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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.

GeneID Chromosome Start End strand Descript
LITCHI000636Chr51612063216130899+Shaggy-related protein kinase kappa

Gene ID Start End Accession Domain Type Bit Score E-value
LITCHI000636.m186368PF00069.28PkinaseDomain2181.50E-64
LITCHI000636.m188288PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain886.70E-25
LITCHI000636.m286308PF00069.28PkinaseDomain2005.00E-59
LITCHI000636.m288287PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain88.35.40E-25
LITCHI000636.m386302PF00069.28PkinaseDomain197.33.20E-58
LITCHI000636.m388284PF07714.20PK_Tyr_Ser-ThrDomain87.96.80E-25
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>LITCHI002253.m1
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GAAGATGAGAAACTTCTCAATTATATCACCAAGCATGGACATGGCTGCTGGAGCTCTGTC
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>LITCHI024388.m1
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>LITCHI024388.m1
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GTCAGACACGAGTTTGACTTAAGAAAAAACAAGCATCATCGTCATCATCATCGTCGTCGT
CGGCTTATCCTGCGCACACC
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GAAAATACTTTTTCAATATATTCTGGGATGGTTCAAAATAAAGAGAAATGGTCAACTTTA
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CAGTGTACCGTATTCCAATATATAAACATAGTATGTTAAGATGAAGAGATATACAACCAA
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GTCAGACACGAGTTTGACTTAAGAAAAAACAAGCATCATCGTCATCATCATCGTCGTCGT
CGGCTTATCCTGCGCACACC
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GAAAATACTTTTTCAATATATTCTGGGATGGTTCAAAATAAAGAGAAATGGTCAACTTTA
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ATAAATCTGACATATTACACCTTGGACACAACAAATTTTTTTTTGACGCTAAGATGTTTA
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CAGTGTACCGTATTCCAATATATAAACATAGTATGTTAAGATGAAGAGATATACAACCAA
CTCAATTAAAAGTTATTCGTGTCACATAACTAGTTTAATGATAGAGGACATTTATTTTAT
ATGAAAATGTTTTAAGTTTGAATTGTTGCTTAATAGGTTTCATTAAAAGTAAAAATAATT
GAATGTTAGTTACAATATCCCAACTTTTGAATCATAAGCATGGATAACTTTATACCTACC
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TTAAGAGTTGAAATATGACGTTAGATACCTAACGTTAAGGGTGAAATCATAAAATAATCT
TTCATAACTTAGAGAACATATATTAAACAATTATAATTTTATATATGAGGGAAGAGGACA
AGTGACTTTCATTTATAATATCATTGATGTGAGTGTAAAAGATGCTATTAAAAATATTAA
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GTCAGACACGAGTTTGACTTAAGAAAAAACAAGCATCATCGTCATCATCATCGTCGTCGT
CGGCTTATCCTGCGCACACC
>LITCHI021725.m5 +  Up_Stream_Len 2000
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GAGATATACAACCAACTCAATTAAAAGTTATTCGTGTCACATAACTAGTTTAATGATAGA
