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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000082 | Chr5 | 2346056 | 2346640 | - | AP2/ERF and B3 domain-containing transcription repressor TEM1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000082.m1 | 7 | 85 | PF02362.24 | B3 | Family | 33.8 | 2.60E-08 |
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>LITCHI000082.m1 ATGGCACCACTCTTGTTGAAGATAGTTACTGAGATGGATGTTACAAGAAACTTATCAATT CCGATGAGTTCATTGGGTTCGATGTCTATTGAAGAAGAGCGTTTAATGTATATGCATGTT TATGATGATCATGGGCGATTATGGGTCTTTCACTGCTCAATTCAAAAAATGGAGAATGAG GGACGTGCTCTTTCTGTGAACTGGCTTGAATTTGTTAGGCACAAAAACGTTCGTGTGAAT GATAAAGTCACTATCATTGAAGAAATCACGGATGATCCAACTAAAGGCGCAAAGTTCAAA ATTGAAGTGAAAAGACATATCAGATTGTTTGGCCAAAATATTTGGGCAGATGCAAACTAA
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>LITCHI002779.m1 MASAHVVLLLFIFILKAKSNTVLKHQSNISLGDSLTPTNKPHSWISPSRRFAFGFYQQGS GFRVGSWLVTSPEITVVWTANRDDPPLPSNATLKLTRKGKLIISTDKEDKLIANISESAT SASMLDSGNFVLYNESSGIIWSSFDSPTDTILGGQYLNAGSELVSSASEFNSSSGRFRLK MQNDGNLVLYPINTIDEYTEAYWASDTNGYYQRRLYLNNTGKLAIFDSNMSTVKTLSYSS SYSESISYRAKVGHDGNFRLYSQSISHEGEYNISIVYQVPGDMCDVKTFCGLNSYCTLYD DQPMCRCLPGTDLVDPSQMHAGCERNFIDEGCKGTYNMTSLEKITWDDYPYLKEDLQEED CKTSCLEDCSCDAVIYRSGYCEKLKLPLKSAKRNQGESSKSYTAYFKTGLKSIKIEDGSH PTRSEPTSTGKKAIILIMVITLGFTTCSCVFLATFGCFVFKYRVLKYKRLLETGNYFGSN DELTLRSFSYTELKKATSGFKELLGNGSFGAVYKGAFQKGEKLVAVKRLEKIVKEGEKQF QSEMLVIGRTHHKNLVRLLGYCAEDSKRLLVYEYMSNGSLADLIFSSKNFPVWNERVRIA LDIAKGILYLHDECEVPIIHCDIKPQNILMDDDWTAKISDFGLAKLLMPDQTRTFTLIRG TRGYLAPEWCKNIPISVKADVYSYGVVLLELVCCRRNLDIDTSKPDEMVLTNWVYKCFIE RELNKLVRGQDVEKKTLENMVKVGLWCVQDEPALRPSMKSVVMMLEGITDISTPPCPTA.
