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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000899 | Chr5 | 20181766 | 20185997 | - | Auxin response factor 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000899.m1 | 230 | 300 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 25.3 | 1.40E-05 |
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>LITCHI000899.m1 ATGGGGAATTTCAGGCGAGAAATAGAAGGAAAGCTTCAGTCTTTTCTGCATCTCCCAATT TGCACTGTTTTGCGGGGTATTTGCTGCTATGTTGCCTCACGCATGTGCAAGGGTTGTAAG CTTCTTGGTACACACAAGGAACGTGCACTTGCTCTGTTGTTCTTTGTGATGGAGGCAATA TCAGTTGTGTTGGATGTTATTGGGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTAGCTGCATTTCTC TTATCAGCATTTGGTTTTGCTATAACTCTATATTCTTGTGTGGAGGAAAAAACCAACATG AAAACATTGGCTGAGAGGCAACTAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCAGTAATTCAGTTG ATTGTTACATTCATTCAATTTCTTCTAACAGTTTTGCAAGTGGAAAACAGCTACAATGCA TCAACTTTTCCACTTGCCTTCGCGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTCAAGAAGGGTCGA AAGAATGTCGATGACCATTCACCACCAAGAGACTTTCATTTGCCTCTTGTGAATGCTCAA CCTATTGATCACTCTATGTCTATTAATACTCCTACTGAACTTGATCAAAATGGGACCTCC TCGCCGAACCTAACAAGTCCTTCATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCCAAGAATATTACG GTTCTTGTGCCGGAATATGGAGTTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTGTTCACAAATTAC AAGGACCTTTATAAGGGGTTGAAGACGATGTTCAACATTAGATTATACTTCAACAAGCGA CCAAAGAGCCATTGGGAACTTATGTATGAAGATGATAATGGTGACATGTTTTTGGTTGGA GATAATTCATGGGATGAGTTTTACCACAATGTGAGGAAACTTCATCTCTACAAAAGGAAA TCACTGAGAAACAATTTCATGGTGAATCCACAACAGATCATGCATGATGATGTTTCTCCA CCAGCACCATTGCCAGCAGAGCAGCAACAGAATATGATGGAACCGGCAACTGCATATGAT CCTCATTCATCACGTCTAAATGATATAGATATAGAGGCGCCATCAACTCTCGATTTGGAG ATGATGACTGCACCAGCACCAGCACCACCAACATCAGTATCATTGGACCTGCTAGAGGCT GATTCTGAGGAGGGGTTATTGCGACTTGCTCATGCAGAGATGGATGCCAGCGATGTGACT AGGCCTTGGGAGTAG
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>LITCHI000899.m1 - Up_Stream_Len 2000 TGTTAAATGTATAATCGGCGCATTAAATCTCTCTCGAGAACTATAAAGATTGAGTCGGTG TGAAATTTGAAAATCAAGATGTTCTGGCATTGGCCTCTCAAGACACTGCTTGGCACGAGC TCCTCGATCTATCTACTTATATGAGCTGAAGATAGGTTAAAGTGGACCGAGAATATCTTG AAGTGGACCTATTATAGAAACGAGTTGGAAAGCAGTGAGACGGGCTTGATGCAAGTGTGA GCTTGACGATCTAGTGAGCTCGTGCAGCGACCTGAATACTAAGCTCCTTGAGCCCTTTGT