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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000336 | Chr5 | 10075991 | 10078519 | + | Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000336.m1 | 32 | 121 | PF03101.18 | FAR1 | Domain | 89.4 | 2.00E-25 |
LITCHI000336.m1 | 277 | 299 | PF04434.20 | SWIM | Domain | 24.7 | 1.50E-05 |
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>LITCHI000336.m1 ATGTATGGAACTAAAAGTGTTATTGAATGCTTAAATGATTCTGATTGGAAACCTAGATAT GGTATGGAGTTTGAGTCGAAACAATCAGCATATGATTTTTATAATGCGTATGGAAGGAGA GTGGGATTTAGTATTAGAAGAGATTCATGTGCGAGAAACAAGCACACTAGTGAAATTACT TCTAGGATATTTGTTTGTTCTAAGGAGGGTTTGCAATCGAAAGATAAACGTGATGTTCTT ACTAAAAACCCTAGAGCAATAACGAGAACTGGTTGTGGTGCCCAATTAAATATTAAGTTA AATAGATCTAATAATAATTTTTCGGTCATTCATTTTGTGGAAGAGCATAACCACCCTTTA GTAATGCAAGATTGTGTGCATATGTTATCTTCACAACGAAAATTGACTGTTTCACAAGCA ATTGAAATGGAATTGGTAGAAGGATCTGGAATTCCAATTAGATCTTCATATGAGTTGATG GGTAGACATGTGGGTGGTAAAGAGTCTCTTGGGTATACAAAGTCCGACCTCAATGTGGCA CAATTTTTCATGCACTTTGATAGAATACTTAATGATAAACGATATAAAGAGCTAGAGGCA GAATATGATTTGCGTTATAAGTTGGTTAGTCTAAAAGTTTCATGTAAAATGTTGGCTCAA GCAAGAGAAGTTTACACGAAACCAATATTTCAAGAGTTTCAAGATAATTTTGAAGAAGCT CTTGATTTGACCTTATCAAATTCCGAAGTTTTAATTGATGGGAGTTTCTATTATATAGTA AGGAATGACCATTCGAAAGAGTGGCAAGTGAAAAGAGAAAATGATGCTTCAATATGTTGC AGTTGTAGGATGTTTGAGATGAAAAGAGTATTATGTAGTCATGCCATTAAGGTTCTCAGA GAAGGTATGAACATCAAAGAAATTCCTAGTCAATATATCTTGAAAAGGTGGACAAAACAA GCAAGAGTAGAATGCATGCAAAACATGCATGGACATGATATCCAAGAAGACCCCAAGTTA CAGCAAACAACCCGGTATAGGTCCTTGTGCTCTATATTCACAAGAATATCAAGTAAGGCT TCTGAGAGTGAAAAAACATATAACTTAGTAAATGTTGAAGCAAGTAAATTGGCAAAACTA GTGGAAGACAGTTTATGCTTAGAAATGGATGGGAACAATCAAGAGAAAGTTCATGAATCT CAAGATGACAATCTTGGAATGAATTCTGCTCAAGATTCCAACCTTAAAAGAGCAAAAGGG CTAAAGAAAAAGGAGACATCTCGTGGAGGACAACGTAGACTCAAGAGTGGTTTGGAGAAA GCTTTGGCAAAAAGAAAAAAGTCAACTAATCTTCCCTCGAATGCTCAAACATCTAAGGTC ATAATGCGTCTGCTGCTTTGGTATGGACTCCTCAAGAGCAATTTCAACAAACAAGTTTTC AAGAATTGCTTCAACAGAATAGTGCAAGCTTTGCCTTCGAATTTCAAGACTCTCAAGCTT CCAATAACTCTTCTTTTAACTTAA
