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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000534 | Chr5 | 13844214 | 13847080 | - | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000534.m1 | 139 | 228 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 68 | 1.00E-18 |
LITCHI000534.m1 | 350 | 444 | PF10551.12 | MULE | Domain | 89.6 | 1.50E-25 |
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>LITCHI000534.m1 ATGAAATTGGAACGTTGTGGAGTTAGACTAGTTATGGTTTACTGTGCTATGTTTGGAATA TCTGATGCAGTTGGTTCTCCTTTTGGATATGGTCCTAAACCACAATGGCTGCAGTTGCTC CATGCACTCTTAGGAGCTGCTGATCAGTTCACCCACCACCGTGCAGGAATGGAAGATCAA CAGAACGTTTATTTTACTCACCAATGGTTTCCGGATGTCAACAACAATGCCTTCCAAGCT TCGCCCTCATTAGTCGAATGTACAGCCAGCCCGTCACATTCCGACACAAGTGGTAATGTT GCGGCTCCAGTTGGAGGTTGCAAATGTCCTTCAGAGGATCATAATCAAATGTCGCGTTTA ACAACAACCGATGTGTTGGGTAAAGAATTCGTTTCTGTTGATGATGCCGAAGCATTTTAC CAGAAATATTCTTTTTTTGTTGGATTTAGTGTGCGTAAGGACATGCTACGAAAGGATGCA ACTGGCTTAATAACATGTCGACGGTGGGTTTGCTCGAAGCAGGGGTTTACACAGAAAAAA TACTTGGATCGACGAGATAGGCAGCGCGAGTCAAAAGGCATAACTCGGGAAGGTTGTCGA GCTGCTCTCCGAATAAAATTCAATCATGACACAAGTATGTGGGTTGTGAATGAGTTCGTC GCTGAACATTGTCATGCCTTAGCAACCCGCAATCACGTGCAGTTCCTCCGTTCCCATCGT CATGTTCCATCTGCCAACATTGCACAAGCTACATCATGGAAATATGTTGGTGTTCCCACC TCTCAAGTAATGGAGCATATGGTCCACGAAGCTGGCAGTCATGCGGCTGTGGGTCACACT CGTAAAGACTTGCAAAATGGGTTAGATTCCAAACTAAGACAAACCTCAAGCAATGGTGAT GCAGACGCAGTTATTGCATACATGACAGCAAAACAGCAGATGGAAGGTAATTTTTTTTTC AAGTATACTGTATGTGACGATGGGTCATTAGGGAACATGTTTTGGGCCGACTCGCAGTCC CGTGTTGATTACCATTACTTTGGGGATGTTGTATCTTTCGATTCAACGTACAAGACAAAT GCGTACAATCGACCCCTTGTCATCTTTGTCGGCGTGAATAACCATAATAAAACCACAGTT TTCGGATTCTGTTTGGTGGTAGATGAGACAATAGCCACGTATACATGGGTCCTCAACACA TTTCTGCATGCAATGCAACAAAAGCATCCTGTAGCTGTAGTCACGGATGGAGATATTGCA ATGCATAAAGCACTAAAGACAGTAATGCCTGGGGCAACTCGGCGATTATGTGCGTGGCAT CTCGAACGAAATGTGCAGACAAATATCTGCAATGCTGCATTCACTAGGAATTCACAACCT GCATGTTCACGTACATGA
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>LITCHI025720.m1 GGAGCCCATTGGTAATTTAATAGAAGCTTCGCGTCGAAGCAATTAGGATAGACCATTACT CTCCTCTCCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAACGAAGACTGGTCGACTCTGTCTATGGAG ATTAGATAGACGGAGTCCAAGCTGTATTTTGTTGGAAGTTACTTCACTACGCTTTCACGT TGCAGTCTTTCAATTTCCTTCCAATTGTATAATATTTTCGTTTTACCATAAGACAGCCAA TACCTATGACCCCACCACATACCATCCCCACAACAAAAAATCTCTCCTCTCTTTCAAATC CTAAACATTATCGGATTTGGTTGAATCCTGATGAGCTTTTTCAAATATTGAGTTTGTTTA ATTTTTTACTATTATTGTCTTATGAATGGCTGTGGTGAGTCATGTGCCGTCAATTCCACA ACAGGTCGACCCAATAAGGTTTGCCGGCTTCGGGTTGCCGGGAATTATGTCCACCAGAAA AGAGATAGTGGAGCAACCCGTGGCGCGTGTGATTGAAGACAAGATATATGTTGCTGTTGG ATTAAAAAAGAGCAAATCTGTTCTGTTATGGGCATTGCAGAACTCTGGAGGGAAGCGAAT TTGTATAATTTCTGTCTACCAACCCGCGCAAATGATTCCAGTTATGGGTACTAAGTTTCC GGCTAGTTCGCTTGAACCGGAGGAAGTTAGAGCATACAGGGAGCTGGAAAGGCAAGATAT GCAGAAGGTGCTGGATAAGTACCTTGCTATTTGTCGACACATGGGGGTACAGGCGGAGAA ACAATACATTGAGATGGAATCTATTGAGAAGGGGATTTTGGAGTTGATTTCACAATGTGG GATCACGAAGCTTGTTATGGGAGCAGCAGCGGATAAGTACTATACAAGGAGAATGACGGA CATCAAGTCAAAGAAGGCTATTTCGGTGCGGTTACAAGCACCTGCTTCATGTCACATATC 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>LITCHI020253.