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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI000960Chr52103327221034505+Disease resistance protein RRS1

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI000960.m185104PF03106.18WRKYDomain25.21.60E-05
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>LITCHI000960.m1
ATGCCTCCTCCATCTCGTACAAGCACTTTGGCAGCTCGTCGCATTACAAGAAATGACATT
TTGCACAACATAAATTGCTTGGTCCACAAGACTCAAGCTAAGGAGATAGATTCAGACTTG
CCTGGAGGGTCTTCATTATCTATCAATGACAATGCAAGAAGTGATGGTTCTGATGGGGGT
TCGAAGGATAATCTGGATAAACATAAGAGCTTAAAGAAGCGAAATATAGTCCATAGCCCT
GAGAGTACTGATGATGATGGCTACAGCTGGAGAAAATATGGGCAGAAAGATATTTTTGGA
GCCAAATATCCAGGCGGTGCTATTATAGATGTGCATATAGACATGCAATGGGATGTTTGG
CTACAAAAGAAGTGCAAAGATCAGATGAAGACCCCACAACATATGAGGTCAAATATAGAG
GAGTACACACTTGCTCAACGGAAGGCGGCCCGAGCACGGAGCTTGGTGTTGAATCAGGAC
TCAAACTTCAATAACCTCAATTGA
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>LITCHI011618.m1
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MPSGMSYFIKKLNWSDKIFQLGSHDKFEQELEVLGKLNNSNVMTPLAYVLSTDSAYLFYE
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LTGKPAVTEGTELAKLVLRCSAQQDKLDNILDSSVTRTLPAIRSQMLAVLKVAIACVNVS
PEARPKMRSVLRMFMNAR.
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>LITCHI011618.m1
ACGGGAATAAATGGTAAGAGATTGAACGAAGATCCCAATGTACACAAAAACAATACTCAA
ATCTGTTCTGCTGATATTGAAAAGGAAAGTGTACTGGTAACTGGCAGGAGAGTAGAGTGT
CATGCATACGAAAGTTTGTGATGAACAGGAAAGCACGGCCAAAAAAACCAAAAAAAAAAG
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CTATTATTCTCTTCCTTTGCTTCTCATGTTCTGTTCTGCTGTGTTTTATGTGCCCTCCTC
CTCCCACCTGAAAAACCGACACTTAAAAAACTATAGGAGACGTTTGAGTAACTTTAACTC
AGCTATGTTCCTGTCTCCTTTTTCCTTCTTCTTCTTTGTTTTTTCATTATGTCCTCTGGT
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TGACTTCCTGCCTGTTGTTTGCCAGATAGGTTCTTTGCAGGCTCTTGATGTTTCCAACAA
CCAGCTGAGCTCAATCCCACCTGAGTTCATCACAAGTTGTGGAAAGGTTGATGGGTTGAA
GTCGTTGAATTTTAGCAGGAACAGGTTGGTTGGTTCTTTGCCTACTTTTCATGGTTTTGT
TGGATTAGAATTCTTGGATTTATCTTTCAATCATTTGAATGGAAAAATTGGTGTAGAGTT
GGATGAATTAGTTAGTCTCAAAAACTTGAAACTTAATGGCAATATGTTTCATGGGACTAT
TCCTACCAACCTAGGAAAATCCAAGGCTTTAGAGCAACTTGACCTTTCTATGAATAAGTT
GAATGGTGCAATTCCTGATCAAATAGCAGATTATGGGAATTTGACTCTGATTGATCTTAG
TGTTAATCAGCTTTCTGGTTCTATTCCTCCTAGAATTGTACAACTCTCCAAGTTGAAGGT
TTTGATTTTGTCTGAAAATAATTTAACTGGAGAAATTCCAGCAAACCTGTCAACTATACA
AACCCTGTCTCGTTTTGCAGCAAATCAGAATAATTTTAGAGGTCCAATTCCTAGAGGGCT
