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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000828 | Chr5 | 19147001 | 19149428 | + | Uncharacterized protein At5g08430 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000828.m1 | 16 | 89 | PF02201.21 | SWIB | Domain | 47.4 | 1.40E-12 |
LITCHI000828.m1 | 148 | 244 | PF03126.21 | Plus-3 | Domain | 52.6 | 6.00E-14 |
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>LITCHI000828.m1 ATGAAAAGAAGCACTAAGTCAAAAAAGGAATTCGTCGGATGGGGATCAAAACCTCTCTTG GAGTTCCTTGCCTCCATCGGCAAAGATACAAGTGGTGAAATGTCACAGTCTGCTATTACA GATATCATCTCAAATTACTGCAAGCAAAACAAGCTTTATGACCTAGAGAATAAGAAGAAA ATCAATTTTGATTCACAGCTTCAGGCTCTTTTAGGAAGGAAGTCGGTGAATAAAAACAGG TTGTACAAGCTTTTGACACCCCATCTTGTTGAGAATTTGATACTCTCAGAAGACGAATTG GAATTCAGATCATATAACACTCATGAAGATGACTTAGTGCCTCGAAAAAGGCAGCAACGA TTAAGCTCTAGTGAGAAGTCGAATACGAAGGCAGAAGTCATGAATGTTCAAAAGAGCTGT TTTGCCTCTATAGTCCCCAAAAATATCAAGCTTCTCTACTTGAGGAAGAGTTTGGTCGAG CAGATGGCAAAGCAAATTGAAACATTTGAGGCTAAAGTATTGGGAACTTTTGTGAGAGTA AGATCTGACCCAAATGACTACCTGCAGAAAAATTCTCATATGCTCGTACAAGTTACTGGC ATAAAGAAAACTTCTATCGCTAACTCAGAAACTATGCTTCAGGTTTCCAACATGGTAAAA GAGGTGCCAGTTTACAAGCTTTCCGATGATGGCTTCACTGAGGAAGAATGTGAGGATTTG GGTCAAAGAGTGAAAAATGGGCTGCTTAAAAAGCCAACTGTTATGGAGATTGAACAGAAG GCCAGGTGTCTTCATGAGGAGATAACAAAATATTGGATTTCAAGGGAGCTGGTTTTGTTA CAAAAACGCATTGATCGCGCAAATGAGAAGGGATGGAGAAAAGAATATCCTTTCTTAGAG CTGCTTCAAAAGCCTGAACAACAATTTAGGCTACTACATGATGTCCAGGAAGTAATTGCT GAAGAATTAAATCCTGAACCCTTTTACGATGAGGTTGCTACAACACAAGGTGAACAAGAA CAACATGATGGCTCATCTTAG
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>LITCHI000828.m1 ATGAAAAGAAGCACTAAGTCAAAAAAGGAATTCGTCGGATGGGGATCAAAACCTCTCTTG GAGTTCCTTGCCTCCATCGGCAAAGATACAAGTGGTGAAATGTCACAGTCTGCTATTACA GATATCATCTCAAATTACTGCAAGCAAAACAAGCTTTATGACCTAGAGAATAAGAAGAAA ATCAATTTTGATTCACAGCTTCAGGCTCTTTTAGGAAGGAAGTCGGTGAATAAAAACAGG TTGTACAAGCTTTTGACACCCCATCTTGTTGAGAATTTGATACTCTCAGAAGACGAATTG GAATTCAGATCATATAACACTCATGAAGATGACTTAGTGCCTCGAAAAAGGCAGCAACGA TTAAGCTCTAGTGAGAAGTCGAATACGAAGGCAGAAGTCATGAATGTTCAAAAGAGCTGT TTTGCCTCTATAGTCCCCAAAAATATCAAGCTTCTCTACTTGAGGAAGAGTTTGGTCGAG CAGATGGCAAAGCAAATTGAAACATTTGAGGCTAAAGTATTGGGAACTTTTGTGAGAGTA AGATCTGACCCAAATGACTACCTGCAGAAAAATTCTCATATGCTCGTACAAGTTACTGGC ATAAAGAAAACTTCTATCGCTAACTCAGAAACTATGCTTCAGGTTTCCAACATGGTAAAA GAGGTGCCAGTTTACAAGCTTTCCGATGATGGCTTCACTGAGGAAGAATGTGAGGATTTG GGTCAAAGAGTGAAAAATGGGCTGCTTAAAAAGCCAACTGTTATGGAGATTGAACAGAAG GCCAGGTGTCTTCATGAGGAGATAACAAAATATTGGATTTCAAGGGAGCTGGTTTTGTTA CAAAAACGCATTGATCGCGCAAATGAGAAGGGATGGAGAAAAGAATATCCTTTCTTAGAG CTGCTTCAAAAGCCTGAACAACAATTTAGGCTACTACATGATGTCCAGGAAGTAATTGCT GAAGAATTAAATCCTGAACCCTTTTACGATGAGGTTGCTACAACACAAGGTGAACAAGAA CAACATGATGGCTCATCTTAG
