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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000899 | Chr5 | 20181766 | 20185997 | - | Auxin response factor 1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000899.m1 | 230 | 300 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 25.3 | 1.40E-05 |
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>LITCHI020914.m1 ATGGAACAAATGGCTGAGACAATTGAGATATCTGATGAAAGTAACAGTACTACTGGAAGT GCAATTCAAGCCCACACCTCTTGTCTTGTCAGTTCTCAGAAATGTTCATCCTTTGACTTG AACGAACAAGCCATGGATGATGAGAATGATATTAGCACTACCAATGAATCATACAAAAAT TTTATCAAAGATCAATCATCTCCAGATGGTAATACAAGCAGCACCACCACGACCATGGAA GGCAAAGAGCGAACCACCACGGTTAGACAATATGTTAGATCGAAAATGCCTAGGCTCCGT TGGACTCCTGATCTCCACCTAGCTTTCATGCACGCTGTCGAAAGGCTCGGTGGACAAGAA AGAGCAACTCCAAAATTAGTTCTTCAGCTGATGAATGTAAAGGGACTTAGCATTGCTCAT GTGAAGAGTCATTTGCAGATGTATAGAAGTAAGAAGCTGGATGAGTCTGGACTAGTTCTA TCTGAAAATGGCAGGACCATGAGAGGAAGACATCACATTATCGAAATGTGCCAAAGATTC GAGCGACATCGCCATTTTAGAATGCACAGAAGCCCAATCCCACCGCCGGTACTGCTCAAA CATCCATACGACTTCAAGGCCAACTCTTCAAGATCCGAAGCATGGACCTTAAATGATGAT TGTAGTAGATCCACAATCTCTCAGAACGGGAACAAGTTGGCAAGCAGTTCACGACTATTT GATATGGAGGAAATAACAAGAATCAATGGACCAATAAGACCTAGTCGATTTCTTGAAGAG AAGAAATGGCCTCCTCGTAACATGATTGGAAATCAAAGGAGCATAAACAATCCTTTCATA TCTAATTGGGGTGATAACTTTGCTGCCCAAGCTTCTACTACTTGCATGGCCAGAGCCATA TTTAACGACAACGATCAACTTCAACCCAAAACATGTAGCTCCGTATTCATGTCTTCTATC AATGGTTATGATTCCAAGTTCGTGAATTCTTCTCCTCTTGAGGTGGAACCTACAAAAATG CCTCCTCAAAGGCTACAAAAAGGGCAGTTGGAGGTGAAATGCGAGAGTGGTAACAAACAG GAGAAATGGTCACCTGATTTACAGTTGAGTTTATTCCACAACATGAATGATAATCAGCAA AATACTGAAGAAATTGACACAATACTTTCTCTTTCTCTATCACCAGCCTGTGCATCCTGG TCAAATACTACTTAA
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>LITCHI020914.m1 + Up_Stream_Len 2000 CTCATTCAAAGGCTCCTCGGGTGTCCCGGAAGCAATCGTCTCAACGGTTGTGTATATATT ATCCAACCATTGGAAGTCTTCCGATTAGGACAAAACTATCTAAGTGATAAGAAGATATAT TATATGATTAAACGAAAATCACAGGAAATAATCAGTCAGAACAATAAGACAGAAATTTTG GTGTTTAAATATAGGACATTATAAGATAATTTAGACATTTGTAGGTTTCAGTTGATGGCC