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>LITCHI002779.m1 AATTCATTGAATGAAACTATGGACGATATGAACCCACGTTTTGTTCAAGTTTTTCACCAT CTTTAGTGAGAAACCTTAATAATTGAGGACAATACTATCAAAGATTTCTCTCATTTTCAG TCATGGCTTCTGCTCATGTTGTTTTATTGCTCTTCATATTCATTCTTAAAGCTAAATCTA ATACTGTACTAAAACACCAATCAAATATAAGCTTAGGCGATTCACTGACCCCCACCAACA AACCCCATTCATGGATCTCACCTTCTCGCAGATTTGCATTCGGGTTCTACCAACAAGGCA GTGGCTTTCGAGTGGGAAGCTGGTTAGTCACCAGTCCAGAGATTACTGTTGTTTGGACAG CAAATCGAGATGATCCTCCCTTGCCATCAAATGCTACGCTTAAACTAACTAGGAAAGGCA AGCTCATTATCAGTACTGATAAGGAGGATAAACTCATTGCTAATATCTCAGAGTCTGCCA CTTCTGCTTCCATGCTTGATTCAGGTAATTTTGTGCTCTATAATGAAAGCTCTGGTATCA TTTGGTCAAGTTTCGACTCTCCCACTGATACCATCTTGGGAGGACAATATCTAAACGCGG GGTCTGAACTGGTTTCCAGTGCATCTGAATTTAATAGCTCCTCTGGAAGGTTTCGTCTGA AAATGCAAAACGATGGGAATCTTGTTCTGTATCCCATAAACACCATAGATGAGTACACAG AGGCTTACTGGGCCAGTGACACTAATGGTTACTACCAGAGACGCCTATATCTGAATAACA CCGGCAAGCTAGCTATCTTCGACTCTAATATGTCTACAGTCAAAACATTGTCTTATTCAT CTTCCTACAGTGAATCAATCAGCTACCGTGCAAAAGTAGGCCATGACGGAAATTTTCGGT TGTATTCACAAAGTATATCCCATGAAGGGGAGTACAACATATCCATCGTGTACCAAGTCC CCGGGGACATGTGTGATGTGAAGACTTTCTGTGGTTTAAATAGCTACTGCACATTGTATG ACGATCAACCAATGTGCCGTTGTCTTCCTGGTACTGATCTTGTTGATCCTTCTCAAATGC ATGCTGGATGTGAGAGAAACTTCATTGATGAAGGGTGCAAAGGAACTTATAACATGACTT CCTTGGAGAAGATCACATGGGATGATTATCCTTATCTCAAAGAAGATCTTCAAGAAGAAG ATTGCAAGACATCTTGCTTGGAGGACTGTAGTTGTGATGCTGTAATATACAGATCGGGAT ATTGTGAGAAACTCAAGCTTCCTCTGAAATCTGCTAAGAGAAATCAAGGAGAATCGAGCA AGTCCTATACAGCTTACTTCAAGACAGGTCTCAAAAGTATCAAAATTGAAGATGGTTCTC ATCCCACTAGAAGTGAGCCAACAAGCACGGGCAAGAAGGCGATCATACTAATTATGGTCA TCACATTAGGCTTCACCACTTGCTCTTGTGTTTTCCTTGCAACCTTTGGTTGTTTTGTGT TTAAGTATCGGGTGCTTAAATACAAGCGACTGCTGGAAACCGGGAATTACTTTGGCTCAA ATGATGAACTTACCCTGCGCTCATTTTCTTACACAGAGCTGAAGAAGGCCACCAGTGGTT TCAAAGAATTGTTGGGCAATGGCTCTTTTGGTGCAGTTTACAAAGGTGCTTTTCAAAAAG GAGAAAAGCTTGTCGCGGTCAAGAGGTTGGAGAAGATAGTGAAAGAAGGTGAAAAGCAAT TCCAATCCGAGATGCTTGTAATTGGTCGAACACATCACAAGAACTTGGTTCGGTTGCTTG GTTACTGTGCTGAGGACTCCAAGAGGCTTCTTGTGTATGAATATATGAGCAATGGCTCCC TTGCAGACCTGATCTTCAGCTCCAAAAACTTCCCTGTTTGGAATGAAAGAGTGAGAATTG