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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000838 | Chr5 | 19282475 | 19287844 | + | Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000838.m1 | 30 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 38.9 | 8.50E-10 |
| LITCHI000838.m1 | 288 | 349 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 39.1 | 4.90E-10 |
| LITCHI000838.m1 | 392 | 451 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.9 | 9.00E-08 |
| LITCHI000838.m1 | 416 | 438 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.6 | 1.8 |
| LITCHI000838.m1 | 464 | 523 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.6 | 5.50E-08 |
| LITCHI000838.m1 | 561 | 619 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 52 | 4.60E-14 |
| LITCHI000838.m1 | 584 | 619 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 31.3 | 2.10E-07 |
| LITCHI000838.m1 | 584 | 606 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 15.4 | 0.022 |
| LITCHI000838.m1 | 731 | 999 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 164.2 | 4.10E-48 |
| LITCHI000838.m1 | 734 | 1002 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 159.6 | 9.60E-47 |
| LITCHI000838.m2 | 30 | 67 | PF08263.15 | LRRNT_2 | Family | 39 | 7.70E-10 |
| LITCHI000838.m2 | 288 | 349 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 39.3 | 4.40E-10 |
| LITCHI000838.m2 | 392 | 451 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 31.9 | 8.70E-08 |
| LITCHI000838.m2 | 416 | 438 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 9.7 | 1.6 |
| LITCHI000838.m2 | 464 | 523 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 32.9 | 4.50E-08 |
| LITCHI000838.m2 | 561 | 619 | PF13855.9 | LRR_8 | Repeat | 52.3 | 3.90E-14 |
| LITCHI000838.m2 | 584 | 619 | PF12799.10 | LRR_4 | Repeat | 31.4 | 1.80E-07 |
| LITCHI000838.m2 | 584 | 606 | PF00560.36 | LRR_1 | Repeat | 15.5 | 0.02 |
| LITCHI000838.m2 | 731 | 900 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 122.4 | 2.30E-35 |
| LITCHI000838.m2 | 734 | 903 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 111.6 | 4.20E-32 |
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>LITCHI000838.m1 ATGGAAAATACTTGCTTTCTCATCATTCTCATACTTTGTTTCTCACTAAATCCTTCCATT TCTCGGTCATTAACAAATATTTCCATCGATGAAGATGCTCTTCTTACCTTCAAAGCCCGT ATCACTAATGATCCTAACAATATTTTAGCCACCAATTGGTCCAAGACTACCTCCGTTTGT AATTGGATCGGCATCACTTGTGGTGTCCGACATCAAAGAGTTGTGGCTTTGAATATATCT TACCTTGGTCTTATAGGGACCATCCCACCCCAAATAGGGAACCTTTCTTTCCTTGCATCA CTAGCCATCAACAACAACAGCTTTCATGGCTCGCTTCCAAATGAGTTGGCTCATTTACGT