TACTGTGCTCGTCTTTTGGGCCTTCAACAGTCCATTTACCCATATCGAGAAAACAGACAT AACAAAAATCAATACAAAATAACATGCTTTAATTAATTTCGATACATGAGAAGAATTGTA ATTTGATCACGTTTAAGAAATAAATCTATGTTATGCTCTTCTCCAACTCTTTCTCTTTCA TTTTCTTCCACAAGAAATGGCCCATCGTTGTCATAATATTAGAATACTTACTAATTAAAG GAAAGTTTTCAGAGTTTTCTTACTAAAACAAATATGTAAGATGAAAATGGAGTATATTAG GGTTTTAAGAGCATAGCAATATTAACAAAATATGATAAGGATATATTGGATATTTTAATT TTTAACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTACTTTGAAAAGCTCAAAATTTGATCTTCTTTC AATAGATATATTTCAATTTTTTTTTTTTAATTATCTAAAAGTTTTGCTATGATGACAACC AAACAATACATAAAAAATTAAAAAGAACTTTGTAGATTAAAAAAATATTTTGACCAATAA ATAAGTTATATCAAACATATATATATTTTGATTGGTGATTACATTAAAACTTAAGTTCAA ATACCCTTCGCCAAATCAAAACGGAAAAGCGCGAGTAGATTTTGTTAAATCATTAATTAT GGTAATCAAACATATAAATATTATTCAAAACTTTACAAGTGTTTTTTTGTTTTAAAAAAA AAAAGAATTATTTTAAATACGTATCCTAAAGATACATGTAACATGTTACTATTCAAAAAT TAAATAAAAATTGCATATTTATTTATTTAAAACATTAAAAAAATATATATTTATAATGAT CAATGTTGAGTAGTTTCAACTTTTATCCTAATATGTTCACAAGGCAAGCATCTCAAATTC GAGTAATGTCCCTTTCTCCAACTTCTAAATATTTAATGATTAAAATAGATAAACATGTCT AAATCTCACGAAATGCACATATTTTAGAAATTTTAGGTATAGATTTCATTTTAGAAGTTT CTTTCTCTTTTTTTTTTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTCATTTTAGAAAT TTCATGTGTGTAGTTTTTCTTCCTATTGTGTAGGGAACTATCTTTTGATTATTTGCATAT CTAATAATAAATGTAGTGATTGATCACAATAATTATCAACAAACATTTCATCTATTGGAT GTTGCGCTTAAAAAGAAAAAATGTAACCATGGTAAAAGGTGTTGACCATGCGATTGAACG AACACATTTCTTTATCACATTATAATATGAAATCTCATTATAAATAGCTAGTGATAGAGT GGTACTACTACATATATAAAAACAATCATGATACTTATTTAACTTATAATAAAAACAAAC TTATAATTTTATATAGTTTTTTTTTCGAAGTTAAATGGAAAAAAGGAAACACAGATTATT TTCCACTGCATTGACTGGTTTAGTTTCCTCCAAATTTCCTTAAAACTTCCTCTTTCTTAT CCAGATTTCCTTAATTAAAATTTCATTAGATCTGACAACTTTTCATCACTTTCCTCCTCA TCTGAAGACCAAAAACATGAATGCTCTGTAACCACTCTTTCTTCTGCTGTCCTTCACTTG TGTTTCTCTCTCTGCAACAATTCTCGTAGAAAAGCAAAACTGACACTGTCCAGGAAAAAG GGAAATTTGTTCATTGAAAA
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>LITCHI000899.m1 GenomeSequence - ACTACATATATAAAAACAATCATGATACTTATTTAACTTATAATAAAAACAAACTTATAA TTTTATATAGTTTTTTTTTCGAAGTTAAATGGAAAAAAGGAAACACAGATTATTTTCCAC TGCATTGACTGGTTTAGTTTCCTCCAAATTTCCTTAAAACTTCCTCTTTCTTATCCAGAT TTCCTTAATTAAAATTTCATTAGATCTGACAACTTTTCATCACTTTCCTCCTCATCTGAA GACCAAAAACATGAATGCTCTGTAACCACTCTTTCTTCTGCTGTCCTTCACTTGTGTTTC