CATTAGACATTGCAAAAGGAATTCTCTATCTCCACGACGAATGTGAAGTACCCATCATTC ATTGTGATATAAAGCCTCAAAACATCCTAATGGATGATGATTGGACAGCCAAAATCTCCG ATTTTGGGCTGGCCAAACTACTGATGCCAGATCAAACAAGGACTTTCACATTGATCAGAG GGACAAGAGGGTACTTAGCTCCAGAATGGTGCAAGAACATCCCAATATCAGTGAAAGCGG ATGTTTACAGCTATGGAGTAGTACTCCTCGAACTTGTGTGCTGCAGGCGAAACTTGGATA TTGATACATCAAAACCAGACGAAATGGTTCTGACAAACTGGGTTTACAAGTGCTTCATAG AACGAGAGCTGAACAAGCTTGTGCGCGGCCAGGATGTTGAAAAAAAGACGTTGGAGAACA TGGTGAAGGTGGGACTTTGGTGTGTGCAGGACGAACCAGCACTTCGTCCATCCATGAAAA GTGTAGTCATGATGTTGGAAGGCATTACCGACATTTCCACTCCTCCTTGCCCCACTGCCT AGAATATCATCCAGTAAGGAAGCTATATAACTAAATGATAGTTGCTGATTTATAAATAAG ATGTTAATGTGTTGTTGTTTCAACTTGTGATTCATGTAACCATCTTTTGTTCTGCCTTTG AAGAAAGAAACAAACCATAATAATCTTTCGTGAAGTATTAGATGTTACATAATCATATTA GACTACTGTTGTTTCACAAGTTTAGAGTTATAAATAAAACAGCTTCAATTAGTCTATTTT CCTGGATCATCTTTACAAGTAAATGGAGTCTCATACTGTGTACTTCAGTTCTTAACTTTC CTTGTCATCTCTACCTTCTATATATATGAGATAACAGCAACC
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>LITCHI002779.m1 + Up_Stream_Len 2000 TTTTTTCCTCTTCTTCTCCAGGATTCTCTAATCGCTTTATAGCGACAATTTTTTGACCGT CGGATATAGACCCTTTATAGACTGTTCCAAAGCTACCACTTCCCAATTTTTCCTTGAATC CATCTGTGGCTTCACAGAGCTCGTTATAAGAAAATGATTGAAGAGTGAATTCTTGTGTTA GACCCACATTTGAGTTTGCAGGAAGCTTTCTGTATTTATCAACTCGAAATTTGTATACAA GGAAGCTATATATTGCAATGAGGAAACACAAGAATGTTATAGAACCCAAACTTGCAGCAA GAATTGTGATAAGTTTTTTCTTGCTTTCACTCATTTCCCTTTCATGTTCAGGTACAATTG GACTAGAACCTCCTGGAATACTATCACTAGCATTTCTCAAACTCTTGACAAACACAGTAC CTGATTCATTTTCGTCTTTCATTGCGAACATGAGTGGAAGTTTGAGTTTACTGCAAGTTC CATTCGCATAAAAGGCGGCTCCGCAGTAACAGTCCTCTAGGCATGACTCGCTGCAAGCTT CCTTATTCAGTGACAGCAGAGCATAAGGCAATCCTCCCAACTTGGTATTCTCCAAAACAC GACATTGTAAAACAGACTTGGCACCTTTCTTTTACAACCTTGTTCGTCAATAAAGCTTCT TGAGCAGCCCAGGTATCTGTCATGTGGGTTGATAAAATCAAATCCAGGAAAGCAGAAACA ATCAGCTAAGGTGCTGGCATTAGCACAGAAACTATTAAACCCACAGAAACCATTCACTTT GCATTGGTTTTGCAAAGCAGACCAGCGGGTGATCACGTCAGAGCTACCATCAGTCCTGAA GCGATGCAAGTAGAGCCTAAAAATCCCATCAGCATCAAGTGTTGCTCGATGAATCACAGT CTCGTTCCTGACTGCATTGTAAGAGATATTTGCTATGCTAACTCTTGCAATCCCATTCGC TGTAGTTGACAGCAAAATGCCATCTGCAAGATTGCGATCGATTCCATCTGTAACTCTGAC