CGATTGAAATACATTAATTTCAATCATAACCAACTTTCAGGTGCTGTACCCTTCTCTATC TTCAACATGTCTTTCATGCAAGAAATTAGACTCAAACACAACCGCTTCTCGTCTATTGTC AACTTGTCTACTTGTGGACCTAATTTGGTGTTACTTGATCTGTCTGAAAACATGTTTGAG GGAAAGATACCATCCTTTATATCAAAGTGCAGACAACTACAACTTTTGGGGATGTCATAT AACAATTTTACTGGAGGCATACCAAGAGAATTCGGCAACTTGACCGAGATTAAAATGATA ATAATTGAAGACAATAAACTCCTAGGTGAGATACCTTATGAAATTGGCAATCTTCATAAA CTAGAGGCTTTGGCATTTAGCGACAACCACCTAGTCGGTGTCGTTCCAGCCCCAATTTTC AACATTTCAACATTGAATCTGCTTGCACTTGATAACAACACACTCTCAGGAAGTCTTCCA TCAAGCAGTGCTCTTAGCCTTCCAAATCTTGAGTCGCTTGTGCTTACATTCAACAACTTT AGTGGCACATTCCCCAGCTTCATCACAAATTGTTCCAAGCTCAGGTACCTAGAGATGGGG 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CATGCATTGTGTGGTTTGCCTAAACAGCAAGTCCCTCCGTGCAAAAGTACTAGAAGTACT CATCCAAAATCAAGGATCGATGTTGTCCTAGCCATCGCTTTGCCACTAAGTTTTGTTGTC TTCATGACTTTGATAGTCATTGTGTTGAGTGGATGTCGAAAAAGGAGAAGCATTGTCCAA CCACCTAATAGTAATGAAGTTGATGTATCACACCGAGGAATGTGGAGAAGAATTTCTTAT CAAGAACTCGTTCGAGCAACAGACAGATTTAGTGAAAGAAATCTGCTAGGTGAAGGGAGT TTTGGTTCGGTTTTCAAAGGAAGACTTTTAGATGGAATGGAGATTGCAGTGAAGGTGTTC CGCCTACAATCTGAAAGATCACTTAAGAGTTTTGATATTGAATGTGAAGTTATGAGTGGT ATTCGACATCGAAACCTTGTCAAAATCATTAGCAGTTGTACAAATGAGGATGTTAAAGCG TTGGTACTAGAGTACATGCCTAACGGGAGCCTAGAAAAGTGGTTGTACTCTAATGAATAC TTTTTGAATATATTACATAGGTTGAATATAATGATAGATGTGGCATCAGCTTTGGAGTAT CTTCACTTTGGTTATTCAGTCCCTATAGTTCATTGTGACATCAAGCCTAGTAATGTGTTG ATAGACGAAAGCATGGTTGCACACTTGAGTGATTTTGGCATTGCAAAACTTTTAGGTGAA GAAGAATCCATGACACAAACACAGACCCTAGCAACAATAGGTTACATGGCACCAGAGTAT GGAAGAGAAGGAAAGGTTTCCCAAAAAGGAGATGTTTATAGCTATGGCATCATGTTGATG GAGACATTTACTAAGAAGAAGCCGACGGATGAACTTTTTATTGGGGAAACGAATTTGAGG AGGTGGGTTGGTGACTCATTAAATCGTTCAATCATGGAAGTTGTGGATCACAATTTACTA 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>LITCHI027548.m1 ATGGACTCTTCTTCTTCTTCTTCTGCTACAAAGGATAATGATTTTCATGTTCTGGCTGTG GATGACAATCTCGTTGATCGGAAACTGGTCGAAAAGTTGCTCAAGAATTTCTTCTTTAAA GTTACAACCGCGGAGAATGGATTGAGGGCATTGGAGTTCTTGGGCTTGGTAGATGGGCAA AAGCAGAAAACCTCTGTTTCGAAGGTAAATTTAATAATTACAGATTACTGTATGCCAGGA ATGACAGGCTATGAGCTTCTAAAGAAAATCAAGGAGTCATCTGTCATGAAGGAGGTTCCA GTGGTGGTTGTGTCATCAGAGAATATTCCTACAAGAATTAACCAGTGCTTGGAAGAAGGA GCTCAAATGTTCATGCTAAAGCCTCTTAAACAAGCAGATGTGAAGAAACTGAAATGTCAG TTGATGAACTGA
