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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000838 | Chr5 | 19282475 | 19287844 | + | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000838.m1 | 30 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 38.9 | 8.50E-10 |
LITCHI000838.m1 | 288 | 349 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 39.1 | 4.90E-10 |
LITCHI000838.m1 | 392 | 451 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.9 | 9.00E-08 |
LITCHI000838.m1 | 416 | 438 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.6 | 1.8 |
LITCHI000838.m1 | 464 | 523 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.6 | 5.50E-08 |
LITCHI000838.m1 | 561 | 619 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 52 | 4.60E-14 |
LITCHI000838.m1 | 584 | 619 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 31.3 | 2.10E-07 |
LITCHI000838.m1 | 584 | 606 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 15.4 | 0.022 |
LITCHI000838.m1 | 731 | 999 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 164.2 | 4.10E-48 |
LITCHI000838.m1 | 734 | 1002 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 159.6 | 9.60E-47 |
LITCHI000838.m2 | 30 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 39 | 7.70E-10 |
LITCHI000838.m2 | 288 | 349 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 39.3 | 4.40E-10 |
LITCHI000838.m2 | 392 | 451 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.9 | 8.70E-08 |
LITCHI000838.m2 | 416 | 438 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.7 | 1.6 |
LITCHI000838.m2 | 464 | 523 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.9 | 4.50E-08 |
LITCHI000838.m2 | 561 | 619 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 52.3 | 3.90E-14 |
LITCHI000838.m2 | 584 | 619 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 31.4 | 1.80E-07 |
LITCHI000838.m2 | 584 | 606 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 15.5 | 0.02 |
LITCHI000838.m2 | 731 | 900 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 122.4 | 2.30E-35 |
LITCHI000838.m2 | 734 | 903 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 111.6 | 4.20E-32 |
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>LITCHI000838.m1 ATGGAAAATACTTGCTTTCTCATCATTCTCATACTTTGTTTCTCACTAAATCCTTCCATT TCTCGGTCATTAACAAATATTTCCATCGATGAAGATGCTCTTCTTACCTTCAAAGCCCGT ATCACTAATGATCCTAACAATATTTTAGCCACCAATTGGTCCAAGACTACCTCCGTTTGT AATTGGATCGGCATCACTTGTGGTGTCCGACATCAAAGAGTTGTGGCTTTGAATATATCT TACCTTGGTCTTATAGGGACCATCCCACCCCAAATAGGGAACCTTTCTTTCCTTGCATCA CTAGCCATCAACAACAACAGCTTTCATGGCTCGCTTCCAAATGAGTTGGCTCATTTACGT CGATTGAAATACATTAATTTCAATCATAACCAACTTTCAGGTGCTGTACCCTTCTCTATC TTCAACATGTCTTTCATGCAAGAAATTAGACTCAAACACAACCGCTTCTCGTCTATTGTC AACTTGTCTACTTGTGGACCTAATTTGGTGTTACTTGATCTGTCTGAAAACATGTTTGAG GGAAAGATACCATCCTTTATATCAAAGTGCAGACAACTACAACTTTTGGGGATGTCATAT AACAATTTTACTGGAGGCATACCAAGAGAATTCGGCAACTTGACCGAGATTAAAATGATA ATAATTGAAGACAATAAACTCCTAGGTGAGATACCTTATGAAATTGGCAATCTTCATAAA CTAGAGGCTTTGGCATTTAGCGACAACCACCTAGTCGGTGTCGTTCCAGCCCCAATTTTC AACATTTCAACATTGAATCTGCTTGCACTTGATAACAACACACTCTCAGGAAGTCTTCCA TCAAGCAGTGCTCTTAGCCTTCCAAATCTTGAGTCGCTTGTGCTTACATTCAACAACTTT AGTGGCACATTCCCCAGCTTCATCACAAATTGTTCCAAGCTCAGGTACCTAGAGATGGGG 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