Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000281 | Chr5 | 8786760 | 8789648 | + | Transcription factor bHLH160 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000281.m1 | 173 | 226 | PF00010.29 | HLH | Domain | 33.9 | 2.50E-08 |
Download Copy
>LITCHI000281.m1 ATGCTGCTGACTGCCGAAGAAGAAGATGATAAAACTAGTAGTGAGTTGAATTCTTGTGTA TCTCCTTATCGGCCAAAAAACTCAGCCCTAGAAGGATTACCTGAAAACAGCATCACCGAT CATGGAGATCATAACAATTTGACAACAACCCAGGATGCTTTCGAAAGTTTATGTCAAATT TTGGGAGAAAATCGTGATGCAAGTGACAAAGAATTACAAGCAAATAGTAATAACAGTTTG TCTAACTGTACTCCTAAAGGCACACCTAACGATACATGGTTGCAACTGGAGGAGGGCAGC ATATCACTAAACATAGAAAACCATGAAAACAGTGGTGGGTTTGATTCGAGCTTACTTACT GAGCAAGCTAAAGCCTCACCTGTTCAAGCTTACCCCAGTATTGACGAAGAATTGCTTGCA AAAAAATCCAATGCCAAGACAAAGTTGAGAAACCATAAGTTGAAGCAATTACCAAAAAGG GCCGTGCAACCCCATGGAGAAGAAGGACAAATTTCCAAGAAACAAAAGCACAATGCCACG GAGAAAATTAGGAGGATGAAGATCAATGCCACCTATTTAGCTCTTGGAGCATTGCTGCCG GATCATCGAAGAACAAAGAAAAGAAGAAGTGCACCAGTAGTGATAGAAAAAGCTCTTGAA TACATTCCGGAGCTAGAAAAGGAAATTGAAGATCTAACTCTCATAAAGAATCATCTGCTG TCCGCAATTGAAAAGCAAAACCTCAGAGAGACCCCACAATTATCAGATAAGATTCAAGCT CCCACAGTTTTGTTGCATGAAGTTGTAAAGGGTGAAGTGATTATACAAATAGTATGCATT CAGAGGGATCAAGAGACTACTATTTTCTCAAATCTATTGCAGAGTGTAGAAGCACAAGGC ATGTCCATTTTGAGTGCCTCAACTCTTCAAATTTGGCAGTATCGGGAGATAAAATCCCTG GGCTTGCCATCTAGTACCAAATTACTCCCATCCTAA
Download Copy
>LITCHI000281.m1 MLLTAEEEDDKTSSELNSCVSPYRPKNSALEGLPENSITDHGDHNNLTTTQDAFESLCQI LGENRDASDKELQANSNNSLSNCTPKGTPNDTWLQLEEGSISLNIENHENSGGFDSSLLT EQAKASPVQAYPSIDEELLAKKSNAKTKLRNHKLKQLPKRAVQPHGEEGQISKKQKHNAT EKIRRMKINATYLALGALLPDHRRTKKRRSAPVVIEKALEYIPELEKEIEDLTLIKNHLL SAIEKQNLRETPQLSDKIQAPTVLLHEVVKGEVIIQIVCIQRDQETTIFSNLLQSVEAQG MSILSASTLQIWQYREIKSLGLPSSTKLLPS.
