Search Result
On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
| GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
| LITCHI000081 | Chr5 | 2341249 | 2342183 | - | AP2/ERF and B3 domain-containing transcription factor RAV1 |
| Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
| LITCHI000081.m1 | 39 | 116 | PF02362.24 | B3 | Family | 38.9 | 6.70E-10 |
Download Copy
>LITCHI000081.m1 ATGATGTGGTCTTCCGTACTCGGGAAGAGGGAGAAGATCATGGTGTGGAGTGCAGAATTG AGGCCAACTGATATGCTTGTCGTATTTGGTCCCATCGTTGAGGATACTGACATTAACACT AGACTTACTGTCCCAAGCACCGCTCTGCAGCATTTTCAATTTCCGGAAGGCAATAACTTG AAGAATTTGCTGGCAGAGGACTCAACTGGGAGAGTGTGGACATTCCGTTGCTACATCAGG CAAAGAGACCACCCAAAACCGGTATTCACTTCCCGTACTTGGCGTCCATTTGTTGAAGCC AAACGCCTTCAAGTCGAAGACGAAGTGGTCTTGCGTACTCGGGAAGAGGGAGAAGACGGT GCCGAGTACCGAATAGAGGCCAACAGATACGCTTTTCGTTTGTTTGGTCAGTCTATTTGG GCTTCTGTGGAGCAATTTGAGGCGTAA
Download Copy
>LITCHI023466.m1 ATGGGATAGAGTTGTCTCGGGTCAAAACTGAGGCGCTTAGAATTATCAATTATTACAGAA AAGTTAGAAAAGGGAAAGCCAAAACAACCCAGCAAAGTTGCTTTGCGAACCACGTTTCTC TCTCTTCTCAAAATCCAGTATTTATGAGGCATTTGTTGCTCGTAGTGCTTTCGCTCATAA CAATTCTCTCAATCTCTTTTGGTTGCGATGGCTTCTCTGCTTTTCAACTCAATCCCTTCT TTTCTTCCTAACTTTCTGTAGCTTTTATAATCAGCTTTTCCTTTCATTCCTCACAATATC ATACTTTTAGGTGCTTTCAAACATTGAAGAAAAACAAGAGGTTATATAGAATATATTGTT TTAGAGGGGATGGCGAAAAACATATCTGGAGTTGGTAAGGAAGATGATCAGATGGATTTA CCTCCTGGGTTCCGATTCCATCCAACTGATGAAGAGCTTATCAGTCACTACTTGTGCAAG AAGGTCTTTGATGGGGCCTTTTCTGCTAGAGCTATTGGGGATGTGGATTTGAACAAGTCT GAGCCTTGGGAATTGCCATGGAAAGCGAAGATGGGAGAGAAAGAGTGGTATTTTTTCTGT ATGAGGGACAGGAAATACCCAACTGGTTTGAGGACTAACAGGGCCACTGTATCTGGGTAT TGGAAGGCCACAGGCAAAGATAAAGAGATTTACAAAGGAAAAGCTCTTGTTGGAATGAAG AAGACCCTTGTTTTCTACAAGGGAAGAGCCCCTAAAGGACAGAAAACCAACTGGGTCATG CACGAGTATCGCTTAGAGGGTAAATTCTCTGTCCATAACCTACCCAAAACTGCCAAGAAT GAATGGGTGATTTGCAGGGTGTTTCAGAAGAGCTCTGGTGGCAAGAAAACTCATATCTCA GGTCTACTTAGAGTTGGCTCTTTTGGTAATGAATTGGGTCCTTCTGGTCTACCCCCATTA ATGGATTCATCTCCTAACAATGGCAAGACCGCTAAATCCGTGGCCAATTCGGCTTACGTG CCCTGCTTCTCCAATCCTATTGATGTTCAACAAAGAAACCAACAAAACTCAATTGATGGT TGTTTCAACAATCCTCCCTTACCCAATGTTTTTCCAAGAATTCCACATACAAATACATAT GGTTCTCCTTTTAGTGTCCCAAGTGCCCCAAGTTTGCAACTGCCAAGTTCTGTTTTGTTG