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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000092 | Chr5 | 2503774 | 2509287 | - | Zinc finger transcription factor YY1 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000092.m1 | 136 | 160 | PF00096.29 | zf-C2H2 | Domain | 20.8 | 0.0004 |
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>LITCHI000092.m1 ATGGATAGTCATTATACTCACAATTTCTTCGAGAGACGACCCATTATCAGATCCAAGACT CCCGCTGTCAAATGGTTCAAAGAATGGGTGCCCCAAGATGTTGTGGCCACTGGTGGCAAG TGCCAAATACTGAGATGGGTCAATGAGAAAACTTTGAAGGCTTTGAAAGAGAGGGAAAAG GAGCCAGAGGCACCAGAGCCGGAACCAGAACCCACTACTGAAGTTCTATTTCTCTGCAGT TATGAAGGTTGTGGAAAGACCTTTATTGATGCTAATGCATTGAGAAAGCACTCTCACATC CATGGTGAGAGACAATATGTTTGTCACTATGAGGGATGTGGAAAGAAATTTTTGGATAGT TCGAAGTTGAAAAGACACTTTCTCATTCATACTGGAGAAAGAGATTTTGTATGTCCTCAT GAAGGCTGTGGCAAGGCATTCTCTCTGGATTTCAACCTTAGGTCACACATGAAAACACAT TCACAAGAAAATTATCATATTTGCCCGTACCCAGAATGTGGAAAGAGATATGCTCATGAG TACAAGTTGAAGAACCACATTTCATCACACCATGAAAAGAATGGGACAATGGAGGTTCCC AAATATGCTACCCCTCCAGAGAGGATATCCAAAACGCCGAAGACTTCGTCAGCAGTATAT GGCTCAGCATCGTCGGATCGTCCTTACGCTTGTCCTTATGAAGGGTGTGAAAAGGCTTAC ATCCATGAGTACAAACTTAAACTCCATCTAAAAAGAGAGCATCCTGGTCATACACCGGAT GAGGTTGCTGAGAATGCAACACAGAATGCTGATAATGAGATGGACGAAGGCAGTGATCAA GATGTCTATGTTGGAAAGCGTTCAAATGGCAAAAGTCAGAAACAAAGCAGGGCAAAGCCA AACTTGAAGATGCCTCCTTCAAAAATCACACAGCGCAAAGGTTCAAGTCCATCTCCTGCA ACTTTGAATGTTGTGAGAAAACCATGGCCTGTTAAGGAAGAAATCTATGAGGAAGAAGAT AGTGAAGAAACTGAGGAAGATCGTGACAACGTTGAGGATGGATTTAGGTACGGGCAAAAT AATGAGGATGATGATGAAGAGACGGAGTATGAAGACTGA
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>LITCHI000092.m1 - Up_Stream_Len 2000 CAGCAATATTCTCATTGAACTGTTTACTTTATTTTGGAATCGAAATGGATTAATTGTAAG TAACAAAAATACCCATAATTAAAATTATGAATTAATTATAATAGTATGCATTTTTTTTTA ATTTTAATGTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAATATCAAATAAAAAACTGCATATTATTTTAA TAGTCCACAAGCCTAGTGTATAATTTTTTTATTATAATATATAGTTTTTTTTTTTATATC AAATAAAAAACTGTATATTATAAGTAAAAAAAAAATCTACATATTATTTTAATAGTCCAT TATGATAATTAAGAAATTGGTGATGAAAAACCAATAATATGCAGTTTTTTTTTAATATAC GTAGTTTTTTTTTTAATCTCAAATAAAATAGTGTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAGACTTT TTATTTTGACAAAGGGAATGAGAATGAGATTCCCAAGTGAGTTGGGGGGAATGAAATTCC CATTCCATGACCTTAAATTGACGTAGGGCCCGCACTTTCATTCGTATTACAGAATAAATT TTAAGCATGTAAACACTATCAATCAATATGATTCTTAATTTTCATTCCTCAATGCATGAA GTAAACACACCATCAGCGTTTAAAGGAGATAGGAGTTTTCCCATGTTTGTGGGACTAATT AAACAACACTCAACTAAGGGATTGTTAAAGATTTTTTTTTTTAATTATTTTTATTCAAAA