Download Copy
>LITCHI007817.m1 AATAGAACAGTACTTTGCCCACGGTAAAGGAGAACCTAAACCCTAATATTCTTTCTTTGT GTCCTGTATCTCCTCGACAGAAACACAATGAGAAATCTCTACAAACTGCAACTGCAACTT GTACACCAATTTCTCACAAAACCCAATTTTTATTTATACTCTTCTGTCACCAAAACCACA ACTTTAGCTCTTCAAAATTTCCTAATCGAAACCCTAAATTTGCCCAAAACACAAGCCCAA TCAATATCAACTCGCTTCTCATATGTCAAATCCCTTGAAAACACACATTGTGTTCTCCAT TATCTTCGACGTGTTGGATTCTCAGAAACCGATATCCGATCTGCAGTTCTAGGAAATCCA GTGATTCTGTTCCTTAAAGACAGGACACTTAAACCCAAAATGGAGCTATTTCAAGAGATG GGTCTGGTGGGTTCTCATCTGGGTAAGTTCATTTCCAAGAACCCCAAACTTCTTTCATAT AGTTTAGAGGATAGATTGATTCCCCGTATGGGGATTCTCAAGAAGATTTTAGTGGATGAT AAGAATAATGAAGCTTTGATTAGGGTTTTAAGCTCATTCAATTGGGTCCTCACAATGGGC AATGAATCTAGATTGTTAAGCAACATTGCATTCTTGGAGAGTTGTGGCATTGTTGGGTCA CACCTATCAATGCTTTTAAAGCTGCAACCTAATGTCTTCACTTTGGAAGAATCAAAGCTT AGGGAACTTGTTTCGCGGGTTTCAGATATGGGATTTTCGTTTCATTCGAGGATGTTTGTT TATGGACTAAGTCAAGTTAGTAGCTTGAGTGAAGAAACTTTTGAGAGGAAACTGGAATTG GTGATGAGTTTTGGGTTTACCAAGCTCGAATCGATTGAAATGTTCAGGAAGGCGCCTTTG ATGTTTGCCAAGTCCGAGGAGCAGTTAAAGTCTGGACTTGATTTCTTTTTGAACAAGATT GAGCTAGAAAAGAAGACGTTGATTAGATCTCCGGTTTGTTTGATGCTTAGCTTGGGAAAC CGAGTGATTCCTCGATATAGAGTTGTGCAAATTCTCAAGTCAAAAGAGTTGTTGGATAAG GAGCCTAGTCTTGTTAGTGTGTTGACTTTATCTAAGGAGAAATTCTTGGATAAGTTTGTG TTGAAGTTTAGAGATGATGCTGAGGAATTGTTGGTAGCTTACAAGCGTCATTTATTAGAT TCTTCTTCTGTGGGGGGGGAAAGTCGAGGCAAGTTCTAACCCTTTTGAAATCAACACTAC AATGAGGGTTTATTGTTGTTTTGATACATGCAACTCTCATTTTCGGAAATATTTCATACT TTGGAGGTTTGACACTGAAGCATTTGAGTATGGGGTTAAATTGGTCTGAAAAAGGAAAAT TCGTATGAGTTAAATTCCAGTCTAAGAGGAGCAATCATATCAAGAAGGGTATGTTTCAAC ATCTTTGCGTGGTTTGGGCATAATTATTTTATGCTGCAATGGATGTAAGCAAGTGTACAT TTGTCCTGCAGCAAAGATTGCTAATTGCCTTTCAAAGAGAAAAAAAGATTGCTAATTTGT TTCAGCATTGATAAGGGCTGCTGTGCTCATTTTTAGATGATTTGAGTAGCATATATTTAC ATCTTTTCAGCCCTTATACTCGCAAGCAATGCTAAATACAGTCGTTCGCCAGACCTTCTC AAATGGTTGTGAGTTCTATTCTCACTTGTCCCACTTAGTCGGTACTTTCTCCTCCACCTG CTGTGAATTGCTTCCTTCCTTTCTAGGAGCAGATCCTTGTACCGCACTGCAGAATTGTAT CATAATTAGTCTCAGCAACAACTTGGACAAGGTACCAGTACTTTTAGTTTGAAATTATGG ACTCTTATCGTGGATATGGACATAAAGGAGTACATTAAGCTGTTGAGTAAGTGGATTTGA TTTCTTCAAATTATGTTGTGAATTAATTCATTTCGTGGGCGGTATAGTAAAAGGAATCGT ACTGGTCTACATGATCTGCCTCTTGTGCATAGTTGATATTTATATGAAATCAATCATAAA GTTTAGCTATTATTAAACAATATTGTGTCTGGACACAAAAGTGTAGCTGTGGTTGTTATT TATAAGGTTTGAATGGAA
Download Copy