CAGGACCAATCACTTTTGAGGGCCTTACTAGAAAACCAAGGATCAAACATGAGCCAGGCT TTCAAAAGAGATAAGGAAATTATCAGTGTTTCTCAGGATTCGGGCCTTACAGTCATGTCT AATCTTGAAATGCTGAAGAGGCCATTTGATGATCAAGAGGGACCTTCCACTTCAGCAGGA CCAGTTGACTTTGATTGTTTCTGGAATTATTGAAATGAAAATTATATAGCAGCATAAGTA GATATGAAGTTGAAATCAACAGAAAGGCATTAGTTTCTATATTATTGATGTTGGTGTGGA TCTGTGTATACATTTTCTGAATCTAAATGAAGAATTGAAAGAAATTATAGAATATATTAT GTTATGTATATTGTAAGAAGTTTGTATCAACTTAGCTGTTTTTATTTTCTTAATGTCATT TTGGTTTGTTTTTTATATTGCGATGATTAGTTGATTATTGTGAAATTGCCTGGACACAAA ATTTGTCGGAATATGAGATTCAGTTGGTG
Download Copy
>LITCHI023466.m1 + Up_Stream_Len 2000 TAGCCCTATTATTTTAGTCTTTATAAATTTTAATAAATCACCTAACATTTGTAAGGCATA ATAGAATTACCAAGAACTTTCGCATTTAACTTTTATCTTTTCAAAAAGGCAAAAAGAAGA AATAATTAATTTAAGAAGTGGACAACCCATTATTTGATTTTCAAAACCATGAAGCAAAGG TCATATTTTGAAGTTTTGAGCATGAAAGTCAAGCAACGGTTTGCAAATTTTTTTCAATGC TTTCCTTCCCTTTTTTATCTTTCGATTTGTGTATTTTTGTTATCTACCCTTTGAAGGGAA GGTGGGTTAAGGGTATATTGGTATATTGACTTGAATAAAAAATTTTAGCTAAGTTTTGAA AGCTAGGATGTGAGCGTCTGTAATCTTCCACAATTTCACACAGCTGGTGTCTCTTATTAG GATAAAGGAGATTCGTTTTCGTAAAGCCCCTTCTCACTTCAAATAATCGATAACATCCCC CTTTAATTTTAATTTTTTTCTTTTTATTTTTTGTTCCCTTGTTATTGCAGTTTAGACAAT TCATGGTCATTCATTTAACATCTAAAAAATAATAATAATTCATACAAATAGCAAATACTG AATGATTTGGTTATTTCCTTTTGTGGATTATCTCTAAACTTATGTAGATATCCAATATTT TGTTTAATTTTTACCGTCAACCTTATATAATAGTTAATATATCAAAATATTAGAGTTTGA AATTAAAAATTGTGAATTGTAATTTTTTAACATATTAACTGCTAGATAAAGTTAGATAAA AAAGTTAGATAAAATATTTGATGTCAACCATTATATATGGGTGAAACTTGAGCTCCACCA CTAAACAAACGGGAAGGTGCATACCACTTAAGCAAATAAAAAATGTGTTGATGTCATTTC TTGTTAGTGGGATAAATCTAACAATAATAGATTTTGTCAAGAGCATAACACATTAATAAT TACTAATTAATTAATAAAGTCTCTTCAGTTTTTTTAAAAAATAATTACTAATTAATTAAT TAATTAATCAACAATTTTTGTAACAAAAATTGAGATGATTCTAGGGGCAGAGCTATGAAA TATTATTTGGATTGATAATTATAATTAAAAAAATCATATGAGGTGGGCCAAACTTTAAGA CTTGTAACAATTAAGGATACATTCAGCCTTTTTAATGAAATTTTAAAAGGCTTTCGTCTC GAGGAAAGGAGAAAACATGGCCCCTACCAATCTCTCCGCCTTTGTATTGGTAATTTTCTT GGCACCCGTTAAGTTAAATTCGTGATTATGTTGCCTTGTCACCTCAAAAATTCCAAATTA TACTAGAAAAAGTAGCTGACTATTGGCACCACCGGTAAACACCACAGCCTGTGTCTTGTG GTATGGGTTCTATACTAAGTAATAATATTTCTTTCATAAATTTATGTGGAAAAACCTTTT ATCCTCGTGTGGGTTACTTCCTTACCTCCGAGTAGGTCAATATCTCCGATATTAGAATAG