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTCCTTCTTTTACCCTATTTGTTTAGTTATTTATTTGAAAGACTATACATGATGTAGCAA CAACTTAAAAACAACCAAATTGAATGAATACATTCTACCATCAAATCATAGTTGTTTTAC TAGATTAAATGAATACTTTATACCATCAATTGGATTGGAACCAAATATCTACATTATTTT AAATGCACAGTTGTTTTTTACTAATATAATCTAAAACCATTTCCTTGAATTTTACCGTGT ACTTGAAAATTCTCGCCAGAAATTGTTGATTTTATAATCCCAAAAGTTACCAATAATATC GGACATCTTACCTGTTATATCTCAACTCATAATGTGATAATTGCTGAATGAATATGTTTT TCAAGTGAAATATAAAATCGTTAATAACTATTCATTAATTAATGAACACATCATAAATTT AGATCAAAATGAGATACAAAGAAGAGTTGTGTAGCATTACTTTGTGAGTTAAGCCAGCTA GGAGAGATCACTCTAATGAATAGTGGGAATAATAGAGGGCTGCATAATTTCATTTTCAGT TTGTTTCCTCTATACCAAAAATCATAATTTAAAAAAATGTCGAAAATTATAATGGGGTTT GGTGATAAAGTATACTCATTCAATTCAATCTAGTAATATTTTAAATTCGAATAGCCTCAC CAGCCACCGCAAATAGAACAGAAAAAGAAAAAAGTTGAAGCTTATAATAGCTATCTGATG ATTCTTTTGTCAAGATAATATGGAACCAATTTTGCATATGAAGAAACGTTGTTGCCACGA AAATTTGCCGGTTTCGGTTTCAGCCTCTTAAATAAGTGTCGACTTCCTACGGAACGGGCC TTCAAATGGTCATTTAAGTCCATTAACAAACTTACTATCCTGACTGCTACCAACTGTTCA TATGTTTTTATTTTATGGACTAATGGACTGACCGGCATTTTCCTGCGCTTGAAAAAGACA GGAGTTAAACTCATCAATGAATGACATTAGGCAGACCTCAAAGAAATGCTCCCGTTTGAG ATAAGCCAACATTTGCATTTGGCTTGAAATTGATCATATGAATTTCCAAAATATAAGCAG ATGCAAGGAATCGACCTATAAAATTATGTAGTGATGCATGCCAATAGGCCATGACAGAGC ATAAAAAAATTATAGAAACCCCAAAATCTGAAACTGGACAAAGAAATTGTCCATGTCTGA AGCTTACAAGACGCGACATTATCAAATACTACGAATATGTCATTAACTAATATTTTAAAG AAGGTAATGTGGTTTACCCCATATAGTTATTCTGGTTGATGTTATAACTTATAAGCAGGT TTGGAAGCATTTATTAAAAAAACCAAAACAATGGTTTGGAAGAAATTAGACCTTTTGGTG CAACCCAACCTGTCACCAGCAAGGTACACTCCCTTCTAGCATGTCTTTAATTCACATTTA AGACTCAATGAAAGGCAGTATTTCTCACTGTGCCAAAAAATAAGGTAACGTTTCAAGACA GGAAAGAATAAGATAATTTTATTTGACTGAAAGATTAAGGTAACACACGGAGAAAGAGAG AAAGAGAGTGTTCCATAAACCAAACAAGAAAGTGATGAACATATTTGGACAGTCAATTAC AGTAGGGAGGAAAATTTTCTGTTTATGGTAGACTAATTAATGCACTGTATAGTATATTGA CCTCTGACCGTTTAAAAAATTATTTCTAGATTGACCTTAAATGATACCATAATGAAGAGT GAGGTACCCTTTTTATTTAGTGTCCATAAAAGTGACTCTATATATGGATAAATCACTCAC AGGATGGGGGTAAGGTTCATTATAAAATGGCCTTGATTGTAGAATGGAACGATTAGAGAT TAGGCCCTAATTCATGCCACCGAAAACCTAAAATCTCACATATACGTGAATCTTTTCCTT TGTTTCTCAAGTTCCAAGTGGAACTTTTTTGTCTAAACAGACCTTCTACAAAGATTTTCC TTTGCCAACTGGCAATTGGC
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>LITCHI004254.m1 GenomeSequence + ATGGCTATGCCACAGTTTGAAATCTCTAAGTTGCTCACCGATTCTGATATTACTAAAAAA CTTGTGCTTCCGACTCAAGTTATGGTACATCTTCCTATTATAAAAGGAACACATTTTGTG GATTTACAAGTCATAGACTCAGTGGAACAAGTGTGGAAACTTCGTTACTACACTCGGCCA AAAGGAAACCGAGCAAGTCCCGTCTTCACAGTTGGGTGGCTTCGATTTGTTCGTGCTAAA CGTCTTAAAGCTGGGGATAAGTTCAACTTTTATGGACATCAAATTAGAGATTCTTATGGA GAGTTGCGGATGCAGTATGGGATTCAAGTGACTAGGATAAGTAATGTCACTTATCAAGGT GAGCCTGTTTATCTGGATGTGGAGAACTTTCTTTGA