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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000840 | Chr5 | 19289725 | 19295699;19295924 | - | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 11 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000840.m1 | 79 | 172 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 68 | 9.60E-19 |
LITCHI000840.m1 | 295 | 386 | PF10551.12 | MULE | Domain | 61.7 | 7.40E-17 |
LITCHI000840.m1 | 576 | 604 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 29.9 | 3.50E-07 |
LITCHI000840.m2 | 63 | 156 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 68.1 | 9.30E-19 |
LITCHI000840.m2 | 279 | 370 | PF10551.12 | MULE | Domain | 61.8 | 7.10E-17 |
LITCHI000840.m2 | 560 | 588 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 29.9 | 3.40E-07 |
LITCHI000840.m3 | 63 | 156 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 68.7 | 5.80E-19 |
LITCHI000840.m3 | 279 | 370 | PF10551.12 | MULE | Domain | 62.4 | 4.50E-17 |
LITCHI000840.m4 | 123 | 216 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 69.2 | 4.00E-19 |
LITCHI000840.m5 | 63 | 156 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 68.8 | 5.40E-19 |
LITCHI000840.m5 | 279 | 370 | PF10551.12 | MULE | Domain | 62.5 | 4.20E-17 |
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>LITCHI000840.m1 ATGTACAGCGGCTCTTTGGTTTATTCCGCGTGGATTGATGAAAATATTATGATGTCTGGA GAGGCTGGGCAGATGATGGTAGTTTATGATGATCCCTCAGACCAACGATCTTTGTCTTTG GATGATACCAGTAGCACCGAGGAATCACCTGATGAAACCAGACTCTCCCTTGAAAACAGC AATGATGTAGTTCCATATAATGGGCAAAGATTTCCCAATCACGATGCTGCATATGAGTTC TATAGTGAATTCGCAAAGCGATGTGGTTTCTCAATCCGACGTCATCGCACTGAAGGAAAA GACGGTGTTGGCAAAGGACTGACTAGACGCTACTTTGTCTGCCACCGTGCTGGTAACACA CCAATCAAAACTGCAAATGAAAGTAAACCTCAAAGAAATCGGAAATCTTCTCGGTGTGGA TGTCAAGCATACATGAGAATCAGCAAAGTTTCAGAATTAGGAGCACCAGAATGGCGTGTC ACTGGTTTTGCAAATCACCATAATCATGAACTATTAGAGCCAAATCAAGTTCGTTTTCTT CCTGCATATCGAACCATATCAGATACAGACAAGAGCCGGATACTCATGTTTGCAAAAACA GGAATTTCGGTGCAGCAAATGATGAGGCTCATGGAGCTTGAGAAATGCGTGGAGCCAGGA TATTTGCCATTTACCGAGAAGGACGTGAGAAATTTACTTCAATCATTTAGAAAATTAGAT CCAGAAGATGAAAGTGTAGATTTATTAAGAATGTGTAGAAACATTAAGGAAAAAGATCCC AACTTCAAATTTGAGTACACTCTTGATTCTAACAACAGGTTAGAGAATATTGCTTGGTCA TATGCTTCATCAGTCCAGGCTTATGAGATCTTTGGTGATGCAGTAGTTTTTGATACAACA CATCGCTTAACTGCGTTAGACATGCCGCTTGGAATATGGGTTGGAGTGAATAATTATGGT GTGCCTTGCTTCTTTGGTTGCACATTGTTACGCGAGGAAAATTTAAGGTCATTGTCATGG GCACTGAAGGCATTCTTAGGGTTCATGGATGGGAAGCCTCCACAGACTATATTAACTGAC CAGAACATGTGTCTTAAAGAAGCCATAGCCATGGAAATGCCAGCAACTAAACATGCACTC TGCATATGGATGATCGTGGTGAAGTTTCCATCCTGGTTTAATGCTGTGCTGGGGGAGCGT TACAACGAGTGGAAGGCTGAGTTTTATAGGCTGTATAATCTAGAGTCAATTGAGGATTTT GAACTGGGATGGAGGGACATGGTTAATTCATTTGGACTTCACACTAACAGACACATAGCC AACTTGTTTGCCTTGCGAACACAGTGGGCATTACCGTACTTGAGAAGTCATTTCTTTGCT GGAATGACTACAACTGGACACTCGAAGGCAATCAATTCTTTCATTCAAAGGTTTTTGAGT GCTCAAACCCGACTCGCACACTTTGTAGAACAAGTGGCCGTGGCTGTGGATTTTAAAGAT CAAGCTGCAGAACAACAGACAATGCAGCAGAATCTCCAAAACATTTGCCTCAAGACTGGT GCTCCAATGGAATCCCATGCTGCTTCGGTCCTCACTCCTTTCGCCTTCTCCAAGCTGCAA GAACAGCTTGTTTTGGCTGCCCATTATGCGTCATTTCAGATGGAAGACGGTTTTCTTGTT