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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000025 | Chr5 | 398294 | 401059 | + | B3 domain-containing transcription factor NGA3 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000025.m1 | 8 | 88 | PF02362.24 | B3 | Family | 53.2 | 2.30E-14 |
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>LITCHI000025.m1 + Up_Stream_Len 2000 TCTTCTCAAAAACAAAAGAAGATTAAAGTTCGACTATAAGCATCTAGAATATTTTATCAT GATGTGGGACCTCTGACATTATGGTTGGTAGAATTGCGCATTTTTTTTTTAATTTATTGC GGTTATCATAAAACATCTATTTAGTTGTTTTTATTACTCTCAATTGATTGACAAAAATAA TATATTTTTGGGGAAACATCATTGTAGTCCCTTAGGCCATCTCCAATGTATAACACCAAA TTTTACACCATTTTAGTGTTAACACCAAATTTTTTTACATCAAATTTTTTGACACTCCAA TATATTTGATACCAAATTGATGTAAATGGCATCTTCAAATTCAAAGAATATTCTATACAT AATCTTTTAATTAATATTATTAAAAATTTAAAAATACATTAAAATATATTCAATATTATA CTCATTTTAAAGATCTCGATAAAATATTTTAAATGATATATATTTTTTATATTAATTTAT TATATATTTTTAAATAAAACAATTTATTGTGAAACAAACTTTTGGTGTTGAATGAACAGT GCCGCACCAAATTTGGTACGGCACTGTTCATTCAACACCAAATTTCGCATAGGAGCTCGT GCCCCAGCACCAAATTGGTGCTGGGTTGGAGCTGTTTTCAGCACCAAAATGGTGTTTTAC ACCATTTTGGTGCTGGGTTGGAGAGGGCCTTAGGTTTTAAAAAATATCAAAATTTAAAAA CTCTTTTAAAAACAACTCATTTCATCCTAAACTTTTCCAAAATACTTCAAAAAAGTTCAA ATTGTCAGTCAATTGATGGTCAATGGTGACTTTAGACAATTTAAATTGTAATTGAATAAC TTAAATTTAGAAATATTTTAAAGAATTTGAGTTGTAAATTTATTATTTTATGAGGGTAAT TTGATAATTTTTATGCCACTAATAACCATCACAGGGAAAAATGTTTTTTTAACGCATTAT GTTAACGTTGACAGTTAGTTGATAGACAATTTAGACTTTTTTGAAGAATTTTGAAAAAAT TAGGAATGAAAAAAATTATTTCTAAAATAGCTTTAAAAGCTTAATATTTTTCGAAACCTC AAGGATTAAAATAAAATTTTTCCTATATCCGTTTACAAAGGCCATTGACTTGTTATGTAG CATAAGAATCTGACACGCATTCGGGCATCACATGGAAGGTTCGGATCTCATGATCGTGTA AATAACCATTCGTTATTTTTGTCCAAGCATCAAATAAGAGATTCGAATGAGTGTATGGAA AAAAAGTGATAGACACGGAATTCAAAAATAACTACCATGTATATATTTATTCATGATCGA GTAGACAGTGTTTTGTTTTTAACATTCAACTCATAACTCAACTGGGCAATACACAATTTA TCACATACATAATAAATGTCCAAGTCTATATTAAATACGGAAGTTTTCATACGTTAGAGT AGATTGTGGTATTCAATCTTGATAAGTAATGATGAACCCTTGACCATTTATATCAGAATA TATTTATTTATATATAAGACAATATTTTAGCACAAAAAGTTTATTACTGCTCTTTTTTTA TGGTCAAAATAAGTACCCTAAAATCTGTATCTTGAAAAGTAAATCTGAATTTTTAATTAT TTTTTTCAATTATTAATATCCATCTTAAGAATACATATATAAGTAAAACTTTATACAGTT ACATGTGGTTTTCACAAACATATCACTGAAAACAAAATGACATTCTATGACAATGATAAG ATTCCACATTGAGGTATAAATTTGTTAGTGACAAAAACATTTTATTGCCTTACGTGTTAC AAGTTATGAGATTTATTTTTTTTAAAAAAAAAAAAACCTTTAGATAGGGTAAACAATTAC ATATTAAATCATGGTCACGCGGTTGTTGGTGCTTGTATAGAATATAGTACTTGAGATCTC TGTATATGCAACGCTCTGGCTGAGATGGTAGATACAAACTTGTCATTCGAAAGAGAAAGT TGTAAAACCTAGTAAAAGCT
