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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000894 | Chr5 | 20145717 | 20150335 | - | Auxin response factor 1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000894.m1 | 207 | 243 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 24.3 | 2.60E-05 |
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>LITCHI000894.m1 ATGGAGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTGGGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTA GCTGCATTTCTCTTGTCAGCATGTGGTTTTGCTATAACTCTATACTCTTGTATGGAGAAA AATACCATCATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAACTAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCA GTGATTCAGTTGATTGTTACATTAAGTCAATTTCTTCTAACAATTTTGCAAGTGGAAAAC AGCTACAATGGATCAACTTTTCCGCTGGCCTTTGCGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTC AAGAAGGGTGGAAAGAATGTCGATGATCATTCACCACCAAGAGACTTACATTTGCCTCTT GTGAATAGTCAACCTATTGATCACTTTGTGTCTAATAGTACTCCTATTGAACTCGATCAA ATTGGAACCTCCTCGCCGAACCCAACAAGTCCTTTATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCC AAGAATATTGAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAGTTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTG TTCACAAATTACAAGGACCTTTATAAGGAATTGAAGATGATGTTCAACATTAGATTATAC TTCAACAAGCAACCAAAGAGCCATTGGGAACTTATCTATGAAGATGATAATGGTGACATG TTTTTGGTTGGAGATAATTCATGGGATGAGTTTTACCACAATGTGAGGAAACTTTATCTC TATAAAAAGAAATCACTGAGAAACAATTTCATGGTCAATCCACAACAGTTCATGCATGAT AATATTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGCAGAGCAGCAACAGACTATGGTGGAACCGGTA ACTGCATACGATCCTCATTCATCACGTCCAAATGATATAGATATAGAGGCGCCATCAACT CTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGCACCAGCACCAACATCAGTATCATTGGACCTG CTAAAGGCTGATTCTGAAGAGGGGTTATTGCGACTTGCTCAGGCAGAGATGGAGGCCAGC GATGTGACTAGGCCTTGGAAGAAGCCAAGGCTGATCAACTCTGATTTGATCTTGTTGGTG ACTGAGGGTTCCATGTTGGCAGCTTCTTGA