GGACATTTATTTTATATGAAAATGTTTTAAGTTTGAATTGTTGCTTAATAGGTTTCATTA
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ATAATTCTTTGGAATTTAAGAGTTGAAATATGACGTTAGATACCTAACGTTAAGGGTGAA
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TGAGGGAAGAGGACAAGTGACTTTCATTTATAATATCATTGATGTGAGTGTAAAAGATGC
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GTTCGAAATTCATGGAATGGGTCCCATTAAATCAAATTAAGTCTTGCACAATCGAATATA
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TCCACAGAAAATATAAGGTTGTTTTGTAATTTCTCCGTCCAATAGTAATCACAATCATAT
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CCCTCCAAAATTTTCCATTTCTTAGAGCCCGTGTTTTTAAATCTGCAACATCAACAACTT
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CATCATCGTCGTCGTCGGCTTATCCTGCGCACACCATGGCGCACGTTAACGACCTTCCCT
GCGACGGCGACGGCATTTGCATGAGCTGCAAGAGGAAGCCATCGGCCGAAGAAGGAGAGA
CAGTCACGTGCAGGACGTGCGCCACTCCTTGGCACGTGACCTGCCTTTCCGTCAGTCGTC
TCGAGACGCTAGCTGCTGAGAGCGAGTGGGACTGCCCCGACTGCTCGGCGACGGAGGTCT
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AGTCGGACGAGTCACTCACCGAGCTGGAGAAGGCCAAGAGGAGGCAGGAGCTCGTCAGCG
GCGGCCGAGCGAGATCGGAGGCGGATCCAGAGAAGAAGATAATGGAAGGCGATGACGATG
TGATTGGTATTTTCGACGGCGCATTGAGCTGTTCGTTTTGCATGCAGCTACCGGAGAGAC
CTGTCACGGTATCCTATTACATTGTCATTGTCTTTATTATCGTATCGCATTCAATTTCTA
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TAGTATGTGTATGTTTATGGCCTCCTTTGTTTTTGTTTCAGACACCGTGTGGTCATAATT
TTTGCTTGAAGTGCTTTGAGAAATGGATTGGACAGGGAAAGCACACATGTGCAAATTGTC
GCAATATAATCCCATCGAAG
>LITCHI021725.m4 +  Up_Stream_Len 2000
GTTGCATTAAGAGTTCAGTGTACCGTATTCCAATATATAAACATAGTATGTTAAGATGAA
GAGATATACAACCAACTCAATTAAAAGTTATTCGTGTCACATAACTAGTTTAATGATAGA
GGACATTTATTTTATATGAAAATGTTTTAAGTTTGAATTGTTGCTTAATAGGTTTCATTA
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AACTTTATACCTACCACTAATTACAAGCTTATATTGCTTACCGTATATTAGATTAAATTG
ATAATTCTTTGGAATTTAAGAGTTGAAATATGACGTTAGATACCTAACGTTAAGGGTGAA
ATCATAAAATAATCTTTCATAACTTAGAGAACATATATTAAACAATTATAATTTTATATA
TGAGGGAAGAGGACAAGTGACTTTCATTTATAATATCATTGATGTGAGTGTAAAAGATGC
TATTAAAAATATTAAGTGGATAATATCTATTGATCTAATCTCATCAAAATGCTTTTTAAA
GTTCGAAATTCATGGAATGGGTCCCATTAAATCAAATTAAGTCTTGCACAATCGAATATA
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TCAAAAAGATAAGATAGTATCTTTTTGAAAAATAAAACGAAAGAGTAGTAAAAATATGAT
TCCACAGAAAATATAAGGTTGTTTTGTAATTTCTCCGTCCAATAGTAATCACAATCATAT
TTCGTATCATTTCACAAAACTAGAAATAGAAAAAGAGGGAAACTGAAAATTTTGAAAACA
CCCTCCAAAATTTTCCATTTCTTAGAGCCCGTGTTTTTAAATCTGCAACATCAACAACTT
TGAATTCTCACGAAAGTCAGACACGAGTTTGACTTAAGAAAAAACAAGCATCATCGTCAT
CATCATCGTCGTCGTCGGCTTATCCTGCGCACACCATGGCGCACGTTAACGACCTTCCCT
GCGACGGCGACGGCATTTGCATGAGCTGCAAGAGGAAGCCATCGGCCGAAGAAGGAGAGA
