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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000636 | Chr5 | 16120632 | 16130899 | + | Shaggy-related protein kinase kappa |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000636.m1 | 86 | 368 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 218 | 1.50E-64 |
LITCHI000636.m1 | 88 | 288 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 88 | 6.70E-25 |
LITCHI000636.m2 | 86 | 308 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 200 | 5.00E-59 |
LITCHI000636.m2 | 88 | 287 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 88.3 | 5.40E-25 |
LITCHI000636.m3 | 86 | 302 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 197.3 | 3.20E-58 |
LITCHI000636.m3 | 88 | 284 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 87.9 | 6.80E-25 |
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>LITCHI000636.m1 ATGGCATCTGCCAGTCTAGGAAATGGGGGAGTGGGTAGTTCCAGGTCTGTTAATGGCTTC AAGAGTTCATCAAGTTCAGTTGACTGGCTGGGGCGAGAAATGCTAGAAATGAGATTACGG GATAAGGCGGACCATGATGAGGACAGAGATAGTGAACCAGATATAATTGATGGTGTTGGT GCTGAAGCAGGACATGTGATTAGAACTACTGTTGGCGGTCGAAATGGCCAAAGTAAGCAG TCAGTCAGTTATATAGCTGAGCATGTGGTTGGAACCGGATCTTTTGGTGTTGTCTTTCAA GCGAAATGTAGAGAAACTGGAGAGATTGTGGCTATCAAGAAGGTTCTCCAAGACAAGCGC TATAAGAATAGGGAATTACAGATTATGCAAATGTTGGACCATCCTAATATTGTTGCCCTT AAGCATTGTTTCTTTTCAACAACAGACAAGGAAGAGCTTTACCTGAATCTTGTACTTGAA TATGTTCCTGAAACTGTTAATCGTATTGCAAGAAACTATAGCAGGATCGGCCAGCGAATG CCCTTAATATATGTCAAACTCTATACCTACCAGATATGCAGGGCACTCGCCTACATACAT AATTGCATTGGAATTTGTCACCGTGACATCAAGCCTCAGAATCTACTAGTGAATCCACAC ACACATCAGCTCAAACTTTGTGATTTTGGGAGTGCAAAAGTCTTGGTGAAAGGAGAGCCC AATGTTTCTTACATTTGCTCAAGATATTATCGTGCACCGGAACTCATATTTGGTGCCACT GAGTATACAACGGCCATAGATATATGGTCTACCGGCTGTGTGATGGCTGAGTTGCTTCTT GGGCAGCCTCTATTTCCCGGCGAAAGTGGAGTTGACCAACTAGTTGAGATTATTAAGGTT TTGGGAACACCGACCAGGGAGGAGATAAAGTGCATGAACCCCAACTATACTGAATTTAAA TTTCCACAGATAAAGCCTCATCCATGGCACAAGGTCTTCCAAAAACGTTTGCCCCCTGAG GCAGTAGATCTTGTCTGTCGGTTTTTCCAGTACTCTCCCAATTTGCGATGTACCGCTCTG GAAGCTTGCATTCACCCGTTCTTCGATGAATTGAGGGAACCGACCACTCGCCTTCCTAAT GGCCGTCCTCTGCCACCACTATTTAATTTTAAACCTCAAGAGCTCTCGGGCATACCCCCA GACATCATCAACCGACTTATTCCTGAGCATGCTCGTAAGCAGAACTTATTCATGGCCTTG