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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI001009 | Chr5 | 21609330 | 21619442 | + | Auxin response factor 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI001009.m1 | 132 | 229 | PF02362.24 | B3 | Family | 68 | 5.50E-19 |
| LITCHI001009.m1 | 220 | 285 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 92.2 | 2.00E-26 |
| LITCHI001009.m1 | 499 | 592 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 44.1 | 2.40E-11 |
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>LITCHI001009.m1 ATGGCATTCCCAGTGGCAGCTTCTGCACCTTTGCATCATTCTTCCAGAGGGCCCCTTTCA GGGGGCTCCACCGATGCTTTGTACAGGGAATTATGGCATGCTTGTGCTGGACCTCTTGTC TCCCTTCCTCGTGAAGGGGAGCGAGTGTATTACTTCCCTCAAGGTCACATGGAACAGCTA GAAGCATCAATGCATCAGGGGCTGGAGCAGCAAATGCCTTCATTTAGTCTTCCGTCTAAG ATTTTGTGTAAAGTGGTTAATGTTCAGCGTCGGGCTGAACCTGAAACAGATGAAGTTTAT GCGCAAATAACTCTGTTGCCTGAACCTGATCAAAGTGAGGTTACAAGTCCAGATCCTCCT ACCCCTGAACCTGAAAAGTGCACGGTCCATTCGTTTTGCAAGACACTTACCGCATCTGAT ACAAGCACTCATGGTGGATTCTCTGTTCTAAGGAGGCATGCTGATGATTGTCTGCCCCCT CTGGATATGTCCCAGCAGCCTCCATGGCAGGAATTGGTTGCAACTGATCTGCATGGGAAT GAGTGGCATTTTCGGCACATATTCCGAGGGCAACCTAGGCGTCACTTGCTTACTACTGGG TGGAGTGTGTTTGTTAGTTCCAAAAAATTGCTAGCAGGCGATGCATTTATATTTCTGAGA ACTAGTCGGTCTGAGTTCATTGTAAGTGTCAACAAGTACCTTGAAGCTAGAAAACACAAG CTTTCAGTTGGGATGAGATTCAAGATGAGATTTGAGGGTGAGGAAGTTCCTGAACGAAGG TTCAGTGGCACCATTGTGGGTGTTGAGGATAACAAAACCTCGGCATGGCCCAACTCTGAA TGGAGATCCTTGAAGGTTCAATGGGATGAACCTTCATCTATCGTGCGCCCTGAAAGAGTT TCAGCATGGGAATTGGAGCCACTTGTTGCCAATACTACAACTCCTCCTCCTCCAAACTCC CAACCTGCTCAAAGGAACAAGCGGGCAAGGCCACCTGTTTTGCCAACACCAGCCCCAGAT CTTTCCGTTCTTGGTATGTGGAAATCCCCGGTTGAATCCCAGGCTTTCTCATATATTGAC TCACAGCATGGACGAGACCTCTATCTATCTCCCAAGTTTTCTTCTGCTACGAAGGCCAAC CCTCTTGGTTTTGGTGGGAATAGTTCACTAGCTACTGTTACTGGCAACTCAATGTACTGG CCTAATCGAGGAGAAAATGTAATGGAATCATTTGCACCTGTTGTCAGTAAAGAATCCAGT GAAAAGAGACAGGGAACTGGGAACACCTACAAGCTTTTTGGCATCCAGCTAGTTGACAAT TCCAATATAGAAGAATCTTTAGCAGCTGTTACCATGTCTGCTACAGGGGGGGATGATCGA CCAGTTCCATCCTTGGATGCAGATTCCGAGCAGCATTCGGAACCGTCAAATATTCCTTCT GTAAGTTGTGATGCTGAGAAGTCATGCTTGAGATCTCCTCAAGAGTCGCAAAGCAGACAA ATTCGTAGTTGTACAAAGGTTCATATGCAAGGAATTGCCGTTGGTAGGGCTGTCGATTTG ACTCGGTTTGATTGTTATGACGATCTTCTCAAAAGATTGGAAGAGATGTTTGACATCGAG GGAGAGCTCTCTGGAGCCACAGAGAAATGGCAAGTTGTTTACACTGATCATGAAGATGAC ATGATGATGGTTGGGGATGATCCATGGCATGAGTTCTGTAGCATAGTGGGGAAAATTTTC ATTTACACAGCTGAAGAAGTGAAGAGGCTGTCACCCAAGATAAAACTTCCATCTAATGAA GAGGTCAAACCAGCCAAGCCTGATGTTGACACAGCTGTGAACACTGAAGATCGGTTGTCA GTTGTTGGACATGGATGCTGA