CAGTCACGTGCAGGACGTGCGCCACTCCTTGGCACGTGACCTGCCTTTCCGTCAGTCGTC
TCGAGACGCTAGCTGCTGAGAGCGAGTGGGACTGCCCCGACTGCTCGGCGACGGAGGTCT
CCAAACACTCGGAGAGAGCGAATCCAGGCGGCGACCTGGTGGCGGCGGTTCGAGCGATCG
AGTCGGACGAGTCACTCACCGAGCTGGAGAAGGCCAAGAGGAGGCAGGAGCTCGTCAGCG
GCGGCCGAGCGAGATCGGAGGCGGATCCAGAGAAGAAGATAATGGAAGGCGATGACGATG
TGATTGGTATTTTCGACGGCGCATTGAGCTGTTCGTTTTGCATGCAGCTACCGGAGAGAC
CTGTCACGGTATCCTATTACATTGTCATTGTCTTTATTATCGTATCGCATTCAATTTCTA
TATTTTCAATATCTATCGAATTCGCTGTCACAAATGCTACTAGACTTTCAATTTTGATGA
ATATATACTCTTTTATAGTTGTAAGTATCAGTATTTGATTCAAATGTGCTTGCTTTCGGC
TTTTTATGAGTCTTGAAGGTGATTAATTGACAAGTTTTTTGGACAATGAATGCTTTAGTG
ACTTTCAACCATTGTCTGTGGAAGTTGTTATGATAGTTTTCGCGTCTTCTTCACATGGTG
CGTTAACTTTGTGGTGTTTGTTGTTAGAAAGTGAATTACTTGTGGAAATGTAGAAGGGTA
ATGCATCAATGACTTAAAATTAAACAAAAATGCATAAGTGACCCCTTTCTTTATTTCTGA
TAGTATGTGTATGTTTATGGCCTCCTTTGTTTTTGTTTCAGACACCGTGTGGTCATAATT
TTTGCTTGAAGTGCTTTGAGAAATGGATTGGACAGGGAAAGCACACATGTGCAAATTGTC
GCAATATAATCCCATCGAAG
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>LITCHI014137.m4 GenomeSequence - 
TGCATGAGCAGCCCCATTTGCTTCCTGCTGTCTCTTACCTTACAGAAGATTCTGTCCACT
CTCTCTCTAAGATTTTCAACATGATGCTACAGTTGACCAAATTGTCTTCTCCTTGTGTTC
TTATATTAATCATTTTTCCAAGAAACTTCACTCTCTCTCTCTCTAAAGCCTCCCCATAAA
ATCCTCAACAAACTTTTCTTCTATACCAAGTTTGCATCTTTATCTTCTCAACCTCTTCAA
ATTCTTTCAATTTCCTTATCTGGAGTGTCTTTTATTTTATTTATTTTTTTGTTTTTGTAA
ATTTTTATAAATTCAATATTTTTCATCAAAAAGTGTCACAACCCCACTTTATTTGATCAG
TCTTCTATTGAATCCCATCTGGGGTTTTGGTTTTTCACTCAAAGTTTCAATCTTTATAGT
CAAAATCACTGCTTTGTTCATATGGGGTGTTGTTTAACCAAAACTAGTGATTCCAAGCCA
AACCAGAATGGTCTTGGCTATAGATCAGATCCCAACACGAGTGTCAATCACTACCAGAAC
CGCCAAATTAAGACCCCAGTAGTCCAACCGCCACCACCAGCAGCACCTGGTGCTGGTCAT
GTTCCAAGTCCAAAACCAGTGTACAAACCAGATACAATTCTGGGGAAGCCATTTGAGGAT
GTGAGGTCACATTACACAATAGGCAAAGAGCTTGGGAGGGGTCAGTTTGGTGTGACATAT
CTTTGTACAGAGAATTCAACAGGGAGGAAGTTTGCCTGCAAGTCAATCTCAAAGAGGAAG
CTTGTGACCAAGAATGACAAGGATGACATCAAGAGGGAGATACAGATAATGCAGCACTTG
AGTGGCCAACCAAACATTGTTGAGTTCAAGGGTGCTTATGAGGACAGGCAATCTGTGCAT
GTTGTGATGGAGTTGTGTGCTGGTGGGGAGCTTTTTGACAGGATCATTGCTAAGGGGCAT
TATAGCGAGCGAGCTGCTGCTTCTATATGCAGGGCTATTGTCAATGTTGTGCATATTTGT
CATTTTATGGGGGTGATGCATAGGGACCTCAAGCCTGAGAATTTCTTGCTGTCTAGCAAG
GATGAGAATGCCCTTTTGAAGGCAACCGATTTCGGGTTGTCAGTCTTCATTGATGGAGGT
AAAAGATTTTTACTTTTTCTCTTGATGTATTATGTTGTTTGATCATATGAAATTGATGAT
TTGATAGAGTGAGAAAAGTTGTTAGTAGAAGAGACAGTTCAGAGAATTTATTGTTGTAGG
AGTTTTAATGTGTAGAGATTGTTTGATATTTTTGGTTAGGAAGTACCATAGATTGAGCAA
AGTTATAAGTATTGAAAGTTTGTGGATTCATTGGTTGCTGAGTCACTTGTCAAAAGGTGG
TTGGATGTATCTTCACTGGTGAATTTTGTATTGGACAGGAATGAAGAATTGAGATTGACG
GCATACGTTGTGATATTAGATTAAGGGTGATAGACTGATAGGGGCCTTTTAGATGATGGG