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>LITCHI000894.m1 TTATTAACTTATAATTTTATATAAAAAAAGAAAAATCAAACGTTTTGGAAAGTTAAATGG AAAATGAAACACAGATATTATTTTCCACAGCATTGACTGGTTTAGTTTCCTCGAATTTTC CTTAAAACTTCCTCCTCCTTATCCAAAAACACGCAAATGGATTCAAGTATGGCAAACTTC TTTACATTTAACAACTTTCCATCACTTTCCTCCTCTCATCTAAAGACCAAAAACATGAAT GCTCTGTAACCAACCACTTTTTCTTCAGCTTTCCTTCACTTGATTTTCTCTCTCTGCAAC AATTTGCTAGAAAACTGACACTTTCCAGGAAAAAGGGAAATTTGATCATTGAAAAATGGG TAATTTCAGGCGGGAAATCGAAGGAAAGCTTCAGTCTTATGTGCATCTTCCAATTTGCAC TGTTTTGAGGACTATTTGCCGCCATGTTGCCTCACTCATCTGCAAGTTGAAAACTAACTC GGGTCAACCGATCGAGTTCAAGGCAAGTCCCTTCAATCGAATTCGTGTTTGGGACAAAAA GTATGGCCTATTTGAGGTGCAAAATAGCGACACATTTTGCAAGCACGGATTGGCTTTAGG GTACCGTTCAAAAATTCAGGGTCGGGTTTAAAACGAGCGGGTTGAACTGCCCCTGATCCG ACCCGTTGTCATCTATTTGGTCAACCATTAATTTGACCAACAATAAAGAAAGTTAATGTA ATTAAGGCTAAAAGTAGAACATTACAAATTTTTAAATTAAAATCAAGGTAAGTTTGGGTA TTTTTTGCCTTTCTAATATGTTTTTGCAAAACATTATAGAATTTTATTCCACTGCACAGA TTTTGTTTTATTAAAAGACAACCCCTTGGGTTAGTGGCTGTTACACGAGGACATTTTAAT CACTTCATGTTTTAATCTTTTTGTAGCTGTTTATCGCTTATAACTGATCAACATCATATA TATGATAAACTTAGTCTCCAAAATCTTAGGGTTGTAAGCTTCTTGGTACACACAAGGAAC GTGCACTTGCTCTGTTGTTCTTTGTGATGGAGGCAATATCAGTTGTGTTGGATGTTATTG GGAAAAACAAGGAGGTTTTCCTTCTAGCTGCATTTCTCTTGTCAGCATGTGGTTTTGCTA TAACTCTATACTCTTGTATGGAGAAAAATACCATCATGAAAACATTGGCTGAGAGGCAAC TAAAGGCGGTCGAAATTGTCTTCTCAGTGATTCAGTTGATTGTTACATTAAGTCAATTTC TTCTAACAATTTTGCAAGTGGAAAACAGCTACAATGGATCAACTTTTCCGCTGGCCTTTG CGATGATTGCTGTCGTATTCATTTTCAAGAAGGGTGGAAAGAATGTCGATGATCATTCAC CACCAAGAGACTTACATTTGCCTCTTGTGAATAGTCAACCTATTGATCACTTTGTGTCTA ATAGTACTCCTATTGAACTCGATCAAATTGGAACCTCCTCGCCGAACCCAACAAGTCCTT TATTCAATCACTGTGATGTTCTCTCCAAGAATATTGAGGTTCTTGTGCCGGAATATGGAG TTCAAAGAGCTATTGATTTGATTGTGTTCACAAATTACAAGGACCTTTATAAGGAATTGA AGATGATGTTCAACATTAGATTATACTTCAACAAGCAACCAAAGAGCCATTGGGAACTTA TCTATGAAGATGATAATGGTGACATGTTTTTGGTTGGAGATAATTCATGGGATGAGTTTT ACCACAATGTGAGGAAACTTTATCTCTATAAAAAGAAATCACTGAGAAACAATTTCATGG TCAATCCACAACAGTTCATGCATGATAATATTTCTCCACCAGCACCATTGCCAGCAGAGC AGCAACAGACTATGGTGGAACCGGTAACTGCATACGATCCTCATTCATCACGTCCAAATG ATATAGATATAGAGGCGCCATCAACTCTCGATTTGGAGATGATGACTGCACCAGCACCAG CACCAACATCAGTATCATTGGACCTGCTAAAGGCTGATTCTGAAGAGGGGTTATTGCGAC TTGCTCAGGCAGAGATGGAGGCCAGCGATGTGACTAGGCCTTGGAAGAAGCCAAGGCTGA