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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000894 | Chr5 | 20145717 | 20150335 | - | Auxin response factor 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000894.m1 | 207 | 243 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 24.3 | 2.60E-05 |
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>LITCHI000894.m1 ATGGAGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTGGGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTA GCTGCATTTCTCTTGTCAGCATGTGGTTTTGCTATAACTCTATACTCTTGTATGGAGAAA AATACCATCATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAACTAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCA GTGATTCAGTTGATTGTTACATTAAGTCAATTTCTTCTAACAATTTTGCAAGTGGAAAAC AGCTACAATGGATCAACTTTTCCGCTGGCCTTTGCGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTC AAGAAGGGTGGAAAGAATGTCGATGATCATTCACCACCAAGAGACTTACATTTGCCTCTT GTGAATAGTCAACCTATTGATCACTTTGTGTCTAATAGTACTCCTATTGAACTCGATCAA ATTGGAACCTCCTCGCCGAACCCAACAAGTCCTTTATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCC AAGAATATTGAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAGTTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTG TTCACAAATTACAAGGACCTTTATAAGGAATTGAAGATGATGTTCAACATTAGATTATAC TTCAACAAGCAACCAAAGAGCCATTGGGAACTTATCTATGAAGATGATAATGGTGACATG TTTTTGGTTGGAGATAATTCATGGGATGAGTTTTACCACAATGTGAGGAAACTTTATCTC TATAAAAAGAAATCACTGAGAAACAATTTCATGGTCAATCCACAACAGTTCATGCATGAT AATATTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGCAGAGCAGCAACAGACTATGGTGGAACCGGTA ACTGCATACGATCCTCATTCATCACGTCCAAATGATATAGATATAGAGGCGCCATCAACT CTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGCACCAGCACCAACATCAGTATCATTGGACCTG CTAAAGGCTGATTCTGAAGAGGGGTTATTGCGACTTGCTCAGGCAGAGATGGAGGCCAGC GATGTGACTAGGCCTTGGAAGAAGCCAAGGCTGATCAACTCTGATTTGATCTTGTTGGTG ACTGAGGGTTCCATGTTGGCAGCTTCTTGA
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>LITCHI000894.m1 TTATTAACTTATAATTTTATATAAAAAAAGAAAAATCAAACGTTTTGGAAAGTTAAATGG AAAATGAAACACAGATATTATTTTCCACAGCATTGACTGGTTTAGTTTCCTCGAATTTTC CTTAAAACTTCCTCCTCCTTATCCAAAAACACGCAAATGGATTCAAGTATGGCAAACTTC TTTACATTTAACAACTTTCCATCACTTTCCTCCTCTCATCTAAAGACCAAAAACATGAAT GCTCTGTAACCAACCACTTTTTCTTCAGCTTTCCTTCACTTGATTTTCTCTCTCTGCAAC AATTTGCTAGAAAACTGACACTTTCCAGGAAAAAGGGAAATTTGATCATTGAAAAATGGG TAATTTCAGGCGGGAAATCGAAGGAAAGCTTCAGTCTTATGTGCATCTTCCAATTTGCAC