AGACACCACACAAAGCTCGAGGGAGGCCGGAAAGTGTACTGGGTCCCCCAGGAAGGCATC ATAAGTTGCAGCTGTCATCAGTTTGAATTCTCTGGAATTCTCTGTCGCCATGCCCTTCGA GTTCTCTCAACAGGAAACTGCTTTCAGATCCCAGATAGGTACCTTCCCATCCGCTGGCGC CGGATCAGCACACATTCTGTAAAGCTTCTCCAAACTTCTCCAAGTGACCACACAGAGAGG ATTCAGTTATTGCAGAGCATGGTCTCCTCTCTAGTATCAGAATCCGCCAAATCAAAGGAG AGGCTTGATCTTGCTACCGAGCAAGTCTCCTTCCTTCTATCTCGGATAAGACAGCAGCCA GTTTCATCTCAAGGTATGAGAGACATCTCACCCATTCACAGAAACCTATAA >LITCHI000840.m2 ATGATGTCTGGAGAGGCTGGGCAGATGATGGTAGTTTATGATGATCCCTCAGACCAACGA TCTTTGTCTTTGGATGATACCAGTAGCACCGAGGAATCACCTGATGAAACCAGACTCTCC CTTGAAAACAGCAATGATGTAGTTCCATATAATGGGCAAAGATTTCCCAATCACGATGCT GCATATGAGTTCTATAGTGAATTCGCAAAGCGATGTGGTTTCTCAATCCGACGTCATCGC ACTGAAGGAAAAGACGGTGTTGGCAAAGGACTGACTAGACGCTACTTTGTCTGCCACCGT GCTGGTAACACACCAATCAAAACTGCAAATGAAAGTAAACCTCAAAGAAATCGGAAATCT TCTCGGTGTGGATGTCAAGCATACATGAGAATCAGCAAAGTTTCAGAATTAGGAGCACCA GAATGGCGTGTCACTGGTTTTGCAAATCACCATAATCATGAACTATTAGAGCCAAATCAA GTTCGTTTTCTTCCTGCATATCGAACCATATCAGATACAGACAAGAGCCGGATACTCATG TTTGCAAAAACAGGAATTTCGGTGCAGCAAATGATGAGGCTCATGGAGCTTGAGAAATGC GTGGAGCCAGGATATTTGCCATTTACCGAGAAGGACGTGAGAAATTTACTTCAATCATTT AGAAAATTAGATCCAGAAGATGAAAGTGTAGATTTATTAAGAATGTGTAGAAACATTAAG GAAAAAGATCCCAACTTCAAATTTGAGTACACTCTTGATTCTAACAACAGGTTAGAGAAT ATTGCTTGGTCATATGCTTCATCAGTCCAGGCTTATGAGATCTTTGGTGATGCAGTAGTT TTTGATACAACACATCGCTTAACTGCGTTAGACATGCCGCTTGGAATATGGGTTGGAGTG AATAATTATGGTGTGCCTTGCTTCTTTGGTTGCACATTGTTACGCGAGGAAAATTTAAGG TCATTGTCATGGGCACTGAAGGCATTCTTAGGGTTCATGGATGGGAAGCCTCCACAGACT ATATTAACTGACCAGAACATGTGTCTTAAAGAAGCCATAGCCATGGAAATGCCAGCAACT AAACATGCACTCTGCATATGGATGATCGTGGTGAAGTTTCCATCCTGGTTTAATGCTGTG CTGGGGGAGCGTTACAACGAGTGGAAGGCTGAGTTTTATAGGCTGTATAATCTAGAGTCA ATTGAGGATTTTGAACTGGGATGGAGGGACATGGTTAATTCATTTGGACTTCACACTAAC AGACACATAGCCAACTTGTTTGCCTTGCGAACACAGTGGGCATTACCGTACTTGAGAAGT CATTTCTTTGCTGGAATGACTACAACTGGACACTCGAAGGCAATCAATTCTTTCATTCAA AGGTTTTTGAGTGCTCAAACCCGACTCGCACACTTTGTAGAACAAGTGGCCGTGGCTGTG GATTTTAAAGATCAAGCTGCAGAACAACAGACAATGCAGCAGAATCTCCAAAACATTTGC CTCAAGACTGGTGCTCCAATGGAATCCCATGCTGCTTCGGTCCTCACTCCTTTCGCCTTC TCCAAGCTGCAAGAACAGCTTGTTTTGGCTGCCCATTATGCGTCATTTCAGATGGAAGAC GGTTTTCTTGTTAGACACCACACAAAGCTCGAGGGAGGCCGGAAAGTGTACTGGGTCCCC CAGGAAGGCATCATAAGTTGCAGCTGTCATCAGTTTGAATTCTCTGGAATTCTCTGTCGC 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ATTGCTTGGTCATATGCTTCATCAGTCCAGGCTTATGAGATCTTTGGTGATGCAGTAGTT TTTGATACAACACATCGCTTAACTGCGTTAGACATGCCGCTTGGAATATGGGTTGGAGTG AATAATTATGGTGTGCCTTGCTTCTTTGGTTGCACATTGTTACGCGAGGAAAATTTAAGG TCATTGTCATGGGCACTGAAGGCATTCTTAGGGTTCATGGATGGGAAGCCTCCACAGACT ATATTAACTGACCAGAACATGTGTCTTAAAGAAGCCATAGCCATGGAAATGCCAGCAACT AAACATGCACTCTGCATATGGATGATCGTGGTGAAGTTTCCATCCTGGTTTAATGCTGTG CTGGGGGAGCGTTACAACGAGTGGAAGGCTGAGTTTTATAGGCTGTATAATCTAGAGTCA ATTGAGGATTTTGAACTGGGATGGAGGGACATGGTTAATTCATTTGGACTTCACACTAAC AGACACATAGCCAACTTGTTTGCCTTGCGAACACAGTGGGCATTACCGTACTTGAGAAGT CATTTCTTTGCTGGAATGACTACAACTGGACACTCGAAGGCAATCAATTCTTTCATTCAA AGGTTTTTGAGTGCTCAAACCCGACTCGCACACTTTGTAGAACAAGATGATATTTTTTAG
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