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>LITCHI000828.m1 + Up_Stream_Len 2000 ACTTATAAGGTTGAAGAAGTGTATTTGTATTAGTTTATAAAGTTTTGATAAACCTTCACT CATAAGCTAGTTTTTATAGTGGAGTTAGGTCCAAGACCCCTTTTTTGACATAGTATCAGA CCTAGACGGACTCTAGCTAAGTTGGATAGGTACAAGTGTTGTCGAGTAGGCATGTTGTGA GTAAGGAAAAGTGTTGGATCATCCCACATTGATTGAAAAAGTAAGTTTGTATTGGTTTAT AAGGTAAGGGTAAACCTCCACTCCTGAGCTAGCTTTTATGGTAGAGTTAGACCCAAGACC ATTTTCTGACAATTCAACCTTTTGAAAAATCTCACATGTAACAATGCACATGAAAAGTAT TTCAAGACTAAAAAAAGGGGGTTAAAAATTATTACAACTTACATTTTGAACAAAAAACAA ATACCTTTTTTATGGCATAAAATGGATTTTCACTTGTTTCAAGACATTTCCCCTAGTTTT ATATCATTTTATTTTAGAGATTGTGGATAACATAAGAACCCATTTAAACTATTTAGTTTA CAGCATACTTATTTTCACAATGCAATCTTCCATAAATTGTAATTGTTCGGTGGGAGTCTT TCCCATAAACAATATAGTGAAAAAAGATTGGAGGATGGCGTATCATTTTCTTTACAAAAT CATGAAAATGAAAGAGAACTCTTAAGTATTAATATTTCACATGTGGAATTAACTGCTTTT TTCGATTTTACACCAAGCATGTCTATGATTTCATATTCGTAAAACCATAGTTCTATCTTT GCAGCCAGAATAGCATCTATAGCCTGGTACATTGTCCTTTTAAGAAATACTTTTTAGTGT CCTCGTTTCTCAAGAGTCTAATGTCCTTAAAGGACTAAACAGACTCTGGTTTAAAGCTCT CCCTCCATTTAGTCCATCATCATTTTCAATGTGTTGCTGTATGCTTTGATACTTGTTTAT GGAAAATATGTAAATAAAATAATATGTCATTTCACTGCATGTTGTAATAGTTGTCAACAA CATCATGACCTATCCGTTAGAAGTGGCAGTTGTAATACAAAATCTTAACCAGAATGTTAT GTTGCTTGGCAAGTGGAGTTTGAAAATGAGGCCAAAAATCTGCAGGAGGAGATAACAAAT ATGTATGCATTTCTGATCTATATATTTGTGATATTTCTAAGTAATTTTTTATATTTTACA TTTTTAAATCAATTTAGGAAATCATTCATCATATGTCATGAAACTTTGCAAATGCAAGCT GCTTTATTTTATTGTCCTTATTTTGATGGTGTGTGTTAAAGAATCTTTATGTTATCAAGC ATATGTTATTATTTTTATAATATTATGTTTGATTTATTGTTGTTTAAAATAATCTTATCT TAGGATGCCACATTTATGTATTACCTATAAATAGGCTCTTTTTGTATCTTTTAATAAGTA ACTAAATAGAATAAAATCATTCTCTTTACTGTCATTTGAAAACTGTCATAATTGTATTAG AAATATTATTTACTTTTGTTTCACTCTTACATGATGTCTTTATTTTCCAATAAGGAAGTT GTGTCAGGTGCTATCCTTGGTTTACCTATAAATGTAAGAAAACGGTTCTTTTTCTATTAT TTGACAACTATCATAAATGAATTAAAAGTAACGTCCAGTTTTTCATTCTTATATAACGCC TCGACTTTCTAGTAGGGGAGTAGTGTCAGCCTGTCAGTGCTCTCCTTGGTTCAGTCATCT GAAATTGTAAGTATCGGTGCTCTCCTTGGTTCGGTCGTCTGAAATTGTAAGAATTCTTAA TCTTTATTTTCTGAGTAGTTTTTACTAATATAATTTATTTTTTTAATTTTGTAGAGCAAA TTAAACTTCCATGATCGATACAAATTAAGTTCCTATTTTACGAGTATCTAGAGATCATAA AGGAAAAAAAAGGTTTAATTTCTGATCAAGTCATTCCAGGGGTAACCAATTGAAAAAGGG TTGAAAGATCTGCCTTGACG
