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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
LITCHI000001 | Chr5 | 4288 | 4820 | + | Putative AP2/ERF and B3 domain-containing protein Os01g0140700 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
LITCHI000001.m1 | 6 | 88 | PF02362.24 | B3 | Family | 42.9 | 3.80E-11 |
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>LITCHI000001.m1 ATGGAGATCTTCTCTAAATTACTAACATCCACTGATGTTACTGATGGACTATTGATCCCA AAGGGGGCTCGGGCGCTGTTGCATATTCCGATACCAAATGGAGGTAGACACTACTGCAAG GCTTTGGCTGTTAATGACTCGATTGGTAAATTGTGGAAGTTCTACTTCTCCACTAATGGA TTTGTTTTCACTAAAGGATGGTTTGAATTTGTTCAAGAGAAAGGTGTTAGAGAAGGTGAT AAAGTCATCTTCTCAGAGAACCAAGATGGAGCTAGTGGAGCAATACAATATAGCATTGTG GTGATGCGATCTCCTTTCACTTTCCAAAATGAGCCTATTTATATGGATGTGGAAGAACTG CCAAGAGAAAGATTGCCGATCCCTACTTTTGAGATTAATTTCTTCAAATAA
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>LITCHI016970.m1 MEEVCLNSEPVFDEGDDYEVDGHSSMEHDDQASESHLKKEPPQPTVGLEFDSFDEAYDFY NVYAKERGFGIRVSNSWFRSKRKERYRAKLSCSSAGFKKKSEANNPRPETRTGCPAMIVM RLMDSKRWRIVEVELEHNHPVSPQVKRFYKSHKKMILAARKAQPLPQPVTEIHTIKLYRT AVVDVGCNGCVNVDVREGLNSTDHSKHLELKEGDAHAVYNYFCRMKLTNPNFFYLMDLDD DGHLRNVFWADARSRAACDFFCDTVAIDSTCLANKYEIPLISFVGVNHHGQHILLGCGFI GHESVESFVWIFRAWLNCMSTPPPLVIITDQCKALQSAVSEVFPKARHCYCMWYIMQRVP EKLGGLKGYETIKSLLNKAVYNSLKIAEFEMAWADMIKQHGLGDNKWLQMLYEDRQRWVP VYLKDTFFAGMIPVKEKESLNAFFNGYVHKHTSFKEFVDKYDLALHRKHLKEAMADLESR VPCFELKTRCNFELQLSKLYTKEIFERFQSEVEGMYSCFNTRQVSANGPIITYIVKERVE VEGNEKEIRNFEVLYETSQVDIRCICSLFNYKGYLCRHALNVLNYNGVEEIPSRYILPRW NKDFKCRYLLNHGFNNIDVYNPIYWYNHLYRRAIPIVEEGAQSEDHYRVALHELEELLNR FNIVDDNLM. >LITCHI016970.m2 MEEVCLNSEPVFDEGDDYEVDGHSSMEHDDQASESHLKKEPPQPTVGLEFDSFDEAYDFY NVYAKERGFGIRVSNSWFRSKRKERYRAKLSCSSAGFKKKSEANNPRPETRTGCPAMIVM RLMDSKRWRIVEVELEHNHPVSPQVKRFYKSHKKMILAARKAQPLPQPVTEIHTIKLYRT AVVDVGCNGCVNVDVREGLNSTDHSKHLELKEGDAHAVYNYFCRMKLTNPNFFYLMDLDD DGHLRNVFWADARSRAACDFFCDTVAIDSTCLANKYEIPLISFVGVNHHGQHILLGCGFI GHESVESFVWIFRAWLNCMSTPPPLVIITDQCKALQSAVSEVFPKARHCYCMWYIMQRVP EKLGGLKGYETIKSLLNKAVYNSLKIAEFEMAWADMIKQHGLGDNKWLQMLYEDRQRWVP VYLKDTFFAGMIPVKEKESLNAFFNGYVHKHTSFKEFVDKYDLALHRKHLKEAMADLESR VPCFELKTRCNFELQLSKLYTKEIFERFQSEVEGMYSCFNTRQVSANGPIITYIVKERVE VEGNEKEIRNFEVLYETSQVDIRCICSLFNYKGYLCRHALNVLNYNGVEEIPSRYILPRW NKDFKCRYLLNHGFNNIDVYNPIYWYNHLYRRAIPIVEEGAQSEDHYRVALHELEELLNR FNIVDDNLM.
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>LITCHI016970.m1 TGTCACTAAACACAAACCACACGTGTCAGCTCACCAGGTCGAAGGATCTATGAAACCTCT GTAAGCCCCAGTGTGACTTGCACTTTCCTTCAAGCGCCAACTCGGAGCACTGACTCAGTC CCAACCGATTCTCGTCTCCTTCTCCGATTCCAACCTCCGCTCAGTAATTCCCACTTTGGT GGATGATGTTCTCATGTGGGTGTATTTGGAAGCTGGTTGGAGATAGCATTTTGTTGGATT AGAGGGGTGTCTTGAAGCTTGTTGGATTGGTTAAACTATGCTAACTTTTTTAAGTGTTTG ATTTGGTGAAAGTTCTTCAAAAGTGAGGCATGATGAAGAAGGGTGATAAAATTTGATGTG AAGATGGAAGAAGTTTGTCTTAATAGTGAGCCAGTGTTTGATGAAGGTGATGATTATGAG GTTGATGGACACTCTAGTATGGAACATGATGATCAAGCCAGCGAAAGTCATTTGAAGAAG GAACCTCCCCAACCTACTGTTGGTTTGGAATTTGATTCTTTTGATGAAGCTTATGATTTT TATAATGTTTATGCCAAGGAACGGGGTTTTGGAATCAGAGTAAGTAATTCATGGTTTAGA TCAAAGAGAAAAGAACGGTACAGAGCAAAACTTAGCTGCAGCAGTGCTGGTTTCAAGAAA AAGAGTGAAGCCAACAATCCCAGGCCAGAGACAAGAACTGGATGCCCTGCCATGATAGTG ATGAGGCTCATGGACTCTAAAAGGTGGAGAATAGTTGAAGTTGAGCTTGAACACAACCAT CCTGTGAGTCCACAAGTAAAACGGTTCTACAAGTCCCATAAAAAAATGATCCTTGCAGCA AGAAAAGCACAGCCGCTGCCACAGCCTGTTACTGAAATACATACAATTAAGTTGTATCGA ACAGCTGTAGTGGATGTTGGGTGTAACGGATGTGTAAATGTTGATGTGAGAGAGGGTTTG 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