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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000117 | Chr5 | 2955344 | 2958011 | + | Transcription factor TCP8 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000117.m1 | 160 | 263 | PF03634.16 | TCP | Family | 127.9 | 5.30E-37 |
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>LITCHI000117.m1 ATGGAACTTAGAGATTTGGCAAGCAATAAGCAGAGCAACAATTCCTCATCAGAACCCCAC CACCAGCTCCACCACCACCACCACCACCAGCAGTCTTCTCAGTTTGTGGGGCCGTTTGAT GGCGGCAGATCAGGCCCTTTCATGGGCTCCATCTCCGTCCAAGCTGGCCTCACCACACAT CACCACCACCACCATCACCACAACACTCTCACTTCTTCTTCTCCAACTACTCCCTCTTCT TCTTCCTCCTCCTCCGCCGCCAACCACCCTACTCCATCACCTCCACCTCCGCCTCCTCAG CTCGTTGATGCCTCTCTCGCTATCGCCACCAGATCTACTCCTCTACTCGACTCCTCCTCT TCCAAGAAGAATCAACAGAATTTGACCGAGACAACGACAACAGCGGCAGTCACAACCACC ACCACCACCACCGCGGCCGCCGCCACCACCACGACCACGAACCCTCCGGTGAAGCGGTCG ACGAAGGACAGACACACGAAGGTGGACGGTCGAGGCCGGCGTATAAGAATGCCGGCCACT TGCGCTGCTAGGGTTTTCCAGTTGACTCGTGAACTGGGTCACAAATCCGATGGTGAGACC ATCGAGTGGCTACTACAACAAGCCGAGCCGGCTATTATAGCCGCCACTGGAACGGGTACA ATACCGGCTAACTTTTCGAGTCTCAACGTGTCTCTTAGAAGCAGCGGATCTACCCTCACA GCTCCAGCTTCAAAGTCAGCTCCTCATTCTTTTCACGGGGCGCTTGCTTTGGCCCATCAT CCGGCTCACTATGAAGAAGCGTTTCCTCATGCTGCTTTACTAGGGTTTCATCAGCAGCCA CCACACCATCTGATGACAGCTGATCAGATAGCGGAGGCGCTACCTAGTGGTGGTGGCGAA GGTGAGAATTATATGAGAAAGCGTTTTAGAGAGGATTTGTTTAAAGATGATAATAGTAAT AATAATAATCAGTCACAAGATGAAAGTGGAGGAGGTGGAGGTGGAGGAGAGTCATCGTCT TCAGTGAACAAAGCGTTTAAAGGGGGTGGTTTACAATTGCCTAAACAACAACAGCAGCAT GAGGGAGGAGGATCTTCTTCAGGTCTGCTTAGGTCATCCAACGTGTTACCAGCAACAGCT ATGTGGGCAGTGACGCCAGCAGTACCCAGTAGTGGAGCTGGAAGCACTTTTTGGATGCTA CCCATGACAACCGGGGCAGGTGGGGGTCCATCTATGGCCACCCCAGCTACTTCAGAGATG TGGCCATTTGCACCACCAGCTGCTGCCACGCCATCAACAGCACAAGCTCCATTACATTTT GTGCCAAGGTTTAATTTACAAGGCAACATTGATTTCCCAAGTGGGAGAGGGAACCACCAC CCTCTACAATTGGGTTCAATGTTAATGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCTTCTCAGCATCTC GGGCTGGGGATGTCCGCGGAGACGAATCTGGGAATGTTGGCAGCCCTTAATGCTTATTCT AGGGGGAATTTGAATATGAACTCCGAGGACAATCCAATGGAGCATCATCAGCATCAACAG CATCAACAACAACATCAGCAACACCAGGCTCAGGAGACTGATAGTGGAGATGAGGATCCA AATAGCTCTCAGTGA
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>LITCHI026357.m1 AAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTATAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATT AAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCA TGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAATATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACG ACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAGAGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGA GATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAAACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAA CAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCACACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTT GGTGGTTTTTTTGGGTGTGTTGTCTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAGTTTTGTT GAGGTTTAGAGAGATGGCTGGTGTGGGTGGAAATGGGAAAGGCCGTGCTGGTGGGGGTGA