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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000041 | Chr5 | 993647 | 994201 | + | B3 domain-containing transcription factor NGA4 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000041.m1 | 47 | 125 | PF02362.24 | B3 | Family | 42.6 | 4.70E-11 |
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>LITCHI000041.m1 ATGATGGGTTCGCACCTGGCTATAAATATGGGGTTCCTGATACAAATAATTCTCATCGTT GAAATTTTGAACGTTCTTGTAACCAAGCTAGTTAGTATGGCAATATTTTCAAGGACGCTT ACAAGAATTGATATTGAGAGAAGACTCACGATTCCAAGATACTGCGTTGAAGCATTCCCA CATGTTCGAAAAGGCCAGCCAGCAGAATTGAAAATCAAAGACCAAATGGGTAATATGTGG ACATTTCATTGCTCTCTTCCATCTTCTATCAAGCCAAGCCCTGTTTTCTGCTCAGGATGG CTTCAATTCGTTCGTAATAAAAATCTCCATGTTGGTGATACAATTATCATTCACAAGGGG GCAGATGATGCTACTGAAGCGCTCTACAACATTGAAATTAGAAAAACTCACGATTCTCAA TAA
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>LITCHI000041.m1 CCCCACCCGTCCCCCCAAATGATGGGTTCGCACCTGGCTATAAATATGGGGTTCCTGATA CAAATAATTCTCATCGTTGAAATTTTGAACGTTCTTGTAACCAAGCTAGTTAGTATGGCA ATATTTTCAAGGACGCTTACAAGAATTGATATTGAGAGAAGACTCACGATTCCAAGATAC TGCGTTGAAGCATTCCCACATGTTCGAAAAGGCCAGCCAGCAGAATTGAAAATCAAAGAC CAAATGGGTAATATGTGGACATTTCATTGCTCTCTTCCATCTTCTATCAAGCCAAGCCCT GTTTTCTGCTCAGGATGGCTTCAATTCGTTCGTAATAAAAATCTCCATGTTGGTGATACA ATTATCATTCACAAGGGGGCAGATGATGCTACTGAAGCGCTCTACAACATTGAAATTAGA AAAACTCACGATTCTCAATAATTTTTGTATGTTATTGCTCAAATGAGAAGATGGTGGTTT TTATTTTCACAATGGCAGTCAGTTTTGTTCAATTGCCCGTGTAGACTGTCCGCAGATGTT TTAATGCAGGCCGAC
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>LITCHI000041.m1 + Up_Stream_Len 2000 TATCTCAATAAAACATTTTAAATGATATATTTTTTTTATAATAATTTATTATATATTTTA AATAAATTAATTTATTATGAATGAAAATATTTTATATTGATAAATAGTGCAATACCAATT TTGGTGTTGCACTATTCATCAACACTAAATATTTACCTTGAAACTTATATTTTGGTGTAA ACATTGAAGATTAAAATTATATTAAATTGGTGTTTTTTACACCAATTTGATGCTCCATTG GAGTTGGTTTAACACCCTCGAGGCCACGCTTGAAGCCTTCGAAAAAAACAAAAAAAGCAA CGCTTGAAATCTAGCAATGGTGCGTGCAGCGTGGCTTCCACGGAACTGTCGGTATCATTT TCACCGTGATTCCACGTATCATTAGAATTCTCCATCTGTCACTATCAAATAATTGTTTCG GAAAAGCTGTCAGTGTCGACTTTTCTGTCAGCTTCGAATATAGTAATAGCAGCAACTTCG ACGCATTTAAAATTATTTTCATAATTAGTAATTGACAGAGATTATTAATATATGTTAATA