CACAAGATTTCTGAACAATTTGGATCTTAGTTATAATAAGTTATTTGGGTTGATTCCATC
AGATTTGTTGTCACAACCATATTTGCAGACTGTAGATTTATCTTATAATTTATTGGAGGG
TCCAATACCAGAAAAGGTGTCTTCAAGCTTGATCAGGTTGAGATTGGGAAGCAATCATTT
TCTGTCTGGGGAGATCCCTTCTGCTATATGTGCAACACCTGGGAAACTAACATACTTGGA
GCTGGATAACAATACCTTTACTGGAATGATACCTCACCAATTGAGTTCTTGCCAAAGTTT
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TCTTGGTGATCTTCAAGTTATGAAGCTTCAAATGAATAAGCTGAGTGGAGAGATTCCAAG
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GCTTGGAGAAAATCAACTAAGTGGGACAATCCCGATCATGCCAACAAAACTGCAGATTTC
TTTGAATCTGAGCAGCAACCACTTTGAAGGACCGATCCCAGCTACTCTTCGCGGGCTGCA
GGGATTAGAAGTTTTGGATCTCTCAAACAACAACTTCTCTGGTGAGATTCCAGAATTTCT
GACCCAAATGACATCCCTTACACAGTTGATACTTTCTAATAATCAGCTCTCTGGAGATAT
CCCTGAGTTTCGTTCATATGTTTCACTAAATACTAGTGGAAATCCAAATCTCAGAAACAG
AACAACACCAAACATTTCCCCAGAGCCAGCGAAGAAAAGAAAGTCGGTTGCTGTGGCAAT
TACAGTTGCCCTTGGGGTTGCAATTCTGATTATTGGGGTAGTCTCAGTCGTCGCTCTAGC
AATCTCAAGACGCTTTTACAGGGTTGATGACGAGCAATTACATTCAGGAGGGGATCTTCC
ATCTCCTCAGGTCATCCATGGCAATTTTTTGACGACGAATGCAATCCACAGATCAAACAT
CTGCTTCCCCAAAGCCATGGAAGCAGTGACTGATCCGTTGAACATAGCACTGAAAACAAG
GTTTTCAACCTATTACAAAGCAATCATGCCATCCGGAATGAGCTACTTCATTAAGAAGCT
TAACTGGAGTGACAAGATATTCCAATTGGGCAGCCACGACAAATTTGAACAAGAGCTGGA
GGTCCTGGGGAAGCTGAACAATTCAAATGTGATGACTCCTTTAGCTTATGTCCTATCTAC
GGATAGTGCTTATCTCTTCTACGAATATGCTTCAAAGGGTACACTTTTCGATGCTCTTCA
TGGCAGCCCCGAAAATGCTTTAGATTGGCCCAGCCGTTACAGTATAGCAGTTGGAGTAGC
TCAAGGTCTTGCTTTTCTTCATGAATGCACCTCCGGTCCCATTCTCCTCCTCGACCTATC
TAGTAAAAACATTCTGCTCAAGTCAACAAAAGAGCCGCAAGTTGGAGACATTGAACTCTG
CAAAGTCATTGATCCTTCAAAGAGCACTGGCAGCCTTTCCACAGTTGCTGGTTCGGTCGG
TTATATTCCTCCAGAGTATGCTTACACAATGAGGGTAACCATGGCCGGGAATGTTTACAG
CTTTGGGGTTGTTCTGCTGGAGTTGCTGACTGGAAAACCTGCAGTTACTGAGGGGACTGA
GTTAGCAAAGTTGGTATTACGTTGCTCAGCACAGCAAGATAAATTGGATAACATCCTTGA
TTCTAGTGTCACCAGAACATTACCTGCCATTAGAAGCCAGATGCTTGCAGTCCTAAAGGT
TGCCATTGCTTGTGTTAATGTCTCACCCGAAGCAAGGCCAAAGATGAGGAGCGTGTTACG
GATGTTCATGAATGCAAGGTAAACTTTGCCAATGGAAAAATTTGGGTTAGTGAAGTCAAT
TTGGAAGCAGCAGTCTATGCATAAGATGGTTATTGGTTATCCAGAGTTTTGATCGTATTA
TAGTATTAGCTACTGCTAGAACATAATCTTCTGCATATACAAATATATGGCTGCACCGTA
ACTTGTAAGGCAACCTGCATGTAAAAGTCGCTGATTATGAAAATATTTGTCATATATAAT
ACGTATAAAAGTTTGTGTCAGTAGCTCCATTTTAGCTTTACACATGCTTCTAAAAGGCTT
ACGCAATGTGAGAATTACATGTTATCATAAATACTCATATTACATGACAAGATAAGAATG
CAGCAGGTGAAAATGTGCTTCATAACTGGCTATTTTGTTGTATTCTTGTATTGTAGTAGA
TTACTGAGGAAGTTTCATGCGATCTATCCAGAAAACTTGGTGAACAATATATAGGCAAAA