TCAAAAAGGAAAAGCCCCAAGTACTGATCCTCATGTGCATGATGATCAGAGCAGAAAACG TACCAACATTAACGATGCGTTGCCTACCAACAACACTGACCAATGTAGGCAAGATGGGCT ATACAAAGCACTATGGCGTGCGTGTGCGGGTCCACGTGTTTATGTTCCATGCGTTGGAGA TTACGTCTACTACTTCCTTCAAGGTCACTTGGAACAGATTGAGGCATATGCAAACCATGA AATTAGAGCGGAAATGCCTGTTTATAATGTACCTTCTAAGGTTCTATGTGAGGTTGTCCA TGTTCAACTAATGGCGGAAACTGGTACTGATGAGGTATTTGCACAGATTACTTTGCAACC GAAAACAAAGCAAGACATGCAAAATTTGGAAGATGGGAGTTCTGCACCTTTGCCACCAAA AACAAAGGTGTGCTCCTTTAGCAAGAAACTCACTCAATCTGACACCAGCACACATGGTGG ATTCTCTGTTCCCAAACGAAAAGCCGATGAGTGTCTACCCCAACTGGACATGTCCAAGCA ACCCCCAGCTCAGGAACTGATTGCAACTGATTTGCATGGATATGAATGGCGTTTTCGGCA TATATTTCGTGGTCAGCCAAAGCGCCATTTGCTTACTAGTGGTTGGAGTATATTTGTGGC ATCAAAAATGCTTAACAGTGGAGATTTATGTATCTTTCTCAGAGGAGAACATGGAGAACT TCGCATAGGGATTCGTCGTCTAATAAAAAGACAGAACTGTGCTTCAACAACAATCATATC TAGCCATAGCATGCAGCATGGTATACTTGCCGGTGCCTTCCATGCAATTTCTACAGGGAC CACGTTTTCCGTCTACTACCATCCTTGGACCAGCCCTTCTGAATTTATCATACCTGTTGA TCAATGCGATAAGTCGACTTCCATTGACTATTCTGTTGGGACAAGAATCAGAATGGCGTT TGAGACTGAAGACTTTACGGAAAAGAGAATTGCTGGCACGGTTGTTGGTATCGAAGATGT TGATAGAATTAGGTGGCCTGGTTCAGAGTGGAGATGCCTCAGGGTGAAATGGGATGCCTT ATCTGATAGAATAAGGTGTCCAGAAAGAGTCTCTCCATGGAATGTTGAACTGATAGAAGG TGCCAACAGGAAGCCTGCTTCATTTCTGCATCGACAAAAGAGGCCACGTCCAGATAATTT GTCATTTCCTGGGTGTAGCAATGGTCAGTATCTCTTACTCTTTTCTGTAACAAGGGTCTT GCAAGGTCAAAAAAACAATGTCACAGGTGTCAAGGAATCGGGTCCTCTTGAACCGCTGTC ATTTCCATATTTGGTTCCCCAAAAGAGTTCTGATTGGGGCCATGTTTTAATGCATGATCC ATTTTATCCATGTCACAATGGTAGAGTGTCAATTCCAAGTGGAATCATAGTGAGGAGTTC AGGTCTGCCTAATTACTGGCCTGCGACATATGCAACAAATAGTGTTCGTAACAATGCTGT GTTAAGCAGAAATATTTCGGCTCCCAGTGGCAAGTCTCTTAATTCCAGCTCTAAGGAGCG GAGATCTTTGGAATCGAAGAATGAAAATGAATCTCCTCTCTCGCAGTCTCATGGTGGCAA AAAATACATGCTTTTTGGAGTCAATTTAGCCAATACTAGTCCACCGGAGCTCCCTTTACT TCAACAAGCCACTTCCAATGAGCTCGAAAGTCGTTGTTCAGGCCCTCCAATGTCTCAGTC CAGCATTTCAGGACCTTTTCAGGTTTCAGAGCCATCTAATAGTGTATCTGACATCCCTTC AGGAAAACAATGCAAGAATTGCCGTCTTCTCAAGAGTTGCACCAAGGTGATCAAGTATGG AACTGCTCTTGGAAGGTCAGTTGACCTCTCGCGATTTGACGGGTATGAAGAACTCGTTTA TGAGCTTGACCAGATGTTTGACTTTAATGGAACTTTGATTGATGGGAGCAGCGGGTGGGA GATAACCTTCATCGATGATGAAGGCGACATGTTGCTAACTGGAGACCACCCCTGGAAGGA ATTCCTTTGCGCCGTGCGAAGAATGTTCATCTGTCCAAAGGAAGACATTGACAAACTGAA TCCAAGCTCACCAAATCCAACTTCTGTTTGA
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>LITCHI026357.m1 - Up_Stream_Len 2000 TTTCACATTGTGATCAAAAGTTGGGGACAAGACAGAAATCTCCCTTAAATAAATATTTTA AGGATGCTATCAATTATGATCATTTAATTCTTCTTATCTTGTTTTGGCAAATATTCCAAA ACCGGAAGTCACTTTTAGCATATTCCGAGCCGTTACAGTACTTCATTTATATCAAATTCT TAATCCTTTTTTTTTTTTTTGAAATAAATCAAATTGTTAATCCTGTTGCTTCATATTTAT AAATGATTTTTTATAGGTGTTATTTTGAAAAATTGACCATTGTTTTCTTTCTCCTAAATT AATTTGTAAAAGATAAATATATAAATAAATTAAAAGTCAATTTATGCATACACACTATCT TTTAATAGAAATGGTTGAATATCTCTCTTAATCCGAAAAGATTAGAGGTTTAAATCTTAC CATTGTCGAATATATGGATAATTTTCTATGAATTTAATCACCTATTCCCTCATCATTAAA AAAAAAAAAAAAAACTTGATTTATAAATGCACACATTTTGTACAATATTTGCTTGAAAAA TAATTTTTGCAACTTATTTATACTAAAATAGATTTTTCTATCGATAAAAATACTATAAAT