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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000894 | Chr5 | 20145717 | 20150335 | - | Auxin response factor 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000894.m1 | 207 | 243 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 24.3 | 2.60E-05 |
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>LITCHI000894.m1 ATGGAGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTGGGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTA GCTGCATTTCTCTTGTCAGCATGTGGTTTTGCTATAACTCTATACTCTTGTATGGAGAAA AATACCATCATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAACTAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCA GTGATTCAGTTGATTGTTACATTAAGTCAATTTCTTCTAACAATTTTGCAAGTGGAAAAC AGCTACAATGGATCAACTTTTCCGCTGGCCTTTGCGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTC AAGAAGGGTGGAAAGAATGTCGATGATCATTCACCACCAAGAGACTTACATTTGCCTCTT GTGAATAGTCAACCTATTGATCACTTTGTGTCTAATAGTACTCCTATTGAACTCGATCAA ATTGGAACCTCCTCGCCGAACCCAACAAGTCCTTTATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCC AAGAATATTGAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAGTTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTG TTCACAAATTACAAGGACCTTTATAAGGAATTGAAGATGATGTTCAACATTAGATTATAC TTCAACAAGCAACCAAAGAGCCATTGGGAACTTATCTATGAAGATGATAATGGTGACATG TTTTTGGTTGGAGATAATTCATGGGATGAGTTTTACCACAATGTGAGGAAACTTTATCTC TATAAAAAGAAATCACTGAGAAACAATTTCATGGTCAATCCACAACAGTTCATGCATGAT AATATTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGCAGAGCAGCAACAGACTATGGTGGAACCGGTA ACTGCATACGATCCTCATTCATCACGTCCAAATGATATAGATATAGAGGCGCCATCAACT CTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGCACCAGCACCAACATCAGTATCATTGGACCTG CTAAAGGCTGATTCTGAAGAGGGGTTATTGCGACTTGCTCAGGCAGAGATGGAGGCCAGC GATGTGACTAGGCCTTGGAAGAAGCCAAGGCTGATCAACTCTGATTTGATCTTGTTGGTG ACTGAGGGTTCCATGTTGGCAGCTTCTTGA
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>LITCHI000894.m1 TTATTAACTTATAATTTTATATAAAAAAAGAAAAATCAAACGTTTTGGAAAGTTAAATGG AAAATGAAACACAGATATTATTTTCCACAGCATTGACTGGTTTAGTTTCCTCGAATTTTC CTTAAAACTTCCTCCTCCTTATCCAAAAACACGCAAATGGATTCAAGTATGGCAAACTTC TTTACATTTAACAACTTTCCATCACTTTCCTCCTCTCATCTAAAGACCAAAAACATGAAT GCTCTGTAACCAACCACTTTTTCTTCAGCTTTCCTTCACTTGATTTTCTCTCTCTGCAAC AATTTGCTAGAAAACTGACACTTTCCAGGAAAAAGGGAAATTTGATCATTGAAAAATGGG TAATTTCAGGCGGGAAATCGAAGGAAAGCTTCAGTCTTATGTGCATCTTCCAATTTGCAC TGTTTTGAGGACTATTTGCCGCCATGTTGCCTCACTCATCTGCAAGTTGAAAACTAACTC GGGTCAACCGATCGAGTTCAAGGCAAGTCCCTTCAATCGAATTCGTGTTTGGGACAAAAA GTATGGCCTATTTGAGGTGCAAAATAGCGACACATTTTGCAAGCACGGATTGGCTTTAGG GTACCGTTCAAAAATTCAGGGTCGGGTTTAAAACGAGCGGGTTGAACTGCCCCTGATCCG ACCCGTTGTCATCTATTTGGTCAACCATTAATTTGACCAACAATAAAGAAAGTTAATGTA