TCTTAGAGGAATATAGATGCTTGGCATGTTTAAGAGATTGATTAATGAAACATTGAGACA
ACAATGAACACCCAAAATTTAATGGACAACACAACAGAGAAAATTAAAGAGTTCCTGACA
GCCAAGTGAAAAAATATATATATGTCAGAACATTAATGGAATGAAATTCGAAACAAACAT
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GAGAGGGGGTGAGAGATCTGACAATCAATCGAAAAGCCAACAACATCTCATTTTGAGACA
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AAGAATTGAGCCAGATCAGCACCATATATAACACGATGATCAGCCGTAAC
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>LITCHI011618.m1 -  Up_Stream_Len 2000
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AAAGGAAAAATAACAGATGAGGAAGCCAGAGAATGGGCCACCTTCACCTTGTTTTCTGAA
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ATAATAATCAAAATCAGAAGAAAAACATTGTAATATTGACTAACCCGGTTGTAGTGTTGA
GTCATATTACTTCCTATAAAATTTTTACAAACAAAATTTATTTTAATGTGTGTATTTATG
ACATATCTTCATAATTCTAACGTGAAAAGTTTGAATAAAAATTCATTTTACAAGTCAATG
CGCCAGTTGCCCCACGACCTTTGGTGGCATGGGTTCGACACTCTAATAGCCAAAAAATAA
TAGCTTTCCACCATTAGGTTGTCCTTTCACTCTCGTATAGTTTCTTCTCCAACTATATAT
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GTTGATCTTTGTAAATCTCATGACCAGTTGCAATCCTTAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAA
AACCACTTTATACGAACTTGTCTTTTCCAATGAAGTAGAATTCTTGCTTTTACACATCAA
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TTTCCCCACATTAATATATACATATTTAAAAAATAAAAAGTGAGTCAACAAAGTAAACGT
GGAAAAAACACATCAGAAGGTTTTATTACTCCCAAAGTCATTCTCAAAAACGCGTTTCTT
CTAGTCAATTGTAGTGTGGGCTCCTCCTCCCATGACTTTGAATCTTCTCCTGCCTTTTCT
TTCATGACTTTGCAGATGCAAACATTTCAGCGAAATCAATACTTTGTGTCGGTTTCCATT
CACTTTCTTCTCAATTTAACGTAAATCAGATTTATTAACTAACAAAAATAAGATTTGAAC
ATTTCGAAAAAAAAAAAAGAAAGAGATATCAAGATTAGTAAGAAATACTGCCGTACAATG
AATATACTCTCACTTTATCTGTTACGTAAAAATAAAATATTGAATCGAATGTATATTTAT
CAACAACTTTATACAACATACGTTGTGGTATACTTGTTACGACAATACTTTCATTTTCGT
TTTAATATATAACATCAATATTTAGATTAAATGGTATATCAAAACATATTGACATCAATT
GTTCTAAGTATAGGGTTTAACTACAACCCTTAACATTGGAGAAAAATCTTCTTATATTTT
ACAATACTACACTATTGAGACCTTAACCTAATCCTTCACTCGTTATCCCGTAGGGTTTTG
ATTTTTTTACCTCATTCCCTTAATTGGTAGGAGATTTGTATCCAAAAAATACTTAATATT
TTGAGTTTAAATCTCAATAAACTATTTATTTTATGAGATAAAAGATCAAAATCTTACGGG
AATAAATGGTAAGAGATTGAACGAAGATCCCAATGTACACAAAAACAATACTCAAATCTG
TTCTGCTGATATTGAAAAGGAAAGTGTACTGGTAACTGGCAGGAGAGTAGAGTGTCATGC
ATACGAAAGTTTGTGATGAACAGGAAAGCACGGCCAAAAAAACCAAAAAAAAAAGGGCAG
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TCTCCACTTGGTTGCAGTTCCAAGTCTGCAGTCAACTCCACTTCCAACACAGCACGCATC
CAACACACCAACAACATCTTTTCTTCTCCTTGAAATCCCCAGTCTCCATTTTCTTCTATT
