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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Acyan08G0024500 | chr08 | 2107754 | 2121264 | + | "Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g13270 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Acyan08G0024500.1 | 136 | 237 | PF02362.24 | B3 | Family | 73.8 | 9.00E-21 |
Acyan08G0024500.1 | 262 | 344 | PF06507.16 | Auxin_resp | Family | 117 | 3.60E-34 |
Acyan08G0024500.1 | 627 | 720 | PF02309.19 | AUX_IAA | Family | 35.6 | 9.60E-09 |
Acyan08G0024500.1 | 862 | 888 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 13.8 | 0.056 |
Acyan08G0024500.1 | 891 | 920 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 12.7 | 0.13 |
Acyan08G0024500.1 | 967 | 988 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 10.7 | 0.55 |
Acyan08G0024500.1 | 988 | 1036 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 33.9 | 3.00E-08 |
Acyan08G0024500.1 | 991 | 1021 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 20.3 | 0.00048 |
Acyan08G0024500.1 | 1092 | 1120 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 22.8 | 7.70E-05 |
Acyan08G0024500.1 | 1190 | 1238 | PF13041.9 | PPR_2 | Repeat | 45.4 | 7.50E-12 |
Acyan08G0024500.1 | 1190 | 1237 | PF13812.9 | PPR_3 | Repeat | 29.2 | 7.90E-07 |
Acyan08G0024500.1 | 1193 | 1223 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 26.6 | 4.60E-06 |
Acyan08G0024500.1 | 1265 | 1289 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 25.5 | 1.00E-05 |
Acyan08G0024500.1 | 1308 | 1369 | PF20431.1 | E_motif | Repeat | 56.5 | 2.70E-15 |
Acyan08G0024500.1 | 1332 | 1359 | PF01535.23 | PPR | Repeat | 10 | 0.97 |
Acyan08G0024500.1 | 1375 | 1397 | PF20430.1 | Eplus_motif | Motif | 24.4 | 2.00E-05 |
Acyan08G0024500.1 | 1422 | 1497 | PF14432.9 | DYW_deaminase | Domain | 102 | 1.20E-29 |
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>Acyan08G0024500.1 ATGGAGAGAGACGTCGTCGACGTCGTAGACGACGGAGATGATTCATCGGGAGGAGAAGGA GTCGGAGGAGGAGGAGACTCGTTGTATAAGGAGCTGTGGCGCGCGTGCGCGGGTCCACTG GTGACGGTGCCGCGTATCGGAGACATTGTGTACTACTTTCCTCAAGGACACATCGAGCAG GTCGAAGCGTCGATGAATCAAGGGTCTGATCAGCAAATGCCGGCTTATGATCTTCCGGAC AAGATACTTTGTAAAGTCGTCAATGTTCTGTTGAAGGCTGAACAAGACACCGACGAAGTG TTTGCTCAAGTCACTTTGCATCCGTTAAACAAACAAGAGGAGGTGTCGATGTTGAAGGAG AAGAAGGCGGCGTGTCCACCGACCCCGCGTCGTCGGGTGTATTCCTTCTGCAAGACTTTA ACAGCGTCAGATACGAGCACTCACGGTGGATTTTCGGTGTTGAGACGACACGCTGAGGAA TGCTTGCCTCCTCTGGACATGTCCAAGCAACCTCCAACTCAGGAATTAGTGACCAAAGAC TTGCACGGAAATGAGTGGTGTTTCCGCCACATCTTTCGTGGTCAACCAAGGAGGCACCTT CTTCAGAGTGGCTGGAGTCTTTTCGTCAGCTCCAAGAAGCTTGTTGCAGGAGATGCTTTT ATTTTCCTCAGGGGTGAAAATGGGAAACTTCGTGTTGGGGTAAGGCGTGCTATGAGGCAG CCAAGTACTGTTTCATCTTCAGTCATATCAAGCCATAGTATGCATATTGGTGTTCTTGCG ACAGCCTGGCATGCAGTTGCAACGGGAACATTGTTCACTATCTATTACAAACCAAGGACA AGCCCTGCTGAGTTTATGGTTCCTTATGAAAAATATAAAGAGGCTGAGAAGAACAACTAT ACCGTAGGGATGCGTTTCAAAATGAGGTTTGAAGGTGAAGAGTCTCCAGAACAGAGATAC GCGGGCACCGTTGTTGGAGTTGAAGAAGCTGATTCAAACAAGTGGCCTGGTTCTAAGTGG