ATTGCGATAATTGGTTAACTTTTATGTACAACTTGAACATCTGGGATGTTCTATAGTAAC
GTAAACAACATCCTTAGACGAAGACCGTAAAACTAGGTGAAATGAATGAAAAAAAAAAAA
AAATGTGTTGTTTAGCTCTAACGACGACCATAGAAAGTAAACATACCTTAATAGGGATAT
GACTTATCAATCATTATGATATTTCAAACTTGTTCAGGTCTTAATTGTAGAAAGAGTGAG
TGTTTATTAATGTAACTTTGTGTGTAAACCATGACTGTTTGTTCGTAATATAGGTATGAA
TATCTTTATCTGACTTTTCCATGGTACTGTTTATAGGGAAGGAGTATCGGGATATAGTTG
GGAGTGCATATTATGTTGCTCCTGAAGTGTTGAAGCGCAGATATGGTAAAGAAATAGACA
TTTGGAGTGCTGGAGTTATATTGTACATTTTACTCAGTGGAGTACCACCGTTTTGGGCAG
GTGAATTTTTTTATTTTGCAACTATATTTTTTGGCAACCTATGGTTCACCTTGGTCGTGC
CTCCCTCTTTATTTTACTATTAAAAGTATGTTAAATAGTCACTCAACTATGATGATGTGC
TCTACAGAAACGGAGAAGGGGATATTTGATGCTATATTGCAAGGAGATATTGATTTTGAT
AGTCAACCATGGCCAACTATATCAAGCAGTGCCAAGGACTTGGTCCGCAGGATGCTGACT
CAGGACCCCAAAAAGAGAATTACTTCTGCTCAAGTTTTAGGTATCTATTAACTGACATAA
TTAATCATTGTATTATATTTGTGATAAACTTCATAAAAATTTTAGAGACTGCTTTATTAT
CTTCCTTAATTCATAATGAGACCTTCAAGATTCATTTTTTTCTGTATTCATTATCGGTAC
TAAGTGAAATTCATTTGGTCTTTTACTAGTACAAAACCTGGAATTTATCAAGCCGCAATA
TACAAAATGATTCCATGACAATTTATGTTGTCTAACAAATTGGTTGTGGACCAAAATTAA
CAACATTGGTGATATTGTGCTTGTATTTTTGCTAAGTAAATTGTATGTTGTATGCAGAGC
ACCCATGGATTAGAGAAGGTGGAGAAGCATCAGACAAGCCAATAGACAGTGCAGTACTTT
CTAGGATGAAGCAATTCAGGGCAATGAACAAACTAAAGAAACTTGCACTAAAGGTGAATC
CTAAGACTCTAATGTACCTGATGTCACTGCAGTTTGAACTTTTTACCAGTAAAACAAGAT
TCTTGAGAATCGCATGATATGTTTTTCAATTGAACTTTTTCATCTACATATCTCATCACT
GTTGTATTTTCAAATGTTTGTTATGTTTCACTTGATATGTGTAAGTCCAACGCATTACGA
ATCTTATAATGCCTCATGTTCTGATAAAAATGGGTTGACTCTGAAATATATCTCAGGTTA
TTGCCGAGAACCTCTCAACTGATGAGATCCAAGGGCTCAAGCAGATGTTTACCAACATAG
ATACTGACAACAGTGGGACAATCACCTATGATGAACTGAAGACAGGATTAGCTCGGCTTG
GATCAAAGCTTACCGAAGCTGAAGTCCAGCAGCTCATGGAAGCTGTAAGTACTTGTCGCA
CATTCTGACTAATTTTGAGTTGTTGATCACTTGCGTTAGACTCAAAATGATACAATGTTC
GTCTAAATTTCAGGCCGATGTGGATGGAAATGGTACAATCGACTACATTGAATTTATCAC
AGCTACGATGCACAGACACAAGCTAGAAAGAGATGAACATCTTTGTAAAGCCTTCCAACA
TTTCGATAAGGATAGTAGCGGGTAAGTTGTTTTTCTTCTAAACTATGAGAATTGTAAACC
CTTTTGTGGACTTGTAGTTTCATTAGAACTTGTCTTCATTGTCCTTTTGCTCTTGAATTC
TCTAAATCTGTGAACGAAAGAGTCCATACACAACCTTTCTGTCAAGTAATATCTGTATCC
GAAAGTGAATCACTTAAATTACTGAGTTTTCTTTGCCTGTACAGATTTATCACGGTTGAT
GAACTAGAAACAGCAATGAAAGAATATGGGATGGGTGATGATGCCACAATCAAAGAAATA
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>LITCHI014137.m3 GenomeSequence - 
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CTAGGATGAAGCAATTCAGGGCAATGAACAAACTAAAGAAACTTGCACTAAAGGTGAATC
CTAAGACTCTAATGTACCTGATGTCACTGCAGTTTGAACTTTTTACCAGTAAAACAAGAT
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GATCAAAGCTTACCGAAGCTGAAGTCCAGCAGCTCATGGAAGCTGTAAGTACTTGTCGCA
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