ATTCTCTTCCTTTGCTTCTC
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>LITCHI030616.m1 GenomeSequence - 
ATGTGTATTGTGCGTGAGAAATGTTTGATTTGCGATTTGCAACATGATTATATGAGAAGT
GTAAAACATTTTGTGCATCTTAAACCTTCTGGACTCACCAAATTATTACAATATCACAGG
AAAAGGAAGACCAGTTATGAGCTGGCCAACTTGAATGAAAATTGCTTTAGGCTCGGCGAG
AGGATTGGCGTATCTACATGAGGACTGTGAGTATTCTATGACTTTTGCTTACATCTTAAA
CTTTAAAAAAACTTAAGATTTAAAGTACATGTCTTGGAGTTTCACTCATTTTGAGTAAAA
ATATTTACAGATTAGCCCAAGATCATGCACCGCGATATAAAGGCCGCTAATATTCTTATT
AATGACAGCTTTGAGGCAAAGGTATAATTTATAGTCTTTTCACATTATTCATACAAATGT
AACTATTCTTTGGATAGTTCCAGTTTAAGCCTTTGCCTCTTGCATTCATTGACTTCTCTT
TTTAATCTTTGCTGGATTGAGTTCCAATGGATGTTATCATGTACCTTTATAGGTTTCTTC
AGTTCTTGTGAAAATCAGTGGTTGGAGAGCAAAGTTAAAGTGATATTATTGCGAGATATG
TAGGATTTACTGTCTGACTTTGTGCTGATATGTGTCAGTTTGTACAGAGGTCTGATCTGT
TCAGATTTTTGTTATTTCTGTTCTCCTGAGAATGTATGTGTTCTTGGGTTAGTTGTTCTA
TGCCTGGTAGTGTTAGAATGAATCTGTTTGTTCTCATTTTCCCCTTATAAGAAGATTTGT
AATGAAGATTTCACACAGCAAGTCATAGATCTGCAAACAAGATCTTAATTTCTCCCTTAA
TGTTCCTTCCGACGACAAACGAAAGGTCCAATTTCTTCTTTTATTGTTTAACTGCCTATT
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AAAAATTTCATTCTTCTTTTCACACATCATTGTACAGTTTCCTACATCCTCAAAAATTAA
TAAGGTTTCTATTTATTTTTCCAATTTTTAGGACACATGTTAAACACAATTTATATCGAA
AATAGAATCCTCAAATTTGTATTGCATGACATATGCTCAACTCCATTTATGAGATAGATT
CATCAAATCGAAACTGAGTATGTACATGATTGGACAAAATTATGAGCAAGTAATGGTAAA
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CCAGAGTATGCGTCTTCTGGAAAGCTCACTGAGAAGTCAGACACATTTTCCTTTGGGGTT
CTGCTTCTGGAGTTGATCACTGGACGTCGACCTTTTGATAAAAATAATTCCTTCCTTGGT
GATAGCATCGTCGACTGGGTATGTTCTCTTTGTCGCTACAACCGGCTGCTGTTATGAATT
TTAGTTTAAGCATTTACGGTCTTCATGATATTCCGTGCAAGATGATACAAGTTATTTCAT
TCTATTTGCCGGTGCCCACTTTTTACTCGTTAACCTGTAGGTACTGTCTTTTATGCAACA
TGATACAAGTGATGGTGGTCAGAACCCATCTAGCTCTACTACTGAGGGCCAGCAAACAAC
TCAAGAGATAGAACTTCAGAAAGCCGAGAAAGACACCAATGTCTGATCCAACCATTGGCT
GCCATGCGTTTGGTACACTCTTCCTTAACTGATCCAACCATTCAATTCCAAGATTTTCTC
TGTAGTTATATCCCACATGTCAGCAAGTCGAGAACAAAATTAGGACATGCCAACGGTAGG
TGTAATGGATCAAATATTGGAAACAGACAACTTTAACTATAATTCACATTGATAAGATAT
TCTCAAGATGAATATTCATTCCACTATATATCTTAACGATTTTATACTCAACTGAATATC
ATTCAATCGGGGATTCTTTCATCACGTGATCCACTCAACCTTATAAATTTTGATACTAAA
ACTTCATGGGGTTATGTGATGTGCAAGTCTGGGATTAGGCAGAGGGTTGTGCAGTTGCCT
GGGTAGTAGGCGTAAGTTTGATATAGTAGTTTGTAACTCATTAATATTAGGCGTTATTTT
TCATTGTTTAGAGTTGATGAAGTGATTGTATATGGAAAGAATATTCAGTGACTGGGTTGT
GTTTCATTTAGTAGTATGTCAATGCAGTTGAGTTGTAAATGTATTATTGTTGAA