>LITCHI007817.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAAGGTTATATAACACATTTCAAATTTTATAAAAACTTAAAAAGATTTATTTGAAAAAAC TCAAAATTTGAACTTTTCAAATAAAAATTGTTCAACTTTTTTAATTATCCAAAAGCTCTA CTAGGATAACAACCAAACGACGTAAAAAAATCAAGTAAAGTTTTAGACATTAAAAAAATA CTTGCAGTCAGTATATAAATTGTACCAAACATATACTTATAATAATAATAATAATCAAAC TACAACAATATTTTTGTGTCCTTGTATAATAGCTAAACTTTTTGATTGATTTCAAATATA TCATACCAAAATTGATGTGGTAGTTATAAATCAACTTATCATATCATTTAGATAAATTTT TGGAAATATATTATTATTCTTTTATTTTTCATTCTTGTTGCGGTGAACTTTATTGACATA TTTTTATGTGAATTAAATGGAGATTAGTTCAACCATTTCGAAAAGGTTCTTAGAAATAGT CCTTATTCAAATGTTAAAATTAATTTTATATTTATTATTAGAGGGACTAATTATTTTGGT CAAACCCACCTTAAATGTGGGAGACCAATTTTAATTAAATTTACAAACAATATTCCATGA AATATAGGGATGTTCTTCACATATTTTCTTTTTTTAATGTGAAAATGATGAAAATTGACA TCAAATTTAGTTTTCCTTATGAAACAATTGTTGTACTAATATTTTGAGTTTTCATGGCAC CTAAAATTTTAAACTTTTGATATTACCCTTAATGAATAAAACAAAAAGATATGACACTCA TCTCCATCTCTCCTCTCTTCTCCATCTCTTTCTCTTTCATTTTGTTGGAAAATAAGAGAT AAAAGTCCATTTTAATGAACCATTCTAATTAAGTTTTTTATAATCTCAGTTTTGAAAGAT CAAGATAGATCCATGTTCTCTTTTGCAAGGTCATCAATTTGGCATATTATTTGATCAAAA TGGTGCTTAGGCGAATGAGAAATTGAATTTTAAAGTGCATCTATTGGAAAAAATGTCCTG TATTGGAAAAATATAAGAAAGGAAGTTTGGTATATAAATGCATATTTTATAGCTATACAA TAACTTGTGAAACACATGCTCTCTCTCACAAGGAGAGATGCGAATCATGGTCCAACCCAT TGTTTAAAACTAGTCGAGTGGGCCAAGTTATCGACAAGAAATCATGGATCGATTGGAAGT TGATCTGATAACCCTCTAATCGACAGTCATGATTCACCTCAAACCACCAAGCTTTAAACC AAAAAAAAAAAAAAATCCACCACCATGTTTTTCTTAACTAAACCACTTGAATCCAAACCA AAACAAAAAGTTCTAATATGAATCCCTTCATCAAAATTGACCAATAACAAGACAAAGAGC AGAAGAAATATAAATTTAATTCAAAAACATGTTAAACGGCTTGCCTTGCGACGATGGCGA AGGAGGATGAAGATTGGACTGGAGAGGCGAGATGGTGATGATGGTGGAGGTTGAGAGATC AGTCAGTGTTTAAAATGGTGATTGAGTGAGGGTGGAAAGGGAGAGAGAGAGAGAGAAGGG GTTAGAAGCGGTGGTTTGAGAGTGAGAAGAAGAGAACCAATAGGATTGGTGTGGAAAGAC ATATATATTATAGTATATTACACAAACATCTATGAGGTTTGATAAAATTAAATAATCAAA GTATCAAATTGTCCTTAACAGTTAAAGAAATGTCAATTTATGTTTTTAAATTTAAAAAAA ATTATAATTTCCTCTTCAAATAGTGTCTTTTGAGTACTCACCGATTAAGTAAACGATTAT TGCTATTTATTGGGTTGTCAGTCAAGTAGCGAGTTATGAGTTTTGGAACTATGGTCCAAC CTCGTCTACATAAACCCTAATTTACTAATGATGCGATATTGACATTTTTAAGGAATAGAA CAGTACTTTGCCCACGGTAAAGGAGAACCTAAACCCTAATATTCTTTCTTTGTGTCCTGT ATCTCCTCGACAGAAACACA
Download Copy
