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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000106 | Chr5 | 2674447 | 2674830 | - | Auxin response factor 18 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000106.m1 | 15 | 90 | PF02362.24 | B3 | Family | 35.4 | 8.20E-09 |
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>LITCHI000106.m1 ATGAATCAAATTGTCTCTCATGAACTTACCAAGACAGATGTTGAGAACAGACTCTCACTG CCCAGCCATGCTCTTCTACATCTGCCTCCTTTTGAAGGTGATCGACGTGCACAAGATCTG ACTGTGAAAGATGAGGAGGGGATAGAGTGGAAATTTCTCTATAGAATCCGTGAGGGTCCC TACAAGAAACCTGAACTCTCTACTAATTGGCTTAATTTTGTCAGGCGTAAGAAGCTTAAA ATTGGTGATGAGATTCAATTTTTCAAGAAAGAAGAGGCTACTGGAGGCCCGACCTACATG ATTAAAGTGATGAAGAAGTTCACACTGATGGGTAATGTTCATTACCTCCCTTACGTCCCT TATGTGAATCAGGCTGATCGCTAA
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>LITCHI010952.m1 MADLYGTTAPTSGHEPEEISAFLNQLIHNSSSSSSCLCFNAKYINHSLSPPPPPPDAKSD SAALISQPEDRHHRSADPPSAVPDSSPGGFNFSNSLATCVTAVDSDTYDSEKGPEASEAP SNNNTVRPKPPSKRSRAAEVHNMSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIE YLKQLQLQVQMLTMRNGLSLHPMWLPGALQPVQLPQTGMVFDEENGLLNTNRGTGTFSAN EEGSIQTAFNICDQSTISNQPIAISSAANITTSSETSFGLEPLIQAHYGPFGLSSSSKDI VDGGAPQLHLDMNFTGKDSSSGMS. >LITCHI010952.m2 MADLYGTTAPTSGHEPEEISAFLNQLIHNSSSSSSCLCFNAKYINHSLSPPPPPPDAKSD SAALISQPEDRHHRSADPPSAVPDSSPGGFNFSNSLATCVTAVDSDTYDSEGPEASEAPS NNNTVRPKPPSKRSRAAEVHNMSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIEY LKQLQLQVQMLTMRNGLSLHPMWLPGALQPVQLPQTGMVFDEENGLLNTNRGTGTFSANE EGSIQTAFNICDQSTISNQPIAISSAANITTSSETSFGLEPLIQAHYGPFGLSSSSKDIV DGGAPQLHLDMNFTGKDSSSGMS. >LITCHI010952.m3 MADLYGTTAPTSGHEPEEISAFLNQLIHNSSSSSSCLCFNAKYINHSLSPPPPPPDAKSD SAALISQPEDRHHRSADPPSAVPDSSPGGFNFSNSLATCVTAVDSDTYDSEKGPEASEAP SNNNTVRPKPPSKRSRAAEVHNMSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIE YLKQLQLQVQMLTMRNGLSLHPMWLPGALQPVQLPQTGMVFDEENGLLNTNRGTGTFSAN EEGSIQTAFNICDQSTISNQPIAISSAANITTSSETSFGLEPLIQAHYGPFGLSSSSKDI VDGGAPQLHLDMNFTGKDSSSGMS. >LITCHI010952.m4 MADLYGTTAPTSGHEPEEISAFLNQLIHNSSSSSSCLCFNAKYINHSLSPPPPPPDAKSD SAALISQPEDRHHRSADPPSAVPDSSPGGFNFSNSLATCVTAVDSDTYDSEKGPEASEAP SNNNTVRPKPPSKRSRAAEVHNMSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIE YLKQLQLQVQMLTMRNGLSLHPMWLPGALQPVQLPQTGMVFDEENGLLNTNRGTGTFSAN EEGSIQTAFNICDQSTISNQPIAISSAANITTSSETSFGLEPLIQAHYGPFGLSSSSKVN L. >LITCHI010952.m5 MADLYGTTAPTSGHEPEEISAFLNQLIHNSSSSSSCLCFNAKYINHSLSPPPPPPDAKSD SAALISQPEDRHHRSADPPSAVPDSSPGGFNFSNSLATCVTAVDSDTYDSEKGPEASEAP SNNNTVRPKPPSKRSRAAEVHNMSEKRRRSRINEKMKALQNLIPNSNKTDKASMLDEAIE YLKQLQLQVQEHYNQCNCLKQEWSLMRKMDC.
