAAATAATTAAAATG ATATATATATATCAAATTATTGATTTTTATATTATTTTAGTTTTAGAAAATAAATAAATT TATAATATATTTAAAGATTAAAAAAGTAAATATTCACTCTAAAAAAGCAGGCGACGCCAA GTATGGGTAGAAGTACGGTG
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>LITCHI001011.m1 GenomeSequence + ATGAGATGGGATTTTAAAGGGAGTCAAAGATTTTTCTTCATTTTTGCTATTGCCACCCCA ACCATCTCTTCCTTCTATCTTTCCCCCTCCACTTCTTCCATTTCCGTCACCGCACGATAC AGCGGCAGCGACGACGCTTTTCGTCGCTTCTCCAGCCCCAACGAATTTCGGCGCGGCCTG GACGACTCCGTCGATGAAAAATCATACGATATCGAGACCTCAGGTCGGATACTGTGAGGC TCATTGATGCACAGCAGAACGTGGTTAGTTTGTTAGTTAGTTACTACAACTTTTATATTT AATTTCGCTTTTATTGGTTATTGAAGTATGAGTTGTTTGAAGAGGGTCGGCAATGAGATG TATAAGAAGGGCCATTTTGTTGAGGCTCACAAGTTGTATGACAAGGCGATTTCTATGTCG CCGGAAAATGCGGCGTATCGGAGCAACCGAGCGGCGGCTTTGACGGCGATGGGGAGGTTG AGGGAGGCTTTGTTGGAGTGTGAGGAGACTGTCAGGTTGGACCCTGTTTATGGCAGGGCT CATCAGAGGTTGGCTTCTCTTTATCTAAGGATAGTGACTTTTTTCTTTTGTTTTGATTAT TTTTTATATAACAATGTGTGTGACTTTTGTTTATGTGTTTGATATTTTCTTGGAAGAATT ATCATGTTCTATGTTATTTTGTTTGTTTACTTGAATTTCTGTGTTGTGTTTTCTACTGGC TTTTGATTTTGTTCACAATGATAGTTTTGTTTTTGGGGTAAGTTTTAGTTTAGTTAGTTG TTACTTGGCTTTTTGCCTTTTTTATTTTTTTGAAGTTTTGGTGGTTTGATGATTCAGAAT ATGTTTTTGTTACTAACCCATGATTGTATGTGCGAAATTTGGAGATGGGTATTTTTCGGA 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