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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000883 | Chr5 | 20069320 | 20073276 | - | AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor RAV1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000883.m1 | 208 | 294 | PF02362.24 | B3 | Family | 37.6 | 1.60E-09 |
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>LITCHI000883.m1 ATGGAAACTCTCAGCAACATCATCGGTTTACCAGCCAATTCGATCAACCGGATCATATGC AGTGTGATAATGCAGGGTATTGTGCGCCACAGACGTATGCTAATAGCGCTTCTCTGCCTC GCATTAGAGGCCACATCATTTGCACTCGACCAAATTGGAGGAAGCCATCTTGGTTTCCTT GTAGCTTCTTTTGTTTTGTCCATTATAGGCTTTGTTATGACTGCCTACAGTGCCACGCGA AGTACAACGGATCTTGAAATTGATCGTGTTGTGATAGAGATGGCCTTCTCGACTGTCCAA ATGATTATGACATATGTTTATTTATTTCAAGATCCAACACCAAACACTTTAGGGAGAGAT GAAGAAGGGTTTACGGGTACATTGGTACCCCCAATACCCTATGTCGTTCCATCGGATAAT CAATCAATGGTCGATATAGAGGAAGAAGAAAAAGAGATTCCAGGAACATCAAGAGCATCA CTCGTTTCATCAGATACTCCAATGATGACTGATGATAAGGACATTGCTATTCTAACAGCT AAATGGTCTGATAGTAATAATGAGATTTCAGATTCCACAGCAGCACCTACAACACCAGCA ATATGTTCGAAGACCAAGATGTTTTCAAAACTTATCATTACAAGTGACCTTAAGAAGGAG CTAATAGTCCCAAACGAAGCTATGGAGCATTTTCTGATTCCTGAAGGACATGACTTCGTT GATTTGCTGGTGCAGGACATGAAAGGAGATGTTTGGAAATTTTGTTTGACCATTAAGCCA ACGCCTATTTTGACTGAAGGTTGGGTTGAATTTGCGCAAGCTCATGGTCTTGTGCAGGAT AAAATCGTGACTTTCTACAAGCAGCAAAATGAAGATTTTGAAGAGCTATACAGAGTTGAG ATCGACAGCATCAACAAGTGA
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>LITCHI000883.m1 ATGGAAACTCTCAGCAACATCATCGGTTTACCAGCCAATTCGATCAACCGGATCATATGC AGTGTGATAATGCAGGGTATTGTGCGCCACAGACGTATGCTAATAGCGCTTCTCTGCCTC GCATTAGAGGCCACATCATTTGCACTCGACCAAATTGGAGGAAGCCATCTTGGTTTCCTT GTAGCTTCTTTTGTTTTGTCCATTATAGGCTTTGTTATGACTGCCTACAGTGCCACGCGA AGTACAACGGATCTTGAAATTGATCGTGTTGTGATAGAGATGGCCTTCTCGACTGTCCAA ATGATTATGACATATGTTTATTTATTTCAAGATCCAACACCAAACACTTTAGGGAGAGAT GAAGAAGGGTTTACGGGTACATTGGTACCCCCAATACCCTATGTCGTTCCATCGGATAAT CAATCAATGGTCGATATAGAGGAAGAAGAAAAAGAGATTCCAGGAACATCAAGAGCATCA CTCGTTTCATCAGATACTCCAATGATGACTGATGATAAGGACATTGCTATTCTAACAGCT AAATGGTCTGATAGTAATAATGAGATTTCAGATTCCACAGCAGCACCTACAACACCAGCA ATATGTTCGAAGACCAAGATGTTTTCAAAACTTATCATTACAAGTGACCTTAAGAAGGAG CTAATAGTCCCAAACGAAGCTATGGAGCATTTTCTGATTCCTGAAGGACATGACTTCGTT GATTTGCTGGTGCAGGACATGAAAGGAGATGTTTGGAAATTTTGTTTGACCATTAAGCCA ACGCCTATTTTGACTGAAGGTTGGGTTGAATTTGCGCAAGCTCATGGTCTTGTGCAGGAT AAAATCGTGACTTTCTACAAGCAGCAAAATGAAGATTTTGAAGAGCTATACAGAGTTGAG ATCGACAGCATCAACAAGTGA