TGCCTTTTTCACAGAGAGCTCCTGCAAAAAATATATACAAATCAATCATATTGTAATTAA TTAAGTAAATAAATCAAGATGGACAAAAGTGTTCAGTCCCCAGCAAAGGTCAACTTATAA AGATTATCATTGATTTGCAAGAGATAGAGATAGAGAGAGAGAGAGAGGGAGGCAGCTGTC AAAGAACAATGATAACGAGAAAGGCTCGAGAAGTCACATGATTTTCAACAGTCAAAGAGG GTGGTCGTAATATTGGTATTACTATATGTAATTGAAGTGTGAAGAGATCAAGTTGAAGCA AGACCATTGTCTTCCATACACATTATTGTATATATAATTTATTGCATATTGAAGTCTAAA GAATTTTTGAAGTTTGGTGAGTGACGGTATGAAGCTTAATTAATTTTCCACACATTCCTA GCCTAAAATTCCACATATAGATAGTGAAACTTGAATATTTCAACGCAGGGGAACAATAAT ACCTCACAGTAAAAGCTCTCCCTCTCTCTTCCTCCTCTTTCTCTCTCCGTGTGTGCTTGT TTACTTCTGGATCCATGTTAGAGCTCTTCCATTCTTTGATGGGTAAGTTTGTTTTAACTT CTCTTTAAATCTACTGCTAGCTAAGCTGTTACTAGATCAGTAGCAAATTATCATACTGGA TCCAAGGATTTGCTTGGATTGAAAGTACATGAGATTTTATGACTATGTTTCAATGAATCT CATAAGTTTGAATCCACTGCTATACATCTTTCTGCTCAAAACCTTGAAGAAGACAGCAAT TAAGCATCTTCATTGTCAATGGTTTTGTCCTCTATGATATGATAGATTGATAGTCACTAT TTCTCTGCACCAGAAAGAAATTAAAGAATCTCACAAATACTATATGTAGATTATATGTTA TAAATATTTATAATTAAGCAGTACTGTTAACTGTTTAATTATTATTATTATTATTATTAT TATTTTGTTGCTTCCCTTCTTTGTTTGAACTTTAATTTTAGTCTCCTTAATTTGTGTTGT TTTCAAGGAACAAAATGGTGTAATTACCTTACTATGTATCCTTCTTTTAATAAAATTTCC AGAAGTTAATAATTTTATCATCATATACTTTGTTTATGTATCCAATCTTAACCCTAAGAT TTGTACCTTATTGCACCCCTTTTTCAAAATCGTAGTTTGTCCAAAATTTTCAATCACAAG CACATTTCTATTACAAGATTAATTTCTAGAAGTAAAGAATACATACTACTTTGTTTGGGT GTATGTCCTTGAATTGAATGGAAACAATTTCATGCACCATTAAAGTTTCAATCAAATTGT GATAACATAGAAAGGTTTTAAAAGAAACTTTTGTCATTTAAGCTGAATATGCCTCTCGGT GGATATAGCACGTCATTTTCCACTTTGTTATTGTAATAGAGATAAATTAATATATTTATA AGATGTTTATTAGATTTGGAGTAATTGATTGAGGGAATGGATGCATATATGTATATATGC TTGTAATTACACCAGTTGCATGTACACACATGATTTGAGCATCTATCTTTTCTATATAAT TACATCAGTTTCATGATTTCTTTTGCTTCTCTTTTCTTTTTCACTTTTCTCATTAACAAA AATATTTAATGCTATATATAGTACTTATTCCTACTTCCTCATTATCAATCACTTCCAATC AATTAATCCTACAGTGAAGCAGCCGGCTACATGCATATAGTGTTGAAGATTACTGTGTAA TAAGAAGACAAAGCTTATCA