TCTCTCTGCAACAATTCTCGTAGAAAAGCAAAACTGACACTGTCCAGGAAAAAGGGAAAT TTGTTCATTGAAAAATGGGGAATTTCAGGCGAGAAATAGAAGGAAAGCTTCAGTCTTTTC TGCATCTCCCAATTTGCACTGTTTTGCGGGGTATTTGCTGCTATGTTGCCTCACGCATGT GCAAGGTTACTTTTTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTAATTTTGTCTAAATATGCTTTAT TTTATTTTATTTTATTTTATACTTTTGCTTTATTTTTAAGGATAAATTTGTTGATTCTTA CAATCTACTGCTGTGAATCTGTGACTGTGATCAATTTATTTGATGGATAAATTAGATATT TGCTTCTTTTTTTAATATGGAAAATCACACAAACTTACCTTGAGTTTGACATATATGACA TCATATTGAATTTTTGATAAAAATGATATAGGTATCCCTTCCGTCAGTTTAGAATAGTTA GATTTAACTCTTAATAAGATCAAATTACTCCTCTAGTTCATTTATCATCATATAAAAATA ATAAAAAGAAAAAATTTGAAAAAATCCCTAAAATGAAAAATAATATCATAATTAAAAAAT AATTTCAAAGAACAAAGAAAAATTTACTTTTAATATCAATTAAAAATTAATTTATGAAAA TATTTAATTAAAAAAAGGAAAAAACCTCTACTGGTAGAGCTTCAATCTCCCCTATTGTCA TAGGAGGAACTCGATGATCTATCACAAAGTAGATTGTCAAAAATCTCCCACAAAGGAGAA GATTAATTGATTTCCTTCTATTAAAGACCGGTCTATAAGTGAATAACACAATCTACTCCT AACGGAGATCATCTCTTCTGTAGAGGAGATCTCGATCTCTCTCTACTATGGAGGAAATCA ATCTACATTTTAAAAGAAATTCACAATCTCCTTTTCCTACAATTTTTTTTTTCGAAATTT TTGTTCCTTTTGTTTTTGAAAGTCCTCAAAATTTCGTTTTGGAACAAATTTTAATTATAA AAGGAATGTTTAGAGCCGTCTTAAAAATTGCTTTGGGTAAAAATATACTTATAAAAGTTT TGAGATTGGTTTTAGAGTTCTTAATTTTAGTCAATAGTAAAATGTTAATTCTACCCTTCA TTGTTATATAATCTGCTAGGTCAACTGTTAATTTGACCAGCAACAAAGAATTTAATTTAA TTAAGGCTAAAAATATAACATTACAATTTTTTGAATTAAAATCAAGGTAAGTTTGAGTAT TTTTGCCTTCCTAATATGTTTTTGCAAAACATTATTGGAAAATTACGAACTTTCACTGAT CTTTACAGCCATTTTATTCTGCTGCACAGATTTTGTTTTATTAAAAGACAACCCCTTGGG TTAGTGGCTGTTACACGAGGACATTTTAATCACTTCATGTTTTAATCTTTTTGTAGCTCT TTATTGCTTATAACTTATCAACATCATGTATATGATAAGTTTAGTCTCCAAAATCATAGG GTTGTAAGCTTCTTGGTACACACAAGGAACGTGCACTTGCTCTGTTGTTCTTTGTGATGG AGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTGGGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTAGCTG CATTTCTCTTATCAGCATTTGGTTTTGCTATAACTCTATATTCTTGTGTGGAGGAAAAAA CCAACATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAACTAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCAGTAA TTCAGTTGATTGTTACATTCATTCAATTTCTTCTAACAGTTTTGCAAGTGGAAAACAGCT ACAATGCATCAACTTTTCCACTTGCCTTCGCGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTCAAGA AGGGTCGAAAGAATGTCGATGACCATTCACCACCAAGAGACTTTCATTTGCCTCTTGTGA