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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000317 | Chr5 | 9626429 | 9628291 | + | Probable receptor-like protein kinase At1g11050 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000317.m1 | 1 | 163 | PF19160.3 | SPARK | Domain | 114.9 | 5.00E-33 |
LITCHI000317.m1 | 281 | 345 | PF00069.28 | Pkinase | Domain | 36.2 | 4.60E-09 |
LITCHI000317.m1 | 283 | 375 | PF07714.20 | PK_Tyr_Ser-Thr | Domain | 35.5 | 6.60E-09 |
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>LITCHI000317.m1 ACATGTCCTGTGGACCTCAACTATGTGTTGAGAATTCCATTCAACACCTCAGGTTGTGAT GACCTCCATCAAAACACCAACATAGGCAAAAACAAAAACCCATGTTGTCACAGTCTCTTG TCTCTCTTTGGTGTGGCTTTGGCTCAGCATCTCAAAGAGACCTCTTTGTTTCAGCTCCCA AACTTGGCCACCTCAGTTTCTTGTCTCCGTGATTACCAGACAAAGCTCTCTTCTCTCTCC TTGCCTGGTGATTTGGTTTCTCTTTGCTTTGACCCTTTGCAGTTTGTGATCACGCCTAAT ATCTGTGCAAGCATTCAGAACCTCCAGGACTGGAAGAGGCATCTTGGTGACTCAACTGTG CTGGACACAGCTTGTAAACCTGACCTCAGTGATCTTACTGCTTGTGATGCTTGTCTTGCT GCTGGCTTCAGAGTCCAGTCTCAGTTGGTTGCCGTCGATGGTAATAGCTCTCATGCCATT GATTGCTTTTATTTTTCAATTCTTTATGCTGCTGGTATTGTTAATGAGTTTGGACCTGAA GGTCATGGAACCTTGTCATGTGCTCTTGGGTTGCCATTGACATCCCAAAAGCATGCCTCT CAAAAGGCCAATTCAGCTCTTGTTTTTGGCTTGACTGGAGCTGGGGTTGCTCTGTTTGTC ATGCTTACTTTGTTGAGTTTGTATGTTTGGTGGGATAAAAAGTGGAGGAGAAGAATTTAT GGGGCTAGATTTGATTCGGATTTGCATTTAGAGGACCAGGGTTCTAGGCCGAAATTGAGG CCTAATACTGGCTCTATTTGGTTCAAGATTGAGAATCTTGAGAGAGCTACTGATAATTTT TCCCAAAAGAATTTCATAGGTAGAGGTGGGTTTGGAATTGTTTACAAGGGGGTTCTTGAT GATGGGACTACGGTTGCTATTAAGAGGATTATCGAATCAGATTTTCAAGGCGATGCAGAG TTTTGTAACGAGGTTGAAATCATTAGCAATTTGAAGCATAGAAATCTTGTGCCTCTTAGA GGATGTTGTGTGATTGATGGGAATAATGAGAGCTATGATGAGAGAGCTAATTGGGCTTGG TCATTGGTGAAATCTGGAAAGCTACAGGAGGCCTTGGATGCATCTTTGTTGAAAGAGGGT GATTCGGTGAATGCAAATCCCAAATCAATAATGGAGAGATTTGTATTGGTAGGAATTTTG TGTGCTCATGTCATGGTAGCTTTGAGGCCTACCATTGCGGATGCTCTGAAAATGTTGGAA GGAGATATTGAAGTTCCACCCATCCCGGATCGACCAATGCCTCTTGGGCATCCTTCATTT TATGGTGATGGTAATAAATTCAGCATCTCACCAGCATTGAGCGGGCCACAGTTGAATGCT GGAGACATGCTCAGGTAA