TGTTTTGAGGACTATTTGCCGCCATGTTGCCTCACTCATCTGCAAGTTGAAAACTAACTC GGGTCAACCGATCGAGTTCAAGGCAAGTCCCTTCAATCGAATTCGTGTTTGGGACAAAAA GTATGGCCTATTTGAGGTGCAAAATAGCGACACATTTTGCAAGCACGGATTGGCTTTAGG GTACCGTTCAAAAATTCAGGGTCGGGTTTAAAACGAGCGGGTTGAACTGCCCCTGATCCG ACCCGTTGTCATCTATTTGGTCAACCATTAATTTGACCAACAATAAAGAAAGTTAATGTA ATTAAGGCTAAAAGTAGAACATTACAAATTTTTAAATTAAAATCAAGGTAAGTTTGGGTA TTTTTTGCCTTTCTAATATGTTTTTGCAAAACATTATAGAATTTTATTCCACTGCACAGA TTTTGTTTTATTAAAAGACAACCCCTTGGGTTAGTGGCTGTTACACGAGGACATTTTAAT CACTTCATGTTTTAATCTTTTTGTAGCTGTTTATCGCTTATAACTGATCAACATCATATA TATGATAAACTTAGTCTCCAAAATCTTAGGGTTGTAAGCTTCTTGGTACACACAAGGAAC GTGCACTTGCTCTGTTGTTCTTTGTGATGGAGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTG GGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTAGCTGCATTTCTCTTGTCAGCATGTGGTTTTGCTA TAACTCTATACTCTTGTATGGAGAAAAATACCATCATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAAC TAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCAGTGATTCAGTTGATTGTTACATTAAGTCAATTTC TTCTAACAATTTTGCAAGTGGAAAACAGCTACAATGGATCAACTTTTCCGCTGGCCTTTG CGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTCAAGAAGGGTGGAAAGAATGTCGATGATCATTCAC CACCAAGAGACTTACATTTGCCTCTTGTGAATAGTCAACCTATTGATCACTTTGTGTCTA ATAGTACTCCTATTGAACTCGATCAAATTGGAACCTCCTCGCCGAACCCAACAAGTCCTT TATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCCAAGAATATTGAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAG TTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTGTTCACAAATTACAAGGACCTTTATAAGGAATTGA AGATGATGTTCAACATTAGATTATACTTCAACAAGCAACCAAAGAGCCATTGGGAACTTA TCTATGAAGATGATAATGGTGACATGTTTTTGGTTGGAGATAATTCATGGGATGAGTTTT ACCACAATGTGAGGAAACTTTATCTCTATAAAAAGAAATCACTGAGAAACAATTTCATGG TCAATCCACAACAGTTCATGCATGATAATATTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGCAGAGC AGCAACAGACTATGGTGGAACCGGTAACTGCATACGATCCTCATTCATCACGTCCAAATG ATATAGATATAGAGGCGCCATCAACTCTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGCACCAG CACCAACATCAGTATCATTGGACCTGCTAAAGGCTGATTCTGAAGAGGGGTTATTGCGAC TTGCTCAGGCAGAGATGGAGGCCAGCGATGTGACTAGGCCTTGGAAGAAGCCAAGGCTGA TCAACTCTGATTTGATCTTGTTGGTGACTGAGGGTTCCATGTTGGCAGCTTCTTGATGAT CATTTCTGCAACAGGGGTGTGGCCACTTGTACATTTATGAAAAGCATTGTAAATATAGCA TGGATTTACTGATGTACATTATTTATTTCCAAGGATTTAATGAAAACTTAAAAGCATTTT ATTTTTATTCTTGAACCTGTTAAATAACTTTTTGTTATGCCTTGCTAACTTGTTTTGGGC TAGGCTCCCACAATTTAGGTTGTAGTTTCAAGTGAAAATTTTTAAAAGTGTCAC