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>LITCHI001009.m1 MAFPVAASAPLHHSSRGPLSGGSTDALYRELWHACAGPLVSLPREGERVYYFPQGHMEQL EASMHQGLEQQMPSFSLPSKILCKVVNVQRRAEPETDEVYAQITLLPEPDQSEVTSPDPP TPEPEKCTVHSFCKTLTASDTSTHGGFSVLRRHADDCLPPLDMSQQPPWQELVATDLHGN EWHFRHIFRGQPRRHLLTTGWSVFVSSKKLLAGDAFIFLRTSRSEFIVSVNKYLEARKHK LSVGMRFKMRFEGEEVPERRFSGTIVGVEDNKTSAWPNSEWRSLKVQWDEPSSIVRPERV SAWELEPLVANTTTPPPPNSQPAQRNKRARPPVLPTPAPDLSVLGMWKSPVESQAFSYID SQHGRDLYLSPKFSSATKANPLGFGGNSSLATVTGNSMYWPNRGENVMESFAPVVSKESS EKRQGTGNTYKLFGIQLVDNSNIEESLAAVTMSATGGDDRPVPSLDADSEQHSEPSNIPS VSCDAEKSCLRSPQESQSRQIRSCTKVHMQGIAVGRAVDLTRFDCYDDLLKRLEEMFDIE GELSGATEKWQVVYTDHEDDMMMVGDDPWHEFCSIVGKIFIYTAEEVKRLSPKIKLPSNE EVKPAKPDVDTAVNTEDRLSVVGHGC.
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>LITCHI001009.m1 ATACAAACACAATAATTTCTTTTTCTTTTTATATATAAAAAGTAAAAACAAAAAACAAAA AACAAAAATAAAAAAAATAAAATATAAAACCAAAGTATGTGTTGTGTGTAAGAAAAAGAA CAGAAAAAGAGGCAGAAGTGGTCGTGTCGGCTTCGACCAAACATTGACGGTCAATTGTGA GTTTGTTGTGGTTTTGTTATGGCATTCCCAGTGGCAGCTTCTGCACCTTTGCATCATTCT TCCAGAGGGCCCCTTTCAGGGGGCTCCACCGATGCTTTGTACAGGGAATTATGGCATGCT TGTGCTGGACCTCTTGTCTCCCTTCCTCGTGAAGGGGAGCGAGTGTATTACTTCCCTCAA GGTCACATGGAACAGCTAGAAGCATCAATGCATCAGGGGCTGGAGCAGCAAATGCCTTCA TTTAGTCTTCCGTCTAAGATTTTGTGTAAAGTGGTTAATGTTCAGCGTCGGGCTGAACCT GAAACAGATGAAGTTTATGCGCAAATAACTCTGTTGCCTGAACCTGATCAAAGTGAGGTT ACAAGTCCAGATCCTCCTACCCCTGAACCTGAAAAGTGCACGGTCCATTCGTTTTGCAAG ACACTTACCGCATCTGATACAAGCACTCATGGTGGATTCTCTGTTCTAAGGAGGCATGCT GATGATTGTCTGCCCCCTCTGGATATGTCCCAGCAGCCTCCATGGCAGGAATTGGTTGCA ACTGATCTGCATGGGAATGAGTGGCATTTTCGGCACATATTCCGAGGGCAACCTAGGCGT CACTTGCTTACTACTGGGTGGAGTGTGTTTGTTAGTTCCAAAAAATTGCTAGCAGGCGAT GCATTTATATTTCTGAGAACTAGTCGGTCTGAGTTCATTGTAAGTGTCAACAAGTACCTT GAAGCTAGAAAACACAAGCTTTCAGTTGGGATGAGATTCAAGATGAGATTTGAGGGTGAG GAAGTTCCTGAACGAAGGTTCAGTGGCACCATTGTGGGTGTTGAGGATAACAAAACCTCG GCATGGCCCAACTCTGAATGGAGATCCTTGAAGGTTCAATGGGATGAACCTTCATCTATC GTGCGCCCTGAAAGAGTTTCAGCATGGGAATTGGAGCCACTTGTTGCCAATACTACAACT