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>LITCHI000828.m1 GenomeSequence + ATGAAAAGAAGCACTAAGTCAAAAAAGGAATTCGTCGGATGGGGATCAAAACCTCTCTTG GAGTTCCTTGCCTCCATCGGCAAAGATACAAGTGGTGAAATGTCACAGTCTGCTATTACA GATATCATCTCAAATTACTGCAAGCAAAACAAGCTTTATGACCTAGAGAATAAGAAGAAA ATCAATTTTGATTCACAGCTTCAGGCTCTTTTAGGAAGGAAGTCGGTGAATAAAAACAGG TTGTACAAGCTTTTGACACCCCATCTTGTTGAGAATTTGATACTCTCAGAAGACGAATTG GAATTCAGATCATATAACACTCATGAAGATGACTTAGTGCCTCGAAAAAGGCAGCAACGA TTAAGCTCTAGTGAGAAGTCGAATACGAAGGCAGAAGTCATGAATGTTCAAAAGAGCTGT TTTGCCTCTATAGTCCCCAAAAATATCAAGCTTCTCTACTTGAGGAAGAGTTTGGTCGAG CAGATGGCAAAGCAAATTGAAACATTTGAGGCTAAAGTATTGGGAACTTTTGTGAGAGTA AGATCTGACCCAAATGACTACCTGCAGAAAAATTCTCATATGCTCGTACAAGTTACTGGT AATCGTCTTATCAAACACTACCGTAGTTTAATTAATGCATCATTCTATTGGCTCCACAAG TTATATGTTTCTTAATTTTATCAGCTATAATATTGTTTTATGTGAACTGCATGATCATGA ATGCAATTGTAACATGCTTGATTGGATGCAACAGTAACATGCTTGATATTTTGTTTCACC GTCCTTATCTGTCATTGCAGGCATAAAGAAAACTTCTATCGCTAACTCAGAAACTATGCT TCAGGTTTCCAACATGGTAAAAGAGGTGCCAGTTTACAAGCTTTCCGATGATGGCTTCAC TGAGGTAAAACATGTTAACAACATATTAAAAATATTAATTTTGTGTGTACCAATTGCTAT TGGTTTAAGTTTTGATAATGATCGAAATTTAGACAATAAAATCAGGTTTCTGATAGAATT TTCTTGGGCTATATTTGAATTAATCCTCTCCAATGTGGGTTTTATTGACAAGGCAAAAAA AAAAAAAACTCTCCTTAGCTTTACTTGTCCTCCCTTTTTCACTTTTGTCTTGACATGTAG TTTTGTTTGTGCTGAAAAAAAAAAAGTGTTGAAAATATTTATTTTCTACTTCTTTCATGA TAGAATGTGAAAGCATCCCCCAATTACTATCTTTTTTGATTGACTGTTTTGTTAATAATC GAAAGCTGTGAATTAAGAAAGACAGCTTCTTAAGAATTTTATGAAGCTATTGCCTGCTAT GATAGTTTTATATATTTTCTATCTTTTGCATACAAATACTTAAATGCTGTTTTTCTTTTC TTCTTCACCTTTTTTGTTTTTTTTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCAGGAAGAA TGTGAGGATTTGGGTCAAAGAGTGAAAAATGGGCTGCTTAAAAAGCCAACTGTTGTAAGT TTATTCATAATTGGATCACTTTTTCATAGATTGTGGACAACTTGAGAACTCATTTGTATT GTGTTCTGTATAGTATATTTTTTCCCAATACAATCTTTCATATGTTTTTCACTGTATTCT ATAATAGTTGTAAACTTTGCTAGCTTTCCGTTACAAGTGGCGTTTCTGATATGAAGTCTT GATCATAATGTTGCGTTGATTGACAGATGGAGATTGAACAGAAGGCCAGGTGTCTTCATG AGGAGATAACAAAATATGTATGCATTTCCGATTTTCATTTTTGTGGTACTTCTAAATAAT GCTTTATACTTTCTGTTTCTATAATTGATGTGACTATCCTTTAACACTCTCTTCTTTGGA TTTTCATGAGATAACAATAGTGGATTTCAAGGGAGCTGGTTTTGTTACAAAAACGCATTG ATCGCGCAAATGAGAAGGGATGGAGAAAAGAATATCCTTTGTTAACATGATTTGTCATGC AAATTATTCTTTGATTTTTAGTACAACCTAAGATCTACTCCAATGAATTTATTTATGATC AACACCGAGTGACAAAGGAAACTGATTTTCGAACTTCAAAAAGGAAGAAAACAACATATA GTTCCAACTATCTAATGTAATGAATGACTTTTTATCTTTTCATTAGTTTGATAGTTTGAT TTGTAAGGTAGCATAATTTTGTTATTTGTCCAAAGACACAATCACTTCAAAAGACTGTTG TAGATTAATAATTGATTCTTAACCTATCTTTTCATATACGCTCTCTGAATATCTGGATAG CTTAGAGCTGCTTCAAAAGCCTGAACAACAATTTAGGCTACTACATGATGTCCAGGAAGT AATTGCTGAAGAATTAAATCCTGAACCCTTTTACGATGAGGTTGCTACAACACAAGGTGA ACAAGAACAACATGATGGCTCATCTTAG