ATTAAGGCTAAAAGTAGAACATTACAAATTTTTAAATTAAAATCAAGGTAAGTTTGGGTA TTTTTTGCCTTTCTAATATGTTTTTGCAAAACATTATAGAATTTTATTCCACTGCACAGA TTTTGTTTTATTAAAAGACAACCCCTTGGGTTAGTGGCTGTTACACGAGGACATTTTAAT CACTTCATGTTTTAATCTTTTTGTAGCTGTTTATCGCTTATAACTGATCAACATCATATA TATGATAAACTTAGTCTCCAAAATCTTAGGGTTGTAAGCTTCTTGGTACACACAAGGAAC GTGCACTTGCTCTGTTGTTCTTTGTGATGGAGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTG GGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTAGCTGCATTTCTCTTGTCAGCATGTGGTTTTGCTA TAACTCTATACTCTTGTATGGAGAAAAATACCATCATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAAC TAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCAGTGATTCAGTTGATTGTTACATTAAGTCAATTTC TTCTAACAATTTTGCAAGTGGAAAACAGCTACAATGGATCAACTTTTCCGCTGGCCTTTG CGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTCAAGAAGGGTGGAAAGAATGTCGATGATCATTCAC CACCAAGAGACTTACATTTGCCTCTTGTGAATAGTCAACCTATTGATCACTTTGTGTCTA ATAGTACTCCTATTGAACTCGATCAAATTGGAACCTCCTCGCCGAACCCAACAAGTCCTT TATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCCAAGAATATTGAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAG TTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTGTTCACAAATTACAAGGACCTTTATAAGGAATTGA AGATGATGTTCAACATTAGATTATACTTCAACAAGCAACCAAAGAGCCATTGGGAACTTA TCTATGAAGATGATAATGGTGACATGTTTTTGGTTGGAGATAATTCATGGGATGAGTTTT ACCACAATGTGAGGAAACTTTATCTCTATAAAAAGAAATCACTGAGAAACAATTTCATGG TCAATCCACAACAGTTCATGCATGATAATATTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGCAGAGC AGCAACAGACTATGGTGGAACCGGTAACTGCATACGATCCTCATTCATCACGTCCAAATG ATATAGATATAGAGGCGCCATCAACTCTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGCACCAG CACCAACATCAGTATCATTGGACCTGCTAAAGGCTGATTCTGAAGAGGGGTTATTGCGAC TTGCTCAGGCAGAGATGGAGGCCAGCGATGTGACTAGGCCTTGGAAGAAGCCAAGGCTGA TCAACTCTGATTTGATCTTGTTGGTGACTGAGGGTTCCATGTTGGCAGCTTCTTGATGAT CATTTCTGCAACAGGGGTGTGGCCACTTGTACATTTATGAAAAGCATTGTAAATATAGCA TGGATTTACTGATGTACATTATTTATTTCCAAGGATTTAATGAAAACTTAAAAGCATTTT ATTTTTATTCTTGAACCTGTTAAATAACTTTTTGTTATGCCTTGCTAACTTGTTTTGGGC TAGGCTCCCACAATTTAGGTTGTAGTTTCAAGTGAAAATTTTTAAAAGTGTCAC
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>LITCHI027344.m5 - Up_Stream_Len 2000 ATTCACAGGCGTAGCCAATTTTCCGCAAGGAAAGGTCTAATGGGAGATTTACGTAGGTCC TGTTACATGTACGATATTTTTCTCATAAGCCGATGACACCATCCCACGTTTGGTAGATTC TACACTACGTCGCAGGTAATGATTCCCTACCAACACAAGACAGACCCTGAAAAGGTTTGT TGATCTGACCAGACAGATAAGGGATACATCGTTGGTTAAAAATAAATAAATGAATAAATT AAATGACGAAGTATTTGAACATGTACGTATGCATGGTCAATCTCTTAGTAATCAATGGAT CCTAAATCATTTAAAAATCAGAAGTTTAAATCGATTTCAAAATGGTCTAATAACAGCTTA TAAGCTTTCTAGAGAAAAGGCAAGGTGGCTGCAGAGTGAGTCACGTCTAACTTGCCTCTT GAAATGGTAAATTAAATCAATATCATCATTTATATGGACAATTCTCTTTCTATATCTAAA