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>LITCHI000336.m1 + Up_Stream_Len 2000 AAAACGTTTTGTCTCGTGACCTGTACGAACTAATTAATTGCTGCCGTGTGACAGATTGTT TGATGCAGCGTCGTCACATGGGTTGGGGTTGGACCATTGGACAAAACAAGATAAACGTCA AATGCATCTACGTATCCCATCAATTCACTGGATTCGGATTCTCTGCCTATCTCATTTTTA CTAATCTTTTAATTCGATCGCGACACGTGGCAAGTGAAAAAATGAGTGGTGCAGATCTCT TTTTTTTCTTTTACCGAAAGCAAACAATATGGAGTCCATATTTTCATCCCTGTCAATGAT ACAGAGCCAAAGGTTTATCATTTTCTCAGACCACCATCATCCACTCTGTCTCTCCTTCCC CATAGCCGCTGCTTCAAGCCAAACCACCATCATCGACAACACTACTCTTGTCCATAGTAG TATTTGTGTTTATGGGTATTCGTCGATAGCATATTGACAGCACCACTCTATCTCTCTCTC CCCATAGCCACTCTGTCTCCCTCTCTCTATAACCATTTTTTCTATCCAGCCCTGCCATTT TTTTCTCCCATTATAAAACACTGTCATTGAAGCACAGAACAATGCCATTTTTTTCTCCCA TTATAAAACACTGTCATTGAAGCATAGAACAAGCACACGTCCATTAACAAAATGCCAATC GCGCCATCCCTATCAGTCAAGCAAGCAGCCAAAATCTTCAATTAATTGCCCGCCACTTGT TCGACCAAAGTCCAACACTGGTAAGAATCCGAAATTTTGCCTTTTGGATTGTTAATGTTA CTCCATATAAGATAGAACTTCTGATTGCTATAGTGCAACATTTATCTGGGACACAAAAAA AGCCCGAAACTTCTAAAAAAAAAAAAATCTGATATTGTACTGAGTGTAGATACTTGTACA TTGTAGTTCAATGGTGCTAGCTTATATATACAAGGGGTTATTTGATGCTATAGTGCAACA TTATGTTGGAAGGAAATTGCATTTACAAGGGGTTATGTGATGCAAAGTCTACTTGTCTTT GTCATTTTTATCATTAACGAAGTTTTATGTGTATGTTTTGATTGATTGGTTCTATTTTTT AAATGTTTTCAGATTCTTGAACTACTGCTCTGTTTATTGAATTAGGTGGTTTACTACTGT GTTAATGTTTATTGATTTACTGTTGTGTTTATTGAATTTGTGTTATTTTAACAATAACAC CAATTCTGGTGTTTGCTGTTTTTTTTTTCATTGAAGTTTTTGTATAGTTGAGTCATTATG TGGTTAAAGGCATTGATTATTTATTCAAAGACTTGTAGCTTTTTGAAATTTGATGCTCAG AGAATAAAAAAGTTTGTGTTTATTGATTTGCTACTGTGTTTGTTTGTGTGAATCTATTTT AGGTGAATTGGAGGTTAATGTTTATTGTATTAGAGGTTTAGGTGATTTGCTGCTCTGTGT GTGTGTGAATTAGGCACATATTGATGTTAAGTTGTGAAGGAAAACTGTGTAATTCTGGCT TTACATATGTTTTGATATTCATTTTTAACCCCTTGTGGTCAATACCATGCATACAGAACT TGCTCATTGATATTAACAGCATCAGCATGTCAATATTAACAGCATGTCAGTACCAATTCT GGTGCTTGCTTTTCTTTTTTTTTTCGTTTTTCATTGAAGTTTTTGTATAGTTGAATCATG GTGTGGTTAAAGGCATTGATTATATATTCAAGGATTAGTAGCTTTTTGAAATAAAAAAGA ACTTACTATTGCTTTAATACTCAGAGAGTCAAAAAGTTTGCTTAAAAAATAATTTTTTTA CTTTTATTTTTCACAAAACCCATGTTGTATGAATTATTTAATTTATCTTTGTGTTTTGAC TTGCAGGTTCATTAACAAATAAAAATAGTGTGGGTTGACAAGAAAGATAAGTTTTCGATT TTGATCAGGCCTCTCTTGCGAAGCTTTTCCACAATTTCAAGTGTATTGATTTGTTTGATT GTTTTCCCTGATTTTTAAAA
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>LITCHI000336.m1 GenomeSequence + ATGTATGGAACTAAAAGTGTTATTGAATGCTTAAATGATTCTGATTGGAAACCTAGATAT GGTATGGAGTTTGAGTCGAAACAATCAGCATATGATTTTTATAATGCGTATGGAAGGAGA GTGGGATTTAGTATTAGAAGAGATTCATGTGCGAGAAACAAGCACACTAGTGAAATTACT TCTAGGATATTTGTTTGTTCTAAGGAGGGTTTGCAATCGAAAGATAAACGTGATGTTCTT ACTAAAAACCCTAGAGCAATAACGAGAACTGGTTGTGGTGCCCAATTAAATATTAAGTTA