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>LITCHI000883.m1 - Up_Stream_Len 2000 TCATAAAAAGATTTCTCTCAGGCTAAACCTGGTTCTTGAGCTCCCAATTTGATCAAGTTC AAGACAAGTCCTAGTCATAGATCCAATATATTGAAAATTTGCAAACGGTGGTGAGCAATT GGTGATTTTTCCATCCATGCTGAAAATGAATATAACAGCAAAACCATGGCAGGGCTAGGG GTGCCTGGCCCAACCCGGTTAGTTTCTTTTATCGTTTTATTTATATATATTTTTTTAAAT ACAAACTATATAAAATTAAAATTTAATAAATTCATCCAATTAATTATTATTATTATAATT AAAATCACATATATTAAATTAAATTTTATCTAAAAGCATAAAATACTTCCCTCTTATTAT TTGACAATATATAAATTATTTCATAGCATTCCTATCTTAAATAAGGAATTTTTTTTTCCC ATTATTGACATATTATGCAATATTGTTTTATAACAATTTTTACTCTACGTTTTGACTACT CATCTTTGTTATTACATCTAAGTTTGTCAAGTTTGAGCTTGTAAATTAATAAATATTTTA TAGATTTTTTAAAAATTTATGTTTTTTATATTTATTATTTTGTTAGCTTATTAAAGACTA AGCACACAACAAAGTAAAGAATGACTTTTTTATGAACTCTTTCGATAATTTGAAAGAGAT ATGGTAAAAAAATTTAGTGTAGTTTTAGTATTTTAAATAATATTTGATATTCAAAAGAAT AATAAGTTCTATCTTAAACTAAATAATCATATTTAGTTTTGAACAATTTGATGTATTAAC ATAAGTAATCATTTTGCATTAATAGAAATATATATATATATATATTTGGCCCTCCTAATG CTAAAATCCTAGCTTCGCCCCTAACTGTAATCATAGCAAAGGCTAGTGGAAACGCCAATG CATCATGATCAATCTTCACTTCAAAACTGTTGGTATATATATCTTGAAACGAATGTAACA ATCAACTGAATTACTGGGAAAATAATTTTCACCAACTTATGTTGCATCTATGCCATGATT GTTAGATTGGTTATTGCCTCGACAAAGGAATAGGCAGTCATAGGCTCATAGCAAAACCGA TTTTTGATGCATTTTTGGGGCTCAGAGGCCAGAGTCGCGGCACTTCTACATATTTATAAC ATCTTTGGTTGTGCACGGACTTGTGTTTTGCGGATGTGGATCCCGCCATCCCCGTCAGTT TGACATTGACGTCATTCAACTTTTATTTTTTAATATGTTACGGTTTTTTTTTTGGCGCTG TATGTGGTATTATTTTGTTTGTTTTGTTTCCTGGGAAAATGCACTTTCTAAATATGCCAT GATTTATATAGTTTACACAAATTACTTCCGCGTTACTTGGATTGGTTTTTGAACTAGTTT TTCAAAAGAACAATAGCGAAGAGTTTTTTTCCAAAAAAAAAAATAGCGAAGAGTTTTTAC ACAAATTCAAAAAAAAGAAATTAAAAGAAAAACAAAATTAAAATGCTAATTGAGATCTCC ACCTACCATGAAGATGAAAATCTAGGCATTGGCATCCTCCATGCAGACCCTAGATCCCAT CTCTATAAATGACAATTTTTGAATTGAGTGAAAATCATATATGAATATTTAAGATATAGA TTTAAAATAAAAATTTTAAGTTGACTTACCCTTTAAAAAATTATATATTTATTTACAGTT TTTTTTTTTTTTTTTTAATTTCTTTTGATACCACTCAACTATCCTGATATGGTTGTATGA TCTATGGGAATAAATCTTTCGAACTCCACATTTGTTCAACAAAAGAATAACAAAAGTTAA GTCAACAAAGTCAAACTGGACTTTAAAAAGAGAGTAACTTAAAAAGAAGTTTGGGAGGAA GAAATCGTCTTGCATGTGCTTTGGAGAGGAAGAACTCCTCCATACAGGTGCTTCTTTCTT TATCATTTTAAATAGACTCTCAACCATTAAAGTAAGACTTTACCAAACTTGTGCCCGTCA ATTCTCATAACCAAAAGACG