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>LITCHI020914.m1 GenomeSequence + ATAATACCTCACAGTAAAAGCTCTCCCTCTCTCTTCCTCCTCTTTCTCTCTCCGTGTGTG CTTGTTTACTTCTGGATCCATGTTAGAGCTCTTCCATTCTTTGATGGGTAAGTTTGTTTT AACTTCTCTTTAAATCTACTGCTAGCTAAGCTGTTACTAGATCAGTAGCAAATTATCATA CTGGATCCAAGGATTTGCTTGGATTGAAAGTACATGAGATTTTATGACTATGTTTCAATG AATCTCATAAGTTTGAATCCACTGCTATACATCTTTCTGCTCAAAACCTTGAAGAAGACA GCAATTAAGCATCTTCATTGTCAATGGTTTTGTCCTCTATGATATGATAGATTGATAGTC ACTATTTCTCTGCACCAGAAAGAAATTAAAGAATCTCACAAATACTATATGTAGATTATA TGTTATAAATATTTATAATTAAGCAGTACTGTTAACTGTTTAATTATTATTATTATTATT ATTATTATTTTGTTGCTTCCCTTCTTTGTTTGAACTTTAATTTTAGTCTCCTTAATTTGT GTTGTTTTCAAGGAACAAAATGGTGTAATTACCTTACTATGTATCCTTCTTTTAATAAAA TTTCCAGAAGTTAATAATTTTATCATCATATACTTTGTTTATGTATCCAATCTTAACCCT AAGATTTGTACCTTATTGCACCCCTTTTTCAAAATCGTAGTTTGTCCAAAATTTTCAATC ACAAGCACATTTCTATTACAAGATTAATTTCTAGAAGTAAAGAATACATACTACTTTGTT TGGGTGTATGTCCTTGAATTGAATGGAAACAATTTCATGCACCATTAAAGTTTCAATCAA ATTGTGATAACATAGAAAGGTTTTAAAAGAAACTTTTGTCATTTAAGCTGAATATGCCTC TCGGTGGATATAGCACGTCATTTTCCACTTTGTTATTGTAATAGAGATAAATTAATATAT TTATAAGATGTTTATTAGATTTGGAGTAATTGATTGAGGGAATGGATGCATATATGTATA TATGCTTGTAATTACACCAGTTGCATGTACACACATGATTTGAGCATCTATCTTTTCTAT ATAATTACATCAGTTTCATGATTTCTTTTGCTTCTCTTTTCTTTTTCACTTTTCTCATTA ACAAAAATATTTAATGCTATATATAGTACTTATTCCTACTTCCTCATTATCAATCACTTC CAATCAATTAATCCTACAGTGAAGCAGCCGGCTACATGCATATAGTGTTGAAGATTACTG TGTAATAAGAAGACAAAGCTTATCAATGGAACAAATGGCTGAGACAATTGAGATATCTGA TGAAAGTAACAGTACTACTGGAAGTGCAATTCAAGCCCACACCTCTTGTCTTGTCAGTTC TCAGAAATGTTCATCCTTTGACTTGAACGAACAAGCCATGGATGATGAGAATGATATTAG CACTACCAATGAATCATACAAAAATTTTATCAAAGATCAATCATCTCCAGATGGTAATAC AAGCAGCACCACCACGACCATGGAAGGCAAAGAGCGAACCACCACGGTTAGACAATATGT TAGATCGAAAATGCCTAGGCTCCGTTGGACTCCTGATCTCCACCTAGCTTTCATGCACGC TGTCGAAAGGCTCGGTGGACAAGAAAGTAAGATTAATTTGTTTAACTAATGTACGACTTT GTTTCTAAATTAATATTACTTGATACTGATACTAATGCTGTTGGTTTTAATTGGTTTTTG TTGGATATTGGTTTCTATATATATATATATAGGAGCAACTCCAAAATTAGTTCTTCAGCT GATGAATGTAAAGGGACTTAGCATTGCTCATGTGAAGAGTCATTTGCAGGTAATTATAGT AATGAGTTCCGTGATATTCTTAATTTTTATATATATATGTATAGCTTATTTTGCCTTTAA TTTCCAATTCTCTAATCAATCATTTTTTATTTCAGATGTATAGAAGTAAGAAGCTGGATG AGTCTGGACTAGGTAATATACCATGTGTTTTCTCTTTTCTGCCCGAACTCCACGTGTACT