CCTCCTCCTCCAAACTCCCAACCTGCTCAAAGGAACAAGCGGGCAAGGCCACCTGTTTTG CCAACACCAGCCCCAGATCTTTCCGTTCTTGGTATGTGGAAATCCCCGGTTGAATCCCAG GCTTTCTCATATATTGACTCACAGCATGGACGAGACCTCTATCTATCTCCCAAGTTTTCT TCTGCTACGAAGGCCAACCCTCTTGGTTTTGGTGGGAATAGTTCACTAGCTACTGTTACT GGCAACTCAATGTACTGGCCTAATCGAGGAGAAAATGTAATGGAATCATTTGCACCTGTT GTCAGTAAAGAATCCAGTGAAAAGAGACAGGGAACTGGGAACACCTACAAGCTTTTTGGC ATCCAGCTAGTTGACAATTCCAATATAGAAGAATCTTTAGCAGCTGTTACCATGTCTGCT ACAGGGGGGGATGATCGACCAGTTCCATCCTTGGATGCAGATTCCGAGCAGCATTCGGAA CCGTCAAATATTCCTTCTGTAAGTTGTGATGCTGAGAAGTCATGCTTGAGATCTCCTCAA GAGTCGCAAAGCAGACAAATTCGTAGTTGTACAAAGGTTCATATGCAAGGAATTGCCGTT GGTAGGGCTGTCGATTTGACTCGGTTTGATTGTTATGACGATCTTCTCAAAAGATTGGAA GAGATGTTTGACATCGAGGGAGAGCTCTCTGGAGCCACAGAGAAATGGCAAGTTGTTTAC ACTGATCATGAAGATGACATGATGATGGTTGGGGATGATCCATGGCATGAGTTCTGTAGC ATAGTGGGGAAAATTTTCATTTACACAGCTGAAGAAGTGAAGAGGCTGTCACCCAAGATA AAACTTCCATCTAATGAAGAGGTCAAACCAGCCAAGCCTGATGTTGACACAGCTGTGAAC ACTGAAGATCGGTTGTCAGTTGTTGGACATGGATGCTGATCTGTCCATGCATGTGAAAGA GGGAAGGTAAAAACAAATAAGATGACTCTCAAAAAACATCTTCTCTATATATGGCTGCAA TCACGAAGTTGGAGAGAAGGTGGCAAGATGGTCGATATGTCATTCGATGAGTGAGACTTG TAAGGTAAAAGATAACAGTTTGAGTGTTATAAGTTTATTGTTTTGTTTGGCCATTGGAAT CTCATAGTGCTTGCTTACTAAGATGTCCAAATGGGCGTTAAACTTTAGCGGATTGATATC CCGTACCAAGCTTATTAGGTGGACAATATTCTCCCTTGTATTTTCTTTTTTCTTTTTTGA TATGATTTATATAATTTACATGACATGGTACGTTTGTCTTTTGTATATAAATATATATAG TCTTGCATTTTCTTGCGTCCTGTTGCATTATATTCTGCTATTTCTTTTTCCTCGAAAGAA TATGTAAAACTGGACCGGCTAAAGATCTTCTTTGCCAGGTTCTTTTGGCAATATATATTT TTGTTGTATTGGACTTATTTTTATGTCATCTTGCGCTGAATGCACTTATTTAATAGATAT TTGTGTTGGAGATGAAGTACCATATTATGTTTCTGTTGTAATGAAGAATTTCTATGTCTG TACTTGAATTGAAGAAAGTCTTAAATGGAATATTAGTATCTTATCATTTATATGTGCGTG CAATTAGTTGTGCCATGTATAGACCATATTTAAACACCATTACCCTGGTCATGGCAAACA TAAAGAAAAGTAAAAAGGCTTAGAATTTAAATTTGCAAACGGTAGGATTTGATTTAACGG AAATCTGTAGTGGCAATATTTAGATGGTAATCTATTTGGAAATCTTTAGATTGACGTATT ATGAATCATAATAAAATCTTATCAATTGAGTATGCGGTTGTTATAGGTTCAAAATCTGTT ATCATTATTAGTTCATACATCTTGAAAAATGGTCTATATGAGACAGATTTTACATTGAAG ACATGACAAGTTTCAAGATTTGACTTTTTCTTGAATTTGAGCCCCACTGGATCCAGCACT TCCTTGTCAAGGAGCCAGTAGGATTAAATTTGAAAAAGCTCAAAAAGTGACAACTTTTCC TGTACAAGCCTACCATCTTTATGCTTCCTTTTTCCATCTCAAAGATGCCATTCCAAAGCT TGTAAAAACACTCATATTCTCTCAAATTCTTCTTCATCATCTTCAAATTCTTCTTCATCT