CACTCTTAG >LITCHI000636.m2 ATGGCATCTGCCAGTCTAGGAAATGGGGGAGTGGGTAGTTCCAGGTCTGTTAATGGCTTC AAGAGTTCATCAAGTTCAGTTGACTGGCTGGGGCGAGAAATGCTAGAAATGAGATTACGG GATAAGGCGGACCATGATGAGGACAGAGATAGTGAACCAGATATAATTGATGGTGTTGGT GCTGAAGCAGGACATGTGATTAGAACTACTGTTGGCGGTCGAAATGGCCAAAGTAAGCAG TCAGTCAGTTATATAGCTGAGCATGTGGTTGGAACCGGATCTTTTGGTGTTGTCTTTCAA GCGAAATGTAGAGAAACTGGAGAGATTGTGGCTATCAAGAAGGTTCTCCAAGACAAGCGC TATAAGAATAGGGAATTACAGATTATGCAAATGTTGGACCATCCTAATATTGTTGCCCTT AAGCATTGTTTCTTTTCAACAACAGACAAGGAAGAGCTTTACCTGAATCTTGTACTTGAA TATGTTCCTGAAACTGTTAATCGTATTGCAAGAAACTATAGCAGGATCGGCCAGCGAATG CCCTTAATATATGTCAAACTCTATACCTACCAGATATGCAGGGCACTCGCCTACATACAT AATTGCATTGGAATTTGTCACCGTGACATCAAGCCTCAGAATCTACTAGTGAATCCACAC ACACATCAGCTCAAACTTTGTGATTTTGGGAGTGCAAAAGTCTTGGTGAAAGGAGAGCCC AATGTTTCTTACATTTGCTCAAGATATTATCGTGCACCGGAACTCATATTTGGTGCCACT GAGTATACAACGGCCATAGATATATGGTCTACCGGCTGTGTGATGGCTGAGTTGCTTCTT GGGCAGCCTCTATTTCCCGGCGAAAGTGGAGTTGACCAACTAGTTGAGATTATTAAGGTT TTGGGAACACCGACCAGGGAGGAGATAAAGTGCATGAACCCCAACTATACTGAATTTAAA TTTCCACAGATAAAGCCTCATCCATGGCACAAGGAGGAAGGCTCAGAGAATGAGGGTTGA >LITCHI000636.m3 ATGGCATCTGCCAGTCTAGGAAATGGGGGAGTGGGTAGTTCCAGGTCTGTTAATGGCTTC AAGAGTTCATCAAGTTCAGTTGACTGGCTGGGGCGAGAAATGCTAGAAATGAGATTACGG GATAAGGCGGACCATGATGAGGACAGAGATAGTGAACCAGATATAATTGATGGTGTTGGT GCTGAAGCAGGACATGTGATTAGAACTACTGTTGGCGGTCGAAATGGCCAAAGTAAGCAG TCAGTCAGTTATATAGCTGAGCATGTGGTTGGAACCGGATCTTTTGGTGTTGTCTTTCAA GCGAAATGTAGAGAAACTGGAGAGATTGTGGCTATCAAGAAGGTTCTCCAAGACAAGCGC TATAAGAATAGGGAATTACAGATTATGCAAATGTTGGACCATCCTAATATTGTTGCCCTT AAGCATTGTTTCTTTTCAACAACAGACAAGGAAGAGCTTTACCTGAATCTTGTACTTGAA TATGTTCCTGAAACTGTTAATCGTATTGCAAGAAACTATAGCAGGATCGGCCAGCGAATG CCCTTAATATATGTCAAACTCTATACCTACCAGATATGCAGGGCACTCGCCTACATACAT AATTGCATTGGAATTTGTCACCGTGACATCAAGCCTCAGAATCTACTAGTGAATCCACAC ACACATCAGCTCAAACTTTGTGATTTTGGGAGTGCAAAAGTCTTGGTGAAAGGAGAGCCC AATGTTTCTTACATTTGCTCAAGATATTATCGTGCACCGGAACTCATATTTGGTGCCACT GAGTATACAACGGCCATAGATATATGGTCTACCGGCTGTGTGATGGCTGAGTTGCTTCTT GGGCAGCCTCTATTTCCCGGCGAAAGTGGAGTTGACCAACTAGTTGAGATTATTAAGGTG ATATCATCTTTTGACTTGCTCAACGATTATGATAATTTTTTTTTGTTTTTAAACAACTTA GTTTCAATCGCTATCGGAAGTGGAAATGTTCTGGTTTATGAAAGCTTATAG
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