TTTCCAGTAGAATTCTTCATCGACACCAGTGTGATTGGCAGGGTAGGCTACCAGCTCTCC CCATTGAGTGATCTGGATTCGAAATCGTCCGCTGTAGTGGTCAGATGTTGATCGACTTGA AGTCAATGCAGTCTTACCTGACAGGCTTTGGCCGCCTAACAAGGTGTCTGTTGGACGACT GAAGCTTTGCCAGATGACTTCAGAATCTTTGTCGTAGATTACGAAATTACCAGAATCCAA CATGGAAGCTGAAACACCATCAGATATTTCAGTAATGTTCTTCATCTCTTGATTTTGGCT TGTTTGAAGAATGAGCTGTCCATCCCATGTGAATTGAATAGTAGAATTTGAGGAGACTAA TGGGTCGCCTTGATTAGCAGTCCAGACCACGGTGATGTTGTCAGTGTTGGGTTGCCTTCC AACACTAACCAACCAAATTCCAACTGCAAATTCATTTCCTTCTGGATAGAAACCAAATGC AAAACGGCCTGAAGGGGAGAGCCAATAACTGTTGTTAGTGTTGGGTTGGAGTGAAGATCC TCTTCTTATCAATCTTGTGCTTTCTGGTTGAGCTATCAGTGTCATCAGTTGAGAAACCAC AAAAACTGATAACCACATGATAACTTGTGTAGAAGCCATCAGAGAGAGATTTTCAAGAAA TAAAAGTTCTCCACTTTATGAAGACACTCTCAGGAGCTTGATTTCCAAGTTATAACAATA TGATTCTTTTTTTTTTCAATGTTTTGCTTTTTACATGAAGTAGAATTTTTAGGAACTGTA ATTGGTCCCACAAAGTAGACTTATGTATCATTCAATATTTTTGAATTTAAACTCGTACGG AACAGTATGAATTATTGAAATTCATTGAATGAAACTATGGACGATATGAACCCACGTTTT GTTCAAGTTTTTCACCATCTTTAGTGAGAAACCTTAATAATTGAGGACAATACTATCAAA GATTTCTCTCATTTTCAGTC
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>LITCHI029151.m2 GenomeSequence + TGGATTCATAACCGAAACAAAGTCGCTAAAACCTCAAGAAAACACAGGTCAGCATCACCT TCGTCTCTCTCTGTTGCTCAAGCATCAGTACGAAAACCGTGATTAGAATCCATCCTGTGC GTTACCGTCCCTAATGCATACTTCATTCGCCGCTCGCGCCGCCGCCGCCGCCTCCGACGA CGACGAGGAGCAGGAGCCCTCCGAAGTCGCCGCTTCCGATAACGACAAAAAAATGGTACA AGGCGAAGAGGAAGTAGACGATTTGTCTGATTCACAAAACGATCATGACGGTCAGTTAAA AAAAAATCACTGTTATCGTTTCGATTACGGTTTCGAAGTTGGATTGACGTATAAATTACG TGTAAAGAGACTGTCGTTTGTATTCTTTGATTGATATAATACATGGTTTGTGCTGTGTAT AATCTAATGCTGGAAATGCTCATTTCTGTTTCTTGAAAGTTAATTGGATATGTTAGGGCT CGTATTTTTTATTGTGTTTATGTTGCTGGTTTGTGGATTTGTGGAGGAATTTGATATCTG GATAGAAATGTATGTTATGTGCAGATATGTTTGATAGTTGTTTGCTTTGGCTGCAAATTG TGTTGCTGGTAATTTGATGTGTATCAATGTGGCGGCAATTGTCTGCGATTTGGATTTGAT TGATTGTTGTTTTAGTTATTGCAGATGACTAATTTTTTTGAAATAAAATGAATTGAAAGT TGTTTGTTAGTTCATGCCATGTTGTAGCTGATGATTGGCTGTAGGAGTTTATGCGGAGCT TAGTTCACAGTGTACCATTTTAGGCGTTATATAATGGCTAGAAAACTTAATGTTTAGTGA AAATATGCATTTATATGTCTAGTACTGTAAGGAAGTGGTACCGAGAGTTAGTACAAAAGC 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