TCAACTCTGATTTGATCTTGTTGGTGACTGAGGGTTCCATGTTGGCAGCTTCTTGATGAT CATTTCTGCAACAGGGGTGTGGCCACTTGTACATTTATGAAAAGCATTGTAAATATAGCA TGGATTTACTGATGTACATTATTTATTTCCAAGGATTTAATGAAAACTTAAAAGCATTTT ATTTTTATTCTTGAACCTGTTAAATAACTTTTTGTTATGCCTTGCTAACTTGTTTTGGGC TAGGCTCCCACAATTTAGGTTGTAGTTTCAAGTGAAAATTTTTAAAAGTGTCAC
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>LITCHI000894.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTATTTTTACATAAAAAAAACATATGCTTTATTTTATATATATATATATTTTTTTTGCTT TATTTTTTAGGATAAGTTTGTTGACTCTTACAATTTACTGCTGTGAGTCTGTGGCTGTGG TCAATTTATTCGATGCATATATTAGATATTTGCTTTTTTTTTTTAATATGGAAAATTGCA CAAACGTACCGCGAGTTTGACATATATGACATCATGTTTAATTTTTGATAAAAATGATAC TAGTATCTCTTCTGTTAGTTTAGAATAGTTAGATTTAACTCTTACTAAGATCAAATTACT CCTATAGTTCATTTATTAGTTATTACCATATAAAAATCGTTAATTAAAAAATAATTTCAA AAACAACAGATAAATTTCTTTTTAACAACAATTAAAAATTAATTTATGAAAATATTTAAT AAAAAAAAATAAACTCTAATGTTAGAGCTCTAATCTCCTCCATGACAAGAGGAAATCCAT GATCTCCTCCTATAATTAAAGCAGATGGTCAAAGATCTCCCACAAAGGAGAAGATTAATT GATTTCTTTCTATTAAAGGAGATTAATCTATAAGTGAAGAACACAATCTCGTCCTGGTGG AAATTATCTCTTCTATAGAGGAGATCTTGATCTCTCTCTACTATGACGGAGATCAATCTT CATTTTAAAAGAGATTCATGATTTATTTTTCCTGCAAAAATTTTTTTTTCAAAATTTTTG TTCCTTTTGTTTTTGAAAGTCCTCAAAATTTTGTTTTGAGACAAAATTTAATTATAAAAG GAATATCTAGAGTCATCTTAAAAATTGTTTTAGAGAAAAGTATACTTATAAAATTTTTGG GATTGGTTTTAGAATTCTTAATTTTAGTTAATAGTAAAATGATAATTCCACCCTTCATAT ATTTACCTAACGAGTGGCAAAAATACTAGATCTGATCTAAAACTAGGGGATCCAGTCTAT TTGGGATGAAAAATAACAACTCGTTTGGGACAAGGTTGGGTTTGGACCCAAGTCGACCTG GACCCAATTTGACCCGTTATTATATCTAGCCTGGAGTTTTATACTGTTTTCACATTTTAT TATTATTATTATTATTTATTTATTTAGTGTTTGTAATGAAACTTGGTTATATTGTTATTA TTAATTTGATATTGGTGACTATGTAGTAATAGTACTTTGGATTGTGTAATGAAATTTTAT CATGAATGTGGCAAGTATTTTGATATTTGTAATAAAACATTTGTAATGTAACAAGTCTTT TGTATTTGTATTTAAAAAATTTGTGTGTTTTATGAATTTTATGTTAACAATTATATAGAT GTGATGTTACATTGTAGTTAAATTGAACTACTGAAAATTAAAATGTGTATTTTTTGTTGT TTGTATATTTGTTTTTTTTATATATTAATTATATTATCAGTTGAAAACTAACTCGGGTCA ACCGATCGAGTTCAAGGCAAGTCCCTTCAATCGAATTCGTGTTTGGGACAAAAAGTATGG CCTATTTGAGGTGCAAAATAGCGACACATTTTGCAAGCACGGATTGGCTTTAGGGTACCG