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>LITCHI000025.m1 GenomeSequence + ATGGCCATATTTTCAAGGATGCTAACAAGACCTGATATTGAGAAAAGATTGACGGTTCCC AGATATTGTGTATCAGAATTCCCAGTACCATCCGAAGGAGGCCAAGCCACAGAATTCAAG TTGAAAGATGAGAAGGGAAATGTATGGACTTTCAATTGCTCTTTTCAGTCAGTCAGCCCC AGACTTGTTATTTCTTCAGGCTGGCTCCAGTTTGTTCGTAGTAAAGAACTGAATGTTGGC GATACAGTCTACTTTCACAAAGAGGTAGAACAGGAGGCAACAGAAGTACCGTACAAAATT GAAATTAGGAAAGATAATAACATTCACATACATGCGCGCATTTGTTAGGTGAATCAAAAT GAGTGTTAGCTAACTTCGTCCGGCAACCGTTATATATATATATATATTTTTTTTTTTTCA ATGAATGGGATCAATCTAAGATACAATAGAGACTAACAACAATACACATTGTAGTGCCGT CTAGAAATTAACTCCCAGAAAATGAAGGGCCAACATACACAAGTAAGGGAAGAAACTTAC ATATTAGCGAGGATTGCATTTAAACCCATGACCTTGAAGCTACATGGATGGAGATGGTTT TTTATTGCTACACCAACTCCACTTTGCTTCGTTTTATAGTTGTTATACACAATAAACTTC GGGTTGGGTTCGAGTTTAGCACACAATAAAATAATGAGTTTTATTTACATTTGTGTAACA TTTGTCTTTTAAAAAAACATAAAATAAAATATTTTTGCTTTTTCAAGAAAAAATGGATGT TATATATGAGTGTTCCATCATTATTTTAATTATTATTATTATTATTATTTTTCATACATC ATTTAATTATGTGTTCAATGTGCTTAAATAATTTTCTATTATTGTTATTTTCAAAAGATA TTAAAGACATGGCCCTCAAGTTTAATGATGTCTTACATTTGTAGTAAATTGTCACTTACA TGTACAATTTTACATTTATACTTCATATCATTTACATTTACATACGTGACAAGTCCACTC CTAGAATCATATCAAAGCACGGAGGACTGAGAAGGATAGGAATTAATAATACTTTCCTCA TCCTACACAAATCATAAAAAAATGACACTTATACAATGTTCGATTATGTATGTCATGAAG AAACTGCATGTGTGATAGTTTTATGTCTATTTTATAATTTCTAGTTTCGATGGGTATTGT TGTAATATAGAAAACATCCTAATAGAAAATGCGTTACTAAGAGAGCTATCAGTTTCAGAT GACAAAAAGTGAAAAAATGTGTCTACCAAGTGTAAAGATAAAAGAAACCTTAAAATAAAG AGAATGTTTAAGGTAGGGAGATTGAAATTTAGAGGGGATAGAAAGCTAGTGTGGCAAAAG GTTTGCTATTATTACATCTACGTATGTCAGTGAATCATGTAAAATTGCTTGTGTTGTATT GTGATTTGTCTTTTAGTTCTTAGCTTGATTGTGTTTTTTTTGCCTTGTATTACCTATTGT TCTTGTAAGTTCATCCATTATTTGGTTCATCAAATCTTCTCTTAAACAAGAGCATAGCAA GAATCCAATCATCATTATTGACACTTAGTATGATCTATTATCAAGCTCTTTAAAGTTGCA AACCATGAGAGTGAAGATACAAATTTCACACATTCTCTGAGCTCGATAAGCTACAACGTT CATATTACTGAAATATCTTTAAATCATGATATGACCTTTTATACCCTTCTAGAATAGCTT TCAAATGTATTTGGTTGAAACATTTCAAATCATAACCTATATATTATATATATATATATA TACATTCTTTATATACAATTTAACAATTTACTATATATGTGACTTATTTTTTCAGTTATA GTTACCTAAACTTTAGTTGTTAAAAATAAATTAACTAATAAAAATTAAATGAAAATTATA AATTCATTTATGCATAATAATTCGTACAAATTATGTCAATAATTTTACATAACATTGTAA TGATAAAAAAATATTTTATCTAAACATTGATTCTCTTGCAATTGGTTTATATGAGGAGGC ATTGGATTATATGAGGTTAAACAAGCACCACATCAAATACAAGCATGTAAAGCTTTTATG ATCTTTTAAATACCATTATCTGAATTATTTAGAGCTGGTTCAATTATACAAACAGTTGAT CCTTTCTGCTCTCATGACACCTGACATGCTAAGGGTGGGAAGAAAGATTGGTTGATGATA ATCTGAAAGACTGAAACTAATAATTTCTGTTGTTTTGAGTTTCAAAAGATAAAGTGTAAA GATTCTAGGTAGAGTTCTGTTCTTTTCCTATGTTTCCCAAAACAATAACTGTACCAAGAC AATAGAGAAAATTTATAGTAAATCTAATTCAAAGAGCTGTTAAATCAATCTACAAAATTT TGGATGAATGATAATCAATAAAAATTACAAACTTACAACAACTCTGCCAATGGATATAGA GATCCTGTAAGCCATTGATGCTGTGTTGTTGATAACTCACAGAAAGGTAGCTGAAATTGA GCATCAATTCAGTTTCATTTTATTCAGAAGATGCACAAAGCAGTAACTCTGTTATGGATT TTGAGTGTAATAATTAGGCTAATAGAGTTGCCCGAGCTGAAAGAAAGATGCATGACAAAA ATCTCAAGTCATCAAATTTGTACAAGAATATCATCCTTTAAGCCATTCCCGGAAATAGGA CTGCATCTTGTCTCATTTAGCGGCATTCCAGACATTGACGGTAGGAATTATCTTGTCAGG CCTTAA