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>LITCHI000883.m1 GenomeSequence - ATGGAAACTCTCAGCAACATCATCGGTTTACCAGCCAATTCGATCAACCGGATCATATGC AGTGTGATAATGCAGGTCTTAATTTGTTCTTGAAAGTAGAATTAGTTATTTTGTGATATA TATATGTATATTGTTATATGTATTTTTCGGACTCATTAATTGGGCTGGTAAAAGTCCAAT TTAGGCCCATTTTAGACCCAATAAGAAGGCCCGATAAGGTCAACCCAGTCAAAGCCCATC AGACGAGGCTCAGATATCAACTCCAGGCCCAGCAGAAGGTACAGTTCATCTCAGTATCCT GTCAGCTCGCTACAACGAGCTCGTTTCACAGCTCACCTCATGCACAGCTCGTCTCTCAGC GAGCTCGAGCTCGAGACCACCATAGACACGTCAGCTCGTCCAAAAGCGTAATAAATGCAG TATCTTCCAGAAACAGGCATTACCAAGTTCAACCATGATTCTCTCTCCGAATATGGTAAT TACCCAGTCAAACCATGATTTCCTTATCAGATATGGAAGTCTACTCAAAATCAAAATCAA ATCAACCTTATCTCGAGATAATTACAGTAGTTTCCTGATATTATTCAAATATATTAGGAA GCATAATTAATGTATAATTCTTTTCCTTATTTTTCTTGATTATTTGGGAAGTGTAATTAA TTCATGATTTTTTTCCTGATTTGCTACAACTAGAATTGTAACATCTCTTTCCCTATAAAT AGGGATTAAGATCATTGTAACATGATGAGAGAATAATCAATAATATACTGTCACTCTGCA GAATTTAAGAGACAGACAGTCGTGGACGTAGGCCAATTATTGCCGAACCATGTAAAAGCT CCGTGTCCCTCGTTTGATTCTCGGTATTTGTCTGTATCTTTTCTTGGTATTTGTGCTTTC TCACATTGATTGCAGGTATTGGGTATTGATTACTCGTCGGCTGAAATCCAACGTCGACAT ATATATATATATATATATATATCAATGTTTTTGGGTATATATTAGTCCAATGATATATGT TTTCTTTGTAAGAAAGTTTAAACGATACAAATTTTATGGTGATTTTTTGGTTAATTTATT TCTTCTTATTTTAACTGCGCTGACAAACCACAAATGGTTAGTTACATTTTATTATCTTTT TAAATATAGATGTTGTCTAATTCTGTACATAATTCTAATGCTTCATTGCAGGGTATTGTG CGCCACAGACGTATGCTAATAGCGCTTCTCTGCCTCGCATTAGAGGCCACATCATTTGCA CTCGACCAAATTGGAGGAAGCCATCTTGGTTTCCTTGTAGCTTCTTTTGTTTTGTCCATT ATAGGCTTTGTTATGACTGCCTACAGTGCCACGCGAAGTACAACGGATCTTGAAATTGAT CGTGTTGTGATAGAGATGGCCTTCTCGACTGTCCAAATGATTATGACATATGTTTATTTA TGTATGTCGATTTTGAGAGTCAATTTCAAGTCAAATATTGCATCCATTTTCCCACTAGTC CTTGCTGTCACTACCCTTGCCTTGGCATAGAAACATAATGTACTAGTTCAAGATCCAACA CCAAACACTTTAGGGAGAGATGAAGAAGGGTTTACGGGTACATTGGTACCCCCAATACCC TATGTCGTTCCATCGGATAATCAATCAATGGTCGATATAGAGGAAGAAGAAAAAGAGATT CCAGGAACATCAAGAGCATCACTCGTTTCATCAGATACTCCAATGATGACTGATGATAAG GACATTGCTATTCTAACAGCTAAATGGTCTGATAGTAATAATGAGATTTCAGATTCCACA GCAGCACCTACAACACCAGCAATATGTTCGAAGACCAAGGTAAAAATTTGGAGTTTTACC