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>LITCHI000317.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTTCAAAAAGGTAAAAATGACTTTTCAAAAAAAAGCTAAAAACGGCATTTTAAAGTGTA CATCAAGTCAAGGGCAAAATAGTCTTTTACTATTTTTTTTGTAAATGTTGACAATAAAAA ATCATATTAAAAGGACTAATTTGAGGTGTTTTTGAAACGTGATGGATTACTAACGACATA AACAGATTAATAGTTAGAAAAAGAAGTTTTCTAAAGATATAAACCAAAATGAAATTTGTC CAAAGAACAAAAATCCCGAAAAATAAAGGAAAAGCTCACAATTGGTTTGCCTTAGTGGCA TACCCACCTTGTCACTTATCACATATATAGGGTTTGAGTACCATCCACCATAAAAAGTTG ACAATTTTATATTGAACAAAATGCACAAAACCCCCATAAGGTAAGCGTTTAAATACGTGA AGTCAACATTTGAGTTTTGTAATAGGTTAGCCCCTAACTTAAGAGTCAAATTGAGTGAAT TATAACCGTTGACTGTGTGAATCGATAAAAAGACGAAAATGCTCTTACCAGTTTAAATTA AAAATTTAAACAATGAAAATAAATTTAAAATTAAAATATGAAAAATAAATTAAAAATTAA AATAGTTGAAAAACATATCAAAGTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC TCTAACTCCTTCACCACACTCTATCTTCTTTCACCGCTCAATGCCGCCATTTTCATCCCT TCTGCACTCCACATCCATTCGTCGCCACATATCTCTTCGATGCTTATCACTAGAGATGTT AATCATTCTTCTTTTTTCTGCCTCTCCCTTATCCCTCTCTCTCTCTCGTCTAGGAGCCTA ACCCACAACCGTCCTCTTCATCGTCTAGGTTTGCGAACCCATTGTTCATTTGGGTTTGAT GAACCCACTTGTTCATCTAGGTTCGACGAACCCAAGTGAAGATATATTACTGTTTTTTTC AATTGAATCTTAGGACTCTTCTTGGTGATTAATTTTTTCAATTGTTGAGATGATTAATGG TGGTTTTTTTTTTGCTGGGTGGTTTTTCATTTTACGGGGATATAATTTAGTTGGTGTTTG ATGGGAGAGAAAATTTATTGTTCTTCAATATGGTTTGGAGGGTTTTATTTTTTATTTTTT ATGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCAACCTTTTTTTTTTTTTTTCAT GTTCATTTGGTTGCACATTGACGAAATTACCCCTTAGTCAAACTAATGTGGACTAATTGA CATTAACGGTCGAGGGCTAATTTATTACAAAACTCAAGCATTGATTCCGCACTTTCAAAC ACTTACATCAGTGGAGTTTTGTGTATTTTGCTCTTTTATATTAGCTCACTTATTTGTGGG CAATTTATATATAAGTTTCTTTAGTTGAAAGATAGTTTTCTCTATTTAACGTGAGTTTCT CTCTTCTTGCTATTAGAGAATGGAGTTAAATGTTGTATATTAGACCTTTTTATAGTATTA TTATTTAGGGGTCTTTATAATGTAATCATCTTTCTAATTTAAAAAAAATAATAATAATAA ATAAATGATGGAGGCCGAGGTAACGTGGCCGAACAGTTTACATGTTTTTTTTTTTTTTTT TTGAGATCGAACATTTTACACGTTGGTTTAACTTTCAAGACAAACCTTCAGATTGCAAAG TCTAAGACCTCCGCATCATGTCATGCCACCACCAATGCCGTATTCCCCTTCTGCAGCGCG TGTATTTCGGTATTTCCACGTATTTTCTTCTAGAGCGTCATCGTCACGCGCATGGACACT GTTAACATGAAAAGTTGGAGGTTTGACCCAACTGGCCACAACATGCGACTCTTAACGACA AACGTGGTGTCCATCCCCATTTGAAGAAGATAAGCCATTCCATTCGCATAAGCAAAATCT ATCCATTTTGTTAGAAAATGATGAAGAAGAGCCTTCTTCTCTCACTGTTTCTCTCTTTTG TTACTCTGTCTTCTGCAGCA