CTCTCGAATCGTACTATCAATACTCATATTGATTAGTTTCGATAGTTTATTAAATCAGTT TTAATAATCAAATATATACTTGAAAAATTATATAAAATATAATATGACTATCATAGTTTA TGTGATTGGCAATGGGATAGAGTTGTCTCGGGTCAAAACTGAGGCGCTTAGAATTATCAA TTATTACAGAAAAGTTAGAAAAGGGAAAGCCAAAACAACCCAGCAAAGTTGCTTTGCGAA CCACGTTTCTCTCTCTTCTCAAAATCCAGTATTTATGAGGCATTTGTTGCTCGTAGTGCT TTCGCTCATAACAATTCTCTCAATCTCTTTTGGTTGCGATGGCTTCTCTGCTTTTCAACT CAATCCCTTCTTTTCTTCCTAACTTTCTGTAGCTTTTATAATCAGCTTTTCCTTTCATTC CTCACAATATCATACTTTTAGGTGCTTTCAAACATTGAAGAAAAACAAGAGGTTATATAG AATATATTGTTTTAGAGGGG
Download Copy
>LITCHI023185.m1 GenomeSequence + ATTGACTTGAATCACCACATAAATCAATACCGAACCCCCCTTGGTTTTTTAGTAATAATC CCAAAATTTCGGTCAAATTTTGGGAAGACAAAGAGGTTCATGTAATAACAATGGCATTTT TGTAATTTTAAGAGAAAAATCCATATTTTCATGCACCATCTTTGTCAAAGTGTTAGCTGT AATTATCAAGATAAAATAAGATAAACCACAGCTGCTTCTTCTTCAAGAGTACACACCATT AATATATGATCCTGATCTTGTTACAGGTTAGAGACGCTTGATATCTTTTAAGCTAGCATC GTCGGTACTTGGGTTCTGGAATCCAATTACTGCAGGGTTTGCAAGTAGAATTATTTCTGA GCTCTGGAAATGGAGGAAAACAATCTCCCTCCTGGGTTCAGATTCCATCCCACGGACGAA GAACTCATTACTTACTACCTGACGCGAAAAGTTTCCGATACTACTTTCACTTCTAAAGCA ATTGTAGATGTTGATCTCAACAAATGTGAACCTTGGGACCTCCCAGGTAGCTACTTTCTG TGTTTTCTTTTTCTTTTCTTTGGTCATGTTTTCTTGTGTTTGTTTTATCATTCTTATTAT TATTCAGTTTGCTAATTATTTCTGGATACATCTGGCTTGTCTTCTTATATAACTTTATGA TTTATGTAGTCACCTTCTGTTCATATATTTCATTCATGTTTATAAGAGTTCAGAGAGTTT TGTGTTCTCCAAAATCCATAAATTAATATTGTCATTTTATTGTAAGTTTAATTCTTGTAA GTTAGTAAGTTTAATTTCAGAAATCATATTTTTGATTTTTTTTCAAGTTTCAGAAATCAT ATTTTTTATTTTTTTTTTCAAATTTCAGAAATCATACTTTTGATGTTTTTTCTGTAATTT AGGTTTTTCATTGGTTTTATTAAAAACAATAAACTTTATGTGCTTTAAATATTACTTTTG TTTTTTTCGAAACAATACTTTAAATGTATTAAATATTAGTTACTAATGAAGATTGCTTTG TAAGAAAAATTTTCCCTCTCCATTGCCAAGCTTATAAGCAAACAATAAATATTAAAATTA AAAGTAAAAATTAATTAATAAATAATAAATACTATGGAAACCTAACATAAAAGTGATACC ATTATCAAATAATTTATTGGTTATATACATGGCTATATATAATTTACAAAGTTCTTGAAT CTATAGTTTAATTCTACCTATTTATATCTTTTGGACTAGTTAATAATAAAAATTAATGTA AATTAGGAATTATAAATAACTTTTATAGTTTGTGATGGATTTAACTACTATACAGAAACT ATACTGGATAGCTATAAAATATAACTGTTGTCACTTCTTCTGTTAAATTTTTTTATATTT TAATTTTTATACATGATTGGATTGCAATCCAATGACCATAAATCCATCATATATCTACAC CAAATAAGTATAAGAGCATGACCCATTAATGATATTTCTATGCAATCTACAAATGTCAAA