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On this page, GENE INFORMATION displays basic Information about the Gene ID being queried, including the chromosome location, starting and ending locations, plus or minus chain Information, and swissprot functional annotations. In addition, the CDS sequence, protein sequence and promoter sequence of the gene are also shown, and download links are provided.
GeneID | Chromosome | Start | End | strand | Descript |
Acyan08G0006500 | chr08 | 493428 | 498868 | + | Putative RING-type E3 ubiquitin transferase C3H69 |
Gene ID | Start | End | Accession | Domain | Type | Bit Score | E-value |
Acyan08G0006500.1 | 6 | 26 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 25.5 | 8.50E-06 |
Acyan08G0006500.1 | 6 | 25 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 14.6 | 0.042 |
Acyan08G0006500.1 | 34 | 53 | PF18044.4 | zf-CCCH_4 | Domain | 32 | 7.90E-08 |
Acyan08G0006500.1 | 34 | 54 | PF00642.27 | zf-CCCH | Family | 24.2 | 2.60E-05 |
Acyan08G0006500.1 | 34 | 53 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 13 | 0.13 |
Acyan08G0006500.1 | 200 | 259 | PF13639.9 | zf-RING_2 | Domain | 30 | 5.40E-07 |
Acyan08G0006500.1 | 201 | 258 | PF00097.28 | zf-C3HC4 | Domain | 31.6 | 1.20E-07 |
Acyan08G0006500.1 | 293 | 315 | PF14608.9 | zf-CCCH_2 | Domain | 19.1 | 0.0016 |
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>Acyan08G0006500.1 ATGGCTAAAAGGGTCCTCTGCAAGTTCTTTGCTCATGGAGCATGCCTAAAAGGCGAGCAT TGCGAGTTTTCTCATGACTGGAAGGATCCGCCAAATAATATATGCACTTACTATCAGAAA GGAGTCTGCTCTTATGGTAGCCGATGCAGATATGAACATGTCAAACCTTCTCGACCTGAG TCATCCGCTTCATCCTCCTCAACAGTTTCACTTCCTCCAACAGCTGAATCGAGTGTTGGG GTAACTACAGTTCCTGGTGTGCTACCGGAGCTTTCTGCTTTGAGTAGACCTTATCTTCCT CCCAATAATCCAGCATGGAATTTGGAGTCTGGAGACTCTGGACATGATGATTCTTTAGAG GATAGCGATTTTGGGGAGCTTAGGGATCTTAAACCAGCTGATCGTCCTATCTGTTCCTTT GCTGCTGCTGGTAATTGCCCCCGTGGAGGAAAATGTCCTCATGTTCATGGAGAGTTGTGT CCTACTTGTGGGAAACATTGCTTGCATCCTTTCAAACCTGAAGAAAGAGAAGAGCATATT AAAACATGTGAGAAAAAGCAAAAGCACCTTGAGTCTTTAAGACGCAGCCAAGAAATAGAA TGTAGTGTGTGCTTGGATCGTGTATTATCAAAGCCCACAGCAGCTGAACGAAAGTTTGGG TTGCTTTCAGAATGTGATCATCCATTCTGTATATCCTGTATCAGGAACTGGCGTAATAGT TCCGGTACCTCTGGAGTGGATGTCAATACTGCATTGAGGACTTGTCCAATTTGCCGTAAG CTATCATACTTTGTCATTCCAAGTGTCATTTGGTATTATACACCAGAAGAGAAAATGGAA ATTGTTGATAGCTACAAGGGGAAACTCAGGTCAATCGATTGCAAGCACTTCAACTTTGGT AATGGGAACTGCCCATTTGGAACTAGCTGCTTTTACAAGCATGCATACAGAGATGGTCGT TTGGAGGAGGTAGTTCTGCGTCACCTTGGCGCTGAAGATGGAGACACTGTGATAGCTAAA GATATCAGGTTGTCGGACTTTCTTAGTAATATGAACTTAAGGTGA