ATGCTCAACCTATTGATCACTCTATGTCTATTAATACTCCTACTGAACTTGATCAAAATG GGACCTCCTCGCCGAACCTAACAAGTCCTTCATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCCAAGA ATATTACGGTATGGATCTAACGAATCTCCATTATTATGTTCATTATCGATAATTTAAAAT AATGTTACTTTTTAACGTTAAATTTCCAATGATAAACAGTATATTTCACTGAATATGATG AAAATAGTTGTATGCTGTAATGCTACACAGTGAATTAATTTATATGAATATATAAAATTG GTCTCTCAAACTACATTTCTACAATGTTGTCAACATTCAAGGTAAATATTTAGATAACTT GACTATTGACCCTCTGTCAAGTCTGTACACAAGCAGTATAATTGCCTTGAATTCTGATGT CCAGATTAAAGTTTTTGATCGTGGTACTCTTATTTGAGGTTTCCAAGCATGTGTTTCTGC GTCTATATGTTCCTATATTTTGGATATGCATTTGGCAAATGTTTGATAGCGTATTTACAT TTTTACAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAGTTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTGTTCA CAAATTACAAGGACCTTTATAAGGGGTTGAAGACGATGTTCAACATTAGATTATACTTCA ACAAGCGACCAAAGAGCCATTGGGAACTTATGTATGAAGATGATAATGGTGACATGTTTT TGGTTGGAGATAATTCATGGGAGTGAGTGCACTTGCTTTAGTCTTTTGTTCATTATTCTT TCTTTGTTAATATATATCTGCTCATTTTCTTATAACATTTTTAGAGGTTAATATTATCGT TGATTTATTTTTCTTAAATTTGGATTCTAGGACATAACTTATGTCTAGGACCACGATTAC AAAAATTTTACATATTCATTTCTGTCGTTGGATCATGCATGATTTCCCGTGTTAACATTG GAGAGTGGTTCTTCAACGAATATCTTACATATTCATTTATTTTATGTTTACGATTCAGTT GCTTTAGTTTTGATCTTGTAAATTTGTGTTTGATTGCAGTGAGTTTTACCACAATGTGAG GAAACTTCATCTCTACAAAAGGAAATCACTGAGAAACAATTTCATGGTGAATCCACAACA GATCATGCATGATGATGTTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGCAGAGCAGCAACAGAATAT GATGGAACCGGCAACTGCATATGATCCTCATTCATCACGTCTAAATGATATAGATATAGA GGCGCCATCAACTCTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGCACCAGCACCACCAACATC AGTATCATTGGACCTGCTAGAGGCTGATTCTGAGGAGGGGTTATTGCGACTTGCTCATGC AGAGATGGATGCCAGCGATGTGACTAGGCCTTGGGAGTAGAGGTGGGTATCTCTTATCTA ACTTGGCAAACCCAACTCAACTTAACCATTTTTTATTGGGTTGGGTTGAGTTAGGTTACA TCTTAAAAAAAATGGATGGGTTGAGTTGAGTTTGGTTGAAAATTAAATTGGATTGGGTTG AGTTAAAAAATTTTCTACCCAACCCGGTCAGAACCCAACAAACGTCTATTCTCAATTTTA AACTCAAGATTTTCTTTCTTCTCTAGAAGAGCATTTGTTGAGGATAAAGATTAAAGACAA TCTTTATGTCGAATGTACTCTTTTATTTACAATAATTGGATTTTTATTTTTATTCATTTT ATCTATAATCAAATTATTAAGATTAAGAAAGTAATCAACTAGACCATTTGTGCCTATGTG GTAAATTAAATCTAACTCAATCTATCCAACCCAACTATTATTGGGTTGAGTTGAAAATTT TTCAACCCAAGATTAAAAAATTATCAACTAGATCATTTGTGTCTTTGTGGTAAATTAAAT TTAACTCAATCAACCCAACCCAACTATTATTGGGTTGGATTGAAAAATTTTCAACTCAAC CCACCTTAGGTTGGGAAATTTTTAACCTAACC