AATAGATCTAATAATAATTTTTCGGTCATTCATTTTGTGGAAGAGCATAACCACCCTTTA GTAATGCAAGATTGTGTGCATATGTTATCTTCACAACGAAAATTGACTGTTTCACAAGCA ATTGAAATGGAATTGGTAGAAGGATCTGGAATTCCAATTAGATCTTCATATGAGTTGATG GGTAGACATGTGGGTGGTAAAGAGTCTCTTGGGTATACAAAGGTAGATCAGAAAAATTAC TTGAGATCAAGAAGGCAAAATAATTTAGCATATGGGCAAGCTGGATGTTTGGTAAATTAT TTTTCTGAACAAACATTAAAAAACCCTTCATTTTTTTATTCTGTGCAATTAGACAATGAA GAGCAAATCACAAACATATTTTGGGCTGATGCTAAAATGATTATTGATTATGGTCAATTT GGGGATGTTGTAAGCTTTGATACAACTTACAAAATAAATAAAGAAAATCGACCATTTGCG GTGTTTGTAGGATTTAATCATCATCGAGAGACTATTGTATTTGGAGCATCTTTAATGTAT GATGAAACATTTGATTCCTTTACATGGTTGTTTGAAACATTTTTGCAAGCTATGTCAGGA AAGACTCCAAAAACAATTTTTACAGATCAAGATGCTGCAATGGCTAAAGCCATTTTACAT GTGATGCCTAACACATATCAAAAGGCTTTGTACGTGGCATATTATGCAAAATGCCTTAAA ACATGTGCATAGTATGTTTAGTGGGGGTGGTGGAGTGAAAAGTGTCTTATCAACCTTTAT GTTTGATATTGAGGAAGAACATGAGTTTTTAAATGCTTGGAATAATATGCTTAATAAGTA TGATTTGCATAATAATTATTGGTTGAAAACCATGTTTGATTTGAAAGAAAAATGGGCTTA TGCATATGTTAGGCGTGCATGGTCTGTTGGAATGAGCAGCACATAACTTAGTGAAAGCTT CAATGCTTCTTTAAAAGATTATTTGAAGTCCGACCTCAATGTGGCACAATTTTTCATGCA CTTTGATAGAATACTTAATGATAAACGATATAAAGAGCTAGAGGCAGAATATGATTTGCG TTATAAGTTGGTTAGTCTAAAAGTTTCATGTAAAATGTTGGCTCAAGCAAGAGAAGTTTA CACGAAACCAATATTTCAAGAGTTTCAAGATAATTTTGAAGAAGCTCTTGATTTGACCTT ATCAAATTCCGAAGTTTTAATTGATGGGAGTTTCTATTATATAGTAAGGAATGACCATTC GAAAGAGTGGCAAGTGAAAAGAGAAAATGATGCTTCAATATGTTGCAGTTGTAGGATGTT TGAGATGAAAAGAGTATTATGTAGTCATGCCATTAAGGTTCTCAGAGAAGGTATGAACAT CAAAGAAATTCCTAGTCAATATATCTTGAAAAGGTGGACAAAACAAGCAAGAGTAGAATG CATGCAAAACATGCATGGACATGATATCCAAGAAGACCCCAAGTTACAGCAAACAACCCG GTATAGGTCCTTGTGCTCTATATTCACAAGAATATCAAGTAAGGCTTCTGAGAGTGAAAA AACATATAACTTAGTAAATGTTGAAGCAAGTAAATTGGCAAAACTAGTGGAAGACAGTTT ATGCTTAGAAATGGATGGGAACAATCAAGAGAAAGTTCATGAATCTCAAGATGACAATCT TGGAATGAATTCTGCTCAAGATTCCAACCTTAAAAGAGCAAAAGGGCTAAAGAAAAAGGA GACATCTCGTGGAGGACAACGTAGACTCAAGAGTGGTTTGGAGAAAGCTTTGGCAAAAAG AAAAAAGTCAACTAATCTTCCCTCGAATGCTCAAACATCTAAGGTGAGTTTTGTATATTA TCTTTATTTGTTATATTTTAATAATGGGTTTATAATTTTGAATATTACATGTTGTGCAAG CTCCAATCTCCTTGCCTCCTATGATTGGCAATATTCCTTACCCGCCACAAATGGCTTTTA GGCCTAACTTGGTTAGTATTTTATAGTTACAATTTCATATGTCTAATTTATTTAATCATT ATTAAGTACATATGTACTAACAATTAGTTTAATAGTTTCAAGGTCATAATGCGTCTGCTG CTTTGGTATGGACTCCTCAAGAGCAATTTCAACAAACAAGTTTTCAAGAATTGCTTCAAC AGAATAGTGCAAGCTTTGCCTTCGAATTTCAAGACTCTCAAGCTTCCAATAACTCTTCTT TTAACTTAA