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>LITCHI023430.m3 - Up_Stream_Len 2000 GAAGGCGGCGAATGGTTTGTTTTAAATAAAATTTGTTTTCTGTTAGTTTTCTTCATTTCT TCTTTTTAGTTTCCCCTTCATATAGATAGTCTAAGGAAATACTTTTCTTCATTTTGATTG GTACTCACTAGCAGACACTAAGGATAGGTTCAAGTAATATATATTTGTTAAATTTGTATT TCCTTAGACGTTAAATATTTGAGCTTAACATTATTTATTTCAAGTTCTCACTCTGACATT CACTGAGTGATCAGAAGGTTGCTGAAAATTATACTACTTTTTCATCTAGTGCATCAGAAT TAGGAGTATACTGATTCTAAGTGGCCCAATCTCTCACTATAGTTGTGTTATATGTTCACA TGTAGATGAGCACTCTTCAAAGTTAGATGATAGGATTTGTGTTTTAAACTAAGCATTATG ATTCATGCGAGTTTCTTATGTTTTGGCAGCTTGGGCTGGCAGAAAAGAACATCTTGAACT GTGACTTTGATCTGGTGGCATCGGACCCTAGTGATGCTAATACAAACAGTACGACTCTGT TCTCAGATGACACAGATGACAAGTCTCGAAAGAGTACCAATCCAGAATTGGTCATGGCAT CTCATCAGGAGAATGAAGTGAGTACTGAAGTTTGGTAACCTGAAATATGCCAGATCAACA GTGAATTGCAAAATGATGAGCTTGTGCACCATGTGAACCTTGGCCCTTAAAACACGAGCG AAATTACAAAAATCATGATTGCAGTATCAATTCCATCTCTCTTAATGCATTTTCTATAGA AGTTAATTCCTTTAAATATTTGAAATATGACTTAGATATATGGTCTAAAAATTAATCATA GGATTGGATTGGGTATCAGTTGCAGGATGTGCCATAGTTTTGTAGGTGTGTAGTTAACTA CTGAAAAAGAAAGCTAGTTATATGTAGTCATGGCATATTAGAATGGATCTAGTTCTGATT CCACTGTAACTACTTAGATGAAACAAACATGTTATGCAGGATTGTTAACAGCTGCAGTCT AGCTCAGCTTTAGCTAATATTTAAATATCAGGAAAATATTAGTTGTTCTTGTTGTTTGAT TTTATGATGACTCTTTTGCTGTATTTTTTTAGTGCTTTTGTGTCGGTTACATACTCAAGT GGGCCTTTTAATAGTTAATTTGTACATCATTGTAGAACTTTATAGGATATTTATTGCATT CAATGAGTATACAGCCCCACCACAATATCTGAACCAATTTAATTATGCATGTTAGAATTT GGTTTCGCTTTTTAAATCTCATGAAGTTTTGCACTGTGATGTCACGTTTAATAGTTTCAG TGAAAATTCTAAAAACAGAATGTGAATCTCTTTTGTAAGTTTCCAAATTAAAATGATTTC CTTCTAATGTAAAGATCCCTCCTGCTATTTTATTTTTTATTTCTTTTCTCTTTTTGGTTG CTGAGGGATCCCTTGAATTATTGTTACTGTATTGAGGATGTAAATATATGCCTGTTACAT ATATTTAGAATTAGTAAATTGCTTCTGATGAACAGAACAATGTTATTACAGGCCAATTAG TAATCGATATGCCTGTACTAGGGTCTATATTATTGAACCTTGGGGCCAACTAAGATTTTA CTTCCAGCATTTGGAGTTTCCGTCTTTAGAACTTTGAAAATTTTAATTCATAAGCTGTCC TATTTCAGTCTGCAGTTGTTGCTGCTGTAGAGCCTCCTCAAATTCATTTCTCTGAATGTT GGCCTGATGTGCCGGGTGTAAGTGATCGCCGAACAGGTGAGCAACTCCCCTTTTGAACAG CTGCTTTACTAGTATTGTGCTTCAAAATCCCGTTGACTTGAAGTTATTCTACTGTGCTCT CTGTAGGATAGAACCAAACAAATTTGTATAGCATATACTTAACTAGTGACATTTTTACAG GTCAATTTTCATCTGGTCCAAAGAAGAGTGAATTAAAGATTGGTGGGTCATCCGCCTTCT TCACTTATGTCAAAGCAAGC >LITCHI023430.m2 - 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Up_Stream_Len 2000 TTTTAGAAACGAGATCGATATGTCAGCTCACCGAGCTCGTGCCAGGTAGTCTTCTAGAAG CTTACAGCAGACCAATTCAAGAAGGAGTCGAACTCCCTGATTTTATGCAGATCTTATCCC CAAAATCTCGGGATCAGTTTCAAAAATCTCTCCTGATTTAAAGGAGATAGTTATGGAGGA CAATTAATATGGAGATTTATTTTCTAATTTGTTTTGTATTCAAATTGTACAATCCTCTCA CTATAAATAGAGGTTGAAACTAATTGTAAAAGAGAGAGATAGAATTAATAATATACTGTG ACTCTGCCAAAGTCATCAGATAATACAGTCATGGACGTAGGCACCATTGTCGAACCATGT AAAAATCTCTTTGCACCAACTGTTCTTCCTCTTGCACTCCTCTTTGTTTTCTGTTTTGTT TCTCATTAATTACAGGTATTGGGCTTACAATCTCCGGTCGATCAAAAATTAACGTCGACA TAAGTAAGTTATACCAAACATATACTTACTTTGTTGAAGTTTATGGAATTCGTTATGTTG GAGCTTAACATTTAATTGCATTTTATTTTATTATTATTGTTAGAATTTAAAATTGACTTA AATTTTGGTTATTGAATTTTATTTTAGATATAATTTCATTATTAATTGTTCTTACAATTC