AAGGTTTTCCCTTTTTGTTTCTTAATTTGTTTGGTGTACTAGACCCAAAAAGACTGACTG AGTCAAATATACAAATGGTGCAGGCAAGGCTTCAATGGGGGAGAAAGAATGGTACTTTTT TGCCTTGAGAGACCGAAAATACCCGACTGGACTTCGAACCAACCGAGCCACTGAAGCGGG CTATTGGAAAACAACAGGAAAGGACAAGGAGATCTTTAGAGGTGGAGTCCTTGTTGGGAT GAAGAAAACCCTAGTCTTTTACAAGGGTCGAGCTCCTAAGGGTGAGAAAAGCAACTGGGT AATGCATGAATACAGGCTTGAAAACAAGCATCCTTTCAAATCCACCAAGGTACATATATA TATATATATCAACATATTGTTGGTGTCACTCCTTATTCAAATATTTTTCTTCATTAAGAT ATCAAAACTTAATCGTTCCATACACCAACAAAGGTCATAAAAATAATATAGAACAGCTTG TTGATCATGCACCTAATTGCTGAGATGGATTTTGACTATCACTAGCATTGAAATTAAGTC ATTAGCACATACGAGTTTTATATGCATGAAACATAAAATTTCTGTTGTATTTGCTTAAAC TCTGTTGCAAAGCCACATTTTCACAGCGTGTCCGTACTAAACTCTATTCAATAAAAGTTG CAAATAAAAAGACAAGAATTGAGATTAATCTAATCAATTTGAACCGTATCCGATGTTTTA AAAAACTAAAGTTCAATTTTTAAAAAATTTAATTTATTATTATTATTGATTTTGTTTTAT TTTTTTACGTAGGAGGAATGGGTGGTTTGTAGGGTCTTCAGGAAGAGCTCATCAGCAGTT AAAAAACAACAGCAGACACCATCCTCTCAGCCATCTCTGGAATCTCCATGCGATACAAAC TCGATCGTCAATGAATTCGGGGACATCGATCAGTTACCAAATTTAAATAGCATAGCAAAT TTATCAAGCGCGTTCAGCAATAATATTCCGACACAAGGTTACACTGGTGCTGATAATAGT GTCAACATGAACATGAACATGAACTTGAATATGAACAATTGGACTGCGGCAAGGGAAGCA AGTACCCTTCAGACACTCTCATGGCCTTCTAACTTGCTAAGCCCGAATCTCTCGATGAAT TCCTTGCTTCTCAAGGCACTACAACTTAGAAATTATCAAGCTAGGGAAGCAACAAGTAGT GATAACTCGTTTCTTGCAGGACAAGGGTTAGGGTTTTCGCGGTTTGAAAGTGACTTAAAT TCAAATTTCATCCAAGCTCCTTCTTCTTCTAAGGTCTTAGATTCTGTGGCAGCGGCACAA TCACAACCGGAGCAACCATTTAATATGGACTCCATCTGGTGAAGCTGTAAAGTCTGAACT AACATGCATGTTGTATACATTCTGGATTGAACATATTACTGTAAGTGACTTAAACACTAT TGGGGTGGCTAAACTTTAGTTTGTAAAAGATTATCAAGCATAAATTCACATTAATAATAA TGCTGTAGCAAAATTGTTAAGATGTCGTTACTTAGATGTCAATTATTGTCTAGGGTTACG TGTTGATGTCTATGATCTTCAACCGTTCAGTTGTAGTTAATTATGTTGTTATGTATGTTC ATTTTCAATGTCAATTATGTACCATCTCAACATAGGAAAAACCTTTGTTGGGTCTGTCGA TTGTTATCAATGCATTATTTATTTGCTTTGCCCTCTCTCATTCTTAAATGAGTTATTCTG AGTGGAAAAGAAAAGGAAAAAAAAATTCTCAACCAATTGAAATTGATGGATACAGAAAAT TAATTAAGTGATGCTTTAATATTTATGTATTTAATTGATGGATTTTGCTATCTGTTATCT ATTGTTACTTAGCAGAAGTCTTTTCCTTAGTTTTTCTCTTAGAGAAACTTATGGTGTAAG TTAGTTTGGGTCCTACGGCCTAGTTTTACATTCCTCGTGAACTTGGTTTGGTTTTCTCTT CTTTTCAATATGTGCCACTACTTTGCATTGCAAAAGAGATAGGTCGATTCCTTGGATCTT TGGTTGAAACTTTCAAAGGAAATTGATGTTGATGCTACTATAAGAAGCAAGGA