TCTTCCCTCAGTCATCCCTGTTGAAATCCGAACCATCATGAAGATGATAAAAGCCATGAA GAAGCTCAAGTTTTGGTCAAGAAAGAAGAGGAAAAAGAAGTACTCTTCCTATGACCCTTA TTTTGATTATCACTATCGACCTCCCTCAACATACCACCACACAAAACATCACTACTTATG TAGCTCCTCCTCCTCCTCGGCTCAGCCGTCAGCTCCACCCTTACCACCATGGCTCGAACA GGAGCTAACCCACGAGCCAGTCTGCGAACCCTGCAGGGTGCAATCTGTTCCAGGAGAAAA AGAAGTGGTGTATACAAGCCAAACCACCCACCGCGCGCAGTTTACTTGTCAGGAAGTTGT ACAAGAAACTAGTCCAATGTTGCATCATCCAACTCTGCCTGTTGAAAGTTCCTCCTCATC TTATCAGCAACACATGGATCCGAATCCTCCGGTATACGGGTTGCCTGTTGTGCAGACAAG TAGTGCCAACATAGAGAGAAAATCAAGTGACGTTTTTGGATGTTTTGTGAGGTCTGGTTT GAATCTTGTTGGCTGCTTCTTTCCTTGTTTAACCATCCGAGAAGCTGATCATGATAGACT GAAATTGCATGCACCCTATAAAAAACTATGAATCTGTTTTGTAATATTTTGTTATAATGT TGTATGTATATGTATTTTCAATCTGTGCTTTTTTTTTTTTAATATGTTTTGATGTAATCA TGTTCAAACAATGAGTAAAATTAAAAAGCAAATAATTAGAATGAATTAAAGCCAATATAA TATATGTGTTTGTTATTTGTAATTGTGGATTCTCAATTTATTGGTGATAATCTTATATGT GTTTACTATTTGTAATTGTGGATTCTCAATTTATTGATGAGAAGTCACAATCTATTGACA TAGTGACATTTCCTACATGTACCATGCCAACCTAACATAACATTTCCTTTAAGTACCATC CAACATTGATCTTCTTGTTGTGTTCGATAAAAATCCAACCTTAATTTCCGCCCAAGAAAC ACTCATCCATTGTTTTCCATCTTCATCTTGACAAAGACCCATTCCTATCAAGCTCGCATC AAAATCAA
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>LITCHI001009.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCAATTTTTTATAGATGAAAAATCTTAAATAATTTGCTTTTATTCCGTGATTTGGATTTT TCTGATTTGGATTGATTTGCACTTAAAATATAATATTTTTCGATTTGACTGGGTCAATTA TTTGATCCAAGTATCCAACCAAGCCTCTTTGTGCTTATACAACTCATACAACGATCCAAA CAATTGAAATCAATTATAATTAAGACAACAAAACACATAATCAAAACAAACATATTCTTG ATAATAATCGATATTAATACGACCAAACCAGAGTAACACATACTCTTCAAAATCAACTAC AATCAATACAACTGTACACAACTGGAGCTATACATACTCTCAAATTTACACAAATTATAA AATTTAATCCGTACTCAATCACTATCATAACTAAATAAGAAATTTTTTTTTTTCCAAATA AAGAAAACAAAATTTTAAAAGAATTTAATTTTAAATGGCACGCGCAACACCCCCCCACAA TGTAAAATTTTCTTCGGTCACGTCTATCCACTTTGACACCCCCCTCTATACAAACACAAT AATTTCTTTTTCTTTTTATATATAAAAAGTAAAAACAAAAAACAAAAAACAAAAATAAAA AAAATAAAATATAAAACCAAAGTATGTGTTGTGTGTAAGAAAAAGAACAGAAAAAGAGGC AGAAGTGGTCGTGTCGGCTTCGACCAAACATTGACGGTATAGCACATTTTTCATTTTGTA TTCATTTTCTACCTGCAATTTTTCTGATCTACCTGATTCCAAGCCTAATTTGGCAACCAA GGTGAGCTCCATCTTCTGCTCTGCTTTTAGTATTTTCCTTTTTCGCCGTTTGGATGCCGA GAAAATAACAAGAGAATGAGGGGTTTTGTATAGTTGATGTTTGAAAACCAGTAAAAATTT GAGTTTGTCCACTTGGGTATTTCTATTTTTGGTTTTTGGTCTCTGGGTAGATCCCAAATT TCTGTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTGGATGCCGAGAAAATTATAAAAAGAAGAGAAAATG AGGGGTTTTGATAGTTGATGTTTGAAAATAAGTAAAAATTTGAGTTTGTTCACTTCGGTG CTCCTATTTTTGGGTTTTGGTTTCCGGGTAGATCCTAATTTTGGTTTTGGTTCGATGCCA CGGAAAACTTATACATGAGGAGAAAATGAGGGTTTTTGAATAGTGGATGTGTGAAATAAG TGAAATTTTGATTTTGTTCACATGGCTATCTCTATTTTTGGTTTTTGGTTTCTGGGTAGA GATCGAAATCGTTTTTCGTTTATGTTTTTGTTTGTATGCCGAGAAAACATTAAAAAATTA AGAGGAAATAAGGGGTTTTGAATTGTTGATATTTGAAAAGGAAGTAAAATTAATATATAT ATATATATATATTTTCATATGGGTGTCTTGTTTCTGTTTTTGTTTTTTGGGATGGAGATC AGAACGCCTTTTGTTTAATTTGTTTATATGTGTAAATAATCAGGATCTGGTGCTCAATCA AATGTGTTTCAGTTTTGTTTTATATCAATTGTGTCTCTGTTTGAATAGGAAGCTGTGTGG ATATGTAAATATAGGTTTTGTAAAGTAACTAATTTTTGGTGAAAATCTGTTAAAAAAATT GCTGTTTTTGTGCCAAAAAAAGGGTCCATGGATTTGTTGCATGGTTTTGGGCTGGTTTTG TTTTTCGGTGACAAATTGACGTCAAAGGTTTGTAAAAGATGAAGTTTTTGGCTTCATTAT AGGAGCAAAGCAGGTGCTAGACTGAACCAATGAAGAGAGTAATAAGGATTCTTTGCAATT TATAATAATTGTTGGTGATTGTTATTAAATCAAGTTTTTAGTGCAGTTTTGGTTAGTGGG TTTGCTTTAGTTGGTTAGTAATTAATTGACAGCAGATTTATTGTGGATTGTTATTTGGCA CAGTCAGTGTTTAGTAACAATTGCTTATAACTTAAGGCTTTTTGTTTGTAGGTCAATTGT GAGTTTGTTGTGGTTTTGTT
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>LITCHI001009.m1 GenomeSequence + ATACAAACACAATAATTTCTTTTTCTTTTTATATATAAAAAGTAAAAACAAAAAACAAAA AACAAAAATAAAAAAAATAAAATATAAAACCAAAGTATGTGTTGTGTGTAAGAAAAAGAA CAGAAAAAGAGGCAGAAGTGGTCGTGTCGGCTTCGACCAAACATTGACGGTATAGCACAT TTTTCATTTTGTATTCATTTTCTACCTGCAATTTTTCTGATCTACCTGATTCCAAGCCTA ATTTGGCAACCAAGGTGAGCTCCATCTTCTGCTCTGCTTTTAGTATTTTCCTTTTTCGCC GTTTGGATGCCGAGAAAATAACAAGAGAATGAGGGGTTTTGTATAGTTGATGTTTGAAAA CCAGTAAAAATTTGAGTTTGTCCACTTGGGTATTTCTATTTTTGGTTTTTGGTCTCTGGG TAGATCCCAAATTTCTGTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTGGATGCCGAGAAAATTATAAAA AGAAGAGAAAATGAGGGGTTTTGATAGTTGATGTTTGAAAATAAGTAAAAATTTGAGTTT GTTCACTTCGGTGCTCCTATTTTTGGGTTTTGGTTTCCGGGTAGATCCTAATTTTGGTTT TGGTTCGATGCCACGGAAAACTTATACATGAGGAGAAAATGAGGGTTTTTGAATAGTGGA TGTGTGAAATAAGTGAAATTTTGATTTTGTTCACATGGCTATCTCTATTTTTGGTTTTTG GTTTCTGGGTAGAGATCGAAATCGTTTTTCGTTTATGTTTTTGTTTGTATGCCGAGAAAA CATTAAAAAATTAAGAGGAAATAAGGGGTTTTGAATTGTTGATATTTGAAAAGGAAGTAA AATTAATATATATATATATATATATTTTCATATGGGTGTCTTGTTTCTGTTTTTGTTTTT 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