TTCAAAAATTCAGGGTCGGGTTTAAAACGAGCGGGTTGAACTGCCCCTGATCCGACCCGT TGTCATCTATTTGGTCAACCATTAATTTGACCAACAATAAAGAAAGTTAATGTAATTAAG GCTAAAAGTAGAACATTACAAATTTTTAAATTAAAATCAAGGTAAGTTTGGGTATTTTTT GCCTTTCTAATATGTTTTTGCAAAACATTATAGAATTTTATTCCACTGCACAGATTTTGT TTTATTAAAAGACAACCCCTTGGGTTAGTGGCTGTTACACGAGGACATTTTAATCACTTC ATGTTTTAATCTTTTTGTAGCTGTTTATCGCTTATAACTGATCAACATCATATATATGAT AAACTTAGTCTCCAAAATCTTAGGGTTGTAAGCTTCTTGGTACACACAAGGAACGTGCAC TTGCTCTGTTGTTCTTTGTG
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>LITCHI010190.m1 GenomeSequence - ATGGACCAAATAACGGCTATTTTTTTTCTCTTCTATACGCTGCTAACTCATTTGGCTACT ATTACGACTAACTTTGCCTATGCTCAGCGAAACGGCGTCGTTTTATCGGAAGTACAAGCC TTAACGTCTTTCAAGCTCAATCTTTACGACCCACTCGGCTCGCTTGACGGCTGGGACGCG TCGACACCGTTTGCGCCGTGTGACTGGCGCGGCATTGTTTGTTATAACAACCGCGTCCGC GAGCTGCGTCTGCCTCGGCTCCAACTCGCCGGCCGGCTCACTGACCAACTGTCTCGCTTA CGCCAGCTCCGCAAGCTGAGCCTCCACTCCAACAGCCTAAACGGCTCCATCCCGGCTTCT CTCGCGCAATGCTCGCTTCTCCGTGCCGTCTACTTGCAATACAACTTCCTCTCCGGCCGC CTCCCGCCGGCCGTCGTCAACCTCACGAACCTCCAAGTCCTCAACGTCGCTCACAACCTC CTCTCCGGAAAAATCTTCGGCGACGTCTCGCCGTCGCTCCGGTACCTCGATTTATCGTCC AACTCATTCACCGGCGATATGCCGGACAACTTCTCGGCAAAATCTCACCTCCAACTCATC AATTTCTCGTACAATCATTTCTCCGGAGAAGTCCCGGCGAGCCTCGGACAGCTCCAGGAG CTACAATATCTCTGGCTCGACTCGAACCGCTTGTACGGTACTCTACCGTCTGCTATATCC AACTGTTCTTCGCTTGTACACTTGAGCGTCGAAGACAATTCTCTCGAAGGCTTGGTTCCA GGCACCATTGGAGCGCTTTCGACGTTACAAGTGCTGTCTTTGTCGCGAAATGGGTTCTCG GGTACGTTTCATTTGAGTGTTGTTTGCGGTGTTGGGGGCAATGCCTCTTCTCTGAGGATT CTCCAACTGGGTTTTAATGATTTCACGGGTGTGGTGGAGCCGCCAAACGGCAGGTGTGAT AGTGTTTTGGAGGTTTTGGACCTTAAAAGCAATCACATTCGTGGAATGTTCCCGTCTTGG TTGACAAACGTGACTTCTCTTAGAGTCTTGGATCTTTCTGGAAACTTCTTTTCCGGGAAG CTTCCTGTTGGTGTTGGTGATCTTGTCAGGTTGGAGGAGTTGAGAATGGCTGATAACTGG CTTCGTGGGGTTGTTCCTAGTGAGATTGTGAAATGTAGGGTGTTGCGGGCTTTTGATGTT GAAGGGAACCGATTTGAGGGTCAAGTACCCGTTTTTTTAGGACAGTTGAGGGAGTTGAGG GTTCTTTCTTTGGGGAGGAATATGTTTTCTGGGTCGATTCCGGTGAGTTTTGGGGAGCTT GATCAGCTTGAGACGTTGAATTTGAGCGAAAATGATGTGAGGGGTGATGTGCCGGCAGAG ATAATGAGGTTGAGTAATTTGACTACTTTGAATCTTAGTTACAATAAGTTTGCTGGGGTG