TTACCATCCTGAGTTCAAGGATAGATGAGAATTTATGTGAAACCTAAGGCAGCAAAAGTT CATGCTATATCACAGGTTGACATAGGGGTGGAAAAAAAAAAGAATCAAATTAAATCGAAC TGGATCGAAAATATCGATTTTTAACTTATATTCAATTCGGTTTGATTTTTTATATCAAGA ACTAAATTTTGTCAGTTTTAGTTTGGGTGAGAAAAATCGATCCAACTCAAAAACCAATCT AAAATAAAAAAAAATTGGGATATAAAAGGCTCACAACATTTAAAAAAATCGACTCGACCC GAAAACTGAACCTATTTAAGTTCCAATTCAGTTTTCTATTTCGAAAATCGAGTTTTTTCA GGTTAGTTTAGTTTATATAAAACCGCGTCTAACTATGCCCATCCCAAGACTTATTACATG TCGAAAAATTTGGCCAATTGTGATATGGTTAGTCGAGGCGTAGAAAATATGGGAGCAGTC ATCAGTTGACAGCTCAAAAGCCCACGTGTCAAGTTGCATTAATTTATGTGCAATTCTAAA ATCGATATTTAAAGAAAGATCTTAGCGAATGACGTGGCAGGCTATCTATCTCTACGAAAC TATCCAGACACGACCTTCACCTTTTTTCCATTGCACTTTTTCCCCATCCATCCACGTCAC CCTCTTTCCACTAACATGCGCCGACGCAAACCTGCGCACCCAATGTCCACCATTCATTTT CAGAAAAGTGTCACCCACCTTCTCCAAATCCCAATCCTCGTAAATTTTTCATTTTTATTT TATAATTCAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAATTCAACTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCACTC AGAGTCCGGTTATCGGAATCGGACCGTTGATCGTTGAACAACAACTCTGGTCCCTTTGAT CACAGCGTTGGTCTTTTGCCGTTTATGGCAAGTGAGAGGACACCTGCTTTGTGAAATGTT AGAAACTGTTATCATCAAAATAGAAGAAGCTCTTGTTTTGTTTTGATTTTTTTTTTTTTT TAATTTTTTGTTTTGTTTTTTGAAAGCAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA GAGAGAGTAGATATTTTATTGATTTCATGGGGTCTGTGATCCAAACCCTAGCTCCTACAC TTTTGGAGAAGATTACAGAGATGGGTTTTTCTTTTGAGGTTTTTTTGTAGCGAATCTGAG CTGGGTTTTGTTTTTATTATCTGGGTAAGTTTTATTTTTGGTGTTGTATCTCAAAAACGG TTGCTTTTATTTATTTATTTATTTTTGGCTTTGATATGTTTGGATATTTATTGACTTTGT TATTGTGTGGTGTTGAAGAT
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>LITCHI023430.m3 GenomeSequence - CCAGACACGACCTTCACCTTTTTTCCATTGCACTTTTTCCCCATCCATCCACGTCACCCT CTTTCCACTAACATGCGCCGACGCAAACCTGCGCACCCAATGTCCACCATTCATTTTCAG AAAAGTGTCACCCACCTTCTCCAAATCCCAATCCTCGTAAATTTTTCATTTTTATTTTAT AATTCAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAATTCAACTCTCTCTCGCTCTCTCTCTCACTCAGA GTCCGGTTATCGGAATCGGACCGTTGATCGTTGAACAACAACTCTGGTCCCTTTGATCAC AGCGTTGGTCTTTTGCCGTTTATGGCAAGTGAGAGGACACCTGCTTTGTGAAATGTTAGA AACTGTTATCATCAAAATAGAAGAAGCTCTTGTTTTGTTTTGATTTTTTTTTTTTTTTAA TTTTTTGTTTTGTTTTTTGAAAGCAAAAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAG AGAGTAGATATTTTATTGATTTCATGGGGTCTGTGATCCAAACCCTAGCTCCTACACTTT TGGAGAAGATTACAGAGATGGGTTTTTCTTTTGAGGTTTTTTTGTAGCGAATCTGAGCTG GGTTTTGTTTTTATTATCTGGGTAAGTTTTATTTTTGGTGTTGTATCTCAAAAACGGTTG CTTTTATTTATTTATTTATTTTTGGCTTTGATATGTTTGGATATTTATTGACTTTGTTAT TGTGTGGTGTTGAAGATATGGAAATCAAGGAGCTGAATTTGACCAAAGAGTGTGGTGGTG GTGGTGGTAATGGGAAGAATGGTGGAGAGGGGTTTATTGATAGAAGCAAAGTGAGGATTT TGCTATGCGATAACGATACGAGTAGCTCGGCGGAAGTGTTTTCACTTCTTGTCAAGTGTT 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