TATTATTTATATTTAAGTATTAAATTTAATTGTTTCAAAAATATATATATTAAATATTTA AAAATTAATTTAATATATTTTATCATAATATTGTTATTATTAATTAAAAATTATATTTTA CTTTATTTAGAATTTAGTATTCGTGATTTTATTTATTTTTAATGACAATGTAAATATTTT ATATTATTCAAAATTTAATTTAATATAATTTTATTTTTGCGAAATTAATTTAAAATAAAT TTATTTTATTCAAATATGAATATAATATAATTTTATTCTTTTTTTATGGCTAATATAATT TTATTCTAATTCATAGAAGATATAAAATATATTTTTATCTAATTTTATGCTATACTAAAC AAGAGACAATATTAATTTTAATCTAATCCCTAGTGTGCCAAACACATCACTGGACAAATT AATATAGTCTTTTCTCTTAAATATAATTTAATCCAATCTCATGAGACTTTATAAATTATA TTATAATAGATTTAAATAGCTTTCCTACACACAAGATAAAGTTACTAATGTATAGTTGTA TAGCCCATCAATCATCATGTGATTTGTAACGTGATTGCATTCCATATCCCAACTTCTACA AGGGTAAGGGTGCAAAGTATTTGTCTACAGTTGAATATAACCCAATTAATTTTTGATCAA CTCAAACATAATTTGTTAAGCTGCTTATGAATATTAAAAACCAAAATCCAAATCTAAGTA TTGTACAATTTCATACCAAATATCATTTAACATAAAATTGATCGGAATAATATATAGTCT AATCCAATAATAACAATATAATATACCAATTATCTTACCACTTACGTTATCACAAATTAA ACAATAATTTTGTGTCGACCCATTTATTCAGTAAATTAATGTAAAATCCACTAAATTAAA TGTGGATCCTCTTATTCTAGTGGATTTAACATGTAGTTCGATTCGAACTAAAGGTAATAT TAACCCAAATCCTGGTTTAACGTATAATTCAGTTCTAAGCCGTCGTGATATTAACTCAAA TCTACTAGTTTCGTGTCATCGGCTAAGTAGCTGTCCTATTCCAAACCAAAGCTGGAAAAA CTTGAATCCCGTTTAAGGGTCCCAGAGCCACCACCCAAACACACAAACTTGAAGCACATC GTAACCAAAAGAGGTTCCCCAATCTCTCTTGAAACCCTAATTTGAAAATCGAAACCTCCT CCTCACAGAAACCTTAATCAATAAATTAGAGCTCGATTCAATTACAGAAAAGAAGACAAA AAAAATCCAGTAGAGTCGAG
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>LITCHI000092.m1 GenomeSequence - TATAATTCAGTTCTAAGCCGTCGTGATATTAACTCAAATCTACTAGTTTCGTGTCATCGG CTAAGTAGCTGTCCTATTCCAAACCAAAGCTGGAAAAACTTGAATCCCGTTTAAGGGTCC CAGAGCCACCACCCAAACACACAAACTTGAAGCACATCGTAACCAAAAGAGGTTCCCCAA TCTCTCTTGAAACCCTAATTTGAAAATCGAAACCTCCTCCTCACAGAAACCTTAATCAAT AAATTAGAGCTCGATTCAATTACAGAAAAGAAGACAAAAAAAATCCAGTAGAGTCGAGAT GGATAGTCATTATACTCACAATTTCTTCGAGAGACGACCCATTATCAGATCCAAGACTCC CGCTGTCAAATGGTTCAAAGAATGGTACAAAATGCCAATTCAACCCATACCCATCTCTTC TTTTTGCCAAAGATTGCTTTTTTATTTTATTTATTTTTAATCACTGTTGTTGTCAATTTA CAAGCCTGATTGTTATAAAACATTGTTTTATAGTTGAAAGATTTGGTCTTGTAGGGTGCC CCAAGATGTTGTGGCCACTGGTGGCAAGTGCCAAATACTGAGATGGGTCAATGGTAAGTG ATTATACTTGCTTCTTTGTTTTGTTTATAATTGTTTTGTTTGATTTAAGTGGTTTTTGTA CTTTTACTTAGTGTTGTTCTTTTTTTTTTTTGGTTGAAAATTGGGATGTTAGTGGATACT TGTGTTGGAGAATTCTTGATAGGGTTTTAGTTAAATTCAATACTTGATAAACTTAATCAA CTTGGAGAGGTGGATATCGAAATTTTGTTATATTGTGTATATTGTTATTTATGTTAGATT TATGAATAGGAACAGAAAGGCATGGATGATTTTAGCATGCCCTTAAAAAGGTATTGTTGC 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