GTGCCTCCCAATGTAGGGGACTTGAAGAATTTGTTGGTTTTGAATTTTAGTGGTTGTGGG TTCTCAGGGAAAATTCCTGGGAGTATTGGGAATTTGATGAAACTGACTACTCTTGATTTG AGCAAGCAAAACTTGTCTGGTGAGTTGCCTATTGAACTTTTCGGGTTGCCGAGTTTGCAA GTTGTTGGACTGGAAGAGAATAAGTTATCTGGGGATGTTCCTGAGGGTTTTAGTAGTTTA GTTAGTCTGCAATATCTGAATCTCAGTAACAATGCCTTTTCGGGTCAGATTCCGGCAACT TATGGCTTTCTGCGGTCTTTAGTTGTTCTTTCATTGTCCCACAATCGGATTTCTGGTGCG ATCCCATTGGAGTTGGGTAATTGTACTGATCTCGAAGTGCTTGAGCTTCGTACGAATCGT TTAAGGGGTAGAATTCCTGTTGATATCTCTCGTTTATCGCGTATGAAGGAGGTTGATTTA GGTGAGAATGGATTATCTGGTGAAATCCCAAAGGAGATCTCTAGATGTTCTTCTTTAACT TCGTTTTTATTGGATGTGAATCATCTATCAGGCCACATACCAGGCTCATTGTCGAAGTTA ACGAATCTAACAACATTAAATCTTTCCACAAATAGTTTGAGCGGTGCTATTCCAGCAAAT CTGTCGCGCATATCTAGCTTGAAGTACTTAAACTTGTCAAGGAATAACCTTGAAGGTGAG ATTCCAATAATGCTGGGGTCTAGATTCAATGATCCTTCTGTATTTGCAATGAACCGTGAT TTATGTGGAAGGCCATTGGACGTGGAATGTGCAAATATAAGGAAAAGGAAAAGGAAGAGG CTGATTATAATGATCTGTGTCGCTGTAGCTGGAGGGTGTCTTTTGGCGTTGTGCTGTTGT GGTTACATATACAGCCTCTTACGATGGCGCAAAAAGCTTAGAGCAGCAGCTGGGGAGAAG AAACCTAGTCCTGCCCGTGGGAGCTCAGGGACTGATAGGGGTCGCGGAAGTGGAGAAAAT GGAGGACCAAAACTTGTTATGTTCAATAACAAGATAACATATGCGGAGACATTGGAAGCA ACAAGGCAATTCGATGAGGAAAATGTATTGAGCAGAGGAAGATACGGTCTAGTATTCAAG GCTTCATTTCAAGATGGAATGGTGCTCTCTATACGTCGCCTCCCAGATGGATCCATCAAC GAGAACAACTTCCGCAAAGAAGCTGAATCGTTAGGCAAAGTGAAGCACCGAAATCTGACA GTTTTACGCGGCTACTATGCAGGACCACCACCTGATGTCAGGCTGCTTGTGTATGACTAC ATGCCCAATGGCAACCTAGGCACTCTACTTCAAGAAGCATCTCATCAAGATGGGCATGTC CTAAACTGGCCAATGCGTCACCTCATTGCTCTTGGCATTGCTCGGGGACTAGCCTTCTTG CATTCACTAGATATGGTCCATGGAGACGTGAAGCCACAAAATGTCCTCTTCGATGCTGAT TTTGAAGCACATTTATCCGAATTCGGCCTAGAAAGACTGATCATAGCAACCCCAGCTGAG GCCTCATCATCCTCCACCCCAGTCGGCACACTAGGCTATGTATCCCCGGAAGCATCACTA ACCGGTCAAGCAACAAAAGAAGCCGATGTTTACAGTTTCGGAATTGTACTGTTAGAGATA CTAACAGGGAGAAAACCAGTGATGTTCACACAAGACGAAGACATAGTCAAATGGGTGAAG AAACAGTTACAAAGGGGCCAAATCTCAGAGCTACTCGAACCCGGGTTACTAGAGCTGGAC CCCGAGTCATCCGAGTGGGAAGAATTCTTGCTAGGCGTTAAAGTGGGGCTGCTTTGCACA GCTCCTGATCCACTTGATCGACCGTCAATGGCGGACATTGTTTTCATGCTTGAAGGTTGC AGAGTGGGACCAGACATACCATCCTCAGCTGATCCCACCTCCCTTCCTTCACCTATTTAA