>LITCHI007817.m1 GenomeSequence + AATAGAACAGTACTTTGCCCACGGTAAAGGAGAACCTAAACCCTAATATTCTTTCTTTGT GTCCTGTATCTCCTCGACAGAAACACAATGAGAAATCTCTACAAACTGCAACTGCAACTT GTACACCAATTTCTCACAAAACCCAATTTTTATTTATACTCTTCTGTCACCAAAACCACA ACTTTAGCTCTTCAAAATTTCCTAATCGAAACCCTAAATTTGCCCAAAACACAAGCCCAA TCAATATCAACTCGCTTCTCATATGTCAAATCCCTTGAAAACACACATTGTGTTCTCCAT TATCTTCGACGTGTTGGATTCTCAGAAACCGATATCCGATCTGCAGTTCTAGGAAATCCA GTGATTCTGTTCCTTAAAGACAGGACACTTAAACCCAAAATGGAGCTATTTCAAGAGATG GGTCTGGTGGGTTCTCATCTGGGTAAGTTCATTTCCAAGAACCCCAAACTTCTTTCATAT AGTTTAGAGGATAGATTGATTCCCCGTATGGGGATTCTCAAGAAGATTTTAGTGGATGAT AAGAATAATGAAGCTTTGATTAGGGTTTTAAGCTCATTCAATTGGGTCCTCACAATGGGC AATGAATCTAGATTGTTAAGCAACATTGCATTCTTGGAGAGTTGTGGCATTGTTGGGTCA CACCTATCAATGCTTTTAAAGCTGCAACCTAATGTCTTCACTTTGGAAGAATCAAAGCTT AGGGAACTTGTTTCGCGGGTTTCAGATATGGGATTTTCGTTTCATTCGAGGATGTTTGTT TATGGACTAAGTCAAGTTAGTAGCTTGAGTGAAGAAACTTTTGAGAGGAAACTGGAATTG GTGATGAGTTTTGGGTTTACCAAGCTCGAATCGATTGAAATGTTCAGGAAGGCGCCTTTG ATGTTTGCCAAGTCCGAGGAGCAGTTAAAGTCTGGACTTGATTTCTTTTTGAACAAGATT GAGCTAGAAAAGAAGACGTTGATTAGATCTCCGGTTTGTTTGATGCTTAGCTTGGGAAAC CGAGTGATTCCTCGATATAGAGTTGTGCAAATTCTCAAGTCAAAAGAGTTGTTGGATAAG GAGCCTAGTCTTGTTAGTGTGTTGACTTTATCTAAGGAGAAATTCTTGGATAAGTTTGTG TTGAAGTTTAGAGATGATGCTGAGGAATTGTTGGTAGCTTACAAGCGTCATTTATTAGAT TCTTCTTCTGTGGGGGGGGAAAGTCGAGGCAAGTTCTAACCCTTTTGAAATCAACACTAC AATGAGGGTTTATTGTTGTTTTGATACATGCAACTCTCATTTTCGGAAATATTTCATACT TTGGAGGTTTGACACTGAAGCATTTGAGTATGGGGTTAAATTGGTCTGAAAAAGGAAAAT TCGTATGAGTTAAATTCCAGTCTAAGAGGAGCAATCATATCAAGAAGGGTATGTTTCAAC ATCTTTGCGTGGTTTGGGCATAATTATTTTATGCTGCAATGGATGTAAGCAAGTGTACAT TTGTCCTGCAGCAAAGATTGCTAATTGCCTTTCAAAGAGAAAAAAAGATTGCTAATTTGT TTCAGCATTGATAAGGGCTGCTGTGCTCATTTTTAGATGATTTGAGTAGCATATATTTAC ATCTTTTCAGCCCTTATACTCGCAAGCAATGCTAAATACAGTCGTTCGCCAGACCTTCTC AAATGTAATTTCTTGACTCGACGAATTTATATGTTAGTGATGTTATAGTCAAGATTGTGC TACCATTGTCCGACTCACTTCCTTGTTCTAGGGTTGTGAGTTCTATTCTCACTTGTCCCA CTTAGTCGGTACTTTCTCCTCCACCTGCTGTGAATTGCTTCCTTCCTTTCTAGGAGCAGA TCCTTGTACCGCACTGCAGAATTGTATCATAATTAGTCTCAGCAACAACTTGGACAAGGT ACCAGTACTTTTAGTTTGAAATTATGGACTCTTATCGTGGATATGGACATAAAGGAGTAC ATTAAGCTGTTGAGTAAGTGGATTTGATTTCTTCAAATTATGTTGTGAATTAATTCATTT CGTGGGCGGTATAGTAAAAGGAATCGTACTGGTCTACATGATCTGCCTCTTGTGCATAGT TGATATTTATATGAAATCAATCATAAAGTTTAGCTATTATTAAACAATATTGTGTCTGGA CACAAAAGTGTAGCTGTGGTTGTTATTTATAAGGTTTGAATGGAA