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>LITCHI000894.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTATTTTTACATAAAAAAAACATATGCTTTATTTTATATATATATATATTTTTTTTGCTT TATTTTTTAGGATAAGTTTGTTGACTCTTACAATTTACTGCTGTGAGTCTGTGGCTGTGG TCAATTTATTCGATGCATATATTAGATATTTGCTTTTTTTTTTTAATATGGAAAATTGCA CAAACGTACCGCGAGTTTGACATATATGACATCATGTTTAATTTTTGATAAAAATGATAC TAGTATCTCTTCTGTTAGTTTAGAATAGTTAGATTTAACTCTTACTAAGATCAAATTACT CCTATAGTTCATTTATTAGTTATTACCATATAAAAATCGTTAATTAAAAAATAATTTCAA AAACAACAGATAAATTTCTTTTTAACAACAATTAAAAATTAATTTATGAAAATATTTAAT AAAAAAAAATAAACTCTAATGTTAGAGCTCTAATCTCCTCCATGACAAGAGGAAATCCAT GATCTCCTCCTATAATTAAAGCAGATGGTCAAAGATCTCCCACAAAGGAGAAGATTAATT GATTTCTTTCTATTAAAGGAGATTAATCTATAAGTGAAGAACACAATCTCGTCCTGGTGG AAATTATCTCTTCTATAGAGGAGATCTTGATCTCTCTCTACTATGACGGAGATCAATCTT CATTTTAAAAGAGATTCATGATTTATTTTTCCTGCAAAAATTTTTTTTTCAAAATTTTTG TTCCTTTTGTTTTTGAAAGTCCTCAAAATTTTGTTTTGAGACAAAATTTAATTATAAAAG GAATATCTAGAGTCATCTTAAAAATTGTTTTAGAGAAAAGTATACTTATAAAATTTTTGG GATTGGTTTTAGAATTCTTAATTTTAGTTAATAGTAAAATGATAATTCCACCCTTCATAT ATTTACCTAACGAGTGGCAAAAATACTAGATCTGATCTAAAACTAGGGGATCCAGTCTAT TTGGGATGAAAAATAACAACTCGTTTGGGACAAGGTTGGGTTTGGACCCAAGTCGACCTG GACCCAATTTGACCCGTTATTATATCTAGCCTGGAGTTTTATACTGTTTTCACATTTTAT TATTATTATTATTATTTATTTATTTAGTGTTTGTAATGAAACTTGGTTATATTGTTATTA TTAATTTGATATTGGTGACTATGTAGTAATAGTACTTTGGATTGTGTAATGAAATTTTAT CATGAATGTGGCAAGTATTTTGATATTTGTAATAAAACATTTGTAATGTAACAAGTCTTT TGTATTTGTATTTAAAAAATTTGTGTGTTTTATGAATTTTATGTTAACAATTATATAGAT GTGATGTTACATTGTAGTTAAATTGAACTACTGAAAATTAAAATGTGTATTTTTTGTTGT TTGTATATTTGTTTTTTTTATATATTAATTATATTATCAGTTGAAAACTAACTCGGGTCA ACCGATCGAGTTCAAGGCAAGTCCCTTCAATCGAATTCGTGTTTGGGACAAAAAGTATGG CCTATTTGAGGTGCAAAATAGCGACACATTTTGCAAGCACGGATTGGCTTTAGGGTACCG TTCAAAAATTCAGGGTCGGGTTTAAAACGAGCGGGTTGAACTGCCCCTGATCCGACCCGT TGTCATCTATTTGGTCAACCATTAATTTGACCAACAATAAAGAAAGTTAATGTAATTAAG GCTAAAAGTAGAACATTACAAATTTTTAAATTAAAATCAAGGTAAGTTTGGGTATTTTTT GCCTTTCTAATATGTTTTTGCAAAACATTATAGAATTTTATTCCACTGCACAGATTTTGT TTTATTAAAAGACAACCCCTTGGGTTAGTGGCTGTTACACGAGGACATTTTAATCACTTC ATGTTTTAATCTTTTTGTAGCTGTTTATCGCTTATAACTGATCAACATCATATATATGAT AAACTTAGTCTCCAAAATCTTAGGGTTGTAAGCTTCTTGGTACACACAAGGAACGTGCAC TTGCTCTGTTGTTCTTTGTG