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>LITCHI000317.m1 GenomeSequence + ACATGTCCTGTGGACCTCAACTATGTGTTGAGAATTCCATTCAACACCTCAGGTTGTGAT GACCTCCATCAAAACACCAACATAGGCAAAAACAAAAACCCATGTTGTCACAGTCTCTTG TCTCTCTTTGGTGTGGCTTTGGCTCAGCATCTCAAAGAGACCTCTTTGTTTCAGCTCCCA AACTTGGCCACCTCAGTTTCTTGTCTCCGTGATTACCAGACAAAGCTCTCTTCTCTCTCC TTGCCTGGTGATTTGGTTTCTCTTTGCTTTGACCCTTTGCAGTTTGTGATCACGCCTAAT ATCTGTGCAAGCATTCAGAACCTCCAGGACTGGAAGAGGCATCTTGGTGACTCAACTGTG CTGGACACAGCTTGTAAACCTGACCTCAGTGATCTTACTGCTTGTGATGCTTGTCTTGCT GCTGGCTTCAGAGTCCAGTCTCAGTTGGTTGCCGTCGATGGTAATAGCTCTCATGCCATT GATTGCTTTTATTTTTCAATTCTTTATGCTGCTGGTATTGTTAATGAGTTTGGACCTGAA GGTCATGGAACCTTGTCATGTGCTCTTGGGTTGCCATTGACATCCCAAAAGCATGCCTCT CAAAAGGCCAATTCAGCTCTTGTTTTTGGCTTGACTGGAGCTGGGGTTGCTCTGTTTGTC ATGCTTACTTTGTTGAGTTTGTATGTTTGGTGGGATAAAAAGTGGAGGAGAAGAATTTAT GGGGCTAGATTTGATTCGGATTTGCATTTAGAGGACCAGGGTTCTAGGCCGAAATTGAGG CCTAATACTGGCTCTATTTGGTTCAAGATTGAGAATCTTGAGAGAGCTACTGATAATTTT TCCCAAAAGAATTTCATAGGTAGAGGTGGGTTTGGAATTGTTTACAAGGGGGTTCTTGAT GATGGGACTACGGTTGCTATTAAGAGGATTATCGAATCAGATTTTCAAGGCGATGCAGAG TTTTGTAACGAGGTTGAAATCATTAGCAATTTGAAGCATAGAAATCTTGTGCCTCTTAGA GGATGTTGTGTGATTGATGGGAATAATGAGAGCTATGATGAGAGAGCTAGTGATAGGTAT CTTGTTTATGATTACATGCCTAATGGAAATCTTGATGACCATTTGTTCCCTTCTATCAAT GATCATAGTGGAAATACTAGGAAGCCATTGACTTGGCCTCAGCGGAAGAGTATAATTTTG GATGTGGCAAAGGGGTTAGCTTATTTGCATTATGGAGTGAAACCTGCAATTTATCACCGA GACATTAAGGCTACAAATATACTATTAGATGCGGACATGAGAGCAAGAGTGGCAGATTTC GGCCTAGTGAAACAAAGCAGAGAAGGACAGTCTCATCTTACTACCAGAGTAGCAGGAACT CATGGGTACTTAGCCCCTGAGTATGCGCTTTATGGGCAGTTGACTGAGAAGAGTGATGTT TATAGCTTTGGGGTGGTTGTTTTGGAGATAATGTGTGGGAGAAAAGCTCTTGATTTGTCT TCATCGCGATCGCCACGTGCATTTCTGATCACAGATTGGGCTTGGTCATTGGTGAAATCT GGAAAGCTACAGGAGGCCTTGGATGCATCTTTGTTGAAAGAGGGTGATTCGGTGAATGCA AATCCCAAATCAATAATGGAGAGATTTGTATTGGTAGGAATTTTGTGTGCTCATGTCATG GTAGCTTTGAGGCCTACCATTGCGGATGCTCTGAAAATGTTGGAAGGAGATATTGAAGTT CCACCCATCCCGGATCGACCAATGCCTCTTGGGCATCCTTCATTTTATGGTGATGGTAAT AAATTCAGCATCTCACCAGCATTGAGCGGGCCACAGTTGAATGCTGGAGACATGCTCAGG TAA