ATATATATATCTAGCTATCAATGATGATAATATTTGTGCTTTTATTCTAGTATACTACTT TTTTATTTTTAGGTTTGCTACCTTACCCAACTACTAACCTTATTCATAAATTGTAACTTT TAGATTGGTTGAGTGCTCTAATTTTGGAAAGAATTCATTTATGTCTTAATTATAACTAAT TTTAAAAGTGAGATGAAAAGGTTGAGATTGGAGTAAAAATATGTAACATTAACATATGGA TTATTAATTTGAGATATCATTTTACCCCTTTGAAACGTGAATTGGATTGTTGGTGTAGAG TGAACTGTTTCAGTAATTCGACCACATTCAAATACTAATCAGACCATTAATTATGATGTG CAACAAATATGTGAAGAACTACAGTAAAACGAGACGAATATAGATTAGACATGATCATTT TTACGTCATTGCAAATGAACTAAGCTTTAGCATTCCACTATATTTAGTCTTTTCTCTCCA AACAACCAACCATTAATTGATATAGACAGGTGGCAGTCAACGAAGAAGAACTTTCAATGA TCAACATATGTTCTAATGTCATTAATGTTAGATCAAATTAATATAAGAGTCTCTCGTGTT TTCTAATAGCAAACTTTCACAATGTCTTGTATCGATCTTTATTGTTTCCATAAGTATAAA ATTCAGTCTAAGTCAATGTTTGAGAGCTATTAGTGTTATTTGTTATTCTCAAGCCAATTA ATCAATCCTAGAAATTGATATACTAGGTTTGGAATGAGTGAAAGAAAATTTATTAGTTTT CTGTTAGTTTGTAAGATGATGGAGGAAACAAAAAAAAAAAAAAACCAACTAGGTGATGAG GTGCCCAGGTTCAGGGATTTAAGAATGGGAGTGATATCTCAAAATGGCATGACGAAATCA CCCTTTAAATATGATGCCTAAAGTTACCATATATATTTTCTTTGTCCTATAATATTATTC TTATACATGCATACTGTTATTAGTAAATACAATGATGTGATTATAATATCATGACATTGT CACATGCATTAGTAAGTGTAAACATTTGTTGCTACTAGTTAACTATATTGTTGATATTTG CTATGGTTATGTGACAGATTTTAGGACTAAATCCATTCATACTAAAGTTTGGACAATTTG ATTGCATTGTCTATATAAAATATATGTTAATATGCGCATTAACATTGGACAAAGTGAATA AAATATTATGCTTATTCTTTAAATATTAAAAAAAAAAAAACAATATAGTTAAACTAAGGC ATTATTCAAGTTAAACTCTAGTCAGGAAAACCTTGAAGGTGCATCAATTAAAATGTACAT CAAAACAAAAATTAAAACAAAACGAGAAAAGAATATAAAAAAAATTATCGAAAATGAACA AATGAAATGATAAATGAAAAAAAAAAAACTAGCATGATAGAGATCTGAAACCAGCTAATT AAAATTATCTCTTGCAACTTCCGTTAGCCTTTTATACCCTAAAGAATTTTGCCAAGGGGA AAAATTGATGCATTCTTGAAAATTTTTCCCTTTCTAAGACATGTATTTTATATTTTGTTT TATCAAATATTCCATCTTTACTTGTTTCTTTATTTATTTTTTCTCTATACATTTTCATAT CCTATAAGCACATAAACATTACTTTCATCACAATGTCTAACAACACCAAGGCTTGAAATG GATTCAGTTTATAAGAATGTATTATTATTATTTGTGAAAAATATCTGTCAAAAGCATGAC ACTAATTAACAAAACATTACCAGTCAGAGTTCTCATATATGGTCTATGCAACAGATGTTT TCAAAACTTATCATTACAAGTGACCTTAAGAAGGAGCTAATAGTCCCAAACGAAGCTATG GAGCATTTTCTGATTCCTGAAGGACATGACTTCGTTGATTTGCTGGTGCAGGACATGAAA GGAGATGTTTGGAAATTTTGTTTGACCATTAAGCCAACGCCTATTTTGACTGAAGGTTGG GTTGAATTTGCGCAAGCTCATGGTCTTGTGCAGGATAAAATCGTGACTTTCTACAAGCAG CAAAATGAAGATTTTGAAGAGCTATACAGAGTTGAGATCGACAGCATCAACAAGTGA