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>LITCHI000894.m1 GenomeSequence - TTATTAACTTATAATTTTATATAAAAAAAGAAAAATCAAACGTTTTGGAAAGTTAAATGG AAAATGAAACACAGATATTATTTTCCACAGCATTGACTGGTTTAGTTTCCTCGAATTTTC CTTAAAACTTCCTCCTCCTTATCCAAAAACACGCAAATGGATTCAAGTATGGCAAACTTC TTTACATTTAACAACTTTCCATCACTTTCCTCCTCTCATCTAAAGACCAAAAACATGAAT GCTCTGTAACCAACCACTTTTTCTTCAGCTTTCCTTCACTTGATTTTCTCTCTCTGCAAC AATTTGCTAGAAAACTGACACTTTCCAGGAAAAAGGGAAATTTGATCATTGAAAAATGGG TAATTTCAGGCGGGAAATCGAAGGAAAGCTTCAGTCTTATGTGCATCTTCCAATTTGCAC TGTTTTGAGGACTATTTGCCGCCATGTTGCCTCACTCATCTGCAAGGTGAATTTTTGTTT TGTCTAAATATGCTTTATTTTTACATCAAAAAAAAAAATATATGCTTTATTTTTACATAA AAAAAACATATGCTTTATTTTATATATATATATATTTTTTTTGCTTTATTTTTTAGGATA AGTTTGTTGACTCTTACAATTTACTGCTGTGAGTCTGTGGCTGTGGTCAATTTATTCGAT GCATATATTAGATATTTGCTTTTTTTTTTTAATATGGAAAATTGCACAAACGTACCGCGA GTTTGACATATATGACATCATGTTTAATTTTTGATAAAAATGATACTAGTATCTCTTCTG TTAGTTTAGAATAGTTAGATTTAACTCTTACTAAGATCAAATTACTCCTATAGTTCATTT ATTAGTTATTACCATATAAAAATCGTTAATTAAAAAATAATTTCAAAAACAACAGATAAA TTTCTTTTTAACAACAATTAAAAATTAATTTATGAAAATATTTAATAAAAAAAAATAAAC TCTAATGTTAGAGCTCTAATCTCCTCCATGACAAGAGGAAATCCATGATCTCCTCCTATA ATTAAAGCAGATGGTCAAAGATCTCCCACAAAGGAGAAGATTAATTGATTTCTTTCTATT AAAGGAGATTAATCTATAAGTGAAGAACACAATCTCGTCCTGGTGGAAATTATCTCTTCT ATAGAGGAGATCTTGATCTCTCTCTACTATGACGGAGATCAATCTTCATTTTAAAAGAGA TTCATGATTTATTTTTCCTGCAAAAATTTTTTTTTCAAAATTTTTGTTCCTTTTGTTTTT GAAAGTCCTCAAAATTTTGTTTTGAGACAAAATTTAATTATAAAAGGAATATCTAGAGTC ATCTTAAAAATTGTTTTAGAGAAAAGTATACTTATAAAATTTTTGGGATTGGTTTTAGAA TTCTTAATTTTAGTTAATAGTAAAATGATAATTCCACCCTTCATATATTTACCTAACGAG TGGCAAAAATACTAGATCTGATCTAAAACTAGGGGATCCAGTCTATTTGGGATGAAAAAT AACAACTCGTTTGGGACAAGGTTGGGTTTGGACCCAAGTCGACCTGGACCCAATTTGACC CGTTATTATATCTAGCCTGGAGTTTTATACTGTTTTCACATTTTATTATTATTATTATTA TTTATTTATTTAGTGTTTGTAATGAAACTTGGTTATATTGTTATTATTAATTTGATATTG GTGACTATGTAGTAATAGTACTTTGGATTGTGTAATGAAATTTTATCATGAATGTGGCAA GTATTTTGATATTTGTAATAAAACATTTGTAATGTAACAAGTCTTTTGTATTTGTATTTA AAAAATTTGTGTGTTTTATGAATTTTATGTTAACAATTATATAGATGTGATGTTACATTG TAGTTAAATTGAACTACTGAAAATTAAAATGTGTATTTTTTGTTGTTTGTATATTTGTTT TTTTTATATATTAATTATATTATCAGTTGAAAACTAACTCGGGTCAACCGATCGAGTTCA AGGCAAGTCCCTTCAATCGAATTCGTGTTTGGGACAAAAAGTATGGCCTATTTGAGGTGC AAAATAGCGACACATTTTGCAAGCACGGATTGGCTTTAGGGTACCGTTCAAAAATTCAGG GTCGGGTTTAAAACGAGCGGGTTGAACTGCCCCTGATCCGACCCGTTGTCATCTATTTGG TCAACCATTAATTTGACCAACAATAAAGAAAGTTAATGTAATTAAGGCTAAAAGTAGAAC ATTACAAATTTTTAAATTAAAATCAAGGTAAGTTTGGGTATTTTTTGCCTTTCTAATATG TTTTTGCAAAACATTATAGAATTTTATTCCACTGCACAGATTTTGTTTTATTAAAAGACA ACCCCTTGGGTTAGTGGCTGTTACACGAGGACATTTTAATCACTTCATGTTTTAATCTTT TTGTAGCTGTTTATCGCTTATAACTGATCAACATCATATATATGATAAACTTAGTCTCCA