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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000285 | Chr5 | 8842258 | 8844190 | + | Transcription factor bHLH160 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000285.m1 | 277 | 330 | PF00010.29 | HLH | Domain | 29.5 | 6.00E-07 |
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>LITCHI000285.m1 ATGTCTTCTCCAATACTTCAAACTAATAACGATCATGTAGATCAAGATTTCCCTTTCTAT CATCCGGATAATTCATTATGGTCACTTCTAAATGATCATTGCCACTCAATTCTTGCGGTT GGCGGTTATGATAATGATATCAGTTTAGATCACATATTTCACCATCAAGAAAATTCATTT TCGGCGAAGTTGATTGAAAGCACGCACGAACATTACCCTAATTTGTCGGTCCCTCTTCAA GCTTCAGTTAATCCTCCAAGTCCACTTCTGCATGAAAACAGAATACTGCTGCCCGTTGAA GAAGATTATGATCAAACTAGTCGTGAGTTGAATTCATGTGTATTTCTTGATCAGCATGAA AATTCAGCCCTAACTGGGCCTATCACAGATAAAGAAATACTGGAAAACAGCACCAACGAT CACGAAGATCATAATATTTTTCCAACAACCACGGAGGGTTCCGAAAATTTATGTCAAATT TTAGGAGTAAACCATGATGCTAGTGACAAAAAATTACATGGAAATAGTTCCAACCATCAC AATTATGATAGCAATTTGTCTAACTCTACTCTTGAAGGCACATCTAATGAATCATGGCCG CTTCTGGAGAAGGGCAGCACATCCTTAGATGTAGAAAATCATGAAAATAGTGTTGGGTTC GATTTGACCATGCCTACTGGGAAAGCAGCCTCGCCTGCTCAAGCTACCCCCAGCATTGAC AAAGGACTACTTGGAAAAAAATTCAATGCGAAGACCAAGGAGAGACACCATAAGCTGAAG CGGTTACGAAGTGAAAAAGAACCCAGTAAAGAAGAAGGACAAATCTCAAAGAAACAAGAG CACAATGCCAAGGAGAAAATCAGGAGAATGAAGCTCAATGCAATCTACTTAGCCCTTGGA GAATTGCTACCATCTCATCGAAAGACAAAGAAAAGAAGAAGTGCACCAGTAATTATAGAT AGAGCTCTTGAATATATTCCAGAGCTAGAAAAAGAAATAAAGGATCTAACTCTCAGGAAG AATAATCTGACGTCCACAATTGAAAATCAAAACCTCAGAGAAACCCCACAATTATCAAAT AAGCTTCAAGCTCCCACAGTTTCGTTGCACGAAGTTGTAAAGGGTGAAGTGATCATACAA ATTGTATGCATTCAGAAGGACCAAGAGACCACCGTTTTCTCAAATTTATTGCAGAATGTA GAAGCAGAAGGCATGTCCATTTTGAGTGCCTCAACTCTTCAAGTTTGTAAGGAAAGGGTC TGCTACCAGTTACTTATACAGGTATGGCTCTTCGACTAG
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>LITCHI019996.m7 - Up_Stream_Len 2000 TGATATATTCTTGACGCATATTTCAGGGTTTCAATACCCTATAAATATGATTTTATTCTT TGTCAAAATTATGAAAGCATATATTGTAAAGTTTGTAATTTTTTTGTGTTTTCTTGTTAA GCATATTATGATTAAAATTTTAGTGTTATGTTATTTAGCTCTAGTCTTTTAGCATGATTT AATCATTTATTCTACATGTTTGTTCATGCATTCATGAGCATATAGATAATTCTTTTAGTT CATTAAGTTCTTATTTTCTAGAGAAAGTCTAAGTTGAGGGTTGCCAATTCAAGTGGAGGT GAGAAGGAATTCTAGGATAGTTGGGAATATTGGTAAAAAGGTTAGGTCTAAATAAATCAT TGTTTCAAAAATCATCGGAAATCAACGATTTTCCAATGACTTATTGTTGATCAGTATGTT ACCTATCTGATAAGGATAAGATTGGTGGCCAAAATCGAGATTGGTCAAATTAACCGAGTA ATCGGTCCAAATCGACCCAATTACGGCACTCAGTGAGCCCAATCGACTGGAAATTATAGA ACAACCGCCATAAAAATTGAAAAAAAAAAAAATGATAGAGAGAGAAAAATGATATTAGGG TTTGGTTAAGTATATTAACACAATTCATAAAATTATTCAATCTAAACACAGAAACTCATC TCAAACAACAGATGATCAATTACATGAATAGAAATGAATTAAGCAACTAAAAATATAACC CAAATATATATATATATATATATATATAAAACTTATCAAAACTTCCTCATTTTGACATAT ATCAAGTACAATGAAAATATAACAGCATGTTGATAGATTAGATAATATGAATAGAGATGC AAATAATTATTTATGTTTATTTGCTCTAAAATCAATTCGCAATGAGAATGAAATTGTGGG TCTTACATGAATTTGGAATTAGGAATGAGAATCTCATTCTCCCATCTAACTTGAAATCTC ATTTTTATTTTCTTTTACAAATTAAAAAGTTTTTATTACCCTTGTTTAAAAATATATATA TATATATATTATTCTCAATGTTAGGCATAAGATGGAAATAGTGGTGATAATTATTACTAC CACTGTAATGGTTGTTAAGGTTCTTATAATAGGCTATTACATTTACAAAAGTAGAGTAAA TTTAGGTAATATTTTATATAAAAAAAAAAAATTCACGGCTTGATATACAATATAAATGCA TAATATGCTTATAATAATATTGTTAAGGATTTTTTTTTAGTCCATTCTAATAAGTTACAT GATAAAAAGATGACACTGCATTTGAAATATAATTTTGCAAAAAGATACACAATGCTTCTT TTACAATTGCAAAATCCTGTGGTTACATTATTTATTAATTTATTTTACAAACAACAATAT TTATGAAGTACATAATTTTAATCAAAGATATTTTTATAATTTGTAATTAATTCATTCTAA ATTTAAAACAAAGTAAACATCTTAATGAAAATATTACTAATTTTTATTCTAATTTCTACA ATTGAAATAAATAATTTATTCTGATTCTGATATATCATTCTGATTTAAAATCATTCCAAT TTCAAATAATTTTGATTTCAAATTATTTCAATTACATGCATATAAGAACACCATAAATTT TTGAACTCTGTCAACCATTAAATGGTCAGTGATTTAAATAAGTGTGTTGGGACAGAGGAG AGTGTATTTAATGCTCTTCTTCTTCTTAGAAAAAAACAAAAACAAAAACCAAAAATGCTA TTCGAATCCTCCATGATGTCAGTACACGTGTGCAGTGATCAAACGACGATCACCAATTCA AGCATAGTGCGCGACATACGGTAAATAATCCCAACATTAACGGCCTCCTCCTATCAACCA GTATCCGTCTATCAAAGTCTGTCCAGTTTACTCCTTCTTAACGATTTCTCTGGCCAACCG ACTCACAACAACCAAAGCAAACGAACGCATCACATTTCGATTTTCCAAACCCTAATTTCA CACGAACCCTAATTTCAAAA >LITCHI019996.m6 - 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