AGGTGTCTCAAGGTGCGATGGGATGAAATTTCTCCTCATCATCGTCCGGAGAGAGTTTCC CCATGGGAAGCGGAATTTTCTGTGATTCCTGCGCCAGATTCCCTTACATCATCTAGACTG AAAAGGCCTCGTCTGAATATGGTGTCATTATCTACTGGTTCCTCCTCTGTTCTCTCAAAA GAAGGTCCTCGGAACATGCAAGAGTCCTGCAGATTATCTGAGCCCTTTGTCGAGCAGAAT CCCGAAGATGCTGACCAAACAAAGAGGGGTGATGCAAACCAGGAAAACATATTCAAGTTG ATTCCAGAGTCCAGGATGCATTTGAATCCCCACAATATGATGGTAGAGTCCGGCATGGAG CTTCATGCAGAAGATAAAGAAATGCAATGCCAGAATTCTGTAAATATCCAGTCTGCTGCA GTAAGAGGGTACGAAAGACCTCATTGTCCTGAATTCAAGCATCAGGAAAGAAACTGGTTG TTGCCTTCATTGTCATTGTCGCATGCTGAAAAATCCTCACGACCAATGGAGTCAGACGCC CAACCTCCGGCCAGGAAAGAACAGGAGGTGGTGAAATCTAAAGCAGTAGTTGGTAGTTGC AAACTTTTTGGTATCTCCCTCGTGACTAATTATGTGGCAACTGAACCAGCCACGCCACAT ACGAATTCTGTGTATGGATCACAACGGCAACACAATTTTGGATCAGACCATGTGCAAGAT TTGAATTATGACATACTTGCTGAGCAATTGAAGTGTACAAAGTCAGCCGAGACTGCAATC GGGGGTGATAAACTGGGTGAACCTTTTCAAGCTTCAGATCAGCTTGCTAGAGATGTTGTG GGCAAGCACCTGGGTGGTTCAACGAGAAGTTGCATTAAGGTTCACAAGCAGGGAATTGCT TTGGGGAGATCATTGGATCTGAGCAAGTTTAATGGCTATGATGAATTGTTTGCAGAGCTG GATTGCATTTTTGAATTTAACGGTGAATTAATTGCTTCCAACAAAGAGTGGTTGATTGTT TTTACAGACGACGAAGGTGATATGATGCTAGTAGGAGATGATCCCTGGCTGGAATTCTGT AGCATGGTCCGCAGGATCTTCATTTACACTCGAGAGGAGGTAAAGCAGATGATCCCACGA CCCTTGAATCCGAAAATCAAGAAAACTCTGCTCATGCACCATCTGGTTCTATCACCATCG AATCCTCTTCCTCCTCGACTAGCAGCAGCAGCAGCTACTACAAATAGTAAGTCTGCTAAC TTCTCTCAAATCCCTTCATGGGTTTCTCTCAAACGCACTTCTTCTTCTTCGGTGAAAACA ACTCCACCGCTGCAACAAGGCAGAGTGGAGAATCTCCACTTGGTTTCTCTGTCAAAACAA GCGAAACTCAAAGAAGCACGCGTCTTTCTCGAGCAAATGGACGAGGCTGGCGTTTACGTC ACCCCGCATTCGTACGAGTCCCTACTCGAAACGTGTCGGAATATGAGATCTTTATCGGAC GGAAGATACATTCACGATAGAATGCGAAGAAGAACGGTGAAGAACCCATCTGGGTTTCTC GAGAATTGCGTGCTGAGAATGTATTGTGATTGCGGCAGCTTGGTCGATGCACAGACGATG TTCGATGAAATGGCTGAGAGAAATTTGGGTTCTTGGGCTGTGATCATGTCTGCTTATGCG GAGGCTGGATTTTTGGATCAATCTTTTCGGTTATTATCGGATATGCTTGGACTTGGAATC GAACCGACTTCAATGATATATACTAGCCTTTTGAAGTATTTGGTGAATCCTTCTCTTGTA GAGATTGGTAGACAGTTGCATTCTCGTGTTATAAGAAGTGGGTTGAGTTCAAATGTTGCT 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TTGGGGAGATCATTGGATCTGAGCAAGTTTAATGGCTATGATGAATTGTTTGCAGAGCTG GATTGCATTTTTGAATTTAACGGTGAATTAATTGCTTCCAACAAAGAGTGGTTGATTGTT TTTACAGACGACGAAGGTGATATGATGCTAGTAGGAGATGATCCCTGGCTGGAATTCTGT AGCATGGTCCGCAGGATCTTCATTTACACTCGAGAGGAGGTAAAGCAGATGATCCCACGA CCCTTGAATCCGAAAATCAAGAAAACTCTGCTCATGCACCATCTGGTTCTATCACCATCG AATCCTCTTCCTCCTCGACTAGCAGCAGCAGCAGCTACTACAAATAGTAAGTCTGCTAAC TTCTCTCAAATCCCTTCATGGGTTTCTCTCAAACGCACTTCTTCTTCTTCGGTGAAAACA ACTCCACCGCTGCAACAAGGCAGAGTGGAGAATCTCCACTTGGTTTCTCTGTCAAAACAA GCGAAACTCAAAGAAGCACGCGTCTTTCTCGAGCAAATGGACGAGGCTGGCGTTTACGTC ACCCCGCATTCGTACGAGTCCCTACTCGAAACGTGTCGGAATATGAGATCTTTATCGGAC GGAAGATACATTCACGATAGAATGCGAAGAAGAACGGTGAAGAACCCATCTGGGTTTCTC GAGAATTGCGTGCTGAGAATGTATTGTGATTGCGGCAGCTTGGTCGATGCACAGACGATG TTCGATGAAATGGCTGAGAGAAATTTGGGTTCTTGGGCTGTGATCATGTCTGCTTATGCG GAGGCTGGATTTTTGGATCAATCTTTTCGGTTATTATCGGATATGCTTGGACTTGGAATC GAACCGACTTCAATGATATATACTAGCCTTTTGAAGTATTTGGTGAATCCTTCTCTTGTA GAGATTGGTAGACAGTTGCATTCTCGTGTTATAAGAAGTGGGTTGAGTTCAAATGTTGCT 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