TGTGCATTACAAAAATTTAACTATATAATATATTTTTTTATTGAGAATCTTGTTGGTTGT GACTTATGGTTGAATGTGAAAATGAAGTATATTTATTTCTTTTAATCTTTGATTATCAAA TTATCTTAGAATTAAAATCAAGTATTTAGTATTGTTTATTTTGATTGATAATAGATCTTT AGTTTATAATCTTGTAAAATTCTTGTGATTTAAATTATAATTATTGTATTTTTTTTTAAA AAAATAGATCTTTTTATGCTTTTAATGACCTAATTCTTAATATATCATTATATTAATAAT AATTCAAATAAAAATTATAATCCATAGTTTTATATATATGCATGCACGTGCACACGTGTG CATGGGTGAGCGTGTGTATATTTTTTTAGTGATTTATTTATTTTGAAATATATATTATGA GGGTTAAGATTTACTATAATCTTCATTATACATTTGATAAATTTAATCATAGATAGAGAT TTGATTAAAAGAAAATTTTCTTAATTCATCCCAACATTAAATCGCAACTATGTCCCTGGC CAAAGACAACATTTATTGCAATTGACCCATCTTAATTTTTTTACTTTCTTGGATGTCTAT ATAAAATAAAAACGACAAATTAGAGTAACCATCCAAAGAAGTCTGGTCCAAATGATAATA AAACTATACCATCTATGGAGTTTCAAAAAAAAAATTATACCATCTATAGACTCTTTGGAG TTGAAAAACAGCACCATGAGCACATAATAAATTGACGACCCATGTCCTGCCCCAGTATTC AGACGAAACGCTTGATAGAGGTTGAGTGAGAAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTA TAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATTAAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGG CGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCATGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAA TATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACGACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAG AGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGAGATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAA ACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAACAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCA CACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTTGGTGGGTAAGTGAATTGAGGGAAAGAAAGA GAGAGAGAGAGAGATCATTGAATGGTGTAGAGTGACTTGGGGACGTTTGGTTCTCAAGGC GGTTTTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTCTCTTTTGGGTATATATGTGATTTCTCTTCTTT TGAATTTTGCAGTTTTTTTGGGTGTGTTGTCTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAG TTTTGTTGAGGTTTAGAGAG
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>LITCHI026357.m1 GenomeSequence - AAGAAGTGGAGAGTGGTGAGAGTGACACTATAGTTTTCGCACCAAACAGTACAAGAAATT AAGGATCCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGCGGAGAAGACCAGAGAGCGATGCATGTGCA TGCATAGAACATATCGTGAAGGGTAGCAAATATCGACAGCCACCGAGAGACAGACAAACG ACAGAGACGGAAGAGTGGTATTTCAACAAGAGTGAAAAAAAAAAAGGGTTGGAAGGAGGA GATAGGAGCAACAAACGCAGTCACGAACAAACACAATAAACGTTACAAACACCAAGGGAA CAGGCATCAGCTGCATCACGCCAGCACGCACACAAAACATACACTCATAATCTCCTTTTT GGTGGGTAAGTGAATTGAGGGAAAGAAAGAGAGAGAGAGAGAGATCATTGAATGGTGTAG AGTGACTTGGGGACGTTTGGTTCTCAAGGCGGTTTTTTTTTTTTTCTCTTTCTCTTTCTC TTTTGGGTATATATGTGATTTCTCTTCTTTTGAATTTTGCAGTTTTTTTGGGTGTGTTGT CTTCATCATCAGCTTCTCCACTTTCGTAAGTTTTGTTGAGGTTTAGAGAGATGGCTGGTG TGGGTGGAAATGGGAAAGGCCGTGCTGGTGGGGGTGATCAAAAAGGAAAAGCCCCAAGTA CTGATCCTCATGTGCATGATGATCAGAGCAGAAAACGTACCAACATTAACGATGCGTTGC CTACCAACAACACTGACCAATGTAATATGTCTTTTTTTTCACTACTTGTTATTTACTCAA TGTCTTGCTACTGGTTGACGACTTTGTGTTTCGAGTTATGATATCATGGAAGCAAGTAGC CATCAGTGCTTCAATCTCTCTTTTTCTCGTGCCTTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAGGTGAA 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