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>Acyan08G0006500.1 + Up_Stream_Len 2000 ACCCAACTGTCTTAAAAGACTCATGAACATGCCTCAACATCTCTTCATCGCGAGTCCACT CCGGCGCCGGCGCGTTAACGAAATGCGCGTAAAGCTTGTTATTAGCGCAAGTAACAGTAA TCAAACTATGTGCCCCGACACCATCAATCTCGTACTCATAATAAAGCTGTCCCTTGTCGT CCTTCTTTTCTTCAGACGCCACATTGTCAGCGCTCGCTATCAGGTCCTGTAAATCCACGT CACTCAGGGCCAGGTTGTTCAAAATCACATCTTTTGGTGCCAGTTGCCGGAACCCAGATA GAAAAGTCAAGTACTCCTTCTCGGTCCTCTTCTTCGGGTTGTAGAACTCGCTATCGGTCC CGTTAGTTCCCTTCTCGACCTTCGAGACCAACCGCTCTTTCCACCCGTCAGGGACGTCGT AGACGTACTCGGCGGAGGCTTTCTTGTCGGAGTTTCCACCGTACCCACCGTAGTTCGCGG CGCTGGCGGCGGTGCCGTAGTAGATGTTGTAGGTGTCCGCCGCCAAGGAGGAAGGAGGAG ATGAAGTCAGGAGGGTGGTGGCTGCTAAGGTGGTTGTTATGAGGGCGGTGAGAGATGGAG GCTTGGTGGCGGGAAAGAGTGGTGGGTGTGGTTGTTTTTGTGAGGTTTTGGTGGTGGTGG TGGTGGTGGTTGTGGAGGAGGAGAGGATTGGTGACGGCGAGAATATGGTGGCCATTGGAT TTGGCTAAGTGGATTTGGTTTTTTATTTTTGCGATTTATTTATTGGTGAACTGGTGATAT GAAAGGAAGATTTTCCTTATCCAATGTTTTGGAGGGAAAAAGTTGTTCGGCCAATAGAAA CCCGCCATGTCATCATACCATGGAAAACCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATACCATC AAAAACTCTTTTATATATTTTTACTTGCATTAAAAACTTTATTAGATTATTAATTTATGA GGAAAATTTTGGAGAAAATCTTCGATACATGGACCAATGATTTGTTGTGATCAAATAATC ATTCCACATTATGTGATTTTAATACACGAAATTTTTAAACTTCAAAAAAAAAAAGACGTA AAACTTATCAAAACAAAAATCGATTACGGGAGTTTGTTTGGCTTTTTATTTTCTTTTTTT TGGTTATGGATCCATAATATCTTGTATCGTTAACGATTGTCCTTGTGTTAGGACATTTTG TATATGGTAAAACATTAAATTTATATTAGTGTATATAAAATTTATTTATTTTTCATGTAA ATAAATTAACTTTTAAGGTTGTATGAATCTAGTTATAATACAATAATTATATAATTGTTT AAGTGAAAATTAGACATTAAATTTTAATGAAAGGCACGTAAAAATCAAAGTTTTATAAAA TAAAAATAAATAAATAAAATATTTACTTTTAATAACTAATTAAGTAATATTGATGTTAAC ATCGGTTTATAGCGAAAGCCAAGGTTATATAATAATAATTATAATCATATATTTAACCAA TTATTTTATTTTTAATAATATCTATTAATTCATGAATAGGGATTTTTTTTGAAAATTTAA CCAACTATTTATTCTCGCAAATAATATGTGATTCATGCTATTGAACATCAACATGAAACA TGTGTGATTATTGAATAATGAATTTATTATATTTCCTTAAAAAATACAAAATTTGAATGA TTTTAAATTGAATAACAATCACAATTTAATAGATTTATGATTTAAATAAGTCCACAAAAT TGTGCAAAATTGCACTAAATTCGGGGGTAGGGGTATTGATGTAATTTCAAGTCCAAAACA AGATATAGACCGCCAAAAACCCTACCTCCTCTTCGTGTTTTCTTACATAAAATTGAATTT CACGTGCCTCCTTTATTTTCGCTGCGTCTCTCCCTCCCTCGCTCTCTTTAGATTCTCGTT AAATCAATCAAATTACAAGCTCTCTAGGGTTTCAATTTATTCTTTTGTTGCAAGCAAAGG ACAAAGCCAAGAATCCTCTC
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>Acyan08G0006500.1 GenomeSequence + GCCAAAAACCCTACCTCCTCTTCGTGTTTTCTTACATAAAATTGAATTTCACGTGCCTCC TTTATTTTCGCTGCGTCTCTCCCTCCCTCGCTCTCTTTAGATTCTCGTTAAATCAATCAA ATTACAAGCTCTCTAGGGTTTCAATTTATTCTTTTGTTGCAAGCAAAGGACAAAGCCAAG AATCCTCTCATGGCTAAAAGGTGATTTTCGATGCCTCTTTTTAATTCAATTTCCAGTTTC CTGTAATTGTAATTTTATTTGTTGCGATTTCGTTTTCGTGTTGTTTATTTGCGACGATGA TGATGATAGTGATGGAAGATGTGGAAGATCATCGATTGCGGTTTGTGATCGTGAATTTCT AGATGTTTTTTTAGTGGATTTGATCTTTTGTATGGATGTGTTGCTGTTTATATTTACTTT GTTGATTTTTTCTGACTTTTTTTTTTTTATGTAAATTGTGGAATTCGTTTTTTGAAGTTC ATTTTTATGCATTGATTCGTTGTAATTGCGAATTATGTTTTTTGTTGAAGTATACTATGG ATCAAGTTTGTCGATTTTTGTGACTTATTTATTAGATAGTTTTGAGATGCATGTTTCTTG ACAATGATTTTATTGCCTCAAGCTTCTTGGCTATTATGTTCGGTCTTTATTCATTTACAA TATTATCGATGTTATGATAATCTTATTTTTTTTTATTCTTGTAGGGTCCTCTGCAAGTTC TTTGCTCATGGAGCATGCCTAAAAGGCGAGCATTGCGAGTTTTCTCATGACTGGAAGGAT CCGCCAAATAATGTAAGACGATTTAGTTCTATGTGTTCTTGTGTTTTCTGTAATATTGAT AAAGTGATGCATTTGGTCTTCTCATAATTGATTTTATTTTATTGCTTTATTATCATAGAT 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