AAATCTTAGGGTTGTAAGCTTCTTGGTACACACAAGGAACGTGCACTTGCTCTGTTGTTC TTTGTGATGGAGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTGGGAAAAACAAGGAGGTTTTC CTTCTAGCTGCATTTCTCTTGTCAGCATGTGGTTTTGCTATAACTCTATACTCTTGTATG GAGAAAAATACCATCATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAACTAAAGGCGGTCGAAATTGTC TTCTCAGTGATTCAGTTGATTGTTACATTAAGTCAATTTCTTCTAACAATTTTGCAAGTG GAAAACAGCTACAATGGATCAACTTTTCCGCTGGCCTTTGCGATGATTGCTGTCGTATTC ATTTTCAAGAAGGGTGGAAAGAATGTCGATGATCATTCACCACCAAGAGACTTACATTTG CCTCTTGTGAATAGTCAACCTATTGATCACTTTGTGTCTAATAGTACTCCTATTGAACTC GATCAAATTGGAACCTCCTCGCCGAACCCAACAAGTCCTTTATTCAATCACTGTGATGTT CTCTCCAAGAATATTGAGGTATGAATCTAATGAATCTCCATTATTATGTTCATTATTGAT AATTTAAGATAGTGTTAGTTATTAACGTTAAATCTCCAATGATAAATAGTATTTGACTGT ATATGATACAAAGTAGTTGTATGCTGTAGTCACTACACATGGTGAATTAATTTCTATGAA TACATAAAATTGGTCTCTCAAATTACATTTCTACAATATTGTCATCATTCAAGGTATTCA ACATTTAGATAACATGACTATTGACACTCTGTCAAGTCTATATACACATGCAGTATAATT GCCTTAAATTCCAATGTCTAGATTAAAGTTTTTGATGGTGGTACTCTCATTTGAGGTTTC CAAGCATGTGTTTCTGTGTCTATATGTCTCTATATTTTGGACATGAATTTGGCAAATGTT TGATAGTGTATTTACATTTTTACAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAGTTCAAAGAGCTAT TGATTTGATTGTGTTCACAAATTACAAGGACCTTTATAAGGAATTGAAGATGATGTTCAA CATTAGATTATACTTCAACAAGCAACCAAAGAGCCATTGGGAACTTATCTATGAAGATGA TAATGGTGACATGTTTTTGGTTGGAGATAATTCATGGGAGTAAGTGCACTTGCTTTAGTC TTTTGTTCATTATTCTTTCTTTGTTAATATATATCTGCTCGATTTTCTTATAACATTTTT AGAGGTTAATATTATCGTTGATTTATTTTTCTTAAATTTGGATTCTAGGACATAACTTAT GTCTAAGACCATAATTATGAAAACTTTATATGTTCATTTCTGACATTGGATCATGCATGA TTTTTAGTGTTAACATTGGAGAGTGGCTCTCTAATGAATATATTACATATTCATTTATTT TATGTTTACGTTTCAGCTGCTTTAGTTTTGATCTTGTAAATTTGTGTTTGATTGCAGTGA GTTTTACCACAATGTGAGGAAACTTTATCTCTATAAAAAGAAATCACTGAGAAACAATTT CATGGTCAATCCACAACAGTTCATGCATGATAATATTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGC AGAGCAGCAACAGACTATGGTGGAACCGGTAACTGCATACGATCCTCATTCATCACGTCC AAATGATATAGATATAGAGGCGCCATCAACTCTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGC ACCAGCACCAACATCAGTATCATTGGACCTGCTAAAGGCTGATTCTGAAGAGGGGTTATT GCGACTTGCTCAGGCAGAGATGGAGGCCAGCGATGTGACTAGGCCTTGGAAGAAGCCAAG GCTGATCAACTCTGATTTGATCTTGTTGGTGACTGAGGGTTCCATGTTGGCAGCTTCTTG ATGATCATTTCTGCAACAGGGGTGTGGCCACTTGTACATTTATGAAAAGCATTGTAAATA TAGCATGGATTTACTGATGTACATTATTTATTTCCAAGGATTTAATGAAAACTTAAAAGC ATTTTATTTTTATTCTTGAACCTGTTAAATAACTTTTTGTTATGCCTTGCTAACTTGTTT TGGGCTAGGCTCCCACAATTTAGGTTGTAGTTTCAAGTGAAAATTTTTAAAAGTGTCAC