TTTGCCTTTCTGCTTAGTTTTTTCGAAATGGAATAGAATCAATTTTCTGCTTCCTACGTA CCTTGTCGATCATTTTTCTTTCGAGGCATGAACTAATCACAGATTTTGAATGTGTGGTGC ATTCAGTTCTATCTGAAAATGGCAGGACCATGAGAGGAAGACATCACATTATCGAAATGT GCCAAAGATTCGAGCGACATCGCCATTTTAGAATGCACAGAAGCCCAATCCCACCGCCGG TACTGCTCAAACATCCATACGACTTCAAGGCCAACTCTTCAAGGTTACAACTTACAACTT TAAAGATAAACTAAATATTCTTAATATATATATATATATATATATATATATATAAAATAA AAACTTTACTTTAATCTAGATTTTAAAGGAATATATATGCATATTATTTTATATATATGG ATGGTCGTTTAAAACCTAGATTAAAGTAAAGTTTTTATTTTATATAATATATATATGTAA AAGAAGATAAAAATTTTACTTTAATCCAGATTTAAAGAACCATATATATGTATATATAAA ATATTACGTATATATGATATATATATTTAATTTAGAGTAGGGAGGGTTTGAACTTTCAAC TTGAACTTCAACCTTGTTGAGAGTTGTGGTTATTTGTACAGTATATGTACTTGTTCTCTT CAAAAAAACCAATTTTTACTTTTTCAAAACATTTAAATCTATACAAAACAAATTTGTTTT TATTTAACATAATGCTGTTAATGAGTAATATATATACTATGTAACTAAAGATACTATTCT CTCTTTCTAGATCCGAAGCATGGACCTTAAATGATGATTGTAGTAGATCCACAATCTCTC AGAACGGGAACAAGTTGGCAAGCAGTTCACGACTATTTGATATGGAGGAAATAACAAGAA TCAATGGACCAATAAGACCTAGTCGATTTCTTGAAGAGAAGAAATGGCCTCCTCGTAACA TGATTGGAAATCAAAGGAGCATAAACAATCCTTTCATATCTAATTGGGGTGATAACTTTG CTGCCCAAGCTTCTACTACTTGCATGGCCAGAGCCATATTTAACGACAACGATCAACTTC AACCCAAAACATGTAGCTCCGTATTCATGTCTTCTATCAATGGTTATGATTCCAAGTTCG TGAATTCTTCTCCTCTTGAGGTAACATCTCTTTTTATAATAAACGTTAGGGAATGTTTGT TAGAGTGTATATATATACTATCATTGTGGCATTGTCTAACAACTCAAAGCTTTGAATTAA TTGATTTCTAATATAGCATTAGAGCATTGATAACTTAACGGTCTCAAATTCGAATAATTA GGTATATAATTAAAACATATAACCCATAATGGGTCTATGTATCAAACACGTATTAAGCCC TAAGTTTGGCCTTGCACATGAGGGAATGTATTAGAGTATACATACATAAATTTCATTTTC AAATACATAAATTTCATTTTCAACTATATTTTAATATAGCAGTTATTATTTAATATCTCC CTAATTATTTTGTTAATTGCAGGTGGAACCTACAAAAATGCCTCCTCAAAGGCTACAAAA AGGGCAGTTGGAGGTGAAATGCGAGAGTGGTAACAAACAGGAGAAATGGTCACCTGATTT ACAGTTGAGTTTATTCCACAACATGAATGATAATCAGCAAAATACTGAAGAAATTGACAC AATACTTTCTCTTTCTCTATCACCAGCCTGTGCATCCTGGTCAAATACTACTTAACAAGC AGCTCTGTCTAGTTTAAAACATAAGAATTTACTCTAACTGATCAAAAGTGGGATTTAAAA ATGAATTGCAATTTGCTAGCCAGTGTTGTATTGGGATAAGTACTTAGGATCTGACCATGT CAATTTGAGCATTGGAGTGAGATCTTTTAAGTACTTATCTTAAAAATAGAAATGCCATAT GGGTTTTTAATATTTTTCAGTTTTGAACATTCCCGATGGTTAAGGAC