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>LITCHI030392.m1 ATGCTCATTGATGTAGAGATGCCTATTAGATCTAAGGAAAGTGCGCTAACAGCAAAGAAC CAGCCGTTTACTTACTCTGAGGTTGTTAGTATCACTGGTAATTTTCAAACCGTCATTGGA GAAGGGGGATTTGGAAAAGTGTACTTTGGCACTCTGAAAGATGGCACTGAGGTTGCTGTT AAGGTGCTTTCTTCACTATCAAGACAAGGTTATAAGGAATTTCAAGCAGAGTACAAGGTA ACAACTGAACAATATACTACATGGCTGGATGTAGCTTCCGTCATATATGTTAAAGCTAAG AACTTCTGGAAACTTTGTTGGGTGTGA
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>LITCHI021546.m3 - Up_Stream_Len 2000 ATCCTTTATCGTAAGTTGACTTCCGTAAACTCAAACTGTTGACTATCATTTTAATAAAAA ATAACTACAATACCCTTATCAGGGGTAAAAATGTTTTTTTTAAAAAAAAGTAATTAATAT ATTTATAATAAAAAATATATTTTTTTTCAATAACTTTATTTTATTTTTGGAAAAATGAAA CGTAAGTGTGGATATCCACTGGCAATTAATCAAATTTGCTCTTTCGATGGAGCATATTTG CACTGGACATTTGATTCATATCGCATCTCCGATGGAGATCAAGTATTTAAAAAAAAATTT AAAATCGCTCCTTTCGCAAATCTCCAATAAGAAAGTTTTGTTTGTTTTGTATATGAAATT TTTAAAAAGATTTTATTAAAAAATATTTTTTTGGAGAAATTGAAAAAATTACTTTATATA ATTAATTATTTATAAATTTAGGTATTGCGTGACTCTTTATGATTGGATAAAATAATTTTA ATATATAAAAAACTATTTTACCTTTAAAGTATTAATGTTTCCATCAAGTTTCTATTAGAT AAGGGTATTGTAGTTATTTTATATTAAAATAATAGTTAACAGTTCGAGTTTATAAAAGTC AATTGATGGTAGGAGGTATTTGTGTAATTATAATCAAAATTCCTATTTAGCTACAATTAC ACCTAGACTTGAAGGTATTTATGTAATTTACTCTTATAATTATGACTCATTTAACAAAAT GAGGTAAACATACTAAAGGGTGTATAAACAGTTTTTGAAGGTTGCAAATATCGAACACTC TAATAAGAAAGTGATTTGATAAGTTAAACCTAGTTTAGGCTGTGCTTTTATTTCTTAAAT GGGCCTATATCGAGGCCCAACTGAAATGGCCATGAATACATTCTTTTCTAAATACACTCA ATGTGATTGGGCCCATACAAGGCCGAAATCGGAATGATCATGCATGCATTCTTTTTCTAA ATAACTCCATAAAGATTTTTTAAGGTTTTCTTTCAAATGGGCCGCTATACCACTTCGGGA GAGCATAAATATTAATGCTCGGGTAATCCTAATGCACAAGATCAATATAATACAGTGAAA ACTAGTGATTAATATTTTATTTAAAGGATCATAAATCAACGATTTGAAAAATATAAAAAA AATAAAACTAAAAGGTTAATTTTCTTTGAAAACTAAGGTAGTTAAACCCTAACAGTAATA CAATATCTATATTATAACAAAATTGCATTACTCGTGGTCAAGGAGACATACAGATAATAA ACCCTAATATTTTAGAATTTTAGACGTATCACCCAAATATTAAATTTCTTATGATATTTT ACAATAACGAATATTTTTATAAATCCGAATCTCCCAATACGTTCATTAAAACTGATATAT ATATATATATATATATTTACTTTCATGTTTACATAACAAAAGTCCACCCCACTCAAACTA AAAATAACATTATAACCCAATCTACACTACAAATATCAAAAGCCCAGCCCAATCCATAAC CAAAAGCACAAGATATTTTTTGTCATAGACACAGAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAACTGAAAAACCTCAAGCCAGCAAACAGGACCCATATATAAATATTAACAGATGATAA AACCCAAAACCCTACTCATTTCCAAAAACCCAATCTCTGTTTCTCTGCGTTTTATTAGCT TCTGTTTCTTAACTGGAGTCACTGGACTGTCTCTCTCATTTCAACACAAGTGAGTCTCTT CTCTTCTCTTCTTATATAATCTCACTCTCCCTGCACTGAATTTTGTGTATTTTGCATGTC AGTCTCTGTTTTTCTGTTTGTATTGGTTTGTTGATGAAAAGCTATCTGGGTTTGGTTTTA TGTGTGAGTTGATAAGTATGTGTTTATAATGGGAGACGATCGAGAAAAAAAAGTTGTCTT TGCCTGGTTTTGTTGTGTGATGGTTTTTGATTTCGTGCAGATTATGGGAAATTGATGGTG TGGTTTAATTAATAGAGAGT >LITCHI021546.m4 - 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>LITCHI021546.m3 GenomeSequence - TTTTGTCATAGACACAGAGAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAAAAACCTCA AGCCAGCAAACAGGACCCATATATAAATATTAACAGATGATAAAACCCAAAACCCTACTC ATTTCCAAAAACCCAATCTCTGTTTCTCTGCGTTTTATTAGCTTCTGTTTCTTAACTGGA GTCACTGGACTGTCTCTCTCATTTCAACACAAGTGAGTCTCTTCTCTTCTCTTCTTATAT AATCTCACTCTCCCTGCACTGAATTTTGTGTATTTTGCATGTCAGTCTCTGTTTTTCTGT TTGTATTGGTTTGTTGATGAAAAGCTATCTGGGTTTGGTTTTATGTGTGAGTTGATAAGT ATGTGTTTATAATGGGAGACGATCGAGAAAAAAAAGTTGTCTTTGCCTGGTTTTGTTGTG TGATGGTTTTTGATTTCGTGCAGATTATGGGAAATTGATGGTGTGGTTTAATTAATAGAG AGTATGGAAACGAAAAGGAAGACGCCACTCCAGGTTGAAGCACTTCAGAGATTCTATGAA GGTTAGTTGTGTATATATCTGTAGCTTTTGTGGCTGTATGTGATTTTGTAGTTTTCGTTG AATATGGAAGATTCTGCTTAATGGGTTTTTTTTTTTTCCTGAAATTTTTGTGGAAGTGTT TTGGCTGTTTTTGGGAGTGGTTATAAGTTAATTTTAGTACTTTTGTATGTTTCTGAAGGA AAATGTTGAACACTTTGCGGTATTGTTTGGAGAGCAAGTTGACTGCTGTATTGATGGATT GTTATGTAGTATATTTTATTTATATTCTTGCTTGGTGCTGTTGTGTGAAGCAGGAGAGAA TTATCCCTCGAAAATGGAAATGGAAGAACTTGCTGAGTCTTTGGATTTGACATTCAAGCA 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