TCAAAGAATTAAATAAATTTTAAAAATATTGAATAGAAAAAGAAAAATATCGATGCATAC CTTAAAAACACATGCTAAGATAAGAAAAATTAAATAAAAAATCATACTCAATTTTTTAAA CACAAATTGCATAGTGATATATTATAATATAAACACCAATTATTATTTGAAAATTTGATT GTTAATATGTTCTGTCTCCCTATATTTTAACATTACCCGTAAAAATAGTAAAAGATAAAT ATATATTATTAACACTACCTATATTAGGACATATGTTGGCATCAACTTCAATTTTGCCCA ATCATTCTCTTGTAGAATTTAGTAGTAGTGTCTATGCTTCATCAAGGCTGGCTATAAACA GTGGCAGCCTAAAATTCTATGTGAGAGGAGCAATTTCATATAATAATTATAACATAACAA AACTAAGTTATGTGAAATGTTCTTTATAATGCTTCCTTTAGTTGCTAGAAGGGCATTATA TAAAATAAAAATAGCTAAAACACATAATAGTAGGGGATATATAATTTTGCCTCTTATAAG ATTATAAACAAAATTTCAAAATGATATTCTTAATATAATATAAAATAAAAACATACTAAT TATGAGTTAATTGTCTACTAGCTTCATTTTTCTTAATGAGAGAAGTGAAAATTTCATATT ATTAAAAAAAAAATAAAAACTTAATTTAGGGATATATTTCCTTTATGATGATAGTTACTA TTCAGATTGCAAATAAATATATATAATCAAATTATATATATTTATTATTAAAATTACTAC TCAAGCTAAATTTATAACCTTTGATCTAATAAATATGTGTGATTTATAATAAAGTAAAGT AAAATAAAATAAAATAAGATAAAAACAATTATAATACGTGTGAGTTTTTTTTTATTTATA AATTTTATTATATAAAATAATTTGTATAAAAGAAAAATAATTCACACTAATAATCATGAG TAAATCAATACCTATTTAGATTAGACAACACTGTATGTTCTATTCTTTAGTTCATGTAAA TATGATATAATTTACAATAAAAAAATAATTCGAAATGATTATAATTTGTGAAGTTAAAAT GTTTTAAATTTGAAGATTAGTCTATAATAATGGAGAAAAAAAAAGAGAAAAAAGCAACAT GTTTGTATAGAGAAACAAATTGAACCGTACTGGGAAACAAATTAAGGTAAAGTAACATGT TTTGATAAGGAAAGGAATTAAACCATGGTGGATGGAAGAAAGAAAAACAAGATCCATGCC ATAACCAACCAAAAAAAAAAAAAATTATGAAGGATCGAATGGTGGTGGCATTTGGAGAAA AAGGCAAATTGCAACCATCAAACCCATTTTGTGGCCGTAAGAGGGTATGACATTATATTT ATATATTTAAATACTTAATGACTAATACAGTATTAAGTTTCAAAAAATTTCCCTGTGGTG CCCCCCACCCGTCCCCCCAA
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>LITCHI000041.m1 GenomeSequence + CCCCACCCGTCCCCCCAAATGATGGGTTCGCACCTGGCTATAAATATGGGGTTCCTGATA CAAATAATTCTCATCGTTGAAATTTTGAACGTTCTTGTAACCAAGCTAGTTAGTATGGCA ATATTTTCAAGGACGCTTACAAGAATTGATATTGAGAGAAGACTCACGATTCCAAGATAC TGCGTTGAAGCATTCCCACATGTTCGAAAAGGCCAGCCAGCAGAATTGAAAATCAAAGAC CAAATGGGTAATATGTGGACATTTCATTGCTCTCTTCCATCTTCTATCAAGCCAAGCCCT GTTTTCTGCTCAGGATGGCTTCAATTCGTTCGTAATAAAAATCTCCATGTTGGTGATACA ATTATCATTCACAAGGGGGCAGATGATGCTACTGAAGCGCTCTACAACATTGAAATTAGA AAAACTCACGATTCTCAATAATTTTTGTATGTTATTGCTCAAATGAGAAGATGGTGGTTT TTATTTTCACAATGGCAGTCAGTTTTGTTCAATTGCCCGTGTAGACTGTCCGCAGATGTT TTAATGCAGGCCGAC