AATAATAATTCGAATTATGTAATAAAAATTTTATCTAAATTGATATCAATAGAATCATAT CCTATAAAATGTGTTTGATAACTAAAAAAGAAAAAGAAAAAACAATATAAAACAATATAT AAATTTTCTAATACATTTTCTCTTTATACAAAACAGATTGATTATTTGATATGTGAATCA AATATAATTACAAACTTAAAATAAACTTTAATATCAAAATTAAATAAAAATATATTCAAA TATAATTGAATCCAAAACTTTTGGAGCAGATCAAATCTTGACATTATATTAACAATTATA AAAGTTAAAAGTTTAGATTGAAACCGTTGAACAACAATATATACATTTCTAACACATTCT ACCTGAAATCTTGATGGATTAAGATCTTATCCAGATTCAAAATCTATAAGTTATGGAACC TGTGGATTATCTCAATCCAACCTTCTTCATCTACCGATCTTGAAAAAAAATTTAGACCAA TTTAACTAGAAAAGTATTCCAACAGTGACGACAAGAAAAACTATGATCTCCACCAATGAA AACACGTGAAGCTGACTGAAGCCATGCCACTTCCCTGCAACTGCAAGTACCATAACCCAA GACAACACCACCACCAACACTCCCCCACCTAGACAAGACGACAAAGCTCTCAAGTCAGCA TCAGACTAGACCCCACTTCGCCACGTGGCATTTTGTTTGACCTCCACACAAATATCTTCT TAGCATCTCTCCTCTGCCTCTCTGCTTTGCTTTACTTTGTTAAGTTTTGTCTGTCATTTG CAGATTTCCTTTATTCTGTTTTTTTCCTGCTCTTCTCTTCTTTGCTCCTCTATTCAACTT GTAAGTGATTCCTCTTGATCATATACTCATGATCTTCAATTTTTTCTGGTTCATTTAGCT GTTGACTTTTTGTTTCTCTTTGTTGTTCTGTTGTGTTTTTTGTATATTATTGTTCTTTGT TCTTTATAAACTTTAACGTGCTTTTAAGTTTTTGCTATCTGGGTATTCTTCTCTTTAGCT CCTAAAATTTTTTGCTTTCATATATGATTTATATGATCTCTGTTTAGTTGCTAGTGAAAG TAGGTGCAAAGTTGTTTTGGTTATATTCAACTCTACAGTTAATTATTTGGATACAGATTT TGTGTTTTGACTAGATTATTTGGTTTTCAATTTTGAAAACAGATCAATTTGTTTGTTGAG TTAGACTAAACCAAACTAAAACAATGAACATTGAATATTGTTGAATAATTATACTACTTG TATTTTGTTGATTGTTGATCTTGGTTTATTAGTACAATGATGTAATTATAAGTTGTGTTA ATTTAGCTGAATTGTTGTGTTAGGCTTTCCTTTAGTGTTAAATTCATGACTTGATTGTTT TTTTGGTGTAACGGTTTTTGTTAGGTTGAACTGCAATTAGATATAGGACTTGCATGTATA ATCAACTTTGGTGGTGTGTAGAATGCAATGAGATTCTTAATTATTGTCATTGTGTTGTTT CAGGCAAGTAGTTTCCGACA >LITCHI027344.m6 - 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>LITCHI016174.m1 GenomeSequence - ATGTGGAGACAAGAGGGGCTTGGAGACATCACCAATGACAGTGGCAGTAGAGAGATCTTA GGTGAGAGAGAGAGGGAAAGGGGGTAGTTAAGGCTAATTGGAGATGTGAACATGACTGAG TGAAAAATAAGTTGGGCACTTAGACTGTTAGGTTTTATATTTTCTTTTTTTATTTTTTAA ATGATGTCAGTTTTCGTTTCGGTTGGTTTGCTGATCCAAAATCGACCTGAAATCGAAATA AGTTGGTTTTCTACTCTTAAAACCAACTCGATCTGAATCACAAATAAAAACCAATATTTT CGGGTCAGGTTGGCTTTGGTCTATTCGGACTAGGTTGGTTTCGGTTATTTTGGCCACTTC TATTTGTTAATAGCGTTTGTTTTGTTGTAGGAAAATGATTGAAATAAAAATGATGATTTG TTATAATGGGCAATGAGAGGACACATGTGATTTTAGTTTGACCAGCACATGGGAGAGCTG GCATAACTTCATCATAAATGCTATGATGTGTTGATAAATATAGGCCTCCATAAGTGGTCA AGTGTGTTTTGTGAACATCGTACATATGAAATGATGACCACTAATATTGTTGAGAGTCTT AACTTATGCCTCCACTTCGCATGTCAATTGCCAGTCACAACATTAGCCGAGTTTATTCAC AACATGTTGCAACAATGGTTCTATAATCATCGTGGAAAGGTAAAGTTGTCTCGATCACAA CTAAATAATGCTGCACACGAGAAAATAGAAAAATGGGTGGTTAAATTGAATTCGATGATA GCTTTGCCAGTTGATTAGAACATATTTCTTATGAAGTGTCGTGGGGACGAATGGATTGTG AATTTGGCAGATAAGACTTGTACTTGTAATGTGTTTCAAGGCTTACTCATACTATATACA 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